USP20

USP20
Идентификаторы
Псевдонимы	USP20 , LSFR3A, VDU2, hVDU2, убиквитинспецифическая пептидаза 20
Внешние идентификаторы	Опустить : 615143 ; МГИ : 1921520 ; Гомологен : 4861 ; GeneCards : USP20 ; ОМА : USP20 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	129,881,828 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	30,913,598 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	granulocyte; ; anterior pituitary; ; right lobe of thyroid gland; ; right hemisphere of cerebellum; ; left lobe of thyroid gland; ; right frontal lobe; ; ascending aorta; ; gastric mucosa; ; muscle layer of sigmoid colon; ; Descending thoracic aorta;
	Top expressed in
	spermatid; ; lumbar spinal ganglion; ; spermatocyte; ; habenula; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; dorsomedial hypothalamic nucleus; ; subiculum; ; right kidney; ; paraventricular nucleus of hypothalamus; ; dorsal tegmental nucleus;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	cysteine-type peptidase activity; zinc ion binding; metal ion binding; peptidase activity; protein binding; thiol-dependent deubiquitinase; cysteine-type endopeptidase activity; hydrolase activity; G protein-coupled receptor binding;
Cellular component	cytoplasm; centrosome; microtubule organizing center; perinuclear region of cytoplasm; cytoskeleton; cytosol;
Biological process	endocytosis; protein K48-linked deubiquitination; ubiquitin-dependent protein catabolic process; regulation of G protein-coupled receptor signaling pathway; proteolysis; protein K63-linked deubiquitination; protein deubiquitination;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10868
	74270
	ENSG00000136878
	ENSMUSG00000026854
	Q9Y2K6
	Q8C6M1
	НМ_001008563 ; НМ_001110303 ; НМ_006676
	НМ_028846
	НП_001008563 ; НП_001103773 ; НП_006667
	НП_083122
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Убиквитинкарбоксил-концевая гидролаза 20 представляет собой фермент , который у человека кодируется USP20 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Убиквитин-специфическая протеаза 20 (USP20), также известная как убиквитин-связывающий белок 20 и взаимодействующий с белками VHL деубиквитинирующий фермент 2 (VDU2), представляет собой цистеиновой протеазы деубиквитинирующий фермент (DUB). Каталитический сайт USP20, как и других DUB, содержит консервативные остатки цистеина и гистидина , которые катализируют протеолиз изопептидной связи между остатком лизина целевого белка и остатком глицина молекулы убиквитина. ^{[ 7 ]} Известно, что USP20 деубиквитинирует ряд белков, включая тирониндейодиназу типа 2 (D2), индуцируемый гипоксией фактор 1α (HIF1α) и β2 _- адренергический рецептор (β2AR ₎ . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Ген

Ген USP20 расположен на хромосоме 9 в локусе 9q34.11. ^{[ 6 ]}^{[ 11 ]}

Структура

USP20 представляет собой белок, состоящий из 914 аминокислот, который демонстрирует 59% гомологию с другим DUB, USP33. ^{[ 12 ]} Он содержит 4 известных домена: N-концевой домен Zf UBP, каталитический домен, содержащий консервативные остатки гистидина и цистеина, и два C-концевых домена DUSP. ^{[ 13 ]}

Функция

DUB подразделяются на 5 основных групп: убиквитин-специфические протеазы (USP), убиквитин С-концевые гидролазы (UCH), протеазы опухолей яичников (OTU), протеазы болезни Мачадо-Джозефа (MJD) и протеазы JAB1/MPN/MOV34 (JAMM). /МПН+). Первые четыре группы представляют собой цистеиновые протеазы , тогда как последняя группа представляет собой Zn-металлопротеазы. USP20 принадлежит к группе USP и, как и большинство DUB, катализирует разрыв изопептидной связи между остатком лизина целевого белка и концевым глицина остатком белка убиквитина . Это происходит за счет консервативных остатков цистеина и гистидина в каталитическом сайте фермента. Молекула гистидина протонируется остатком цистеина, и это позволяет остатку цистеина подвергнуться нуклеофильной атаке на изопептидную связь, которая удаляет убиквитин из белка-субстрата. ^{[ 14 ]}

