✖


Jump to content

Валозин-содержащий белок

Эта статья была обновлена ​​внешним экспертом в рамках модели двойной публикации. Соответствующая рецензируемая статья была опубликована в журнале Gene. Нажмите, чтобы просмотреть.
(Перенаправлено с P97 )
«P97» перенаправляется сюда. Чтобы узнать о других значениях, см. P97 (значения) .
ВКП
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы VCP , ALS14, HEL-220, HEL-S-70, IBMPFD, IBMPFD1, TERA, p97, валозин-содержащий белок, CMT2Y, валозин-содержащий белок, CDC48, FTDALS6
Внешние идентификаторы Опустить : 601023 ; МГИ : 99919 ; Гомологен : 5168 ; GeneCards : VCP ; ОМА : VCP — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить

7415

269523

Вместе

ENSG00000165280

ENSMUSG00000028452

ЮниПрот

P55072

Q01853

RefSeq (мРНК)

НМ_007126
НМ_001354927
НМ_001354928

НМ_009503

RefSeq (белок)

НП_009057
НП_001341856
НП_001341857

НП_033529

Местоположение (UCSC) Чр 9: 35.05 – 35.07 Мб Чр 4: 42,98 – 43 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Валозин-содержащий белок ( VCP ) или АТФаза переходной эндоплазматической сети ( TER-АТФаза ), также известный как p97 у млекопитающих и CDC48 у S. cerevisiae , представляет собой фермент , который у людей кодируется VCP геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] TER-АТФаза — это фермент АТФаза, присутствующий у всех эукариот и архебактерий . Его основная функция заключается в отделении белковых молекул от крупных клеточных структур, таких как белковые сборки, мембраны органелл и хроматин , и, таким образом, облегчении деградации высвободившихся полипептидов с помощью многосубъединичной протеазной протеасомы .

VCP/p97/CDC48 является членом семейства АТФаз AAA+ (расширенное семейство АТФаз, связанных с различной клеточной активностью). Ферменты этого семейства обнаружены у всех видов от бактерий до человека. Многие из них являются важными шаперонами , регулирующими сворачивание или разворачивание белков-субстратов. VCP представляет собой AAA+ АТФазу типа II, что означает, что он содержит два тандемных домена АТФазы (названные D1 и D2 соответственно) ( рис. 1 ).

Рисунок 1. Схематическая диаграмма доменной структуры p97.

Два домена АТФазы соединены коротким полипептидным линкером. Домен, предшествующий домену D1 ( N-концевой домен), и короткий карбоксиконцевой хвост участвуют во взаимодействии с кофакторами. [ 8 ] N-домен соединен с доменом D1 коротким линкером N-D1.

Большинство известных субстратов VCP модифицированы цепями убиквитина и расщеплены 26S протеасомой . Соответственно, многие коферменты и адаптеры VCP имеют домены, способные распознавать убиквитин. [ 9 ] Стало очевидным, что взаимодействие между убиквитином и кофакторами VCP имеет решающее значение для многих из предполагаемых функций, хотя точная роль этих взаимодействий еще предстоит выяснить.

Открытие

[ редактировать ]

CDC48 был обнаружен в ходе генетического скрининга генов, участвующих в регуляции клеточного цикла у почкующихся дрожжей . [ 10 ] Скрининг выявил несколько аллелей Cdc48 , которые влияют на рост клеток при недопустимых температурах. Поиск гомолога CDC48 млекопитающих (валозина) выявил предшественник белка массой 97 кДа, названный «валозин-содержащий белок (VCP)» или p97, а также показал, что он образуется только как артефакт очистки, а не во время физиологической обработки. [ 11 ] Даже без доказательств того, что валозин является физиологическим продуктом, в литературе продолжает использоваться номенклатура VCP.

Тканевое и субклеточное распределение

[ редактировать ]

VCP является одним из наиболее распространенных цитоплазматических белков в эукариотических клетках. Он повсеместно экспрессируется во всех тканях многоклеточных организмов. Было обнаружено, что у людей экспрессия мРНК VCP умеренно повышена при некоторых типах рака. [ 9 ]

В клетках млекопитающих VCP преимущественно локализован в цитоплазме, а значительная его часть связана с мембранами клеточных органелл, таких как эндоплазматический ретикулум (ЭР), аппарат Гольджи, митохондрии и эндосомы. [ 6 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] Субклеточная локализация CDC48 полностью не охарактеризована, но, вероятно, аналогична таковой у млекопитающих. Часть VCP также была обнаружена в ядре. [ 16 ]

Структура

[ редактировать ]

Согласно кристаллическим структурам полноразмерного VCP дикого типа, [ 17 ] [ 18 ] шесть субъединиц VCP собираются в бочкообразную структуру, в которой домены N-D1 и D2 образуют два концентрических, сложенных друг на друга кольца ( рис. 2 ).

Рисунок 2- Структура VCP. Шесть субъединиц показаны в виде молекулярной поверхности разными цветами. Домены каждой субъединицы также заштрихованы по-разному. Представлены две точки зрения. Эта структура представляет VCP в связанном с ADP состоянии.

Кольцо N-D1 больше (162 Å в диаметре), чем кольцо D2 (113 Å), из-за прикрепленных латерально N-доменов. Домены D1 и D2 очень гомологичны как по последовательности, так и по структуре, но выполняют разные функции. Например, для гексамерной сборки VCP требуется только домен D1, но не D2. [ 19 ] В отличие от многих бактериальных белков ААА+ сборка гексамера VCP не зависит от присутствия нуклеотида. Гексамерная сборка VCP может претерпевать резкие конформационные изменения во время цикла гидролиза нуклеотидов. [ 20 ] [ 21 ] [ 22 ] [ 23 ] [ 24 ] и обычно считается, что эти конформационные изменения генерируют механическую силу, которая прикладывается к молекулам субстрата, чтобы повлиять на их стабильность и функцию. Однако неясно, как именно VCP генерирует силу.

