Анализ молекулярной дисперсии
Анализ молекулярной дисперсии ( AMOVA ) является статистической моделью для молекулярного алгоритма у одного вида , обычно биологического . [ 1 ] Название и модель вдохновлены ANOVA . Метод был разработан Laurent Excoffier , Peter Smouse и Джозефом Куттро в Университете Рутгерса в 1992 году.
С момента разработки Amova Excoffier написал программу для проведения таких анализов. Эта программа, которая работает в Windows , называется Arlequin и свободно доступна на веб -сайте Excoffier. также есть реализации В языке R в пакетах ADE4 и PEGAS, которые доступны на CRAN (комплексная архивная сеть R). Другая реализация в области информации , которая также работает в Windows . Студенческая версия бесплатная и полностью функциональная. Нативным языком приложения является испанский, но английская версия также доступна.
Дополнительный бесплатный статистический пакет, Genalex, [ 2 ] предназначен для обучения, а также исследований и позволяет использовать сложный генетический анализ и сравниваться и сравниваться в широко используемом интерфейсе Microsoft Excel. Это программное обеспечение позволяет расчет анализа, таких как AMOVA, а также сравнение с другими типами тесно связанной статистики, включая F-статистику и индекс Шеннона, и многое другое.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Экскурсионный, L; Smouse, PE; Quattro, JM (Jun 1992). «Анализ молекулярной дисперсии, выведенный из метрических расстояний среди гаплотипов ДНК: применение к данным ограничения митохондриальной ДНК человека» (бесплатный полный текст) . Генетика . 131 (2): 479–91. doi : 10.1093/Genetics/131.2.479 . ISSN 0016-6731 . PMC 1205020 . PMID 1644282 .
- ^ Peakall, R. and Smouse PE (2012) Genalex 6.5: Генетический анализ в Excel. Популяционное генетическое программное обеспечение для обучения и обновления исследований. Биоинформатика 28, 2537–2539.
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта статья, связанная с статистикой, является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |