АИФМ1

АИФМ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1M6I, 4BUR, 4BV6, 4FDC, 4LII, 5FS7, 5FS9, 5FS6, 5FS8
Идентификаторы
Псевдонимы	AIFM1 , AIF, CMT2D, CMTX4, COWCK, COXPD6, NADMR, NAMSD, PDCD8, DFNX5, фактор, индуцирующий апоптоз, связанный с митохондриями 1, фактор, индуцирующий апоптоз, связанный с митохондриями 1, AUNX1, SEMDHL
Внешние идентификаторы	Опустить : 300169 ; МГИ : 1349419 ; Гомологен : 3100 ; Генные карты : AIFM1 ; ОМА : AIFM1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	130,165,879 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	47,602,440 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	apex of heart; ; human kidney; ; left ventricle; ; right adrenal cortex; ; mucosa of transverse colon; ; right lobe of liver; ; right auricle; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; myocardium of left ventricle;
	Top expressed in
	Ileal epithelium; ; interventricular septum; ; cardiac muscle tissue of left ventricle; ; choroid plexus; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; Epithelium of choroid plexus; ; right kidney; ; human kidney; ; proximal tubule; ; soleus muscle;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	protein binding; protein dimerization activity; oxidoreductase activity; flavin adenine dinucleotide binding; NAD(P)H oxidase H2O2-forming activity; FAD binding; oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H; DNA binding;
Cellular component	mitochondrial inner membrane; cytoplasm; cytosol; membrane; perinuclear region of cytoplasm; mitochondrial intermembrane space; mitochondrion; nucleus;
Biological process	neuron apoptotic process; response to ischemia; chromosome condensation; cellular response to oxygen-glucose deprivation; activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; positive regulation of neuron apoptotic process; regulation of apoptotic DNA fragmentation; cellular response to hydrogen peroxide; intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress; positive regulation of apoptotic process; cellular response to nitric oxide; response to L-glutamate; positive regulation of cell death; mitochondrial respiratory chain complex I assembly; response to toxic substance; cellular response to estradiol stimulus; neuron differentiation; cellular response to aldosterone; apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	9131
	26926
	ENSG00000156709
	ENSMUSG00000036932
	О95831
	Q9Z0X1
	НМ_001130846 ; НМ_001130847 ; НМ_004208 ; НМ_145812 ; НМ_145813
	НМ_001290364 ; НМ_012019
	НП_001124318 ; НП_001124319 ; НП_004199 ; НП_665811
	НП_001277293 ; НП_036149
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Митохондриальный фактор 1, индуцирующий апоптоз, представляет собой белок , который у человека кодируется AIFM1 геном на Х-хромосоме. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Этот белок локализуется в митохондриях , а также в ядре , где он осуществляет фрагментацию ядра как часть каспазо -независимого апоптоза . ^{[ 7 ]}

Структура

AIFM1 экспрессируется как белок-предшественник из 613 остатков , содержащий митохондриальную последовательность (MTS) на своем N-конце и две ядерные ведущие последовательности (NLS). После импорта в митохондрии первые 54 остатка N-конца расщепляются с образованием зрелого белка, который встраивается во внутреннюю мембрану митохондрий . Зрелый белок включает в себя FAD кофактор и складывается в три структурных домена: FAD-связывающий домен, NAD-связывающий домен и C-концевой домен . В то время как C-конец отвечает за проапоптотическую активность AIFM1, домены FAD-связывания и NAD -связывания имеют классическую топологию Россмана с другими флавопротеинами и NAD(P)H-зависимую редуктазную активность. ^{[ 7 ]}

три альтернативных транскрипта, кодирующие разные изоформы . Для этого гена идентифицированы ^{[ 6 ]} Две альтернативно сплайсированные изоформы мРНК соответствуют включению/исключению С-концевого и редуктазного доменов. ^{[ 7 ]} Псевдоген, который, как полагают, связан с этим геном, был идентифицирован на хромосоме 10. ^{[ 6 ]}

Функция

Этот ген кодирует флавопротеин, необходимый для разборки ядра в апоптотических клетках, который обнаруживается в митохондриальном межмембранном пространстве здоровых клеток. Индукция апоптоза приводит к расщеплению этого белка по остатку 102 кальпаинами и/или катепсинами в растворимую и проапоптогенную форму, которая перемещается в ядро, где влияет на конденсацию и фрагментацию хромосом. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Кроме того, этот генный продукт индуцирует митохондрии высвобождение апоптогенных белков цитохрома с и каспазы-9. ^{[ 6 ]} AIFM1 также способствует активности редуктазы в окислительно-восстановительном метаболизме. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