Цикл гидролиза АТФ

[ редактировать ]

Гидролизующая активность АТФ необходима для функций ВЦП. [ 25 ] Два АТФазных домена VCP (D1 и D2) не эквивалентны, поскольку домен D2 демонстрирует более высокую АТФазную активность, чем домен D1 в белке дикого типа. Тем не менее, их деятельность зависит друг от друга. [ 26 ] [ 27 ] [ 28 ] [ 29 ] Например, связывание нуклеотидов с доменом D1 необходимо для связывания АТФ с доменом D2, а связывание нуклеотидов и гидролиз в D2 необходимы для домена D1 для гидролиза АТФ.

На АТФазную активность VCP могут влиять многие факторы. Например, его можно стимулировать теплом. [ 29 ] или предполагаемым белком-субстратом. [ 30 ] У Leishmania infantum белок Li VCP необходим для внутриклеточного развития паразита и его выживания в условиях теплового стресса. [ 31 ] Ассоциация с кофакторами может оказывать как положительное, так и отрицательное влияние на активность АТФазы р97. [ 32 ] [ 33 ]

Мутации VCP также могут влиять на его активность. Например, мутантные белки VCP, несущие единичные точечные мутации, обнаруженные у пациентов с мультисистемной протеинопатией (MSP; ранее известной как IBMPFD (миопатия с тельцами включения, связанная с болезнью Педжета костей и лобно-височной деменцией)) (см. ниже), имеют 2-3-кратное увеличение АТФазная активность. [ 27 ] [ 34 ] [ 35 ]

Белки, взаимодействующие с VCP

[ редактировать ]

Недавние протеомные исследования выявили большое количество белков, взаимодействующих с р97. Многие из этих белков служат адаптерами, которые связывают VCP с определенным субклеточным компартментом для функционирования в определенной клеточной среде. путь. Другие действуют как адаптеры, которые привлекают субстраты к VCP для обработки. Некоторые белки, взаимодействующие с VCP, также представляют собой ферменты, такие как N-гликаназа, убиквитинлигаза и деубиквитиназа, которые помогают VCP обрабатывать субстраты.

Большинство кофакторов связывают VCP через его N-домен, но некоторые взаимодействуют с коротким карбокси-концевым хвостом VCP. Типичными белками, взаимодействующими с N-доменом, являются Ufd1, Npl4, p47 и FAF1. [ 36 ] [ 37 ] [ 38 ] Примерами кофакторов, которые взаимодействуют с карбокси-концевым хвостом VCP, являются PLAA, PNGase и Ufd2. [ 39 ] [ 40 ] [ 41 ]

Молекулярная основа связывания кофактора была изучена для некоторых кофакторов, которые взаимодействуют с N-доменом VCP. N-домен состоит из двух субдоменов примерно одинакового размера: N-концевого двойного Y-цилиндра и С-концевого b-цилиндра ( рис. 3 ).

Рисунок 3- Структура N-домена VCP. N-домен изображается как молекулярная поверхность, наложенная на изображение ленты.

Структурные исследования показывают, что многие белки-кофакторы связываются с N-доменом в щели, образовавшейся между двумя субдоменами.

Среди тех, которые связываются с N-доменом VCP, обнаруживаются два наиболее часто встречающихся мотива последовательности: один называется мотивом UBX (регулятор убиквитина X). [ 42 ] а другой называется VIM (мотив взаимодействия с VCP). [ 43 ] Домен UBX представляет собой модуль из 80 остатков, структура которого очень напоминает структуру убиквитина. Мотив взаимодействия с VCP (VIM) представляет собой мотив линейной последовательности (RX 5 AAX 2 R), обнаруженный в ряде кофакторов VCP, включая gp78, [ 44 ] SVIP (малый белок, ингибирующий VCP) [ 45 ] и VIMP (мембранный белок, взаимодействующий с VCP). [ 46 ] Хотя домен UBX использует поверхностную петлю, тогда как VIM образует спираль для связывания VCP, и UBX, и VIM связываются в одном и том же месте между двумя субдоменами N-домена ( рис. 3 ). [ 47 ] Было высказано предположение, что иерархическое связывание с отдельными кофакторами может быть важным для широких функций VCP. [ 48 ] [ 49 ]

Функция

[ редактировать ]

VCP выполняет разнообразные функции, модулируя стабильность и, следовательно, активность своих субстратов. Общая функция VCP заключается в отделении белков от крупных белковых сборок или неподвижных клеточных структур, таких как мембраны или хроматин, позволяя высвободившимся белковым молекулам разрушаться протеасомой. Функции VCP можно сгруппировать в следующие три основные категории.

Контроль качества белка

[ редактировать ]

Наиболее охарактеризованная функция VCP — опосредовать сеть процессов контроля качества белка для поддержания гомеостаза белка. [ 50 ] К ним относятся деградация белков, связанная с эндоплазматическим ретикулумом (ERAD), и деградация, связанная с митохондриями. [ 14 ] [ 51 ] В этих процессах гидролиз АТФ с помощью VCP необходим для извлечения аберрантных белков из мембран ЭР или митохондрий. VCP также необходим для высвобождения дефектных продуктов трансляции, остановившихся на рибосоме, в процессе, называемом деградацией, связанной с рибосомой. [ 52 ] [ 53 ] [ 54 ] Похоже, что только после экстракции из мембран или сборки большого белка, такого как рибосома, полипептиды могут разрушаться протеасомой. В дополнение к этой функции «сегрегазы», ​​VCP может играть дополнительную роль в доставке высвободившихся полипептидов в протеасому. Эта функция шаперона, по-видимому, особенно важна для деградации некоторых склонных к агрегации неправильно свернутых белков в ядре. [ 55 ] Некоторые данные также указывают на участие p97 в аутофагии, процессе, который перерабатывает клеточные белки (в том числе неправильно свернутые), поглощая их в окруженные двойной мембраной везикулы, называемые аутофагосомами, но точная роль VCP в этом процессе неясна. [ 56 ]

