АВО (ген)

ОНИ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1LZ0, 1LZ7, 1LZI, 1LZJ, 1R7T, 1R7U, 1R7V, 1R7X, 1R7Y, 1R80, 1R81, 1R82, 1WSZ, 1WT0, 1WT1, 1WT2, 1WT3, 1XZ6, 1ZHJ, 1ZI1, 1ZI3, 1ZI4, 1ZI5, 1ZIZ, 1ZJ0, 1ZJ1, 1ZJ2, 1ZJ3, 1ZJO, 1ZJP, 2A8U, 2A8W, 2I7B, 2O1F, 2O1G, 2O1H, 2PGV, 2RIT, 2RIX, 2RIY, 2RIZ, 2RJ0, 2RJ1, 2RJ4, 2RJ5, 2RJ6, 2RJ7, 2RJ8, 2RJ9, 2Y7A, 3I0C, 3I0D, 3I0E, 3I0F, 3I0G, 3I0H, 3I0I, 3I0J, 3I0K, 3I0L, 3IOH, 3IOI, 3IOJ, 3SX3, 3SX5, 3SX7, 3SX8, 3SXA, 3SXB, 3SXC, 3SXD, 3SXE, 3SXG, 3U0X, 3U0Y, 3V0L, 3V0M, 3V0N, 3V0O, 3V0P, 3V0Q, 3ZGF, 4C2S, 4KC1, 4KC2, 4KC4, 3ZGG, 4FQW, 4FRA, 4FRB, 4FRD, 4FRE, 4FRH, 4FRL, 4FRO, 4FRP, 4FRQ, 4GBP, 4KXO, 4Y62, 4Y63, 4Y64, 5BXC, 5C1G, 5C1H, 5C1L, 5C36, 5C38, 5C3A, 5C3B, 5C3D, 5C47, 5C48, 5C49, 5C4B, 5C4C, 5C4D, 5C4E, 5C4F, 5C8R, 5CMI, 2PGY
Идентификаторы
Псевдонимы	ABO , A3GALNT, A3GALT1, GTB, NAGAT, группа крови ABO (трансфераза А, альфа 1-3-N-ацетилгалактозаминилтрансфераза; трансфераза B, альфа 1-3-галактозилтрансфераза), альфа 1-3-N-ацетилгалактозаминилтрансфераза и альфа 1-3 -галактозилтрансфераза
Внешние идентификаторы	ОПУСТИТЬ : 110300 ; МГИ : 2135738 ; Гомологен : 69306 ; GeneCards : ABO ; ОМА : АВО – ортологи
Номер ЕС	2.4.1.37 2.4.1.40, 2.4.1.37
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	133,276,024 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	26,754,991 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	tendon of biceps brachii; ; buccal mucosa cell; ; right lobe of thyroid gland; ; right uterine tube; ; left lobe of thyroid gland; ; left ovary; ; rectum; ; right adrenal cortex; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex;
	Top expressed in
	submandibular gland; ; lacrimal gland; ; morula; ; parotid gland; ; spermatocyte; ; esophagus; ; blastocyst; ; embryo; ; seminal vesicula; ; transitional epithelium of urinary bladder;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; hexosyltransferase activity; metal ion binding; fucosylgalactoside 3-alpha-galactosyltransferase activity; glycoprotein-fucosylgalactoside alpha-N-acetylgalactosaminyltransferase activity; glycosyltransferase activity; nucleotide binding; antigen binding; manganese ion binding;
Cellular component	integral component of membrane; extracellular region; Golgi cisterna membrane; membrane; Golgi apparatus; vesicle;
Biological process	protein glycosylation; glycolipid biosynthetic process; lipid glycosylation; carbohydrate metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	28
	80908
	ENSG00000175164 ; ENSG00000281879
	ENSMUSG00000015787
	P16442
	P38649
	НМ_020469
	НМ_030718 ; НМ_001290444
	НП_065202
	НП_001277373 ; НП_109643
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Трансфераза гистогруппы крови системы АВО представляет собой фермент с гликозилтрансферазной активностью, который у человека кодируется АВО геном . ^[5]^[6] Он повсеместно экспрессируется во многих тканях и типах клеток. ^[7] АВО определяет группу крови АВО человека путем модификации олигосахаридов на гликопротеинах клеточной поверхности. Вариации в последовательности белка у разных людей определяют тип модификации и группу крови. Ген ABO также содержит один из 27 SNP , связанных с повышенным риском развития ишемической болезни сердца . ^[8]

Аллели

Ген АВО расположен на хромосоме 9 в участке 9q34.2 и содержит 7 экзонов . ^[6] Локус АВО кодирует три аллеля , то есть 3 варианта одного и того же гена. От каждого родителя происходит один аллель.

