Фармакометаболомика
Фармакометаболомика , также известная как фармакетабономика , представляет собой область, основанную на метаболомике , количественном определении и анализе метаболитов , вырабатываемых организмом. [1] [2] Это относится к прямому измерению метаболитов в жидкостях организма человека с целью прогнозирования или оценки метаболизма фармацевтических соединений , а также для лучшего понимания фармакокинетического профиля лекарственного средства. [1] [2] Альтернативно, фармакометаболомика может применяться для измерения уровней метаболитов после введения фармацевтического соединения, чтобы контролировать влияние соединения на определенные метаболические пути (фармакодинамику). Это обеспечивает детальное картирование воздействия лекарств на метаболизм и пути, участвующие в механизме изменения ответа на лечение. [3] [4] [5] [6] [7] Кроме того, метаболический профиль человека на исходном уровне (метаботип) предоставляет информацию о том, как люди реагируют на лечение, и подчеркивает гетерогенность болезненного состояния. [8] Все три подхода требуют количественного определения метаболитов, обнаруженных в жидкостях и тканях организма , таких как кровь или моча, и могут использоваться при оценке вариантов фармацевтического лечения многочисленных болезненных состояний.
Цели фармакометаболомики
[ редактировать ]Считается, что фармакометаболомика предоставляет информацию, которая дополняет информацию, полученную из других омиков , а именно геномики , транскриптомики и протеомики . Глядя на характеристики человека на всех уровнях детализации, можно сделать более точный прогноз способности человека реагировать на фармацевтическое соединение. Геном лекарств ; , состоящий из 25 000 генов может указывать на возможные ошибки в метаболизме , транскриптом активно , состоящий из 85 000 транскриптов, может предоставить информацию о том, какие гены, важные для метаболизма, транскрибируются; а протеом , >10 000 000 членов, показывает, какие белки активны в организме для выполнения этих функций. Фармакометаболомика дополняет омику прямым измерением продуктов всех этих реакций, но, возможно, с относительно меньшим числом участников: первоначально предполагалось, что оно составит примерно 2200 метаболитов . [9] но их число может быть больше, если к списку добавить метаболиты, полученные из кишечника, и ксенобиотики. В целом, цель фармакетаболомики состоит в том, чтобы более точно спрогнозировать или оценить реакцию человека на фармацевтическое соединение, позволяя продолжить лечение правильным препаратом или дозировкой в зависимости от изменений в его метаболизме и способности реагировать на лечение. [1] [2] [10]
Фармакометаболомический анализ с использованием метаболомного подхода может предоставить комплексный и подробный метаболический профиль или « метаболический отпечаток пальца » для отдельного пациента. Такие метаболические профили могут дать полный обзор изменений отдельных метаболитов или путей, обеспечивая более реалистичное изображение заболеваний фенотипов . Этот подход затем может быть применен для прогнозирования ответа на фармацевтическое соединение у пациентов с определенным метаболическим профилем. [2] [10] Фармакометаболомический анализ реакции на лекарственное средство часто сочетается или сопровождается фармакогенетическим исследованием. Фармакогенетика фокусируется на выявлении генетических вариаций (например, однонуклеотидных полиморфизмов ) у пациентов, которые могут способствовать изменению реакции на лекарства и общему результату определенного лечения. Результаты фармакометаболомического анализа могут «информировать» или «направлять» фармакогенетический анализ путем корреляции аберрантных концентраций метаболитов или метаболических путей с потенциальными изменениями на генетическом уровне. [11] Эта концепция была основана на двух плодотворных публикациях, посвященных исследованиям антидепрессантов, ингибиторов обратного захвата серотонина. [11] [12] где метаболические сигнатуры смогли определить путь, участвующий в ответе на антидепрессант, и это привело к идентификации генетических вариантов в ключевом гене выделенного пути как участвующих в вариациях ответа. Эти генетические варианты не были идентифицированы только с помощью генетического анализа и, следовательно, продемонстрировали, как метаболомика может направлять и информировать генетические данные.
История
[ редактировать ]Хотя применение фармакетаболомики в персонализированной медицине человека в основном реализуется только сейчас, изучение метаболизма использовалось для лечения заболеваний со времен Средневековья. Ранние врачи использовали примитивную форму метаболомного анализа, нюхая, пробуя и глядя на мочу, чтобы диагностировать заболевание. Очевидно, что методы измерения, необходимые для изучения конкретных метаболитов , в то время были недоступны, но за последнее десятилетие такие технологии значительно развились, позволив разработать точные устройства с высокой производительностью , а также сопутствующее программное обеспечение для анализа данных для анализа результатов. В настоящее время процессы очистки проб, такие как жидкостная или газовая хроматография , сочетаются с аналитическими методами на основе масс-спектрометрии (МС) или ядерного магнитного резонанса (ЯМР) для характеристики профилей метаболитов отдельных пациентов. [1] Постоянно совершенствующиеся информационные инструменты позволяют идентифицировать, количественно оценивать и классифицировать метаболиты , чтобы определить, какие пути могут влиять на определенные фармацевтические вмешательства. [1] Одно из самых ранних исследований, обсуждающих принцип и применение фармакетаболомики, было проведено на животных моделях целью изучения метаболизма парацетамола с и повреждения печени. ЯМР-спектроскопию использовали для анализа метаболических профилей мочи крыс до и после лечения парацетамолом . Анализ выявил определенный метаболический профиль, связанный с увеличением повреждения печени после лечения парацетамолом . [13] На тот момент с нетерпением ожидалось, что такие подходы фармакометаболомики могут быть применены к персонализированной человека медицине . С момента этой публикации в 2006 году Сеть исследований по фармакометаболомике, возглавляемая исследователями из Университета Дьюка и включавшая партнерские отношения между центрами передового опыта в области метаболомики, фармакогеномики и информатики (более шестнадцати академических центров, финансируемых NIGMS), впервые смогла проиллюстрировать силу фармакометаболомический подход при информировании о результатах лечения в крупных клинических исследованиях и при использовании препаратов, включающих антидепрессанты, статины, антигипертензивные средства, антиагреганты и нейролептики. [3] [4] [5] [6] [7] [8] [14] [15] [16] [17] [18] [19] [20] [21] [22] [23] [24] [25] [26] [27] [28] [29] [30] [31] [32] [33] [34] [35] В результате этих исследований возникли совершенно новые концепции использования фармакометаболомики как инструмента, который может привести к изменению парадигмы в области фармакологии. Он проиллюстрировал, как фармакометаболомика может способствовать использованию количественного и системного фармакологического подхода. [2] Фармакометаболомика применяется для лечения многочисленных заболеваний человека, таких как шизофрения , диабет , нервные заболевания , депрессия и рак . [1]
Персонализированная медицина
[ редактировать ]Поскольку анализ метаболитов проводится на уровне отдельного пациента, фармакометаболомику можно рассматривать как форму персонализированной медицины . Эта область в настоящее время используется для прогнозирования для определения потенциальных реакций терапевтических соединений у отдельных пациентов, что позволяет разрабатывать более индивидуальные схемы лечения. Ожидается, что такие подходы фармакометаболомики приведут к улучшению способности прогнозировать реакцию человека на соединение, его эффективность и метаболизм, а также неблагоприятные или нецелевые эффекты, которые могут иметь место в организме. Метаболизм некоторых лекарств варьируется от пациента к пациенту, поскольку число копий генов , кодирующих общие , метаболизирующие лекарства, ферменты варьируется в пределах популяции и приводит к различиям в способности человека метаболизировать различные соединения. [36] Другие важные личные факторы, влияющие на метаболический профиль человека, такие как состояние питания пациента, комменсальные бактерии , возраст и ранее существовавшие заболевания, также отражаются при оценке метаболитов . [5] [13] В целом, фармакетаболомный анализ в сочетании с такими подходами, как фармакогенетика , может использоваться для выявления метаболических процессов и конкретных генетических изменений, которые могут поставить под угрозу ожидаемую эффективность лекарства у конкретного пациента. Результаты таких анализов могут затем позволить изменить схемы лечения для достижения оптимального результата. [11] [12] [37]
Текущие приложения
[ редактировать ]Прогнозирование результата лечения
[ редактировать ]Метаботип информирует о результатах лечения
[ редактировать ]Фармакометаболомика может использоваться для прогнозирования, чтобы определить правильный курс действий в отношении пациента, которому предстоит пройти тот или иной тип медикаментозного лечения. Это включает в себя определение метаболического профиля пациента до начала лечения и корреляцию метаболических показателей с результатами курса фармацевтического лечения. Анализ метаболического профиля пациента может выявить факторы, которые могут способствовать изменению метаболизма лекарств , что позволяет прогнозировать общую эффективность предлагаемого лечения, а также потенциальные риски токсичности лекарств , которые могут отличаться от рисков для населения в целом. Этот подход использовался для идентификации новых или ранее охарактеризованных метаболических биомаркеров у пациентов, которые можно использовать для прогнозирования ожидаемого результата у этого пациента после лечения фармацевтическим соединением . [1] [37] Одним из примеров клинического применения фармакетаболомики являются исследования, направленные на выявление прогностического метаболического маркера для лечения большого депрессивного расстройства (БДР) . [3] [8] [11] [12] [14] В исследовании антидепрессанта сертралина Сеть фармакометаболомики продемонстрировала, что исходный метаболический профиль пациентов с большой депрессией может дать информацию о результатах лечения. [8] Кроме того, исследование проиллюстрировало возможности метаболомики для определения реакции на плацебо и сравнило реакцию на плацебо с реакцией на сертралин и показало, что несколько путей были общими для обоих. [8] В другом исследовании с эсциталопрамом и циталопрамом метаболомный анализ плазмы пациентов с БДР показал, что изменения в метаболизме глицина отрицательно связаны с исходом лечения пациентов при лечении селективными ингибиторами обратного захвата серотонина (СИОЗС) , важным классом препаратов, участвующих в лечении этого заболевания. [11] [12]
