Поездка
| Поездка | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Клада : | Террабактерии |
| Филум: | Поездка Tamaki et al. 2021 [ 1 ] |
| Сорт | |
| Синонимы | |
| |
Armatimonadota -это тип грамотрицательных бактерий .
История
[ редактировать ]Арматимонадота первоначально описывалась исключительно на основе последовательностей клонов гена в окружающей среде 16S и была временно названа кандидатом Phylum Op10. Однако в 2011 году бактериальный штамм, принадлежащий к филому, был выделен из водного растения в Японии. Этот вид был назван Armatimonas Rosea и был первым членом его филома, рода и видов. [ 2 ]
Члены
[ редактировать ]Armatimonas Rosea , аэробная химитеротрофная бактерия, штамма Yo-36T, была выделена из ризоплана водного растения (тростника, Phragmites Australis ), населяющего пресноводное озеро в Японии. [ 2 ]
Chthonomonas calidirosea , аэробная, сахаролитическая , обязательно термофильная, подвижная, не сформирующаяся бактерия, штамм T49 (T), была выделена из геотермально нагретой почвы у Adl's Gate, Tikitere, Новая Зеландия. [ 3 ]
Филогения
[ редактировать ]| 16S RRNA на основе LTP _12_2021 [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] | GTDB 08-RS214 по базе данных таксономии генома [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Таксономия
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на списке прокариотических имен в номенклатуре (LPSN) [ 10 ] и Национальный центр информации о биотехнологии (NCBI). [ 11 ]
- Класс chthonomonadia corrig. Lee et al. 2011 год
- Порядок chthonomonadales Lee et al. 2011 год
- Семейство chthonomonadaceae Lee et al. 2011 год
- Класс Chthonomy Lee et al. 2011 год
- Виды chthonomos Caldirosea Lee et al. 2011 год
- Класс Chthonomy Lee et al. 2011 год
- Семейство chthonomonadaceae Lee et al. 2011 год
- Порядок chthonomonadales Lee et al. 2011 год
- Класс Fimbriimonadia im et al. 2012
- Заказ Fimbriimonadales im et al. 2012
- Семейство Fimbriimonadaceae im et al. 2012
- Класс Fimbriimonas Im et al. 2012
- Виды Fimbriimonas ginsengisoli IM et al. 2012
- Класс " Кандидат Nitrosymbiomonas " Okubo et al. 2021
- Виды " Ca. Nitrosymbiomonas Proteyticus " Okubo et al. 2021
- Класс Fimbriimonas Im et al. 2012
- Семейство Fimbriimonadaceae im et al. 2012
- Заказ Fimbriimonadales im et al. 2012
- Класс UBA5829
- Заказ UBA5829
- Семья UBA5829
- Род " Ca. Hippobium " Gilroy et al. 2022
- Виды " Ca. Hippobium faecium " Gilroy et al. 2022
- Род " Ca. Hippobium " Gilroy et al. 2022
- Семья UBA5829
- Заказ UBA5829
- Класс Armatimonadia Tamaki et al. 2011 год
- Заказ Арматераделл Бескованед Ал. 2011 год
- Семейство Armatimonadaceae Tamaki et al. 2011 год
- Класс Armatimminonas Tamaki et al. 2011 год
- тип Розовый розового тамаки и соавт. 2011 год
- Класс Armatimminonas Tamaki et al. 2011 год
- Семейство Armatimonadaceae Tamaki et al. 2011 год
- Заказ Capsulimonadales Li, Kudo & Tonouchi 2018
- Семейство Capsulimonadaceae Li, Kudo & Tonouchi 2018
- Род Capsulimonas Li, Kudo & Tonouchi 2018
- Виды Capsulimonas corticalis li, Kudo & tonouchi 2018
- Род Capsulimonas Li, Kudo & Tonouchi 2018
- Семейство Capsulimonadaceae Li, Kudo & Tonouchi 2018
- Заказ Арматераделл Бескованед Ал. 2011 год
Примечания
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Орен А, Гаррити Г.М. (2021). «Действительная публикация названий сорока двух фил прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987 .
- ^ Jump up to: а беременный Наверху, Хидюки; Танака, успех; Маттинава, Хироак; Написать, мизухо; Мэн, Сянь-Ий; Хананда, святая; Мори, Казухиро; Бодрствование, Юичи (2010). " -отрицательные щека . , Арм Международный 61 (Pt 6): 1442–7. doi : 10.1099/ ijs.025643-0 PMID 20622056 .
- ^ Ли, Кевин Сай; Данфилд, Питер Ф.; Morgan, Xochitl C.; Кроу, Мишель А.; Хоутон, Карен М.; Vyssotski, Mikhail; Райан, Джейсон Л.Дж.; Лагутин, Кирилл; и др. (2010). « Chthonomonas Calidirosea Gen. Nov., Sp. Nov., Аэробный, пигментированный, термофильный микроорганизм нового бактериального класса, chthonomonadetes classis. Nov., Из вновь описанного филома -арматимонадета, первоначально обозначенного кандидатского разделения Op10» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (Pt 10): 2482–90. doi : 10.1099/ijs.0.027235-0 . PMID 21097641 .
- ^ "LTP" . Получено 23 февраля 2021 года .
- ^ «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 23 февраля 2021 года .
- ^ «LTP_12_2021 Notes» (PDF) . Получено 23 февраля 2021 года .
- ^ "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ "BAC120_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ JP Euzéby. "Armatimonadetes" . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN). Архивировано из оригинала 2011-06-13 . Получено 2016-03-20 .
- ^ Sayers; и др. "Armatimonadetes" . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2016-03-20 .