Аллель А продуцирует α-1,3-N-ацетилгалактозамин трансферазу (А-трансферазу), которая катализирует перенос остатков GalNAc от донорного нуклеотида UDP-GalNAc на остатки Gal акцепторного антигена H , превращая H-антиген в A. антиген у лиц A и AB.

Аллель B кодирует α-1,3-галактозилтрансферазу (B-трансферазу), которая катализирует перенос остатков Gal от донорного нуклеотида UDP -Gal на остатки Gal акцепторного антигена H, превращая антиген H в антиген B в Лица B и AB. Примечательно, что разница между ферментами гликозилтрансферазой А и В составляет всего четыре аминокислоты . ^[9]

Аллель O лишен обеих ферментативных активностей из-за сдвига рамки считывания, вызванного делецией гуанина-258 в гене, который соответствует участку вблизи N-конца белка. ^[10] Это приводит к сдвигу рамки считывания и, таким образом, к укороченному белку, состоящему всего из 117 аминокислот . ^[9]^[11] Укороченный белок не способен модифицировать олигосахариды , которые заканчиваются фукозой, связанной с галактозой . Таким образом, у индивидуумов O не обнаружено антигена A или B. Эта комбинация сахаров называется H-антигеном . Эти антигены играют важную роль при сочетанности переливания крови и трансплантации органов . ^[9] Для этого гена были обнаружены и другие минорные аллели. ^[6]

Общие аллели

есть шесть общих аллелей У лиц европейского происхождения почти каждого живого человека . Фенотип по гену АВО представляет собой комбинацию именно этих шести аллелей: ^[12]^[13]

А
- А101 (А1)
- А201 (А2)
Б
- Б101 (Б1)
ТО
- О01 (О1)
- О02 (О1в)
- О03 (О2)

Многие редкие варианты этих аллелей были обнаружены в человеческих популяциях по всему миру.

Клиническое значение

В клетках человека аллели АВО и кодируемые ими гликозилтрансферазы были описаны при нескольких онкологических заболеваниях. ^[14] С использованием моноклональных антител против GTA/GTB было продемонстрировано, что потеря этих ферментов коррелирует со злокачественным поражением мочевого пузыря и эпителия полости рта. ^[15]^[16] Более того, экспрессия антигенов группы крови АВО в нормальных тканях человека зависит от типа дифференцировки эпителия. В большинстве карцином человека, включая карциному полости рта, важным событием, лежащим в основе основного механизма, является снижение экспрессии антигенов А и В. ^[17] В нескольких исследованиях было обнаружено, что относительное снижение уровня GTA и GTB происходит при карциномах полости рта в связи с развитием опухоли. ^[17]^[18] Совсем недавно полногеномное ассоциативное исследование (GWAS) выявило варианты локуса ABO, связанные с предрасположенностью к раку поджелудочной железы . ^[19]^[20]