Мониторинг связанных с приемом лекарств изменений в метаболических путях
[ редактировать ]Вторым важным применением фармакетаболомики является анализ метаболического профиля пациента после назначения специфической терапии. Этот процесс часто является вторичным по отношению к метаболическому анализу перед лечением, позволяющему сравнить концентрации метаболитов до и после лечения . Это позволяет идентифицировать метаболические процессы и пути, которые изменяются в результате лечения либо намеренно как назначенная мишень соединения, либо непреднамеренно как побочный эффект . Кроме того, также можно определить концентрацию и разнообразие метаболитов, образующихся из самого соединения, что дает информацию о скорости метаболизма и потенциально приводит к разработке родственного соединения с повышенной эффективностью или уменьшенными побочными эффектами . Пример этого подхода был использован для изучения влияния нескольких антипсихотических препаратов на липидный обмен у пациентов, лечившихся от шизофрении . [20] Было высказано предположение, что эти антипсихотические препараты могут изменять липидный обмен у пациентов с шизофренией , способствуя увеличению веса и гипертриглицеридемии . В ходе исследования осуществлялся мониторинг липидных метаболитов у пациентов как до, так и после лечения антипсихотиками . Затем скомпилированные профили до и после лечения сравнивались для изучения влияния этих соединений на липидный обмен . Исследователи обнаружили корреляцию между лечением антипсихотическими препаратами и липидов метаболизмом как в зависимости от класса липидов, так и в зависимости от препарата. [20] создание новых основ вокруг концепции, согласно которой фармакетаболомика предоставляет мощные инструменты для детального картирования эффектов лекарств. Дополнительные исследования, проведенные Сетью исследований фармакометаболомики, позволили составить карты способами, которые были невозможны до воздействия статинов. [4] [5] [6] [17] атенолол [18] и аспирин. [7] [19] Были получены совершенно новые сведения о влиянии этих препаратов на метаболизм, а также выявлены пути, участвующие в реакции и побочных эффектах.
Количественное определение и анализ метаболитов
[ редактировать ]Для идентификации и количественного определения метаболитов, вырабатываемых организмом, использовались различные методы обнаружения. Чаще всего они включают использование спектроскопии ядерного магнитного резонанса (ЯМР) или масс-спектрометрии (МС) , обеспечивающих универсальное обнаружение, идентификацию и количественное определение метаболитов в отдельных пробах пациентов. Хотя оба процесса используются в фармакетаболомном анализе, существуют преимущества и недостатки использования платформ на основе спектроскопии ядерного магнитного резонанса (ЯМР) или масс-спектрометрии (МС) в этом приложении.
Спектроскопия ядерного магнитного резонанса
[ редактировать ]ЯМР-спектроскопия используется для анализа биологических образцов с 1980-х годов и может использоваться как эффективный метод идентификации и количественного определения как известных, так и неизвестных метаболитов. Подробности о принципах этого метода см. в ЯМР-спектроскопии . При фармакетаболомическом анализе ЯМР предпочтителен, поскольку требуется минимальная подготовка проб. Изолированные образцы пациентов обычно включают кровь или мочу из-за их минимально инвазивного сбора, однако с помощью этого подхода также изучались другие типы жидкостей и образцы твердых тканей. [38] Благодаря минимальной подготовке образцов перед анализом, образцы потенциально могут быть полностью восстановлены после ЯМР- анализа (если образцы хранятся в холодильнике во избежание разложения). Это позволяет многократно анализировать образцы с чрезвычайно высоким уровнем воспроизводимости, а также сохранять ценные образцы пациентов для альтернативного анализа. Высокая воспроизводимость и точность ЯМР в сочетании с относительно быстрым временем обработки (более 100 образцов в день) делают этот процесс относительно высокопроизводительной формой анализа образцов. Одним из недостатков этого метода является относительно низкая чувствительность обнаружения метаболитов по сравнению с анализом на основе МС, что приводит к необходимости большего исходного объема образца. [38] чрезвычайно высоки . Кроме того, первоначальные затраты на оборудование как для ЯМР , так и для МС [1]
Масс-спектрометрия
[ редактировать ]Альтернативным подходом к идентификации и количественной оценке образцов пациентов является использование масс-спектрометрии. Этот подход обеспечивает превосходную точность и чувствительность при идентификации, характеристике и количественном определении метаболитов в различных типах проб пациентов, таких как кровь и моча. Подход масс -спектрометрии (МС) обычно сочетается с газовой хроматографией (ГХ) в ГХ-МС или жидкостной хроматографией (ЖХ) в ЖХ-МС , что помогает первоначально разделить компоненты метаболитов в сложных смесях образцов и может позволить для выделения определенных подмножеств метаболитов для анализа. ГХ-МС может обеспечить относительно точную количественную оценку метаболитов, а также информацию о химической структуре, которую можно сравнить с уже существующими химическими библиотеками. [1] ГХ-МС может проводиться с относительно высокой производительностью (более 100 образцов в день) с большей чувствительностью обнаружения, чем анализ ЯМР . Однако ограничением ГХ-МС для этого применения является то, что обработанные метаболитные компоненты должны легко улетучиваться для обработки проб.