Тирониндейодиназа типа 2

USP20 деубиквитинирует тирониндейодиназу типа 2 (D2), фермент, который превращает тироксин (Т4) в активный 3,5,3'- трийодтиронин (Т3). D2 убиквитинируется после связывания Т4, что сигнализирует о деградации D2 через протеасому, а также вызывает инактивирующее конформационное изменение белка. Деубиквитинирование с помощью USP20 спасает D2 от деградации, а также возвращает D2 в его активную конформацию. ^{[ 8 ]}^{[ 15 ]}

Фактор 1α, индуцируемый гипоксией

Белок -супрессор опухоли фон Хиппель-Линдау (pVHL) убиквитинирует индуцируемый гипоксией фактор 1α (HIF1α), когда уровень кислорода в клетках нормальный. Это приводит к деградации HIF1α и предотвращает транскрипцию генов гипоксического ответа, таких как фактор роста эндотелия сосудов , фактор роста тромбоцитов B и эритропоэтин . USP20 деубиквитинирует HIF1α, предотвращая его протеасомную деградацию, и позволяет ему транскрибировать гены гипоксического ответа. ^{[ 16 ]}

β ₂ адренергический рецептор

USP20 участвует в рециркуляции β ₂ -адренергического рецептора. После стимуляции агонистом рецептор интернализуется и убиквитинируется. USP20 служит для деубиквитинирования рецептора и предотвращения его деградации протеасомой. Это позволяет ему повторно перерабатываться на поверхность клетки, чтобы повторно повысить чувствительность клетки к сигнальным молекулам. ^{[ 10 ]}

Регулирование

Помимо регуляции HIF1α, pVHL регулирует USP20. USP20 связывается с β-доменом pVHL и впоследствии убиквитинируется . Это сигнализирует USP20 о деградации через протеасому . ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000136878 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026854 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Пуэнте XS, Санчес Л.М., общий управляющий, Лопес-Отин С (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Обзоры природы. Генетика . 4 (7): 544–58. дои : 10.1038/nrg1111 . ПМИД 12838346 . S2CID 2856065 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: убиквитинспецифическая пептидаза 20 USP20» .
^ Командер Д., Клэг М.Дж., Урбе С. (август 2009 г.). «Разрыв цепей: структура и функция деубиквитиназ». Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 10 (8): 550–63. дои : 10.1038/nrm2731 . ПМИД 19626045 . S2CID 19149247 .
^ Jump up to: ^а ^б Курчо-Морелли С., Завацкий А.М., Кристофоллет М., Геребен Б., де Фрейтас Б.К., Харни Дж.В., Ли З., Ву Дж., Бьянко AC (июль 2003 г.). «Дубиквитинирование йодтирониндейодиназы 2 типа с помощью деубиквитинирующих ферментов фон Хиппеля-Линдау, взаимодействующих с белками, регулирует активацию гормона щитовидной железы» . Журнал клинических исследований . 112 (2): 189–96. дои : 10.1172/JCI18348 . ПМК 164294 . ПМИД 12865408 .
^ Ли З, Ван Д., Мессинг Э.М., Ву Джи (апрель 2005 г.). «Взаимодействующий с белком VHL деубиквитинирующий фермент 2 деубиквитинирует и стабилизирует HIF-1альфа» . Отчеты ЭМБО . 6 (4): 373–8. дои : 10.1038/sj.embor.7400377 . ПМК 1299287 . ПМИД 15776016 .
^ Jump up to: ^а ^б Бертуз М., Венкатараманан В., Ли Й., Шеной С.К. (июнь 2009 г.). «Дубиквитиназы USP33 и USP20 координируют рециркуляцию и ресенсибилизацию бета2-адренергических рецепторов» . Журнал ЭМБО . 28 (12): 1684–96. дои : 10.1038/emboj.2009.128 . ПМЦ 2699358 . ПМИД 19424180 .
^ «Генекарты» . Проверено 10 октября 2012 г.
^ Jump up to: ^а ^б Ли З, Ван Д., На Х, Шон С.Р., Мессинг Э.М., Ву Г (июнь 2002 г.). «Идентификация подсемейства деубиквитинирующих ферментов в качестве субстратов супрессора опухоли фон Хиппель-Линдау». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 294 (3): 700–9. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00534-X . ПМИД 12056827 .
^ де Йонг Р.Н., Аб Э., Диркс Т., Трюффо В., Дэниелс М., Каптейн Р., Фолкерс Г.Е. (февраль 2006 г.). «Структура раствора человеческого убиквитин-специфического домена DUSP протеазы 15» . Журнал биологической химии . 281 (8): 5026–31. дои : 10.1074/jbc.M510993200 . ПМИД 16298993 .
^ Ниджман С.М., Луна-Варгас, член парламента, Вельдс А., Бруммелькамп Т.Р., Дирак А.М., Сиксма Т.К., Бернардс Р. (декабрь 2005 г.). «Геномный и функциональный перечень деубиквитинирующих ферментов». Клетка . 123 (5): 773–86. дои : 10.1016/j.cell.2005.11.007 . hdl : 1874/20959 . ПМИД 16325574 . S2CID 15575576 .
^ Давиет Л., Колланд Ф. (февраль 2008 г.). «Нацеливание на убиквитин-специфические протеазы для открытия лекарств». Биохимия . 90 (2): 270–83. дои : 10.1016/j.biochi.2007.09.013 . ПМИД 17961905 .
^ Кондо К., Кэлин В.Г. (март 2001 г.). «Ген-супрессор опухоли фон Хиппель-Линдау». Экспериментальные исследования клеток . 264 (1): 117–25. дои : 10.1006/excr.2000.5139 . ПМИД 11237528 .