Клинический маркер

Многолокусное исследование оценки генетического риска, основанное на комбинации 27 локусов , включая ген ABO, выявило лиц с повышенным риском как возникновения, так и рецидивов ишемической болезни сердца, а также увеличило клиническую пользу от терапии статинами. Исследование было основано на групповом исследовании на уровне сообщества (исследование «Диета Мальмё и рак») и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22). ^[8]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000281879 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000175164, ENSG00000281879 — Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000015787 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фергюсон-Смит М.А., Эйткен Д.А., Терло С., де Груши Дж. (сентябрь 1976 г.). «Локализация человеческого АВО: Np-1: группа сцепления AK-1 путем регионального присвоения AK-1 к 9q34». Генетика человека . 34 (1): 35–43. дои : 10.1007/BF00284432 . ПМИД 184030 . S2CID 12384399 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: группа крови АВО АВО (трансфераза А, альфа 1-3-N-ацетилгалактозаминилтрансфераза; трансфераза В, альфа 1-3-галактозилтрансфераза)» .
^ «BioGPS – ваша генная портальная система» . biogps.org . Проверено 11 октября 2016 г.
^ Jump up to: ^а ^б Мега Дж.Л., Ститциел Н.О., Смит Дж.Г., Чесман Д.И., Колфилд М.Дж., Девлин Дж.Дж., Нордио Ф., Хайд КЛ., Кэннон КП, Сакс Ф.М., Поултер Н.Р., Север П.С., Ридкер П.М., Браунвальд Э., Меландер О, Катиресан С., Сабатин М.С. (июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза терапии статинами: анализ исследований первичной и вторичной профилактики» . Ланцет . 385 (9984): 2264–71. дои : 10.1016/S0140-6736(14)61730-X . ПМЦ 4608367 . ПМИД 25748612 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ямамото Ф., Клаузен Х., Уайт Т., Маркен Дж., Хакомори С. (май 1990 г.). «Молекулярно-генетические основы гистогрупповой системы АВО». Природа . 345 (6272): 229–33. Бибкод : 1990Natur.345..229Y . дои : 10.1038/345229a0 . ПМИД 2333095 . S2CID 4237562 .
^ Ивамото С, Кумада М, Камэсаки Т, Окуда Х, Кадзи Е, Инагаки Т, Сайкава Д, Такеучи К, Окавара С, Такахаши Р, Уэда С, Иноуэ С, Тахара К, Хакамата Ю, Кобаяши Э (ноябрь 2002 г.). «Крыса кодирует паралогичный ген, эквивалентный гену АВО гистогруппы крови человека. Ассоциация с экспрессией антигена за счет сверхэкспрессии трансферазы АВО человека» . Журнал биологической химии . 277 (48): 46463–9. дои : 10.1074/jbc.M206439200 . ПМИД 12237302 .
^ «ABO - Трансфераза системы ABO гистогруппы крови - Homo sapiens (Человек) - Ген и белок ABO» . www.uniprot.org . Проверено 6 декабря 2021 г.
^ Зельцам А., Халленслебен М., Коллманн А., Блащик Р. (октябрь 2003 г.). «Природа разнообразия и диверсификации в локусе АВО» . Кровь . 102 (8): 3035–42. дои : 10.1182/кровь-2003-03-0955 . ПМИД 12829588 .
^ Огасавара К., Баннаи М., Сайто Н., Ябэ Р., Наката К., Такенака М., Фудзисава К., Утикава М., Исикава Ю., Джуджи Т., Токунага К. (июнь 1996 г.). «Обширный полиморфизм гена группы крови АВО: три основные линии аллелей общих фенотипов АВО». Генетика человека . 97 (6): 777–83. дои : 10.1007/BF02346189 . ПМИД 8641696 . S2CID 12076999 .
^ Голдман М. (февраль 2007 г.). «Серия трансляционных мини-обзоров Toll-подобных рецепторов: лиганды Toll-подобных рецепторов как новые фармацевтические препараты для лечения аллергических заболеваний» . Клиническая и экспериментальная иммунология . 147 (2): 208–16. дои : 10.1111/j.1365-2249.2006.03296.x . ПМК 1810467 . ПМИД 17223960 .
^ Кей Х.Э. (ноябрь 1982 г.). «Трансплантация костного мозга: 1982 год» . Британский медицинский журнал . 285 (6351): 1296–8. дои : 10.1136/bmj.285.6351.1296 . ПМЦ 1500229 . ПМИД 6812684 .
^ Хакомори С. (декабрь 1999 г.). «Структура антигенов и генетическая основа гистогрупп крови А, В и О: их изменения, связанные с раком человека». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Общие предметы . 1473 (1): 247–66. дои : 10.1016/s0304-4165(99)00183-x . ПМИД 10580143 .
^ Jump up to: ^а ^б Дабельстин Э., Гао С. (январь 2005 г.). «Антигены группы крови АВО при раке полости рта». Журнал стоматологических исследований . 84 (1): 21–8. дои : 10.1177/154405910508400103 . ПМИД 15615870 . S2CID 16975373 .
^ Дабельстин Э. (февраль 2002 г.). «Антигены группы крови АВО в слизистой оболочке полости рта. Что нового?». Журнал патологии полости рта и медицины . 31 (2): 65–70. дои : 10.1046/j.0904-2512.2001.00004.x . ПМИД 11896825 .
^ Амундадоттир LT (01 января 2016 г.). «Генетика рака поджелудочной железы» . Международный журнал биологических наук . 12 (3): 314–25. дои : 10.7150/ijbs.15001 . ПМЦ 4753160 . ПМИД 26929738 .
^ Амундадоттир Л., Крафт П., Стольценберг-Соломон Р.З., Фукс К.С., Петерсен Г.М., Арслан А.А. и др. (сентябрь 2009 г.). «Полногеномное исследование ассоциации идентифицирует варианты локуса ABO, связанные с предрасположенностью к раку поджелудочной железы» . Природная генетика . 41 (9): 986–90. дои : 10.1038/ng.429 . ПМЦ 2839871 . ПМИД 19648918 .