ЖХ-МС сначала разделяет компоненты смеси проб на основе таких свойств, как гидрофобность, а затем обрабатывает их для идентификации и количественного определения с помощью масс-спектрометрии (МС) . В целом, ЖХ-МС представляет собой чрезвычайно гибкий метод обработки большинства типов соединений с довольно высокой производительностью (20–100 образцов в день), а также с большей чувствительностью, чем ЯМР анализ . Как для ГХ-МС , так и для ЖХ-МС существуют ограничения в воспроизводимости количественного определения метаболитов. [1] Кроме того, обработка проб для последующего масс-спектрометрического (МС) анализа гораздо более интенсивна, чем при использовании ЯМР , и приводит к разрушению исходного образца (посредством расщепления трипсином ). [1]
После идентификации и количественного определения метаболитов в образцах отдельных пациентов результаты ЯМР и масс-спектрометрии (МС) объединяются в набор данных. Эти наборы данных включают информацию об идентичности и уровнях отдельных метаболитов, обнаруженных в обработанных образцах, а также о характеристиках каждого метаболита в процессе обнаружения (например, отношения массы к заряду для анализа на основе масс-спектрометрии (МС) ). Можно создать несколько наборов данных и объединить их в большие базы данных для отдельных пациентов, чтобы отслеживать различные метаболические профили в течение курса лечения (т. е. профили до и после лечения). Затем каждая база данных обрабатывается с помощью информационной платформы с программным обеспечением, предназначенным для характеристики и анализа данных для создания общего метаболического профиля пациента. Для создания этого общего профиля вычислительные программы предназначены для:
- выявить признаки метаболических заболеваний [1]
- оценить класс лечения (до или после лечения) [1]
- выявить соединения, присутствующие в образце пациента, которые могут изменить реакцию на лекарство или быть вызваны терапией [1]
- определить метаболитные переменные и взаимодействия между этими переменными [1]
- сопоставить идентифицированные переменные с известными метаболическими и биохимическими путями [1]
Ограничения
[ редактировать ]Наряду с новыми диагностическими возможностями фармакетаболомики существуют ограничения, возникающие при рассмотрении индивидуальной вариабельности. Возможность определения физиологического состояния человека путем измерения метаболитов не оспаривается, но крайняя вариабельность, которую могут вносить возраст, питание и комменсальные организмы, предполагает проблемы при создании обобщенных фармакетаболомов для групп пациентов. [39] Однако до тех пор, пока можно выявить значимые метаболические характеристики для создания исходных значений, все еще существуют возможные средства сравнения. [10]
Проблемы, связанные с измерением метаболитов у человека, также могут возникнуть из-за методологии обнаружения метаболитов, и существуют аргументы как за, так и против ЯМР и масс-спектрометрии (МС) . Другие ограничения, связанные с анализом метаболитов, включают необходимость надлежащего обращения и обработки образцов, а также надлежащего обслуживания и калибровки аналитического и вычислительного оборудования. Эти задачи требуют квалифицированных и опытных технических специалистов, а потенциальные затраты на ремонт приборов из-за непрерывной обработки проб могут оказаться дорогостоящими. Стоимость самих платформ обработки и анализа очень высока, что затрудняет для многих учреждений возможность проведения анализа лечения на основе фармакетаболомики.
Последствия для здравоохранения
[ редактировать ]Фармакометаболомика может снизить нагрузку на систему здравоохранения за счет более точного определения правильного выбора лекарственного препарата и его дозировки, чтобы оптимизировать реакцию пациента на лечение. Будем надеяться, что этот подход также в конечном итоге ограничит количество побочных реакций на лекарства (НЛР), связанных со многими схемами лечения. [37] В целом, врачи смогут лучше применять более персонализированные и потенциально более эффективные методы лечения для своих пациентов. Однако важно учитывать, что обработка и анализ проб пациентов требуют времени, что приводит к задержке лечения. Еще одна проблема, связанная с применением фармакометаболомического анализа для индивидуального ухода за пациентами, связана с решением, кто должен, а кто не должен получать этот углубленный, персонализированный протокол лечения. Определенные заболевания и стадии заболевания должны быть классифицированы в соответствии с требованиями такого плана лечения, но критериев для этой классификации не существует. Более того, не все больницы и лечебные учреждения могут позволить себе оборудование для обработки и анализа проб пациентов на месте, но отправка проб требует времени и в конечном итоге задерживает лечение. Покрытие таких процедур медицинским страхованием также может быть проблемой. Некоторые страховые компании могут дискриминировать применение этого типа анализа образцов и характеристики метаболитов. Кроме того, необходимо будет ввести правила, гарантирующие, что страховые компании не будут дискриминировать метаболические профили отдельных пациентов («высокие метаболизаторы» против рискованных «низких метаболизаторов»).