Мутации в гене AIFM1 коррелируют с болезнью Шарко-Мари-Тута (синдромом Коучока) . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} На клеточном уровне мутации AIFM1 приводят к нарушению окислительного фосфорилирования , что приводит к тяжелой митохондриальной энцефаломиопатии. ^{[ 6 ]} Клинические проявления этой мутации характеризуются мышечной атрофией , нейропатией, атаксией , психомоторным регрессом, потерей слуха и судорогами. ^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Было показано, что AIFM1 взаимодействует с HSPA1A . ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Эволюция

Филогенетический анализ показывает, что расхождение последовательностей AIFM1 и других человеческих AIF (AIFM2a и AIFM3) произошло до расхождения эукариот. Этот вывод подтверждается доменной архитектурой этих белков. И эукариотические, и эубактериальные белки AIFM1 содержат дополнительный домен AIF_C. ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000156709 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036932 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Сусин С.А., Лоренцо Х.К., Замзами Н., Марзо И., Сноу Б.Е., Бразерс ГМ, Мангион Дж., Жакото Э., Константини П., Леффлер М., Ларошетт Н., Гудлетт Д.Р., Эберсолд Р., Сидеровски Д.П., Пеннингер Дж.М., Кремер Г. (февраль 1999 г.) ). «Молекулярная характеристика фактора, индуцирующего митохондриальный апоптоз». Природа . 397 (6718): 441–6. Бибкод : 1999Natur.397..441S . дои : 10.1038/17135 . ПМИД 9989411 . S2CID 204991081 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж «Ген Энтрез: фактор, индуцирующий апоптоз AIFM1, связанный с митохондриями, 1» .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Феррейра П., Вильянуэва Р., Мартинес-Хульвес М., Эргедас Б., Маркуэльо С., Фернандес-Сильва П., Кабон Л., Эрмосо Х.А., Лостао А., Сусин С.А., Медина М. (июль 2014 г.). «Структурные данные о кофермент-опосредованном переходе мономер-димер фактора, индуцирующего проапоптозный апоптоз». Биохимия . 53 (25): 4204–15. дои : 10.1021/bi500343r . ПМИД 24914854 .
^ Ринальди С, Грюнсейх С, Севрюкова И.Ф., Шиндлер А, Хоркейн-Сакали И, Ламперти С, Ландуре Г, Кеннерсон МЛ, Бернетт Б.Г., Беннеманн С, Бизекер Л.Г., Гецци Д., Зевиани М., Фишбек К.Х. (декабрь 2012 г.). «Синдром Ковчака связан с мутацией фактора, индуцирующего апоптоз» . Американский журнал генетики человека . 91 (6): 1095–102. дои : 10.1016/j.ajhg.2012.10.008 . ПМК 3516602 . ПМИД 23217327 .
^ Кеттвиг М., Шубах М., Циммерманн Ф.А., Клинге Л., Майр Дж.А., Бискап С., Сперл В., Гертнер Дж., Хуппке П. (март 2015 г.). «От вентрикуломегалии до тяжелой мышечной атрофии: расширение клинического спектра, связанного с мутациями в AIFM1». Митохондрия . 21 : 12–8. дои : 10.1016/j.mito.2015.01.001 . ПМИД 25583628 .
^ Ручальски К., Мао Х., Сингх С.К., Ван Й., Моссер Д.Д., Ли Ф., Шварц Дж.Х., Боркан С.К. (декабрь 2003 г.). «HSP72 ингибирует высвобождение факторов, индуцирующих апоптоз, в обедненных АТФ клетках почечного эпителия». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология . 285 (6): C1483–93. doi : 10.1152/ajpcell.00049.2003 . ПМИД 12930708 .
^ Равагнан Л., Гурбуксани С., Сусин С.А., Мейсс С., Даугас Е., Замзами Н., Мак Т., Яэттеля М., Пеннингер Дж.М., Гарридо С., Кремер Г. (сентябрь 2001 г.). «Белок теплового шока 70 противодействует фактору, индуцирующему апоптоз». Природная клеточная биология . 3 (9): 839–43. дои : 10.1038/ncb0901-839 . ПМИД 11533664 . S2CID 21164493 .
^ Клим Ю, Гладки А, Кухарчик Р, Зеленкевич Ю, Качановский С (май 2018 г.). «Реконструкция наследственного состояния механизма апоптоза у общего предка эукариот» . Г3 . 8 (6): 2121–2134. дои : 10.1534/g3.118.200295 . ПМЦ 5982838 . ПМИД 29703784 .

