Список таксонов со статусом кандидата

Это список таксонов со статусом Candidatus . О таксонах, не вошедших в этот список, см. также:

названий ; опубликованная таксономия GenBank для «эффективных»
Списки кандидатов и LPSN для латинских имен, некоторые из которых очищены в соответствии с Кодексом. ^{[ 1 ]}

Фила

« Ca. Absconditabacteria » (ранее кандидатский тип SR1 ) ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
ПБЯ1 ^{[ 6 ]} также известный как OD1-ABY1, подгруппа OD1 (« Ca. Parcubaacteria ») ^{[ 7 ]}
Кандидат типа AC1 ^{[ 4 ]}
« Ca. Acetothermia » (ранее кандидатский тип OP1 ) ^{[ 6 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
« Ca. Aerophobetes » (ранее кандидатский тип CD12 или BHI80-139 ) ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}
« Ca. Aminicenantes » (ранее тип кандидата OP8 ) ^{[ 6 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
водоносный горизонт1 ^{[ 3 ]}
водоносный горизонт2 ^{[ 3 ]}
« Ca. Berkelbacteria » (ранее кандидатский тип ACD58 ) ^{[ 4 ]}^{[ 8 ]}
БРК1 ^{[ 6 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
КАБИНА-I ^{[ 4 ]}
« Ca. Calescamantes » (ранее кандидатский тип EM19 ) ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
Кандидатский тип CPR2 ^{[ 4 ]}
Кандидатский тип CPR3 ^{[ 4 ]}
Кандидатский тип NC10 ^{[ 6 ]}^{[ 4 ]}
Кандидатский тип OP2 ^{[ 4 ]}
Кандидатский тип RF3 ^{[ 4 ]}
Кандидатский тип SAM ^{[ 4 ]}
Кандидатский тип СПАМ ^{[ 4 ]}
Кандидатский тип TG2 ^{[ 4 ]}
Кандидат типа VC2 ^{[ 4 ]}
Кандидат типа WS1 ^{[ 4 ]}
Кандидат типа WS2 ^{[ 4 ]}^{[ 6 ]}
Кандидатский тип WS4 ^{[ 4 ]}
Кандидатский тип WYO ^{[ 4 ]}
CKC4 ^{[ 3 ]}
« Ca. Cloacimonetes » (ранее кандидатский тип WWE1 ) ^{[ 3 ]}^{[ 5 ]}
СЛР1 ^{[ 4 ]}
« Ca. Dependentiae » (ранее кандидатский тип TM6 ) ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 6 ]}^{[ 9 ]}
В 3 ^{[ 4 ]}
« Ca. Endomicrobia » Stingl et al. 2005 г. ^{[ 10 ]}
« Ca. Fermentibacteria » ( Hyd24-12 ) ^{[ 4 ]}^{[ 3 ]}^{[ 11 ]}
« Ca. Fervidibacteria » (ранее кандидатский тип OctSpa1-106 ) ^{[ 4 ]}
ГАЛ08 ^{[ 3 ]}
Гал15 ^{[ 4 ]}
GN01 ^{[ 4 ]}
GN03 ^{[ 4 ]}
GN04 ^{[ 4 ]}
GN05 ^{[ 4 ]}
GN06 ^{[ 4 ]}
GN07 ^{[ 4 ]}
GN08 ^{[ 4 ]}
GN09 ^{[ 4 ]}
ГН10 ^{[ 4 ]}
ГН11 ^{[ 4 ]}
ГН12 ^{[ 4 ]}
ГН13 ^{[ 4 ]}
ГН14 ^{[ 4 ]}
ГН15 ^{[ 4 ]}
ГУТА4 ^{[ 3 ]}
« Ca. Gracilibacteria » (ранее кандидатский тип GN02 , BD1-5 или группа BD1-5 ) ^{[ 6 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}
Гуаймас1 ^{[ 6 ]}
« Ca. Hydrogenedentes » (ранее кандидатский тип NKB19 ) ^{[ 6 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
JL-ETNP-Z39 ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}
« Ca. Katanobacteria » (ранее кандидатский тип WWE3 ) ^{[ 2 ]}^{[ 4 ]}
