Jump to content

Ресурсные центры биоинформатики

Ресурсные центры биоинформатики ( BRC ) представляют собой группу из пяти интернет- исследовательских центров, созданных в 2004 году и финансируемых NIAID ( Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний ). [1] BRC были сформированы в ответ на угрозы, создаваемые новыми и вновь появляющимися патогенами , в частности, Центров по контролю и профилактике заболеваний (CDC). патогенами категорий A, B и C [2] и их потенциальное использование в биотерроризме . Намерение NIAID при финансировании этих центров биоинформатики состоит в том, чтобы помочь исследователям, занимающимся экспериментальной характеристикой таких патогенов и созданием лекарств , вакцин или диагностических инструментов для борьбы с ними.

Основными целями БРК являются:

1) Создать комплексные базы данных надежных, актуальных биоинформатических данных ( генетических , протеомных , биохимических или микробиологических ), касающихся интересующих патогенов;
2) Предоставить исследователям легкий доступ к этим данным через Интернет- интерфейсы поиска и извлечения данных ;
3) Предоставить исследователям актуальные современные вычислительные инструменты для биоинформатического анализа этих данных.

В настоящее время заключено два контракта BRC: один на бактерии и вирусы, а другой на переносчиков, эукариотических простейших и грибковые патогены, а также реакцию организма на патогенные инфекции.

Ресурсные центры биоинформатики
Имя Имя Акроно Содействующая организация(и) Охваченные организмы Примеры организмов (категория CDC)
Ресурсы по информатике об эукариотических патогенах, векторах и хозяинах ВЕуПатДБ Пенсильванский университет

Университет Нотр-Дам
Университет Джорджии
Имперский колледж Лондона
ЭБИ-АНСЕМБЛЬ

Все соответствующие патогенные простейшие, грибы, переносчики возбудителей и отдельные организмы-хозяева. Кроме того, для филогенетических выводов включены важные непатогенные организмы. Критидия (Другое)

Криптоспоридий (Б)
Энцефалитозоны (группа I)
Энтамеба (B)
Энтероцитозон (группа I)
Лямблии (B)
Лейшмания (Другое)
Неоспора (Другое)
Плазмодий (Другое)
Тейлерия (Другое)
Токсоплазма (Б)
Трихомонады (Другое)
Трипаносома (Другое) Anopheles gambiae (Другое)
Виды Anopheles (x16) (Другое)
Aedes aegypti (Другое)
Biomphalaria glabrata (Другое)
Пятигранный комар (Другой)
Вид Glossina (x5) (Другое)
Ixodes scapularis (Другое)
Lutzomyia longipalpis (Другое)
Домашняя муха (Другое)
Человеческая вошь (Другое)
Phlebotomus papatasi (Другое)

Ресурсный центр бактериальной и вирусной биоинформатики БВ-БРЦ Институт Дж. Крейга Вентера

Чикагский университет

Все болезнетворные бактерии и вирусы Вирус гриппа (грипп) (С)

Аренавирусиды (А)
Буньявирусиды (А)
Филовирусиды (А)
Флавивирусиды (А)
Поксвирусы (А)
Калицивириды (B)
Тогавирусиды (Б)
Вирус гепатита А (В)
Коронавирусы (С)
Парамиксовирусиды (С)
Лиссавирус (С)
Гепатит Е
Герпесвирусы
Реовирусная палочка (А)
Бартонелла (Группа I)
Боррелия (группа I)
Бруцелла (Б)
Буркхолдерия (Б)
Кампилобактер (Б)
Хламидофила (Б)
Клостридия (А)
Коксиелла (B)
Эрлихия (группа I)
Эшерихия (Б)
Франциселла (А)
Хеликобактер (группа I)
Листерия (Б)
Микобактерия (С)
Риккетсии (Б, С)
Сальмонелла (Б)
Шигелла (Б)
Стафилококк (Б)
Вибрион (Б)
Иерсиния (А, Б)
Другие бактерии

См. также

[ редактировать ]
  1. Обзор, Ресурсные центры биоинформатики. Архивировано 15 мая 2008 г., в Wayback Machine , Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний (NIAID), 10 января 2008 г.
  2. ^ Агенты биотерроризма и заболевания CDC (по категориям). Архивировано 22 июля 2014 г. в Wayback Machine , Центры по контролю и профилактике заболеваний (Департамент здравоохранения и социальных служб), по состоянию на 8 июля 2008 г.
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: eddaa63df70e3a6e514ce3c3c5d5ac03__1693419240
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/ed/03/eddaa63df70e3a6e514ce3c3c5d5ac03.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Bioinformatics Resource Centers - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)