Дальнейшее чтение

Даугас Э., Ночи Д., Равагнан Л., Леффлер М., Сусин С.А., Замзами Н., Кремер Г. (июль 2000 г.). «Фактор, индуцирующий апоптоз (AIF): повсеместно встречающаяся митохондриальная оксидоредуктаза, участвующая в апоптозе». Письма ФЭБС . 476 (3): 118–23. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01731-2 . ПМИД 10913597 . S2CID 2156881 .
Ферри К.Ф., Жакото Э., Бланко Дж., Эсте Х.А., Кремер Г. (2001). «Митохондриальный контроль гибели клеток, индуцированной белками, кодируемыми ВИЧ-1». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 926 : 149–64. дои : 10.1111/j.1749-6632.2000.tb05609.x . ПМИД 11193032 . S2CID 21997163 .
Канде С., Коэн И., Даугас Э., Равагнан Л., Ларошетт Н., Замзами Н., Кремер Г. (2002). «Фактор, индуцирующий апоптоз (AIF): новый каспазо-независимый эффектор смерти, высвобождаемый из митохондрий». Биохимия . 84 (2–3): 215–22. дои : 10.1016/S0300-9084(02)01374-3 . ПМИД 12022952 .
Кастедо М., Перфеттини Дж.Л., Андрео К., Румье Т., Пьячентини М., Кремер Г. (декабрь 2003 г.). «Митохондриальный апоптоз, индуцированный оболочкой ВИЧ-1». Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1010 (1): 19–28. Бибкод : 2003NYASA1010...19C . дои : 10.1196/анналы.1299.004 . ПМИД 15033690 . S2CID 37073602 .
Мун Х.С., Ян Дж.С. (февраль 2006 г.). «Роль ВИЧ Vpr как регулятора апоптоза и эффектора на клетках-свидетелях» . Молекулы и клетки . 21 (1): 7–20. дои : 10.1016/s1016-8478(23)12897-4 . ПМИД 16511342 .
Стекло Л (октябрь 1975 г.). «Классификация биологических сетей по их качественной динамике». Журнал теоретической биологии . 54 (1): 85–107. Бибкод : 1975JThBi..54...85G . дои : 10.1016/S0022-5193(75)80056-7 . ПМИД 1202295 .
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В., Рикафренте Дж.Ю., Вентланд М.А., Леннон Дж., Гиббс Р.А. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
Сусин С.А., Замзами Н., Кастедо М., Даугас Э., Ван Х.Г., Гели С., Фасси Ф., Рид Дж.К., Кремер Г. (июль 1997 г.). «Главный исполнитель апоптоза: множественные связи между активацией протеаз и митохондриями в Fas/APO-1/CD95- и апоптозе, индуцированном церамидами» . Журнал экспериментальной медицины . 186 (1): 25–37. дои : 10.1084/jem.186.1.25 . ПМК 2198951 . ПМИД 9206994 .
Сусин С.А., Лоренцо Х.К., Замзами Н., Марч I, Бреннер С., Ларошетт Н., Превост М.С., Альзари П.М., Кремер Г. (январь 1999 г.). «Митохондриальное высвобождение каспаз-2 и -9 во время апоптотического процесса» . Журнал экспериментальной медицины . 189 (2): 381–94. дои : 10.1084/jem.189.2.381 . ПМК 2192979 . ПМИД 9892620 .
Даугас Э., Сусин С.А., Замзами Н., Ферри К.Ф., Иринопулу Т., Ларошетт Н., Превост М.С., Лебер Б., Эндрюс Д., Пеннингер Дж., Кремер Г. (апрель 2000 г.). «Митохондрио-ядерная транслокация АИФ при апоптозе и некрозе» . Журнал ФАСЭБ . 14 (5): 729–39. дои : 10.1096/phasebj.14.5.729 . ПМИД 10744629 . S2CID 7289409 .
Джоза Н., Сусин С.А., Даугас Е., Стэнфорд В.Л., Чо С.К., Ли С.И., Сасаки Т., Элиа А.Дж., Ченг ХИ, Равагнан Л., Ферри К.Ф., Замзами Н., Уэйкхэм А., Хакем Р., Йошида Х., Конг Ю.Й., Мак Т.В. , Суньига-Пфлюкер Дж. К., Кремер Г., Пеннингер Дж. М. (март 2001 г.). «Основная роль митохондриального фактора, индуцирующего апоптоз, в запрограммированной гибели клеток». Природа . 410 (6828): 549–54. Бибкод : 2001Natur.410..549J . дои : 10.1038/35069004 . ПМИД 11279485 . S2CID 4387964 .
Равагнан Л., Гурбуксани С., Сусин С.А., Мейсс С., Даугас Е., Замзами Н., Мак Т., Яэттеля М., Пеннингер Дж.М., Гарридо С., Кремер Г. (сентябрь 2001 г.). «Белок теплового шока 70 противодействует фактору, индуцирующему апоптоз». Природная клеточная биология . 3 (9): 839–43. дои : 10.1038/ncb0901-839 . ПМИД 11533664 . S2CID 21164493 .
Йе Х., Канде С., Стефану Н.К., Цзян С., Гурбуксани С., Ларошетт Н., Даугас Е., Гарридо С., Кремер Г., Ву Х (сентябрь 2002 г.). «Связывание ДНК необходимо для апоптогенного действия фактора, индуцирующего апоптоз». Структурная биология природы . 9 (9): 680–4. дои : 10.1038/nsb836 . ПМИД 12198487 . S2CID 7819466 .
Румье Т., Виейра Х.Л., Кастедо М., Ферри К.Ф., Вул П., Андрео К., Друилленнек С., Хоза Н., Пеннингер Дж.М., Рокес Б., Кремер Г. (ноябрь 2002 г.). «С-концевая часть Vpr ВИЧ-1 индуцирует гибель клеток посредством каспазо-независимого митохондриального пути» . Смерть клеток и дифференцировка . 9 (11): 1212–9. дои : 10.1038/sj.cdd.4401089 . ПМИД 12404120 .

