ФЦН1

ФЦН1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2D39, 2JHH, 2JHI, 2JHK, 2JHL, 2JHM, 2WNP
Идентификаторы
Псевдонимы	FCN1 , FCNM, фиколин 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 601252 ; МГИ : 1341158 ; Гомологен : 1518 ; Генные карты : FCN1 ; OMA : FCN1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 9 (human) Band 9q34.3 Start 134,903,232 bp End 134,917,912 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2|2 A3 Start 27,966,390 bp End 27,974,897 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in monocyte granulocyte trabecular bone bone marrow blood bone marrow cells buccal mucosa cell appendix spleen periodontal fiber Top expressed in granulocyte morula bone marrow body of femur lumbar subsegment of spinal cord cochlea vestibular membrane of cochlear duct spleen triceps brachii muscle submandibular gland More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function sialic acid binding protein binding G protein-coupled receptor binding metal ion binding carbohydrate binding pattern recognition receptor activity serine-type endopeptidase activity carbohydrate derivative binding Cellular component extracellular region plasma membrane collagen extrinsic component of external side of plasma membrane membrane secretory granule lumen ficolin-1-rich granule lumen collagen-containing extracellular matrix Biological process complement activation, lectin pathway complement activation G protein-coupled receptor signaling pathway recognition of apoptotic cell protein localization to cell surface cell surface pattern recognition receptor signaling pathway immune system process proteolysis innate immune response neutrophil degranulation Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 2219 14134 Вместе ENSG00000085265 ENSMUSG00000026835 ЮниПрот О00602 О70497 RefSeq (мРНК) НМ_002003 НМ_010190 RefSeq (белок) НП_001994 НП_034320 Местоположение (UCSC) Chr 9: 134,9 – 134,92 Мб Chr 2: 27,97 – 27,97 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Фиколин-1 , также часто называемый М-фиколином, представляет собой белок , который у человека кодируется FCN1 геном .

Белки семейства фиколинов состоят из лидерного пептида , короткого N-концевого сегмента , за которым следует коллагеноподобный домен, и С-концевого фибриногенподобного домена. Название фиколин произошло от двух последних доменов. Коллагеноподобный и фибриногенподобный домены также обнаружены в других белках, таких как тенасцины , тогда как первый также обнаружен в белке комплемента C1q и коллекционинах , которые включают маннозосвязывающий лектин и белки поверхностно-активных веществ легких . Фиколины избирательно распознают ацетилированные соединения . М-фиколин, кодируемый FCN1, преимущественно экспрессируется в лейкоцитах периферической крови и, как предполагается, функционирует как белок плазмы с эластинсвязывающей активностью. несколько SNP описано В гене FCN1 , влияющих на концентрацию М-фиколина в сыворотке и способность связывания лиганда . Уровни М-фиколина отражают активность заболевания и предсказывают ремиссию при раннем ревматоидном артрите.

Дальнейшее чтение

• Лу Дж, Ле Ю (1999). «Фиколины и фибриногенподобный домен». Иммунобиология . 199 (2): 190–9. дои : 10.1016/s0171-2985(98)80026-0 . ПМИД   9777405 .
• Ичиджо Х., Хеллман У., Вернстедт С. и др. (1993). «Молекулярное клонирование и характеристика фиколина, мультимерного белка с фибриноген- и коллагеноподобными доменами» . Ж. Биол. Хим . 268 (19): 14505–13. дои : 10.1016/S0021-9258(19)85267-5 . ПМИД   7686157 .
• Мацусита М., Эндо Ю., Тайра С. и др. (1996). «Новый сывороточный лектин человека с коллагеноподобными и фибриногенподобными доменами, который действует как опсонин» . Ж. Биол. Хим . 271 (5): 2448–54. дои : 10.1074/jbc.271.5.2448 . ПМИД   8576206 .
• Харумия С., Такеда К., Сугиура Т. и др. (1997). «Характеристика фиколинов как новых эластин-связывающих белков и молекулярное клонирование фиколина-1 человека». Дж. Биохим . 120 (4): 745–51. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021474 . ПМИД   8947836 .
• Ле Ю, Тан С.М., Ли Ш. и др. (1997). «Очистка и связывающие свойства фиколиноподобного белка человека». Дж. Иммунол. Методы . 204 (1): 43–9. дои : 10.1016/S0022-1759(97)00029-X . ПМИД   9202708 .
• Мацусита М., Эндо Ю., Фудзита Т. (2000). «Авангард: активирующий комплемент комплекс фиколина и маннозосвязывающей лектин-ассоциированной сериновой протеазы» . Дж. Иммунол . 164 (5): 2281–4. дои : 10.4049/jimmunol.164.5.2281 . ПМИД   10679061 .
• Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК   139241 . ПМИД   12477932 .
• Цзэн Л., Дай Дж., Ин К. и др. (2003). «Идентификация нового ангиопоэтиноподобного гена человека, экспрессируемого преимущественно в сердце» . Дж. Хум. Жене . 48 (3): 159–62. дои : 10.1007/s100380300025 . ПМИД   12624729 .
• Грегори Л.А., Тиленс Н.М., Мацусита М. и др. (2004). «Рентгеновская структура белка 19, связанного с маннан-связывающим лектином человека (MAp19), и сайт его взаимодействия с маннан-связывающим лектином и L-фиколином» . Ж. Биол. Хим . 279 (28): 29391–7. дои : 10.1074/jbc.M402687200 . ПМИД   15117939 .
• Чжан З, Хензель В.Дж. (2005). «Прогнозирование сигнальных пептидов на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления» . Белковая наука . 13 (10): 2819–24. дои : 10.1110/ps.04682504 . ПМК   2286551 . ПМИД   15340161 .
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК   528928 . ПМИД   15489334 .
• Фредериксен П.Д., Тиль С., Ларсен CB, Дженсениус Дж.К. (2006). «М-фиколин, молекула врожденной иммунной защиты, связывает ацетильные группы и активирует комплемент» . Скан. Дж. Иммунол . 62 (5): 462–73. дои : 10.1111/j.1365-3083.2005.01685.x . ПМИД   16305643 . S2CID   35639359 .
• Танио М., Кондо С., Сугио С., Коно Т. (2007). «Трехвалентная единица распознавания системы врожденного иммунитета: кристаллическая структура тримерного фибриногеноподобного домена М-фиколина человека» . Ж. Биол. Хим . 282 (6): 3889–95. дои : 10.1074/jbc.M608627200 . ПМИД   17148457 .

Артрит Ревматизм. Декабрь 2013 г.;65(12):3045-50. дои: 10.1002/арт.38179. Уровни М-фиколина отражают активность заболевания и предсказывают ремиссию при раннем ревматоидном артрите. Аммицбёлль CG1, Тиль С., Йенсениус Й.К., Эллингсен Т., Хорслев-Петерсен К., Хетланд М.Л., Юнкер П., Крог Н.С., Остергаард М., Стенгаард-Педерсен К.