HM13

HM13
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1INQ, 1JUF
Идентификаторы
Псевдонимы	HM13 , H13, IMP1, IMMAS, IMMAS-1, MSTP086, PSENL3, PSL3, SPP, SPPL1, DJ324O17.1, Гистосовместимость (несовершеннолетняя) 13, Гистосовместимость Минор 13 13
Внешние идентификаторы	Омим : 607106 ; MGI : 95886 ; Гомологен : 7749 ; GeneCards : HM13 ; OMA : HM13 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	31,577,923 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	152,550,590 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	body of pancreas; ; stromal cell of endometrium; ; bone marrow cells; ; anterior pituitary; ; islet of Langerhans; ; minor salivary glands; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; canal of the cervix; ; right adrenal gland;
	Top expressed in
	seminal vesicula; ; lacrimal gland; ; stroma of bone marrow; ; salivary gland; ; decidua; ; Rostral migratory stream; ; parotid gland; ; molar; ; submandibular gland; ; internal carotid artery;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	protein homodimerization activity; aspartic-type endopeptidase activity; aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving; peptidase activity; protein binding; hydrolase activity; ubiquitin protein ligase binding;
Cellular component	integral component of membrane; rough endoplasmic reticulum; endoplasmic reticulum membrane; membrane; integral component of cytoplasmic side of endoplasmic reticulum membrane; plasma membrane; Derlin-1 retrotranslocation complex; integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane; Golgi-associated vesicle membrane; lysosomal membrane; endoplasmic reticulum; cell surface;
Biological process	membrane protein proteolysis; proteolysis; membrane protein proteolysis involved in retrograde protein transport, ER to cytosol; membrane protein intracellular domain proteolysis; membrane protein ectodomain proteolysis; protein homotetramerization; signal peptide processing;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	81502
	14950
	ENSG00000101294
	Ensmusg000000188
	Q8TCT9
	Q9D8V0
	NM_030789 ; NM_178580 ; NM_178581 ; NM_178582
	NM_001159551 ; NM_001159552 ; NM_001159553 ; NM_010376
	NP_110416 ; NP_848695 ; NP_848696 ; NP_848697
	NP_001153023 ; NP_001153024 ; NP_001153025 ; NP_034506
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Незначительная гистосовместимость антиген H13 - это белок , который у людей кодируется HM13 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Незначительный антиген 13 гистосовместимости представляет собой неморский пептид, который происходит из белка, кодируемого геном H13 . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Пептид генерируется цитозолем протеасомой , связанным входит в просвет эндоплазматического ретикулума (ER) транспортером, с обработкой антигена (TAP) и представлен на клетке на H2-D ^{беременный} Основная гистосовместимость антигена I ( MHC I ) молекулы. Аллореактивность, которая приводит к отторжению трансплантации у мышей, присваивается полиморфизмом Val/Ile в пептиде 'SSV (V/i) GVWYL. ^{[ 10 ]} Ген ортологи у людей называется HM13. Однако , если связанный полиморфизм, и если HM13 служит незначительным антигеном гистосовместимости , еще предстоит решить.