См. также
[ редактировать ]- Фармакогенетика
- Фармакогеномика
- Персональная геномика
- Разработка лекарств
- Метаболизм
- Персонализированная медицина
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п Каддура-Даук, Р.; Кристал, Б; Вайншильбоум, РМ (2008). «Метаболомика: глобальный биохимический подход к реакции на лекарства и болезням». Ежегодный обзор фармакологии и токсикологии . 48 : 653–683. doi : 10.1146/annurev.pharmtox.48.113006.094715 . ПМИД 18184107 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Каддура-Даук, Р.; Вайншильбоум, РМ (2014). «Фармакометаболомика: значение для клинической фармакологии и системной фармакологии». Клиническая фармакология и терапия . 95 (2): 154–167. дои : 10.1038/clpt.2013.217 . ПМИД 24193171 . S2CID 22649568 .
- ^ Перейти обратно: а б с Каддура-Даук, Р.; Юань, П; Бойл, Ш.; Мэтсон, В; Ван, З; Цзэн, З; Чжу, Х; Догерти, Дж.Г.; Яо, Дж. К.; Чен, Г; Гитарт, X; Карлсон, П.Дж.; Ноймайстер, А; Сарате, К; Кришнан, Р.Р.; Манджи, Гонконг; Древец, В (2012). «Метаболом спинномозговой жидкости при расстройствах настроения» . Научные отчеты . 2 : 667. дои : 10.1038/srep00667 . ПМЦ 3446657 . ПМИД 22993692 .
- ^ Перейти обратно: а б с Каддура-Даук, Р.; Бэйли Р.А.; Чжу Х; Цзэн ЗБ; Вест ММ; Нгуен, Юта; Уоткинс С.М.; Краусс Р.М. (2010). «Липидомический анализ вариаций реакции на симвастатин в исследовании холестерина и фармакогенетики» . Метаболомика . 6 (2): 191–201. дои : 10.1007/s11306-010-0207-x . ПМЦ 2862962 . ПМИД 20445760 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Каддура-Даук, Р.; Бэйли Р.А.; Чжу Х; Цзэн ЗБ; Вест ММ; Нгуен, Юта; Войнунский К; Уоткинс С.М.; Трупп М; Краусс Р.М. (2011). «Кишечный микробиом коррелирует с реакцией на лечение симвастатином» . ПЛОС ОДИН . 6 (10): e25482. дои : 10.1371/journal.pone.0025482 . ПМК 3192752 . ПМИД 22022402 .
- ^ Перейти обратно: а б с Трупп, М; Чжу Х; Викофф В.Р.; Бэйли Р.А.; Цзэн ЗБ; Карп П.Д.; Фин О; Краусс Р.М.; Каддура-Даук Р. (2012). «Метаболомика показывает, что аминокислоты способствуют вариациям реакции на лечение симвастатином» . ПЛОС ОДИН . 7 (7): e38386. дои : 10.1371/journal.pone.0038386 . ПМЦ 3392268 . ПМИД 22808006 .
- ^ Перейти обратно: а б с Йергес-Армстронг, LM; Эллеро-Симатос С; Георгиадес А; Чжу Х; Льюис Дж. П.; Горенштейн РБ; Бейтельшиес А.Л.; датчанин А; Реймерс Т; Ханкемайер Т; Фин О; Шульдинер А.Р.; Каддура-Даук Р. (2013). «Пуриновый путь, вовлеченный в механизм устойчивости к терапии аспирином: фармакогеномика, основанная на данных фармакометаболомики» . Клиническая фармакология и терапия . 94 (4): 525–532. дои : 10.1038/clpt.2013.119 . ПМК 4001726 . ПМИД 23839601 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Каддура-Даук, Р.; Бойл С.Х.; Мэтсон В; Шарма С; Мэтсон С; Чжу Х; Богданов М.Б.; Черчилль Э; Кришнан Р.Р.; Раш Эй Джей; Пикеринг Э; Дельномдедье М (2011). «Метаботип перед лечением как предиктор ответа на сертралин или плацебо у амбулаторных пациентов с депрессией: доказательство концепции» . Трансляционная психиатрия . 1 (7): e26–. дои : 10.1038/tp.2011.22 . ПМК 3232004 . ПМИД 22162828 .
- ^ Вайс, Р.Х.; Ким, К. (2012). «Метаболомика в изучении заболеваний почек». Обзоры природы Нефрология . 8 (1): 22–33. дои : 10.1038/nrneph.2011.152 . ПМИД 22025087 . S2CID 23576016 .