Функции, связанные с хроматином

[ редактировать ]

VCP также широко функционирует в ядре эукариот, высвобождая белковые молекулы из хроматинов аналогично тому, как это происходит в ERAD. [ 57 ] Идентифицированные субстраты VCP включают репрессор транскрипции α2 и комплекс РНК-полимеразы (Pol) II и ДНК-геликазу CMG у почкующихся дрожжей, а также фактор лицензирования репликации ДНК CDT1, белки репарации ДНК DDB2 и XPC, регулятор митоза Aurora B и некоторые ДНК-полимеразы у млекопитающих. клетки. Эти субстраты связывают функцию VCP с транскрипцией генов, репликацией и репарацией ДНК, а также развитием клеточного цикла.

Слияние мембран и торговля ими

[ редактировать ]

Биохимические и генетические исследования также показали участие VCP в слиянии везикул, которое приводит к образованию аппарата Гольджи в конце митоза. [ 58 ] Для этого процесса требуется адаптер связывания убиквитина p47 и p97-ассоциированная деубиквитиназа VCIP135, что, таким образом, соединяет слияние мембран с путями убиквитина. Однако точная роль VCP в формировании Гольджи неясна из-за отсутствия информации о соответствующих субстратах. Недавние исследования также показывают, что VCP может регулировать транспорт пузырьков из плазматической мембраны в лизосому - процесс, называемый эндоцитозом. [ 56 ] Ингибиторы на основе фрагментов антител были разработаны командой под руководством Аркина для ингибирования взаимодействия между p97 и p47, избирательно модулируя процесс повторной сборки Гольджи. [ 59 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]
[ редактировать ]

впервые сообщила, что мутации в VCP вызывают синдром, характеризующийся лобно-височной деменцией , миопатией включенных телец и болезнью Педжета костей . В 2004 году Вирджиния Кимонис [ 60 ] и Адриано Чио также обнаружили, что мутации в VCP являются причиной бокового амиотрофического склероза В 2010 году Брайан Трейнор . [ 61 ] Это открытие было примечательным, поскольку оно представляло собой первоначальную генетическую связь между двумя разрозненными неврологическими заболеваниями: боковым амиотрофическим склерозом и лобно-височной деменцией. В 2020 году Эдвард Ли описал отчетливую гипоморфную мутацию VCP, связанную с вакуолярной таупатией, уникальным подтипом лобно-височной долевой дегенерации с тау-включениями. [ 62 ]

Мутации в VCP являются примером плейотропии , когда мутации в одном и том же гене приводят к различным фенотипам. Термин мультисистемная протеинопатия (MSP) был придуман для описания этой конкретной формы плейотропии. [ 63 ] Хотя MSP встречается редко, растущий интерес к этому синдрому обусловлен молекулярным пониманием этиологической взаимосвязи между распространенными возрастными дегенеративными заболеваниями мышц, костей и головного мозга. Было подсчитано, что около 50% случаев MSP могут быть вызваны миссенс-мутациями, затрагивающими ген валозинсодержащего белка (VCP). [ 64 ]


Терапия рака

[ редактировать ]

Первый ингибитор р97 Eeyarestatin (EerI) был обнаружен путем скрининга и характеристики соединений, которые ингибируют деградацию флуоресцентно-меченного субстрата ERAD. [ 65 ] [ 66 ] Механизм ингибирования VCP с помощью EerI неясен, но при применении к клеткам он индуцирует биологические фенотипы, связанные с ингибированием VCP, такие как ингибирование ERAD, повышение стресса ER и индукция апоптоза. Важно отметить, что EerI проявляет значительную активность по уничтожению рака in vitro, преимущественно против раковых клеток, выделенных от пациентов, и может синергизировать с ингибитором протеасом бортезомибом, убивая раковые клетки. [ 67 ] Эти наблюдения наводят на мысль о том, что VCP может стать потенциальным средством лечения рака. Эта идея получила дальнейшее подтверждение при изучении нескольких конкурентных и аллостерических ингибиторов АТФ. [ 68 ] [ 69 ] [ 70 ] Совсем недавно был разработан мощный и специфический ингибитор VCP CB-5083, который демонстрирует многообещающую противораковую активность на моделях опухолей ксенотрансплантатов мышей. [ 71 ] В настоящее время соединение оценивается в первой фазе клинических испытаний. [ 72 ]