Белок, кодируемый геном M13/HM13, представляет собой сигнальную пептид-пептидазу (SPP), интрамембранную протеазу ER-резидента . ^{[ 5 ]} SPP локализуется в эндоплазматическом ретикулуме , катализирует внутримембранный протеолиз некоторых сигнальных пептидов после того, как они были расщеплены из препротеина. Эта активность необходима для генерации эпитопов, полученных из лимфоцитов человека-лимфоцитов человека, которые распознаются иммунной системой, и для обработки ядра вируса вируса гепатита С. Кодированный белок является интегральным мембранным белком с мотивами последовательности, характерными для аспартических протеаз типа пресенилина. Для этого гена было обнаружено несколько вариантов транскрипта, кодирующих несколько разных изоформ. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000101294 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000019188 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Wehofen A, Binns K, Lemberg MK, Ashman K, Martoglio B (Jun 2002). «Идентификация сигнальной пептидазы пептидазы, аспартической протеазы типа пресенилина». Наука . 296 (5576): 2215–8. Bibcode : 2002sci ... 296.2215W . doi : 10.1126/science.1070925 . PMID 12077416 . S2CID 45633906 .
^ Nyborg AC, Kornilova AY, Jansen K, Ladd TB, Wolfe MS, Golde TE (апрель 2004 г.). «Сигнальная пептид-пептидаза образует гомодимер, который помечен активным сайтом, направленным ингибитором гамма-секретазы» . J Biol Chem . 279 (15): 15153–60. doi : 10.1074/jbc.m309305200 . PMID 14704149 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: HM13 Гистосовместимость (несовершеннолетняя) 13» .
^ «Ген Entrez: гистосовместимость H13 (несовершеннолетняя) 13» .
^ Snell GD, Cudkowicz G, Bunker HP (Jun 1967). «Гены гистосовместимости мышей. VII. H-13, новый локус гистосовместимости в пятой группе сцепления». Трансплантация . 5 (3): 492–503. doi : 10.1097/00007890-196705000-00011 . PMID 5340356 . S2CID 31345625 .
^ Mendoza LM, Paz P, Zuberi A, Christianson G, Roopenian D, Shastri N (октябрь 1997 г.). «Несовершеннолетние, удерживаемые майорами: локус небольшой гистосовместимости H13, определяемый как комплекс пептида/MHC класса I» . Иммунитет . 7 (4): 461–72. doi : 10.1016/s1074-7613 (00) 80368-4 . PMID 9354467 .