- ^ Перейти обратно: а б с Баральди, Э; Карраро, С; Джордано, Дж; Реньеро, Ф; Перилонго, Г; Закчелло, Ф (2009). «Метаболомика: движение к персонализированной медицине» . Итальянский журнал педиатрии . 35 (30): 30. дои : 10.1186/1824-7288-35-30 . ПМЦ 2773773 . ПМИД 19852788 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Або, Р; Хеббринг, С; Цзи, Юань; и др. (2012). «Объединение фармакетаболомики с фармакогеномикой с использованием вменения однонуклеотидного полиморфизма« 1000 геномов »: фармакогеномика реакции селективного ингибитора обратного захвата серотонина» . Фармакогенетика и геномика . 22 (4): 247–53. дои : 10.1097/FPC.0b013e32835001c9 . ПМК 3303952 . ПМИД 22322242 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Джи, Ю; Хеббринг, С; Чжу, Х; Дженкинс, Джорджия; Бернака, Дж; Снайдер, К; Дрюс, М; Фин, О; Цзэн, З; Шайд, Д; Мразек, Д.А.; Каддура-Даук, Р.; Вайншильбоум, РМ (2011). «Глицин и SNP глициндегидрогеназы (GLDC) как биомаркеры ответа на циталопрам / эсциталопрам при депрессии: фармакогеномика, основанная на фармакетаболомике» . Клиническая фармакология и терапия . 89 (1): 97–104. дои : 10.1038/clpt.2010.250 . ПМК 3034442 . ПМИД 21107318 .
- ^ Перейти обратно: а б Клейтон, А; Линдон, Джей Си; Клоарек, О; и др. (2006). «Фармако-метабономическое фенотипирование и персонализированная медикаментозная терапия» . Природа . 440 (7087): 1073–1077. дои : 10.1038/nature04648 . ПМИД 16625200 . S2CID 4424842 .
- ^ Перейти обратно: а б Вентилятор, ТВМ; Юань П; Переулок АН; Хигаси Р.М.; Ван Ю; Хамиди АБ; Чжоу Р; Гитарт З; Чен Г; Манджи Х.К.; Каддура-Даук Р. (2010). «Метаболомический анализ влияния лития на глиально-нейрональный метаболизм и взаимодействия с разрешением стабильных изотопов» . Метаболомика . 6 (2): 165–179. дои : 10.1007/s11306-010-0208-9 . ПМК 2903070 . ПМИД 20631920 .
- ^ Каддура-Даук, Р.; Богданов М.Б.; Викофф В.Р.; Чжу Х; Бойл С.Х.; Черчилль Э; Ван З; Раш Эй Джей; Кришнан Р.Р.; Пикеринг Э; Дельномдедье М; Фин О (2013). «Фармакометаболомическое картирование ранних биохимических изменений, вызванных сертралином и плацебо» . Трансляционная психиатрия . 3 (1): е223. дои : 10.1038/tp.2012.142 . ПМЦ 3566722 . ПМИД 23340506 .
- ^ Чжу, Х; Богданов М.Б.; Бойл С.Х.; Мэтсон В; Шарма С; Мэтсон С; Черчилль Э; Фин О; Раш Дж.А.; Кришнан Р.Р.; Пикеринг Э; Дельномдедье М; Каддура-Даук Р.; Сетевой пиар (2013). «Фармакометаболомика ответа на сертралин и плацебо при большом депрессивном расстройстве - возможная роль метоксииндольного пути» . ПЛОС ОДИН . 8 (7): e68283. дои : 10.1371/journal.pone.0068283 . ПМЦ 3714282 . ПМИД 23874572 .
- ^ Перейти обратно: а б Краусс, Р; Чжу Х; Каддура-Даук Р. (2013). «Фармакометаболомика ответа на статин» . Клиническая фармакология и терапия . 94 (5): 562–5. дои : 10.1038/clpt.2013.164 . ПМК 4055080 . ПМИД 23945822 .
- ^ Перейти обратно: а б Викофф, WR; Фрай, РФ; Чжу, Х; Бойл, С; Черчилль, Э; Гонг, Ю; Купер-Дехо, РМ; Бейтельшис, Алабама; Лейн, А; Чепмен, AB; Тернер, ST; Фин, О; Джонсон, Дж.А.; Каддура-Даук, Р. (2013). «Фармакометаболомика выявляет расовые различия в реакции на лечение атенололом» . ПЛОС ОДИН . 8 (3): e57639. дои : 10.1371/journal.pone.0057639 . ПМЦ 3594230 . ПМИД 23536766 .
- ^ Перейти обратно: а б Льюис, JP; Йергес-Армстронг LM; Эллеро-Симатос С; Георгиадес А; Каддура-Даук Р.; Ханкемайер Т (2013). «Интеграция фармакометаболомических и фармакогеномных подходов открывает новые возможности антиагрегантной терапии» . Клиническая фармакология и терапия . 94 (5): 570–573. дои : 10.1038/clpt.2013.153 . ПМК 4116100 . ПМИД 23892404 .