Внешние ссылки

AIFM1 в Атласе генетики и онкологии
человека AIFM1 Расположение генома AIFM1 и страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000156709 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036932 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9989411-5] Сусин С.А., Лоренцо Х.К., Замзами Н., Марзо И., Сноу Б.Е., Бразерс ГМ, Мангион Дж., Жакото Э., Константини П., Леффлер М., Ларошетт Н., Гудлетт Д.Р., Эберсолд Р., Сидеровски Д.П., Пеннингер Дж.М., Кремер Г. (февраль 1999 г.) ). «Молекулярная характеристика фактора, индуцирующего митохондриальный апоптоз». Природа . 397 (6718): 441–6. Бибкод : 1999Natur.397..441S . дои : 10.1038/17135 . ПМИД 9989411 . S2CID 204991081 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж «Ген Энтрез: фактор, индуцирующий апоптоз AIFM1, связанный с митохондриями, 1» .

[pmid24914854-7] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Феррейра П., Вильянуэва Р., Мартинес-Хульвес М., Эргедас Б., Маркуэльо С., Фернандес-Сильва П., Кабон Л., Эрмосо Х.А., Лостао А., Сусин С.А., Медина М. (июль 2014 г.). «Структурные данные о кофермент-опосредованном переходе мономер-димер фактора, индуцирующего проапоптозный апоптоз». Биохимия . 53 (25): 4204–15. дои : 10.1021/bi500343r . ПМИД 24914854 .

[pmid23217327-8] Ринальди С, Грюнсейх С, Севрюкова И.Ф., Шиндлер А, Хоркейн-Сакали И, Ламперти С, Ландуре Г, Кеннерсон МЛ, Бернетт Б.Г., Беннеманн С, Бизекер Л.Г., Гецци Д., Зевиани М., Фишбек К.Х. (декабрь 2012 г.). «Синдром Ковчака связан с мутацией фактора, индуцирующего апоптоз» . Американский журнал генетики человека . 91 (6): 1095–102. дои : 10.1016/j.ajhg.2012.10.008 . ПМК 3516602 . ПМИД 23217327 .

[pmid25583628-9] Кеттвиг М., Шубах М., Циммерманн Ф.А., Клинге Л., Майр Дж.А., Бискап С., Сперл В., Гертнер Дж., Хуппке П. (март 2015 г.). «От вентрикуломегалии до тяжелой мышечной атрофии: расширение клинического спектра, связанного с мутациями в AIFM1». Митохондрия . 21 : 12–8. дои : 10.1016/j.mito.2015.01.001 . ПМИД 25583628 .

[pmid12930708-10] Ручальски К., Мао Х., Сингх С.К., Ван Й., Моссер Д.Д., Ли Ф., Шварц Дж.Х., Боркан С.К. (декабрь 2003 г.). «HSP72 ингибирует высвобождение факторов, индуцирующих апоптоз, в обедненных АТФ клетках почечного эпителия». Американский журнал физиологии. Клеточная физиология . 285 (6): C1483–93. doi : 10.1152/ajpcell.00049.2003 . ПМИД 12930708 .

[pmid11533664-11] Равагнан Л., Гурбуксани С., Сусин С.А., Мейсс С., Даугас Е., Замзами Н., Мак Т., Яэттеля М., Пеннингер Дж.М., Гарридо С., Кремер Г. (сентябрь 2001 г.). «Белок теплового шока 70 противодействует фактору, индуцирующему апоптоз». Природная клеточная биология . 3 (9): 839–43. дои : 10.1038/ncb0901-839 . ПМИД 11533664 . S2CID 21164493 .

[12] Клим Ю, Гладки А, Кухарчик Р, Зеленкевич Ю, Качановский С (май 2018 г.). «Реконструкция наследственного состояния механизма апоптоза у общего предка эукариот» . Г3 . 8 (6): 2121–2134. дои : 10.1534/g3.118.200295 . ПМЦ 5982838 . ПМИД 29703784 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]