Примечания

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165280 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028452 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Драк Т., Га Ю., Прабхала Г., Канниццаро ​​Л.А., Парк Ш., Хюбнер К., Кин Дж.Х. (ноябрь 1995 г.). «Хромосомная локализация человеческих генов адаптерных полипептидов клатрина AP2 бета и AP50 и клатрин-связывающего белка, VCP». Геномика . 30 (1): 94–7. дои : 10.1006/geno.1995.0016 . ПМИД   8595912 .
  6. ^ Jump up to: а б Рабуй С., Левин Т.П., Питерс Дж.М., Уоррен Дж. (сентябрь 1995 г.). «NSF-подобная АТФаза, p97 и NSF опосредуют возобновление роста цистерн из митотических фрагментов Гольджи» . Клетка . 82 (6): 905–14. дои : 10.1016/0092-8674(95)90270-8 . ПМИД   7553851 . S2CID   2663141 .
  7. ^ «Ген Энтрез: белок, содержащий VCP валозин» .
  8. ^ Огура Т., Уилкинсон А.Дж. (июль 2001 г.). «АТФазы суперсемейства ААА+: общая структура — разнообразные функции» . Гены в клетки . 6 (7): 575–97. дои : 10.1046/j.1365-2443.2001.00447.x . ПМИД   11473577 . S2CID   6740778 .
  9. ^ Jump up to: а б Йе Й (октябрь 2006 г.). «Разнообразные функции с общим регулятором: убиквитин берет на себя управление АТФазой ААА» . Журнал структурной биологии . 156 (1): 29–40. дои : 10.1016/j.jsb.2006.01.005 . ПМИД   16529947 .
  10. ^ Мойр Д., Стюарт С.Е., Осмонд Б.К., Ботштейн Д. (апрель 1982 г.). «Чувствительные к холоду мутанты дрожжевого цикла деления клеток: выделение, свойства и исследования псевдореверсии» . Генетика . 100 (4): 547–63. дои : 10.1093/генетика/100.4.547 . ПМК   1201831 . ПМИД   6749598 .
  11. ^ Коллер К.Дж., Браунштейн М.Дж. (1987). «Использование клона кДНК для идентификации предполагаемого белка-предшественника, содержащего валозин» . Природа . 325 (6104): 542–5. Бибкод : 1987Natur.325..542K . дои : 10.1038/325542a0 . ПМИД   3468358 . S2CID   19200775 .
  12. ^ Ачарья У, Джейкобс Р., Питерс Дж.М., Уотсон Н., Фаркухар М.Г., Малхотра В. (сентябрь 1995 г.). «Формирование стопок Гольджи из пузырьковых мембран Гольджи требует двух различных событий слияния» . Клетка . 82 (6): 895–904. дои : 10.1016/0092-8674(95)90269-4 . ПМИД   7553850 . S2CID   14725335 .
  13. ^ Латтерих М., Фрелих К.У., Шекман Р. (сентябрь 1995 г.). «Слияние мембран и клеточный цикл: Cdc48p участвует в слиянии мембран ЭР» . Клетка . 82 (6): 885–93. дои : 10.1016/0092-8674(95)90268-6 . ПМИД   7553849 . S2CID   17922017 .
  14. ^ Jump up to: а б Сюй С., Пэн Г., Ван Ю., Фанг С., Карбовски М. (февраль 2011 г.). «ААА-АТФаза p97 необходима для обмена белков внешней митохондриальной мембраны» . Молекулярная биология клетки . 22 (3): 291–300. doi : 10.1091/mbc.E10-09-0748 . ПМК   3031461 . ПМИД   21118995 .
  15. ^ Раманатан Х.Н., Йе Ю (февраль 2012 г.). «АТФаза p97 связывается с EEA1, регулируя размер ранних эндосом» . Клеточные исследования . 22 (2): 346–59. дои : 10.1038/cr.2011.80 . ПМК   3271578 . ПМИД   21556036 .
  16. ^ Мадео Ф., Шлауэр Дж., Зишка Х., Мекке Д., Фрелих К.У. (январь 1998 г.). «Фосфорилирование тирозина регулирует зависимую от клеточного цикла ядерную локализацию Cdc48p» . Молекулярная биология клетки . 9 (1): 131–41. дои : 10.1091/mbc.9.1.131 . ПМК   25228 . ПМИД   9436996 .
  17. ^ ДеЛаБарр Б., Брунгер А.Т. (октябрь 2003 г.). «Полная структура белка, содержащего p97/валозин, обнаруживает связь между нуклеотидными доменами». Структурная биология природы . 10 (10): 856–63. дои : 10.1038/nsb972 . ПМИД   12949490 . S2CID   19281416 .
  18. ^ Дэвис Дж. М., Брунгер А. Т., Вейс В. И. (май 2008 г.). «Улучшенные структуры полноразмерного p97, АТФазы ААА: значение для механизмов нуклеотид-зависимых конформационных изменений» . Структура . 16 (5): 715–26. дои : 10.1016/j.str.2008.02.010 . ПМИД   18462676 .
  19. ^ Ван Ц, Сун С, Ли CC (январь 2003 г.). «Гексамеризации p97-VCP способствует связывание АТФ с доменом D1 и необходимо для АТФазы и биологической активности» . Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 300 (2): 253–60. дои : 10.1016/s0006-291x(02)02840-1 . ПМИД   12504076 .
  20. ^ Бейрон Ф., Древени И., Юань Х., Пай В.Е., МакКаун С., Бриггс Л.К., Клифф М.Дж., Канеко Ю., Уоллис Р., Исааксон Р.Л., Ледбери Дж.Э., Мэтьюз С.Дж., Кондо Х., Чжан Х., Фримонт П.С. (май 2006 г.). «Конформационные изменения в адаптерном комплексе AAA-АТФазы p97-p47» . Журнал ЭМБО . 25 (9): 1967–76. дои : 10.1038/sj.emboj.7601055 . ПМК   1456939 . ПМИД   16601695 .
