РЕД1

РЕД1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2EBW, 2LSI, 2LSK, 2LSY, 3GQC, 3VU7, 4BA9, 4EXT, 4GK0, 4GK5, 2N1G
Идентификаторы
Псевдонимы	REV1 , REV1L, AIBP80, ДНК-направленная полимераза, ДНК-направленная полимераза REV1
Внешние идентификаторы	Опустить : 606134 ; МГИ : 1929074 ; Гомологен : 32309 ; Генные карты : REV1 ; OMA : REV1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	99,490,035 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	38,129,801 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; Achilles tendon; ; cerebellar hemisphere; ; right hemisphere of cerebellum; ; right uterine tube; ; ectocervix; ; gastric mucosa; ; body of uterus; ; skin of abdomen; ; left ovary;
	Top expressed in
	zygote; ; secondary oocyte; ; tail of embryo; ; superior cervical ganglion; ; Rostral migratory stream; ; spermatocyte; ; lobe of cerebellum; ; cerebellar vermis; ; primary oocyte; ; otic vesicle;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; damaged DNA binding; DNA binding; nucleotidyltransferase activity; protein binding; metal ion binding; deoxycytidyl transferase activity;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm;
Biological process	DNA replication; translesion synthesis; DNA biosynthetic process; response to UV; error-prone translesion synthesis; cellular response to DNA damage stimulus; DNA repair;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	51455
	56210
	ENSG00000135945
	ENSMUSG00000026082
	Q9UBZ9
	Q920Q2
showНМ_001037872 ; НМ_016316 ; НМ_001321454 ; НМ_001321455 ; НМ_001321458 ;
	NM_001321459; NM_001321460
	НМ_019570 ; НМ_001359287 ; НМ_001359288
showНП_001032961 ; НП_001308383 ; НП_001308384 ; НП_001308387 ; НП_001308388 ;
	NP_001308389; NP_057400
	НП_062516 ; НП_001346216 ; НП_001346217
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок репарации ДНК REV1 — это белок , который у человека кодируется REV1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Этот ген кодирует белок, сходный с S. cerevisiae белком мутагенеза Rev1. Белки Rev1 содержат домен BRCT , который важен для белок-белковых взаимодействий . Предполагаемая роль человеческого Rev1-подобного белка заключается в том, что он служит каркасом, который рекрутирует ДНК- полимеразы , участвующие в транслейкционном синтезе (TLS) поврежденной ДНК. Обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскриптов, кодирующих разные белки. ^{[ 6 ]}

Rev1 представляет собой ДНК-полимеразу семейства Y ; ее иногда называют дезоксицитидилтрансферазой, поскольку она вводит дезоксицитидин (dC) только напротив очагов поражения. Будь то G , A , T , C или абазисный сайт , Rev1 всегда будет добавлять C. Rev1 имеет возможность всегда добавлять C, поскольку он использует аргинин в качестве шаблона, который хорошо дополняет C. ^{[ 7 ]} И все же верят ^{[ кем? ]} что Rev1 редко использует свою полимеразную активность; скорее считается, что основная роль Rev1 заключается в том, что он служит посадочной площадкой для белков, посредством чего он помогает направлять рекрутирование белков TLS, особенно Pol ζ ( Rev3 /Rev7).

Взаимодействия

Было показано, что REV1 взаимодействует с MAD2L2 . ^{[ 8 ]} Считается, что Rev1 может взаимодействовать с PCNA, однажды убиквитилированным из-за повреждения, и помогать рекрутировать Pol ζ ( Rev3 /Rev7), полимеразу семейства B, участвующую в TLS.

См. также

РЕВ3Л

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135945 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026082 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Линь В., Синь Х., Чжан Ю., Ву Х., Юань Ф., Ван Цз. (декабрь 1999 г.). «Ген REV1 человека кодирует зависимую от матрицы ДНК трансферазу dCMP» . Нуклеиновые кислоты Рез . 27 (22): 4468–75. дои : 10.1093/нар/27.22.4468 . ПМК 148731 . ПМИД 10536157 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: гомолог REV1 REV1 (S. cerevisiae)» .
^ Наир, DT (30 сентября 2005 г.). «Rev1 использует новый механизм синтеза ДНК с использованием белковой матрицы». Наука . 309 (5744): 2219–22. Бибкод : 2005Sci...309.2219N . дои : 10.1126/science.1116336 . ПМИД 16195463 . S2CID 35378034 .
^ Муракумо, Ю; Огура Ю; Она Х; Нумата С; Итихара М; Кроче CM; Фишель Р; Такахаши М. (сентябрь 2001 г.). «Взаимодействие в подверженных ошибкам белках пострепликационной репарации hREV1, hREV3 и hREV7» . Ж. Биол. Химия 276 (38). США: 35644–51. дои : 10.1074/jbc.M102051200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11485998 .

