ФАБП6

ФАБП6
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 1O1U, 1O1V, 2MM3
Идентификаторы
Псевдонимы	FABP6 , I-15P, I-BABP, I-BALB, I-BAP, ILBP, ILBP3, ILLBP, белок 6, связывающий жирные кислоты
Внешние идентификаторы	Опустить : 600422 ; МГИ : 96565 ; Гомологен : 1108 ; Генные карты : FABP6 ; ОМА : FABP6 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 5 (human) Band 5q33.3 Start 160,187,367 bp End 160,238,735 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 11 (mouse) Band 11 B1.1|11 25.81 cM Start 43,486,876 bp End 43,492,367 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in mucosa of ileum right uterine tube bronchial epithelial cell olfactory zone of nasal mucosa nucleus accumbens caudate nucleus putamen testicle hypothalamus substantia nigra Top expressed in crypt of lieberkuhn of small intestine Paneth cell ileum intestinal villus conjunctival fornix blastocyst epithelium of small intestine Ileal epithelium esophagus cornea More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function bile acid binding lipid binding Cellular component cytoplasm cytosol membrane Biological process lipid metabolism triglyceride catabolic process negative regulation of cell population proliferation lipid transport Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 2172 16204 Вместе ENSG00000170231 ENSMUSG00000020405 ЮниПрот P51161 P51162 RefSeq (мРНК) НМ_001040442 НМ_001130958 НМ_001445 НМ_008375 RefSeq (белок) НП_001035532 НП_001124430 НП_001436 НП_032401 Местоположение (UCSC) Chr 5: 160,19 – 160,24 Мб Чр 11: 43,49 – 43,49 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Белок 6, связывающий жирные кислоты, подвздошной кишки (гастротропин) , также известный как FABP6 , представляет собой белок , который у человека кодируется FABP6 геном .

Функция

Этот ген кодирует подвздошной кишки белок, связывающий жирные кислоты . Белки, связывающие жирные кислоты, представляют собой семейство небольших высококонсервативных цитоплазматических белков, которые связывают длинноцепочечные жирные кислоты и другие гидрофобные лиганды. FABP6 и FABP1 (белок, связывающий жирные кислоты печени) также способны связывать желчные кислоты . Считается, что роль FABP включает поглощение, транспорт и метаболизм жирных кислот. Для этого гена были обнаружены варианты транскрипта, генерируемые альтернативными промоторами транскрипции и/или альтернативным сплайсингом.