  21. ^ Бейрон Ф., Флинн Т.С., Ма Дж., Кондо Х., Чжан Х., Фримонт П.С. (март 2003 г.). «Движения и отрицательная кооперативность между доменами p97, выявленные с помощью криоэлектронной микроскопии и модели квантовой упругой деформации». Журнал молекулярной биологии . 327 (3): 619–29. дои : 10.1016/s0022-2836(03)00178-5 . ПМИД   12634057 .
  22. ^ ДеЛаБарр Б., Брунгер А.Т. (март 2005 г.). «Нуклеотид-зависимое движение и механизм действия p97/VCP». Журнал молекулярной биологии . 347 (2): 437–52. дои : 10.1016/j.jmb.2005.01.060 . ПМИД   15740751 .
  23. ^ Руиллер И., ДеЛаБарр Б., Мэй А.П., Вейс В.И., Брунгер А.Т., Миллиган Р.А., Уилсон-Кубалек Э.М. (декабрь 2002 г.). «Конформационные изменения многофункциональной АТФазы p97 AAA во время ее АТФазного цикла». Структурная биология природы . 9 (12): 950–7. дои : 10.1038/nsb872 . ПМИД   12434150 . S2CID   16061425 .
  24. ^ Тан В.К., Ли Д., Ли CC, Эссер Л., Дай Р., Го Л., Ся Д. (июль 2010 г.). «Новая АТФ-зависимая конформация фрагмента p97 N-D1, обнаруженная с помощью кристаллических структур мутантов, связанных с заболеванием» . Журнал ЭМБО . 29 (13): 2217–29. дои : 10.1038/emboj.2010.104 . ПМК   2905243 . ПМИД   20512113 .
  25. ^ Ван Ц, Сун С, Ли CC (2004). «Молекулярные взгляды на p97-VCP: прогресс в понимании его структуры и разнообразных биологических функций» . Журнал структурной биологии . 146 (1–2): 44–57. дои : 10.1016/j.jsb.2003.11.014 . ПМИД   15037236 .
  26. ^ Нисикори С., Эсаки М., Яманака К., Сугимото С., Огура Т. (май 2011 г.). «Положительная кооперативность АТФазы p97 AAA имеет решающее значение для основных функций» . Журнал биологической химии . 286 (18): 15815–20. дои : 10.1074/jbc.M110.201400 . ПМК   3091191 . ПМИД   21454554 .
  27. ^ Jump up to: а б Тан В.К., Ся Д. (декабрь 2013 г.). «Измененная межсубъединичная связь является молекулярной основой функциональных дефектов патогенных мутантов р97» . Журнал биологической химии . 288 (51): 36624–35. дои : 10.1074/jbc.M113.488924 . ПМЦ   3868774 . ПМИД   24196964 .
  28. ^ Й., Мейер Х.Х., Рапопорт Т.А. (июль 2003 г.). «Функция комплекса p97-Ufd1-Npl4 при ретротранслокации из ЭР в цитозоль: двойное распознавание неубиквитинированных полипептидных сегментов и полиубиквитиновых цепей» . Журнал клеточной биологии . 162 (1): 71–84. дои : 10.1083/jcb.200302169 . ПМК   2172719 . ПМИД   12847084 .
  29. ^ Jump up to: а б Сун Си, Ван Ц, Ли Си (февраль 2003 г.). «АТФазная активность белка, содержащего p97-валозин (VCP). D2 опосредует основную активность фермента, а D1 способствует активности, индуцированной нагреванием» . Журнал биологической химии . 278 (6): 3648–55. дои : 10.1074/jbc.M208422200 . ПМИД   12446676 .
  30. ^ ДеЛаБарре Б., Кристиансон Дж.К., Копито Р.Р., Брунгер А.Т. (май 2006 г.). «Остатки центральных пор опосредуют активность p97/VCP, необходимую для ERAD» . Молекулярная клетка . 22 (4): 451–62. doi : 10.1016/j.molcel.2006.03.036 . ПМИД   16713576 .
  31. ^ Гуэдес Агиар Б., Падманабхан П.К., Дюма С., Пападопулу Б. (июнь 2018 г.). «Валозин-содержащий белок VCP/p97 необходим для внутриклеточного развития лейшмании и ее выживания в условиях теплового стресса» . Клеточная микробиология . 20 (10): e12867. дои : 10.1111/cmi.12867 . ПМИД   29895095 . S2CID   48359590 .
  32. ^ Мейер Х.Х., Кондо Х., Уоррен Дж. (октябрь 1998 г.). «Кофактор p47 регулирует АТФазную активность слитого с мембраной белка p97» . Письма ФЭБС . 437 (3): 255–7. дои : 10.1016/s0014-5793(98)01232-0 . ПМИД   9824302 . S2CID   33962985 .
  33. ^ Чжан X, Гуй Л, Чжан X, Булфер С.Л., Сангез В., Вонг Д.Е., Ли Ю, Леманн Л., Ли Дж.С., Ши П.Ю., Лин Х.Дж., Яковино М., Вейхл К.С., Аркин М.Р., Ван Ю., Чжоу Т.Ф. (апрель 2015 г.) ). «Измененная регуляция кофактора при мутациях p97/VCP, связанных с заболеванием» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (14): E1705–14. Бибкод : 2015PNAS..112E1705Z . дои : 10.1073/pnas.1418820112 . ПМЦ   4394316 . ПМИД   25775548 .
  34. ^ Халавани Д., ЛеБлан АС, Руйе И., Михник С.В., Слуга М.Дж., Латтерих М. (август 2009 г.). «Наследственные мутации p97/VCP, связанные с миопатией телец включения, в домене NH2 и кольце D1 модулируют АТФазную активность p97/VCP и конформацию кольца D2» . Молекулярная и клеточная биология . 29 (16): 4484–94. дои : 10.1128/MCB.00252-09 . ПМЦ   2725746 . ПМИД   19506019 .