Дальнейшее чтение

Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (февраль 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют крупные белки in vitro» . Исследование ДНК . 6 (1): 63–70. дои : 10.1093/dnares/6.1.63 . ПМИД 10231032 .
Гилли Дж., Фрид М. (июль 1999 г.). «Обширные различия в порядке генов в областях консервативной синтении между геномами фугу и человека: последствия для хромосомной эволюции и клонирования генов болезней» . Молекулярная генетика человека . 8 (7): 1313–20. дои : 10.1093/hmg/8.7.1313 . ПМИД 10369878 .
Ли З, Ван Д., На Х, Шон С.Р., Мессинг Э.М., Ву Г (июнь 2002 г.). «Идентификация подсемейства деубиквитинирующих ферментов в качестве субстратов супрессора опухоли фон Хиппель-Линдау». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 294 (3): 700–9. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00534-X . ПМИД 12056827 .
Курчо-Морелли С., Завацкий А.М., Кристофоллет М., Геребен Б., де Фрейтас Б.К., Харни Дж.В., Ли З., Ву Дж., Бьянко AC (июль 2003 г.). «Дубиквитинирование йодтирониндейодиназы 2 типа с помощью деубиквитинирующих ферментов фон Хиппеля-Линдау, взаимодействующих с белками, регулирует активацию гормона щитовидной железы» . Журнал клинических исследований . 112 (2): 189–96. дои : 10.1172/JCI18348 . ПМК 164294 . ПМИД 12865408 .
Ли З, Ван Д., Мессинг Э.М., Ву Джи (апрель 2005 г.). «Взаимодействующий с белком VHL деубиквитинирующий фермент 2 деубиквитинирует и стабилизирует HIF-1альфа» . Отчеты ЭМБО . 6 (4): 373–8. дои : 10.1038/sj.embor.7400377 . ПМК 1299287 . ПМИД 15776016 .
Кимура К, Вакамацу А, Судзуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секине М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р., Канда К., Ёкой Т., Кондо Х., Вагацума М., Муракава К., Исида С., Исибаши Т., Такахаши-Фуджи А., Танасе Т., Нагай К., Кикучи Х., Накаи К., Исогай Т., Сугано С. (январь 2006 г.) «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65 . 10.1101 . ПМЦ 1356129 . гр.4039406 /
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000136878 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026854 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12838346-5] Пуэнте XS, Санчес Л.М., общий управляющий, Лопес-Отин С (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Обзоры природы. Генетика . 4 (7): 544–58. дои : 10.1038/nrg1111 . ПМИД 12838346 . S2CID 2856065 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: убиквитинспецифическая пептидаза 20 USP20» .