Дальнейшее чтение

• Бёрхерс Т., Хохофф С., Бюльман С., Шпенер Ф. (1997). «Белок, связывающий жирные кислоты сердечного типа - участие в ингибировании роста и дифференцировке». Простагландины Лейкот. Сущность. Жирные кислоты . 57 (1): 77–84. дои : 10.1016/S0952-3278(97)90496-8 . ПМИД   9250612 .
• Фудзита М., Фуджи Х., Канда Т. и др. (1995). «Молекулярное клонирование, экспрессия и характеристика кишечного белка человека массой 15 кДа» . Евро. Дж. Биохим . 233 (2): 406–413. дои : 10.1111/j.1432-1033.1995.406_2.x . ПМИД   7588781 .
• Олкерс П., Доусон П.А. (1995). «Клонирование и хромосомная локализация липидсвязывающего белка подвздошной кишки человека». Биохим. Биофиз. Акта . 1257 (2): 199–202. дои : 10.1016/0005-2760(95)00098-w . ПМИД   7619861 .
• Биркенмайер Э.Х., Роу Л.Б., Кроссман М.В., Гордон Дж.И. (1995). «Ген липидсвязывающего белка подвздошной кишки (Illbp) картируется на хромосоме 11 мыши». Мамм. Геном . 5 (12): 805–806. дои : 10.1007/BF00292019 . ПМИД   7894165 . S2CID   28184037 .
• Ватанабэ К., Хоши Н., Цуура Й. и др. (1996). «Иммуногистохимическое распределение кишечного белка 15 кДа в тканях человека» . Арх. Гистол. Цитол . 58 (3): 303–306. дои : 10.1679/aohc.58.303 . ПМИД   8527237 .
• Люке С., Чжан Ф., Рутерьянс Х. и др. (1997). «Гибкость, вероятно, является определяющим фактором специфичности связывания в случае липидсвязывающего белка подвздошной кишки» . Структура . 4 (7): 785–800. дои : 10.1016/S0969-2126(96)00086-X . ПМИД   8805562 .
• Гробер Дж., Загини И., Фуджи Х. и др. (1999). «Идентификация элемента, реагирующего на желчные кислоты, в гене белка, связывающего желчные кислоты подвздошной кишки человека. Участие гетеродимера рецептора фарнезоида X / рецептора 9-цис-ретиноевой кислоты» . Ж. Биол. Хим . 274 (42): 29749–29754. дои : 10.1074/jbc.274.42.29749 . ПМИД   10514450 .
• Зайберт С., Хартенек С., Эрнст О.П. и др. (2000). «Активация стержневого G-белка Gt рецептором тромбина (PAR1), экспрессируемым в клетках Sf9» . Евро. Дж. Биохим . 266 (3): 911–916. дои : 10.1046/j.1432-1327.1999.00927.x . ПМИД   10583385 .
• Люке С., Чжан Ф., Гамильтон Дж.А. и др. (2000). «Структура раствора липидсвязывающего белка подвздошной кишки в комплексе с гликохолатом». Евро. Дж. Биохим . 267 (10): 2929–2938. дои : 10.1046/j.1432-1327.2000.01307.x . ПМИД   10806391 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–16903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Курц М., Брахвогель В., Материя Х. и др. (2003). «Изучение системы транспортировки желчных кислот: комплекс липидсвязывающий белок подвздошной кишки человека-холилтаурин и его сравнение с гомологичными структурами». Белки . 50 (2): 312–328. дои : 10.1002/прот.10289 . ПМИД   12486725 . S2CID   20185435 .
• Барли Н.Ф., Тейлор В., Шоу-Смит С.Дж. и др. (2004). «Промотор белка, связывающего желчные кислоты подвздошной кишки человека, и эффекты CDX2». Биохим. Биофиз. Акта . 1630 (2–3): 138–143. дои : 10.1016/j.bbaexp.2003.09.008 . ПМИД   14654244 .
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–45. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД   14702039 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–2127. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Ландриер Дж. Ф., Томас С., Гробер Дж. и др. (2005). «Ген, кодирующий белок, связывающий желчные кислоты подвздошной кишки человека (I-BABP), регулируется рецепторами, активируемыми пролифератором пероксисом». Биохим. Биофиз. Акта . 1735 (1): 41–49. дои : 10.1016/j.bbalip.2005.05.002 . ПМИД   15936983 .
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–1178. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД   16189514 . S2CID   4427026 .
• Бергхайм И., Харш С., Мюллер О. и др. (2006). «Апикальный переносчик желчных кислот натрия и липидсвязывающий белок подвздошной кишки у носителей желчных камней» . Дж. Липид Рес . 47 (1): 42–50. doi : 10.1194/jlr.M500215-JLR200 . ПМИД   16237211 .
• Омачи Т., Иноуэ Х., Мимори К. и др. (2007). «Белок 6, связывающий жирные кислоты, сверхэкспрессируется при колоректальном раке» . Клин. Рак Рез . 12 (17): 5090–5095. doi : 10.1158/1078-0432.CCR-05-2045 . ПМИД   16951225 .
• Фанг С., Дин Дж., Смит Дж.В. (2007). «Новый вариант белка, связывающего желчные кислоты подвздошной кишки, активируется посредством активации ядерного фактора каппаВ при колоректальной аденокарциноме» . Рак Рез . 67 (19): 9039–9046. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-06-3690 . ПМИД   17909007 .