  35. ^ Вейль CC, Далал С., Пестронк А., Хансон П.И. (январь 2006 г.). «Мутации, связанные с миопатией с тельцами включения в p97 / VCP, нарушают деградацию, связанную с эндоплазматическим ретикулумом» . Молекулярная генетика человека . 15 (2): 189–99. дои : 10.1093/hmg/ddi426 . ПМИД   16321991 .
  36. ^ Й., Мейер Х.Х., Рапопорт Т.А. (декабрь 2001 г.). «ААА-АТФаза Cdc48/p97 и ее партнеры транспортируют белки из ЭР в цитозоль». Природа . 414 (6864): 652–6. Бибкод : 2001Natur.414..652Y . дои : 10.1038/414652а . ПМИД   11740563 . S2CID   23397533 .
  37. ^ Кондо Х., Рабуй С., Ньюман Р., Левин Т.П., Паппин Д., Фримонт П., Уоррен Г. (июль 1997 г.). «p47 является кофактором p97-опосредованного слияния мембран» . Природа . 388 (6637): 75–8. Бибкод : 1997Natur.388R..75K . дои : 10.1038/40411 . ПМИД   9214505 . S2CID   32646222 .
  38. ^ Сон Э.Дж., Йим Ш., Ким Э, Ким Н.С., Ли К.Дж. (март 2005 г.). «Человеческий Fas-ассоциированный фактор 1, взаимодействуя с убиквитинированными белками и валозинсодержащим белком, участвует в пути убиквитин-протеасома» . Молекулярная и клеточная биология . 25 (6): 2511–24. дои : 10.1128/MCB.25.6.2511-2524.2005 . ПМЦ   1061599 . ПМИД   15743842 .
  39. ^ Цю Л., Пашкова Н., Уокер Дж.Р., Винисторфер С., Аллали-Хассани А., Акуцу М., Пайпер Р., Де-Паганон С. (январь 2010 г.). «Структура и функция комплекса PLAA/Ufd3-p97/Cdc48» . Журнал биологической химии . 285 (1): 365–72. дои : 10.1074/jbc.M109.044685 . ПМК   2804184 . ПМИД   19887378 .
  40. ^ Чжао Г., Чжоу X, Ван Л., Ли Г., Шинделин Х., Леннарц В.Дж. (май 2007 г.). «Исследования взаимодействия пептида: N-гликаназы-p97 показывают, что фосфорилирование p97 модулирует деградацию, связанную с эндоплазматическим ретикулумом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (21): 8785–90. Бибкод : 2007PNAS..104.8785Z . дои : 10.1073/pnas.0702966104 . ПМК   1885580 . ПМИД   17496150 .
  41. ^ Шеффер В., Акуцу М., Олма М.Х., Гомес Л.К., Кавасаки М., Дикич И. (май 2014 г.). «Связывание OTULIN с доменом PUB HOIP контролирует передачу сигналов NF-κB» . Молекулярная клетка . 54 (3): 349–61. doi : 10.1016/j.molcel.2014.03.016 . ПМИД   24726327 .
  42. ^ Шуберт К., Бухбергер А (август 2008 г.). «Белки домена UBX: основные регуляторы AAA-АТФазы Cdc48/p97» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 65 (15): 2360–71. дои : 10.1007/s00018-008-8072-8 . ПМЦ   11131665 . ПМИД   18438607 .
  43. ^ Стапф С., Картрайт Э., Байкрофт М., Хофманн К., Бухбергер А. (ноябрь 2011 г.). «Общее определение мотива взаимодействия р97/валозин-содержащего белка (VCP) (VIM) определяет новое семейство кофакторов р97» . Журнал биологической химии . 286 (44): 38670–8. дои : 10.1074/jbc.M111.274472 . ПМК   3207395 . ПМИД   21896481 .
  44. ^ Баллар П., Шен Ю, Ян Х., Фанг С. (ноябрь 2006 г.). «Роль нового мотива gp78, взаимодействующего с белком p97/валозин, в деградации, связанной с эндоплазматическим ретикулумом» . Журнал биологической химии . 281 (46): 35359–68. дои : 10.1074/jbc.M603355200 . ПМИД   16987818 .
  45. ^ Баллар П., Чжун Ю., Нагахама М., Тагая М., Шен Ю., Фанг С. (ноябрь 2007 г.). «Идентификация SVIP как эндогенного ингибитора деградации, связанной с эндоплазматическим ретикулумом» . Журнал биологической химии . 282 (47):33908–14. дои : 10.1074/jbc.M704446200 . ПМИД   17872946 .
  46. ^ Йе Ю, Шибата Ю, Юн С, Рон Д, Рапопорт Т. А. (июнь 2004 г.). «Комплекс мембранных белков опосредует ретротранслокацию из просвета ЭР в цитозоль». Природа . 429 (6994): 841–7. Бибкод : 2004Natur.429..841Y . дои : 10.1038/nature02656 . ПМИД   15215856 . S2CID   4317750 .
  47. ^ Ханцельманн П., Шинделин Х (ноябрь 2011 г.). «Структурная и функциональная основа мотива взаимодействия р97/валозинсодержащего белка (VCP) (VIM): взаимоисключающее связывание кофакторов с N-концевым доменом p97» . Журнал биологической химии . 286 (44): 38679–90. дои : 10.1074/jbc.M111.274506 . ПМК   3207442 . ПМИД   21914798 .
  48. ^ Мейер Х.Х., Шортер Дж.Г., Зееманн Дж., Паппин Д., Уоррен Дж. (май 2000 г.). «Комплекс ufd1 и npl4 млекопитающих связывает AAA-АТФазу, p97, с путями убиквитина и ядерного транспорта» . Журнал ЭМБО . 19 (10): 2181–92. дои : 10.1093/emboj/19.10.2181 . ПМЦ   384367 . ПМИД   10811609 .
  49. ^ Бухбергер А., Шинделин Х., Ханцельманн П. (сентябрь 2015 г.). «Контроль функции р97 путем связывания кофактора» . Письма ФЭБС . 589 (19 ч. А): 2578–89. дои : 10.1016/j.febslet.2015.08.028 . ПМИД   26320413 . S2CID   41082524 .