[pmid19626045-7] Командер Д., Клэг М.Дж., Урбе С. (август 2009 г.). «Разрыв цепей: структура и функция деубиквитиназ». Обзоры природы. Молекулярно-клеточная биология . 10 (8): 550–63. дои : 10.1038/nrm2731 . ПМИД 19626045 . S2CID 19149247 .

[pmid12865408-8] Jump up to: ^а ^б Курчо-Морелли С., Завацкий А.М., Кристофоллет М., Геребен Б., де Фрейтас Б.К., Харни Дж.В., Ли З., Ву Дж., Бьянко AC (июль 2003 г.). «Дубиквитинирование йодтирониндейодиназы 2 типа с помощью деубиквитинирующих ферментов фон Хиппеля-Линдау, взаимодействующих с белками, регулирует активацию гормона щитовидной железы» . Журнал клинических исследований . 112 (2): 189–96. дои : 10.1172/JCI18348 . ПМК 164294 . ПМИД 12865408 .

[pmid15776016-9] Ли З, Ван Д., Мессинг Э.М., Ву Джи (апрель 2005 г.). «Взаимодействующий с белком VHL деубиквитинирующий фермент 2 деубиквитинирует и стабилизирует HIF-1альфа» . Отчеты ЭМБО . 6 (4): 373–8. дои : 10.1038/sj.embor.7400377 . ПМК 1299287 . ПМИД 15776016 .

[pmid19424180-10] Jump up to: ^а ^б Бертуз М., Венкатараманан В., Ли Й., Шеной С.К. (июнь 2009 г.). «Дубиквитиназы USP33 и USP20 координируют рециркуляцию и ресенсибилизацию бета2-адренергических рецепторов» . Журнал ЭМБО . 28 (12): 1684–96. дои : 10.1038/emboj.2009.128 . ПМЦ 2699358 . ПМИД 19424180 .

[11] «Генекарты» . Проверено 10 октября 2012 г.

[pmid12056827-12] Jump up to: ^а ^б Ли З, Ван Д., На Х, Шон С.Р., Мессинг Э.М., Ву Г (июнь 2002 г.). «Идентификация подсемейства деубиквитинирующих ферментов в качестве субстратов супрессора опухоли фон Хиппель-Линдау». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 294 (3): 700–9. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00534-X . ПМИД 12056827 .

[pmid16298993-13] де Йонг Р.Н., Аб Э., Диркс Т., Трюффо В., Дэниелс М., Каптейн Р., Фолкерс Г.Е. (февраль 2006 г.). «Структура раствора человеческого убиквитин-специфического домена DUSP протеазы 15» . Журнал биологической химии . 281 (8): 5026–31. дои : 10.1074/jbc.M510993200 . ПМИД 16298993 .

[pmid16325574-14] Ниджман С.М., Луна-Варгас, член парламента, Вельдс А., Бруммелькамп Т.Р., Дирак А.М., Сиксма Т.К., Бернардс Р. (декабрь 2005 г.). «Геномный и функциональный перечень деубиквитинирующих ферментов». Клетка . 123 (5): 773–86. дои : 10.1016/j.cell.2005.11.007 . hdl : 1874/20959 . ПМИД 16325574 . S2CID 15575576 .

[pmid17961905-15] Давиет Л., Колланд Ф. (февраль 2008 г.). «Нацеливание на убиквитин-специфические протеазы для открытия лекарств». Биохимия . 90 (2): 270–83. дои : 10.1016/j.biochi.2007.09.013 . ПМИД 17961905 .

[pmid11237528-16] Кондо К., Кэлин В.Г. (март 2001 г.). «Ген-супрессор опухоли фон Хиппель-Линдау». Экспериментальные исследования клеток . 264 (1): 117–25. дои : 10.1006/excr.2000.5139 . ПМИД 11237528 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

Ген