- ^ Перейти обратно: а б с Каддура-Даук, Р.; МакЭвой, Дж; Бэйли, РА; и др. (2007). «Метаболомическое картирование атипичных антипсихотических эффектов при шизофрении» . Молекулярная психиатрия . 12 (10): 934–45. дои : 10.1038/sj.mp.4002000 . ПМИД 17440431 .
- ^ Яо, Дж. К.; Догерти Дж.Г.; Редди Р.Д.; Мэтсон В.Р.; Каддура-Даук Р.; Кешаван М.С. (2013). «Связь между пуриновыми метаболитами и моноаминовыми нейротрансмиттерами при первом эпизоде психоза» . Границы клеточной нейронауки . 7 (90): 90. дои : 10.3389/fncel.2013.00090 . ПМЦ 3678099 . ПМИД 23781173 .
- ^ Перруд, Б; Паймаан Дж.Н.; Гатчел-младший; Ван Л; Барупал Д.К.; Креспо-Баррето Х; Фин О; Зогби Х.И.; Каддура-Даук Р. (2013). «Фармакометаболомическая подпись мышиной модели атаксии SCA1 и эффекты лития» . ПЛОС ОДИН . 8 (8): е70610. дои : 10.1371/journal.pone.0070610 . ПМЦ 3732229 . ПМИД 23936457 .
- ^ Яо, Дж. К.; Догерти, Дж.Г.; Редди, РД; Кешаван, М.С.; Монтроуз, DM; Мэтсон, WR; Розен, С; Кришнан, Р.Р.; МакЭвой, Дж; Каддура-Даук, Р. (2009). «Измененные взаимодействия метаболитов триптофана у пациентов с шизофренией, ранее не принимавших нейролептики» . Молекулярная психиатрия . 15 (9): 938–953. дои : 10.1038/mp.2009.33 . ПМЦ 2953575 . ПМИД 19401681 .
- ^ Паткар, А.А.; Розен С; Маннелли П; Мэтсон В; Паэ КУ; Кришнан Р.Р.; Каддура-Даук Р. (2009). «Изменения в метаболизме триптофана и пурина при кокаиновой зависимости: метаболомическое исследование». Психофармакология . 206 (3): 479–489. дои : 10.1007/s00213-009-1625-1 . ПМИД 19649617 . S2CID 27979116 .
- ^ Маннелли, П; Паткар А; Розен С; Мэтсон В.Р.; Кришнан Р; Каддура-Даук Р. (2009). «Употребление опиоидов влияет на антиоксидантную активность и пуриновый обмен: предварительные результаты» . Психофармакология человека . 24 (8): 666–675. дои : 10.1002/hup.1068 . ПМЦ 3183957 . ПМИД 19760630 .
- ^ Стеффенс, округ Колумбия; Цзян В; Кришнан КР; Кароли ЭД; Митчелл М.В.; О'Коннор CM; Каддура-Даук Р. (2010). «Метаболомические различия у пациентов с сердечной недостаточностью с большой депрессией и без нее» . Журнал гериатрической психиатрии и неврологии . 23 (2): 138–146. дои : 10.1177/0891988709358592 . ПМЦ 3279728 . ПМИД 20101071 .
- ^ Яо, Дж. К.; Догерти, Дж.Г. младший; Редди, РД; Кешаван, М.С.; Монтроуз, DM; Мэтсон, WR; МакЭвой, Дж; Каддура-Даук, Р. (2010). «Гомеостатический дисбаланс катаболизма пуринов у пациентов с шизофренией, ранее не принимавших нейролептики» . ПЛОС ОДИН . 5 (3): е9508. дои : 10.1371/journal.pone.0009508 . ПМК 2831068 . ПМИД 20209081 .
- ^ Кондрей, Р; Догерти Дж.Г.; Кешаван М.С.; Редди Р.Д.; Хаас ГЛ; Монтроуз ДМ; Мэтсон В.Р.; МакЭвой Дж.; Каддура-Даук Р.; Яо Дж. К. (2011). «3-Гидроксикинуренин и клинические симптомы у пациентов с шизофренией, ранее не принимавших нейролептики» . Международный журнал нейропсихофармакологии . 14 (6): 756–767. дои : 10.1017/S1461145710001689 . ПМК 3117924 . ПМИД 21275080 .
- ^ Каддура-Даук, Р.; Розен С; Мэтсон В; Хан Х; Хьюлетт СМ; Берк-младший; Дорайсвами Премьер-министр; Уэлш-Бомер К.А. (2011). «Метаболомические изменения при подтвержденной аутопсией болезни Альцгеймера» . Болезнь Альцгеймера и деменция . 7 (3): 309–317. дои : 10.1016/j.jalz.2010.06.001 . ПМК 3061205 . ПМИД 21075060 .
- ^ Хан, Х; Розен С; Бойл С.Х.; Хеллегерс С; Ченг Х; Берк-младший; Уэлш-Бомер К.А.; Дорайсвами Премьер-министр; Каддура-Даук Р. (2011). «Метаболомика при ранней болезни Альцгеймера: идентификация измененного сфинголипидома плазмы с помощью липидомики дробовика» . ПЛОС ОДИН . 6 (7): e21643. дои : 10.1371/journal.pone.0021643 . ПМК 3136924 . ПМИД 21779331 .