  50. ^ Мейер Х., Баг М., Бремер С. (февраль 2012 г.). «Новые функции VCP/p97 AAA-АТФазы в системе убиквитина». Природная клеточная биология . 14 (2): 117–23. дои : 10.1038/ncb2407 . ПМИД   22298039 . S2CID   23562362 .
  51. ^ Кристиансон Дж. К., Й. (апрель 2014 г.). «Очистка эндоплазматического ретикулума: за дело отвечает убиквитин» . Структурная и молекулярная биология природы . 21 (4): 325–35. дои : 10.1038/nsmb.2793 . ПМЦ   9397582 . ПМИД   24699081 . S2CID   43665193 .
  52. ^ Брандман О, Стюарт-Орнштейн Дж, Вонг Д, Ларсон А, Уильямс CC, Ли Г.В., Чжоу С., Кинг Д., Шен П.С., Вайбезан Дж., Данн Дж.Г., Рускин С., Инада Т., Фрост А., Вайсман Дж.С. (ноябрь 2012 г.) . «Комплекс контроля качества, связанный с рибосомами, запускает деградацию возникающих пептидов и сигнализирует о стрессе трансляции» . Клетка . 151 (5): 1042–54. дои : 10.1016/j.cell.2012.10.044 . ПМЦ   3534965 . ПМИД   23178123 .
  53. ^ Дефенуйер К., Яо Й., Муайкель Дж., Намане А., Галопиер А., Декурти Л., Дуайен А., Малабат С., Савану С., Жакье А., Фромон-Расин М. (март 2013 г.). «Связанный с Cdc48 комплекс, связанный с частицами 60S, необходим для выведения аберрантных продуктов трансляции» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (13): 5046–51. Бибкод : 2013PNAS..110.5046D . дои : 10.1073/pnas.1221724110 . ПМЦ   3612664 . ПМИД   23479637 .
  54. ^ Верма Р., Оания Р.С., Колава Н.Дж., Деше Р.Дж. (январь 2013 г.). «Cdc48/p97 способствует деградации аберрантных полипептидов, связанных с рибосомой» . электронная жизнь . 2 : e00308. doi : 10.7554/eLife.00308 . ПМЦ   3552423 . ПМИД   23358411 .
  55. ^ Галлахер П.С., Клоуз Кандадай С.В., Гарднер Р.Г. (май 2014 г.). «Потребность в Cdc48/p97 при деградации контроля качества ядерного белка зависит от субстрата и коррелирует с нерастворимостью субстрата» . Журнал клеточной науки . 127 (Часть 9): 1980–91. дои : 10.1242/jcs.141838 . ПМК   4004975 . ПМИД   24569878 .
  56. ^ Jump up to: а б Баг М., Мейер Х. (август 2012 г.). «Выход на новые рынки - VCP/p97 при эндоцитозе и аутофагии». Журнал структурной биологии . 179 (2): 78–82. дои : 10.1016/j.jsb.2012.03.003 . ПМИД   22450227 .
  57. ^ Дантума Н.П., Acs K, Луистербург MS (ноябрь 2014 г.). «Должен ли я остаться или уйти: экстракция хроматина, опосредованная VCP/p97, в ответ на повреждение ДНК». Экспериментальные исследования клеток . 329 (1): 9–17. дои : 10.1016/j.yexcr.2014.08.025 . ПМИД   25169698 .
  58. ^ Утияма К., Кондо Х (февраль 2005 г.). «p97/p47-опосредованный биогенез Гольджи и ER». Журнал биохимии . 137 (2): 115–9. дои : 10.1093/jb/mvi028 . ПМИД   15749824 . S2CID   10459261 .
  59. ^ Цзян, Цзивэнь; Куо, Ю-Сюань; Чжун, Мэнци; Чжан, Цзяньчао; Чжоу, Синь X.; Син, Лицзюань; Уэллс, Джеймс А.; Ван, Яньчжуан; Аркин, Мишель Р. (27 июля 2022 г.). «Адаптор-специфичные ингибиторы фрагментов антител для внутриклеточной модуляции белок-белковых взаимодействий p97 (VCP)» . Журнал Американского химического общества . 144 (29): 13218–13225. дои : 10.1021/jacs.2c03665 . ISSN   0002-7863 . ПМЦ   9335864 . ПМИД   35819848 .
  60. ^ Уоттс, диджей Джайлз; Уаймер, Джилл; Ковач, Маргарет Дж.; Мехта, Сарджу Г.; Мам, Стивен; Дарвиш, Дэниел; Пестронк, Алан; Уайт, Майкл П.; Кимонис, Вирджиния Э. (2004). «Миопатия с тельцами включения, связанная с болезнью Педжета костей и лобно-височной деменцией, вызвана мутантным валозинсодержащим белком» . Природная генетика . 36 (4): 377–381. дои : 10.1038/ng1332 . ISSN   1061-4036 . ПМИД   15034582 .
  61. ^ Джонсон, Джанель О.; Мандриоли, Джессика; Бенатар, Майкл; Абрамзон Евгения; Ван Дирлин, Вивианна М.; Трояновский, Джон К.; Гиббс, Дж. Рафаэль; Брунетти, Маура; Гронка, Сьюзен (9 декабря 2010 г.). «Секвенирование экзома выявило мутации VCP как причину семейного БАС» . Нейрон . 68 (5): 857–864. дои : 10.1016/j.neuron.2010.11.036 . ISSN   1097-4199 . ПМК   3032425 . ПМИД   21145000 .
  62. ^ Дарвич, Н.Ф., Фан Дж.М.; и др. (2020). «Аутосомно-доминантная гипоморфная мутация VCP нарушает дезагрегацию PHF-тау» . Наука . 370 (6519): eaay8826. дои : 10.1126/science.aay8826 . ПМЦ   7818661 . ПМИД   33004675 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  63. ^ Тейлор, Дж. Пол (25 августа 2015 г.). «Мультисистемная протеинопатия: пересекающаяся генетика при дегенерации мышц, костей и мозга». Неврология . 85 (8): 658–660. дои : 10.1212/WNL.0000000000001862 . ISSN   1526-632X . ПМИД   26208960 . S2CID   42203997 .