Дальнейшее чтение

Нагай М., Даве В., Каплан Б.Е., Ёсида А. (январь 1978 г.). «Гликозилтрансферазы групп крови человека. I. Очистка н-ацетилгалактозаминилтрансферазы» . Журнал биологической химии . 253 (2): 377–9. дои : 10.1016/S0021-9258(17)38216-9 . ПМИД 618875 .
Такея А., Хосоми О., Симода Н., Ядзава С. (сентябрь 1992 г.). «Биосинтез антигена группы P, подобного GalNAc бета 1 -> 3Gal бета 1 -> 4GlcNAc/структура Glc: новая N-ацетилгалактозаминилтрансфераза в плазме крови человека». Журнал биохимии . 112 (3): 389–95. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123910 . ПМИД 1429528 .
Коминато Ю., Макнил П.Д., Ямамото М., Рассел М., Хакомори С., Ямамото Ф. (ноябрь 1992 г.). «Гистогены группы крови животных АВО». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 189 (1): 154–64. дои : 10.1016/0006-291X(92)91538-2 . ПМИД 1449469 .
Ямамото Ф., Макнил П.Д., Хакомори С. (август 1992 г.). «Человеческая трансфераза гистогруппы крови А2, кодируемая аллелем А2, одним из подтипов А, характеризуется делецией одного основания в кодирующей последовательности, что приводит к образованию дополнительного домена на карбоксильном конце». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 187 (1): 366–74. дои : 10.1016/S0006-291X(05)81502-5 . ПМИД 1520322 .
Клаузен Х., Уайт Т., Такио К., Титани К., Страуд М., Холмс Э., Карков Дж., Тим Л., Хакомори С. (январь 1990 г.). «Выделение до гомогенности и частичная характеристика гистогруппы крови А, определенной Fuc альфа 1----2Gal альфа-1----3-N-ацетилгалактозаминилтрансферазы из легочной ткани человека» . Журнал биологической химии . 265 (2): 1139–45. дои : 10.1016/S0021-9258(19)40169-5 . ПМИД 2104827 .
Ямамото Ф., Маркен Дж., Цудзи Т., Уайт Т., Клаузен Х., Хакомори С. (январь 1990 г.). «Клонирование и характеристика ДНК, комплементарной человеческой UDP-GalNAc: мРНК Fuc альфа 1 ---- 2Gal альфа 1 ---- 3GalNAc трансферазы (гистотрансфераза группы крови А)» . Журнал биологической химии . 265 (2): 1146–51. дои : 10.1016/S0021-9258(19)40170-1 . ПМИД 2104828 .
Ямамото Ф., Хакомори С. (ноябрь 1990 г.). «Донорная специфичность сахаронуклеотидных трансфераз гистогруппы крови А и В основана на аминокислотных заменах» . Журнал биологической химии . 265 (31): 19257–62. дои : 10.1016/S0021-9258(17)30652-X . ПМИД 2121736 .
Уайтхед Дж. С., Белла С., Ким Ю. С. (июнь 1974 г.). «N-ацетилгалактозаминилтрансфераза из плазмы крови человека А. II. Кинетические и физико-химические свойства» . Журнал биологической химии . 249 (11): 3448–52. дои : 10.1016/S0021-9258(19)42593-3 . ПМИД 4831223 .