- ^ Каддура-Даук, Р.; МакЭвой Дж.; Бэйли Р; Чжу Х; Яо Дж; Нимгаонкар В.Л.; Бакли П.Ф.; Кешаван М.С.; Георгиадес А; Насралла ХА (2012). «Нарушение плазмалогенов у больных шизофренией». Психиатрические исследования . 198 (3): 347–52. doi : 10.1016/j.psychres.2012.02.019 . ПМИД 22513041 . S2CID 22582689 .
- ^ Яо Дж.К.; Кондрей Р; Догерти Дж.Г. младший; Кешаван М.С.; Монтроуз ДМ; Мэтсон В.Р.; МакЭвой Дж.; Каддура-Даук Р.; Редди Р.Д. (2012). «Связь между пуриновыми метаболитами и клиническими симптомами шизофрении» . ПЛОС ОДИН . 7 (8): е42165. дои : 10.1371/journal.pone.0042165 . ПМЦ 3419238 . ПМИД 22916123 .
- ^ Каддура-Даук, Р.; Чжу, Х; Шарма, С; Богданов М; Розен, С.Г.; Мэтсон, В; Оки, НЕТ; Моцингер-Рейф, А.А.; Черчилль, Э; Лей, З; Эпплби, Д; Клинг, Массачусетс; Трояновский, JQ; Дорайсвами, премьер-министр; Арнольд, SE; Сеть исследований фармакометаболомики (2013). «Изменения в метаболических путях и сетях при легких когнитивных нарушениях и ранней стадии болезни Альцгеймера» . Трансляционная психиатрия . 3 (4): е244. дои : 10.1038/tp.2013.18 . ПМЦ 3641405 . ПМИД 23571809 .
- ^ Моцингер-Рейф А.А., Чжу Х., Клинг М.А., Мэтсон В., Шарма С., Фин О., Рейф Д.М., Дорайсвами П.М., Трайоновски Дж.К., Каддура-Даук Р., Арнольд С.Е. «Сочетание метаболомических и патологических биомаркеров для различения ранней болезни Альцгеймера и нормального когнитивного старения». Acta Neuropathologica Communications . 1 (28).
- ^ МакЭвой, Дж; Бэйли Р.А.; Чжу Х; Бакли П; Кешаван М.С.; Насралла ХА; Яо Дж; Каддура-Даук Р. (2013). «Липидомика выявляет ранние метаболические изменения у больных шизофренией: эффекты атипичных нейролептиков» . ПЛОС ОДИН . 8 (7): е68717. дои : 10.1371/journal.pone.0068717 . ПМЦ 3722141 . ПМИД 23894336 .
- ^ Мотульский, А.Г. (1957). «Ферменты реакций на лекарства и биохимическая генетика». Журнал Американской медицинской ассоциации . 165 (7): 835–837. дои : 10.1001/jama.1957.72980250010016 . ПМИД 13462859 .
- ^ Перейти обратно: а б с Корона, Г; Риццолио, Ф; Джодано, А; Тоффоли, Дж. (2011). «Фармако-метаболомика: новый инструмент «омики» для персонализации противоракового лечения и определения новых ценных терапевтических целей» . Журнал клеточной физиологии . 227 (7): 2827–31. дои : 10.1002/jcp.24003 . ПМИД 22105661 . S2CID 26060357 .
- ^ Перейти обратно: а б Чжан, С; Нагана Гауда, Джорджия; Еще; Рафтери, Д. (2010). «Достижения в области анализа биожидкостей на основе ЯМР и определения профиля метаболитов» . Аналитик . 135 (7): 1490–8. дои : 10.1039/c000091d . ПМК 4720135 . ПМИД 20379603 .
- ^ Д'Адамо, П; Уливи, С; Бенедучи, А; и др. (2010). «Метабономика и популяционные исследования, связанные с возрастом экскреции аминокислот и сети выводов посредством изучения образцов мочи в двух изолированных итальянских популяциях». Аминокислоты . 38 (1): 65–73. дои : 10.1007/s00726-008-0205-8 . ПМИД 19067108 . S2CID 24205460 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Справочник по геномике : универсальный ресурсный центр по биотехнологиям для биопредпринимателей, ученых и студентов.
- Сеть исследований в области фармакометаболомики (PMRN)
- Проект метаболома человека : проект поддерживается Genome Alberta и Genome Canada.
- Общество метаболомики : организация, занимающаяся содействием развитию, использованию и пониманию метаболомики в науках о жизни.
- Банк данных биологического магнитного резонанса : хранилище данных ЯМР-спектроскопии белков, пептидов, нуклеиновых кислот и других биомолекул.
- Центр метаболомики и масс-спектрометрии Скриппса