  64. ^ Ле Бер I, Ван Бортель I, Николя Г, Буя-Ахмед К, Камюза А, Валлон Д, Де Септенвиль А, Латуш М, Латтанте С, Кабаши Е, Хорнеа Л, Ханнекин Д, Брайс А (апрель 2014 г.). «Мутации hnRNPA2B1 и hnRNPA1 редко встречаются у пациентов с «мультисистемной протеинопатией» и фенотипами лобно-височной долевой дегенерации». Нейробиология старения . 35 (4): 934.e5–6. doi : 10.1016/j.neurobiolaging.2013.09.016 . ПМИД   24119545 . S2CID   207160856 .
  65. ^ Фибигер Э., Хирш С., Вьяс Дж. М., Гордон Э., Плу Х. Л., Торторелла Д. (апрель 2004 г.). «Рассечение пути дислокации мембранных белков типа I с помощью нового низкомолекулярного ингибитора, ееарестатина» . Молекулярная биология клетки . 15 (4): 1635–46. doi : 10.1091/mbc.E03-07-0506 . ПМК   379262 . ПМИД   14767067 .
  66. ^ Ван Ц, Шинкре Б.А., Ли Дж.Г., Венигер М.А., Лю Ю, Чен В., Вистнер А., Тренкл В.К., Йе Ю (ноябрь 2010 г.). «Ингибитор ERAD ееарестатин I представляет собой бифункциональное соединение с мембраносвязывающим доменом и группой, ингибирующей p97/VCP» . ПЛОС ОДИН . 5 (11): e15479. Бибкод : 2010PLoSO...515479W . дои : 10.1371/journal.pone.0015479 . ПМЦ   2993181 . ПМИД   21124757 .
  67. ^ Ван Кью, Мора-Дженсен Х, Венигер М.А., Перес-Галан П., Вулфорд С., Хай Т., Рон Д., Чен В., Тренкл В., Вистнер А., Йе Й. (февраль 2009 г.). «Ингибиторы ERAD объединяют стресс ER с эпигенетическим механизмом активации белка NOXA, содержащего только BH3, в раковых клетках» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (7): 2200–5. Бибкод : 2009PNAS..106.2200W . дои : 10.1073/pnas.0807611106 . ПМЦ   2629785 . ПМИД   19164757 .
  68. ^ Чоу Т.Ф., Ли К., Франковски К.Дж., Шенен Ф.Дж., Деше Р.Дж. (февраль 2013 г.). «Исследование взаимосвязи структура-активность показало, что ML240 и ML241 являются мощными и селективными ингибиторами АТФазы p97» . ХимМедХим . 8 (2): 297–312. дои : 10.1002/cmdc.201200520 . ПМЦ   3662613 . ПМИД   23316025 .
  69. ^ Чоу Т.Ф., Браун С.Дж., Минонд Д., Нордин Б.Е., Ли К., Джонс А.С., Чейз П., Порубски П.Р., Штольц Б.М., Шенен Ф.Дж., Патриселли М.П., ​​Ходдер П., Розен Х., Деше Р.Дж. (март 2011 г.). «Обратимый ингибитор р97, DBeQ, нарушает как убиквитин-зависимый, так и аутофагический пути клиренса белка» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (12): 4834–9. Бибкод : 2011PNAS..108.4834C . дои : 10.1073/pnas.1015312108 . ПМК   3064330 . ПМИД   21383145 .
  70. ^ Магнаги П, Д'Алессио Р, Вальсасина Б, Аванци Н, Рицци С, Аса Д, Гаспарри Ф, Коцци Л, Кучки Ю, Оррениус С, Получчи П, Баллинари Д, Перрера С, Леоне А, Черви Г, Казале Е, Сяо И., Вонг С., Андерсон DJ, Гальвани А., Донати Д., О'Брайен Т., Джексон П.К., Исакки А. (сентябрь 2013 г.). «Ковалентные и аллостерические ингибиторы АТФазы VCP/p97 вызывают гибель раковых клеток». Химическая биология природы . 9 (9): 548–56. дои : 10.1038/nchembio.1313 . ПМИД   23892893 .
  71. ^ Андерсон DJ, Ле Муань Р, Джакович С, Кумар Б, Райс Дж, Вонг С, Ван Дж, Яо Б, ​​Валле Е, Кисс фон Соли С, Мадриага А, Сориано Ф, Менон МК, Ву ЗЮ, Кампманн М, Чен Ю , Вайсман Дж.С., Афтаб Б.Т., Якс Ф.М., Шоувер Л., Чжоу Х.Дж., Вустроу Д., Рольф М. (ноябрь 2015 г.). «Нацеливание на ААА-АТФазу p97 как подход к лечению рака посредством нарушения белкового гомеостаза» . Раковая клетка . 28 (5): 653–665. дои : 10.1016/j.ccell.2015.10.002 . ПМЦ   4941640 . ПМИД   26555175 .
  72. ^ Чжоу Х.Дж., Ван Дж., Яо Б., Вонг С., Джакович С., Кумар Б., Райс Дж., Валле Е., Сориано Ф., Менон М.К., Мадриага А., Кисс фон Соли С., Кумар А., Парлати Ф., Якс Ф.М., Шовер Л., Ле Муань Р., Андерсон DJ, Рольф М., Вустроу Д. (декабрь 2015 г.). «Открытие первого в своем классе мощного, селективного и перорально биодоступного ингибитора АТФазы VCP AAA (CB-5083)» . Журнал медицинской химии . 58 (24): 9480–97. doi : 10.1021/acs.jmedchem.5b01346 . ПМИД   26565666 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Valosin-containing_protein&oldid=1227022884"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: fa7960e74d4a1f1ea20815d4254b990c__1717383720
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/fa/0c/fa7960e74d4a1f1ea20815d4254b990c.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Valosin-containing protein - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)