Уайтхед Дж. С., Белла А., Ким Ю. С. (июнь 1974 г.). «N-ацетилгалактозаминилтрансфераза из плазмы крови человека группы А. I. Очистка и свойства связывания агарозы» . Журнал биологической химии . 249 (11): 442–7. дои : 10.1016/S0021-9258(19)42592-1 . ПМИД 4831233 .
Кобата А, Гинзбург В (март 1970 г.). «Уридиндифосфат-N-ацетил-D-галактозамин: D-галактозо-альфа-3-N-ацетил-D-галактозаминилтрансфераза, продукт гена, определяющего группу крови А у человека» . Журнал биологической химии . 245 (6): 1484–90. дои : 10.1016/S0021-9258(18)63261-2 . ПМИД 5442829 .
Ёсида А., Ямагути Х., Окубо Ю. (май 1980 г.). «Генетический механизм наследования цис-АТ. I. Случай, связанный с неравным хромосомным кроссинговером» . Американский журнал генетики человека . 32 (3): 332–8. ПМК 1686052 . ПМИД 6770676 .
Олссон М.Л., Турессон Б., Честер М.А. (ноябрь 1995 г.). «Вставка аллель-специфического нуклеотида Ael в локус ABO группы крови и ее обнаружение с помощью специфичной для последовательности полимеразной цепной реакции». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 216 (2): 642–7. дои : 10.1006/bbrc.1995.2670 . ПМИД 7488159 .
Беннетт Э.П., Стеффенсен Р., Клаузен Х., Вегуис Д.О., ван Кессель А.Г. (январь 1995 г.). «Геномное клонирование локуса гистогруппы крови человека АВО». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 206 (1): 318–25. дои : 10.1006/bbrc.1995.1044 . HDL : 2066/22100 . ПМИД 7598760 . S2CID 39351683 .
Ямамото Ф., Макнил П.Д., Хакомори С. (февраль 1995 г.). «Геномная организация генов АВО гистогруппы крови человека». Гликобиология . 5 (1): 51–8. дои : 10.1093/гликоб/5.1.51 . ПМИД 7772867 .
Беннетт Э.П., Стеффенсен Р., Клаузен Х., Вегуис Д.О., Гертс ван Кессель А. (июнь 1995 г.). «Геномное клонирование локуса гистогруппы крови человека АВО». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 211 (1): 347. doi : 10.1006/bbrc.1995.1817 . HDL : 2066/22100 . ПМИД 7779106 .
Ямамото Ф., Макнил П.Д., Коминато Ю., Ямамото М., Хакомори С., Ишимото С., Нисида С., Сима М., Фудзимура Ю. (1993). «Молекулярно-генетический анализ системы групп крови АВО: 2. аллели цис-АВ». Вокс Сангвинис . 64 (2): 120–3. дои : 10.1111/j.1423-0410.1993.tb02529.x . ПМИД 8456556 . S2CID 23119465 .
Ямамото Ф., Макнил П.Д., Ямамото М., Хакомори С., Харрис Т. (1993). «Молекулярно-генетический анализ системы групп крови АВО: 3. Аллели А(Х) и В(А)». Вокс Сангвинис . 64 (3): 171–4. дои : 10.1111/j.1423-0410.1993.tb05157.x . hdl : 2027.42/71979 . ПМИД 8484250 . S2CID 43662514 .
Огасавара К., Ябэ Р., Утикава М., Сайто Н., Баннаи М., Наката К., Такенака М., Фудзисава К., Исикава Ю., Джуджи Т., Токунага К. (октябрь 1996 г.). «Молекулярно-генетический анализ вариантов фенотипов системы групп крови АВО» . Кровь 88 (7): 2732–7. doi : 10.1182/blood.V88.7.2732.bloodjournal8872732 . ПМИД 8839869 .