Дальнейшее чтение

Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Викслер В., Лаплантин Э., Гертс Д. и др. (1999). «Идентификация новых партнеров по взаимодействию консервативной проксимальной области мембраны цитоплазматических доменов альфа-интегрина». ФЭБС Летт . 445 (2–3): 351–5. дои : 10.1016/S0014-5793(99)00151-9 . ПМИД 10094488 . S2CID 9218762 .
Гиббс П.Е., Ван XD, Ли З. и др. (2000). «Функция человеческого гомолога Saccharomyces cerevisiae REV1 необходима для мутагенеза, индуцированного УФ-светом» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (8): 4186–91. Бибкод : 2000PNAS...97.4186G . дои : 10.1073/pnas.97.8.4186 . ЧВК 18191 . ПМИД 10760286 .
Викслер В., Гертс Д., Лаплантин Е. и др. (2000). «Белок DRAL/FHL2, содержащий только LIM, связывается с цитоплазматическим доменом нескольких цепей альфа- и бета-интегрина и рекрутируется в адгезионные комплексы» . Ж. Биол. Хим . 275 (43): 33669–78. дои : 10.1074/jbc.M002519200 . ПМИД 10906324 .
Масуда Ю., Такахаши М., Цунэкуни Н. и др. (2001). «Дезоксицитидилтрансферазная активность человеческого белка REV1 тесно связана с консервативным полимеразным доменом» . Ж. Биол. Хим . 276 (18): 15051–8. дои : 10.1074/jbc.M008082200 . ПМИД 11278384 .
Муракумо Ю., Огура Ю., Исии Х. и др. (2001). «Взаимодействие в подверженных ошибкам белках пострепликационной репарации hREV1, hREV3 и hREV7» . Ж. Биол. Химия 276 (38): 35644–51. дои : 10.1074/jbc.M102051200 . ПМИД 11485998 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Масуда Ю., Омае М., Масуда К., Камия К. (2003). «Структура и ферментативные свойства стабильного комплекса белков REV1 и REV7 человека» . Ж. Биол. Хим . 278 (14): 12356–60. дои : 10.1074/jbc.M211765200 . ПМИД 12529368 .
Кларк Д.Р., Захариас В., Панайтеску Л., МакГрегор В.Г. (2004). «Опосредованное рибозимом ингибирование REV1 снижает частоту вызванных УФ-излучением мутаций в гене HPRT человека» . Нуклеиновые кислоты Рез . 31 (17): 4981–8. дои : 10.1093/нар/gkg725 . ПМК 212819 . ПМИД 12930947 .
Го С., Фишхабер П.Л., Лук-Пашиц М.Дж. и др. (2004). «Мышиный белок Rev1 взаимодействует с множеством ДНК-полимераз, участвующих в синтезе ДНК при трансфекции» . ЭМБО Дж . 22 (24): 6621–30. дои : 10.1093/emboj/cdg626 . ПМК 291821 . ПМИД 14657033 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Охаси Э., Муракумо Ю., Кандзё Н. и др. (2005). «Взаимодействие hREV1 с тремя ДНК-полимеразами Y-семейства человека». Генные клетки . 9 (6): 523–31. дои : 10.1111/j.1356-9597.2004.00747.x . ПМИД 15189446 . S2CID 24470762 .
Тиссье А., Каннуш П., Рек М.П. и др. (2005). «Совместная локализация в фокусах репликации и взаимодействие членов Y-семейства человека, ДНК-полимеразы поля и белка REVl». Восстановление ДНК (Амст.) . 3 (11): 1503–14. дои : 10.1016/j.dnarep.2004.06.015 . ПМИД 15380106 .
Хиллер Л.В., Грейвс Т.А., Фултон Р.С. и др. (2005). «Генерация и аннотация последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека» . Природа . 434 (7034): 724–31. Бибкод : 2005Natur.434..724H . дои : 10.1038/nature03466 . ПМИД 15815621 .
Лин X, Окуда Т., Транг Дж., Хауэлл С.Б. (2006). «Человеческий REV1 модулирует цитотоксичность и мутагенность цисплатина в клетках карциномы яичника человека». Мол. Фармакол . 69 (5): 1748–54. дои : 10.1124/моль.105.020446 . ПМИД 16495473 . S2CID 22316155 .
Масуда Ю, Камия К (2006). «Роль одноцепочечной ДНК в нацеливании REV1 на концы праймера» . Ж. Биол. Хим . 281 (34): 24314–21. дои : 10.1074/jbc.M602967200 . ПМИД 16803901 .
Юаса М.С., Масутани С., Хирано А. и др. (2006). «Эта-комплекс ДНК-полимеразы человека, содержащий Rad18, Rad6 и Rev1; протеомный анализ и нацеливание комплекса на связанную с хроматином фракцию клеток, подвергающихся остановке репликационной вилки». Генные клетки . 11 (7): 731–44. дои : 10.1111/j.1365-2443.2006.00974.x . ПМИД 16824193 . S2CID 32695133 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000135945 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026082 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10536157-5] Линь В., Синь Х., Чжан Ю., Ву Х., Юань Ф., Ван Цз. (декабрь 1999 г.). «Ген REV1 человека кодирует зависимую от матрицы ДНК трансферазу dCMP» . Нуклеиновые кислоты Рез . 27 (22): 4468–75. дои : 10.1093/нар/27.22.4468 . ПМК 148731 . ПМИД 10536157 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: гомолог REV1 REV1 (S. cerevisiae)» .

[7] Наир, DT (30 сентября 2005 г.). «Rev1 использует новый механизм синтеза ДНК с использованием белковой матрицы». Наука . 309 (5744): 2219–22. Бибкод : 2005Sci...309.2219N . дои : 10.1126/science.1116336 . ПМИД 16195463 . S2CID 35378034 .

[pmid11485998-8] Муракумо, Ю; Огура Ю; Она Х; Нумата С; Итихара М; Кроче CM; Фишель Р; Такахаши М. (сентябрь 2001 г.). «Взаимодействие в подверженных ошибкам белках пострепликационной репарации hREV1, hREV3 и hREV7» . Ж. Биол. Химия 276 (38). США: 35644–51. дои : 10.1074/jbc.M102051200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 11485998 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]