Дальнейшее чтение

Lemberg MK, Bland FA, Weihofen A, et al. (2002). «Внутримембранный протеолиз сигнальных пептидов: важный этап в генерации эпитопов HLA-E» . J. Immunol . 167 (11): 6441–6. doi : 10.4049/jimmunol.167.11.6441 . PMID 11714810 .
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J, et al. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы человека 20» . Природа . 414 (6866): 865–71. Bibcode : 2001natur.414..865d . doi : 10.1038/414865a . PMID 11780052 .
Grigorenko AP, Moliaka YK, Korovaitseva GI, Rogaev EI (2002). «Новый класс политопических белков с доменами, связанными с предполагаемой активностью протеазы». Биохимия Моск . 67 (7): 826–35. doi : 10.1023/a: 1016365227942 . PMID 12139484 . S2CID 11785597 .
McLauchlan J, Lemberg MK, Hope G, Martoglio B (2002). «Внутримембранный протеолиз способствует переносу ядра вируса вируса гепатита С в липидные капли» . Embo j . 21 (15): 3980–8. doi : 10.1093/emboj/cdf414 . PMC 126158 . PMID 12145199 .
Lemberg MK, Martoglio B (2002). «Требования к сигнальному пептид-пептидазе, катализируемому внутримембранному протеолизу» . Мол Клетка . 10 (4): 735–44. doi : 10.1016/s1097-2765 (02) 00655-x . PMID 12419218 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Urny J, Hermans-Borgmeyer I, Gercken G, Schaller HC (2004). «Экспрессия пресенилиноподобной сигнальной пептидазы (SPP) у мышиного мозга взрослых и во время развития». Ген Expr. Узоры . 3 (5): 685–91. doi : 10.1016/s1567-133x (03) 00094-2 . PMID 12972007 .
Lehner B, Semple Ji, Brown SE, et al. (2004). «Анализ высокопроизводительной двухгибридной системы дрожжей и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области MHC класса III человека». Геномика . 83 (1): 153–67. doi : 10.1016/s0888-7543 (03) 00235-0 . PMID 14667819 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных человеческих кДНК» . НАТ Генет . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Moliaka YK, Grigorenko A, Madera D, Rogaev EI (2004). «IMMA 1 обладает эндопротеолитической активностью против многоосказанного мембранного белкового субстрата, расщепляющего голопротеин пресенилина 1» . Фебс Летт . 557 (1–3): 185–92. doi : 10.1016/s0014-5793 (03) 01489-3 . PMID 14741365 . S2CID 21770115 .
Soares MR, Bisch PM, Campos de Carvalho AC, et al. (2004). «Корреляция между конформацией и связыванием антител: ЯМР-структура перекрестных пептидов из T. cruzi, человека и L. braziliensis». Фебс Летт . 560 (1–3): 134–40. doi : 10.1016/s0014-5793 (04) 00088-2 . PMID 14988012 . S2CID 21812894 .
Friedmann E, Lemberg MK, Weihofen A, et al. (2005). «Консенсус -анализ сигнальной пептидазы и гомологичных аспартических протеаз человека выявляет противоположную топологию каталитических доменов по сравнению с пресенилинами» . Дж. Биол. Химический 279 (49): 50790–8. doi : 10.1074/jbc.m407898200 . HDL : 2262/89311 . PMID 15385547 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). «Статус, качество и расширение полноразмерного проекта кДНК NIH: коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Res . 14 (10b): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). «Последовательность сигнала и ловушка ключевых слов в Silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек кДНК с олиго» . ДНК Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743 .
Урни Дж, Германс-Боргмейер I, Шаллер Х.К. (2006). «Экспрессия клеточной поверхности нового варианта сплайсинга пептидазы мышиного пептидазы мыши». Биохим. Биофиз. Акт . 1759 (3–4): 159–65. doi : 10.1016/j.bbaexp.2006.02.007 . PMID 16730383 .
Loureiro J, Lilley BN, Spooner E, et al. (2006). «Сигнальная пептид -пептидаза необходима для дислокации из эндоплазматической ретикулумы». Природа . 441 (7095): 894–7. Bibcode : 2006natur.441..894L . doi : 10.1038/nature04830 . PMID 16738546 . S2CID 4346807 .
Sato T, Nyborg AC, Iwata N, et al. (2006). «Сигнальная пептид -пептидаза: биохимические свойства и модуляция с помощью нестероидных противовоспалительных препаратов». Биохимия . 45 (28): 8649–56. doi : 10.1021/bi060597g . PMID 16834339 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 20 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000101294 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000019188 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid12077416-5] Jump up to: ^а ^{беременный} Wehofen A, Binns K, Lemberg MK, Ashman K, Martoglio B (Jun 2002). «Идентификация сигнальной пептидазы пептидазы, аспартической протеазы типа пресенилина». Наука . 296 (5576): 2215–8. Bibcode : 2002sci ... 296.2215W . doi : 10.1126/science.1070925 . PMID 12077416 . S2CID 45633906 .

[pmid14704149-6] Nyborg AC, Kornilova AY, Jansen K, Ladd TB, Wolfe MS, Golde TE (апрель 2004 г.). «Сигнальная пептид-пептидаза образует гомодимер, который помечен активным сайтом, направленным ингибитором гамма-секретазы» . J Biol Chem . 279 (15): 15153–60. doi : 10.1074/jbc.m309305200 . PMID 14704149 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: HM13 Гистосовместимость (несовершеннолетняя) 13» .

[entrez2-8] «Ген Entrez: гистосовместимость H13 (несовершеннолетняя) 13» .

[pmid5340356-9] Snell GD, Cudkowicz G, Bunker HP (Jun 1967). «Гены гистосовместимости мышей. VII. H-13, новый локус гистосовместимости в пятой группе сцепления». Трансплантация . 5 (3): 492–503. doi : 10.1097/00007890-196705000-00011 . PMID 5340356 . S2CID 31345625 .

[pmid9354467-10] Mendoza LM, Paz P, Zuberi A, Christianson G, Roopenian D, Shastri N (октябрь 1997 г.). «Несовершеннолетние, удерживаемые майорами: локус небольшой гистосовместимости H13, определяемый как комплекс пептида/MHC класса I» . Иммунитет . 7 (4): 461–72. doi : 10.1016/s1074-7613 (00) 80368-4 . PMID 9354467 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]