Казань-3Б-09 ^{[ 3 ]}
КД3-62 ^{[ 4 ]}
kpj58rc ^{[ 4 ]}
CSR1 ^{[ 4 ]}
КСА2 ^{[ 4 ]}
КСБ1 ^{[ 4 ]}
КСБ2 ^{[ 4 ]}
КСБ4 ^{[ 4 ]}
« Ca. Latescibacteria » (ранее кандидатский тип WS3 ) ^{[ 6 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
ЛКП-89 ^{[ 3 ]}
ЛД1-ПА38 ^{[ 3 ]}
« Ca. Marinamargulisbacteria » (ранее подразделение-кандидат ZB3) ^{[ 12 ]}
« Ca. Marinimicrobia » (ранее морская группа А). ^{[ 6 ]} или тип кандидата SAR406 ) ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
" Ка. Мелаинабактерии "
« Ca. Microgenomates » (ранее кандидатский тип OP11 ) ^{[ 6 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
« Ca. Modulibacteria » (ранее кандидатский тип KSB3 ) ^{[ 4 ]}^{[ 13 ]}
МСБЛ2 ^{[ 4 ]}
MSBL3 ^{[ 4 ]}
MSBL4 ^{[ 4 ]}
MSBL5 ^{[ 4 ]}
MSBL6 ^{[ 4 ]}
НПЛ-УПА2 ^{[ 4 ]}
НТ-Б4 ^{[ 4 ]}
OC31 ^{[ 3 ]}
« Ca. Omnitropica » (ранее тип кандидата OP3 ) ^{[ 6 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
ОП4 ^{[ 4 ]}
ОП6 ^{[ 4 ]}
ОП7 ^{[ 4 ]}
ОС-К / группа ОС-К ^{[ 6 ]}^{[ 4 ]}
« Ca. Parcubaacteria » (ранее тип-кандидат OD1 ) ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
PAUC34f ^{[ 3 ]}
« Ca. Peregrinibacteria » (ранее кандидатский тип PER ) ^{[ 4 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}^{[ 17 ]}
" Ка. Порибактерии " ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 18 ]}
RsaHF231 ^{[ 3 ]}
С2Р-29 ^{[ 3 ]}
« Ca. Saccharibacteria » (ранее кандидатский тип TM7 ) ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 19 ]}^{[ 6 ]}^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}
SBR1093 ^{[ 6 ]}^{[ 4 ]}
СБИГ-2791 ^{[ 3 ]}
Тип кандидата SC3 ^{[ 6 ]}
Кандидатский тип SC4 ^{[ 6 ]}
Осадок-1 ^{[ 4 ]}
Осадок-2 ^{[ 4 ]}
Осадок-3 ^{[ 4 ]}
Осадок-4 ^{[ 4 ]}
ША-109 ^{[ 3 ]}
СМ2Ф11 ^{[ 3 ]}
ТА06 ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}
" Ка. Тектомикробия " ^{[ 22 ]}
TG3 (« Ка. Хитинивибриония»)
WCHB1-60 ^{[ 3 ]}
WD272 ^{[ 3 ]}
ВОР-1 ^{[ 4 ]}
ВОР-3 ^{[ 4 ]}
WPS-1 ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
WPS-2 ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}
WS5 ^{[ 6 ]}^{[ 4 ]}
WS6 ^{[ 6 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 23 ]}
ZB2 , он же подгруппа OD1-ZB2 OD1 (« Ca. Parcubaacteria ») ^{[ 7 ]}
" Казизибактерии " ^{[ 4 ]}

Классы

« Ca. Lambdaproteobacteria » Anantharaman et al. 2016 год
« Ca. Muproteobacteria » Anantharaman et al. 2016 год
« Ca. Zetaproteobacteria » Emerson et al. 2007 год ^{[ 10 ]}

Заказы

« Ca. Nitrosopumilales » Könneke et al. 2005 г. ^{[ 10 ]}

Семьи

« Ca. Midichromiaceae » Montagna et al. 2013 год ^{[ 10 ]}
« Ca. Nitrosopumilaceae » Könneke et al. 2005 г. ^{[ 10 ]}
" Ca. Procabacteriaceae "
" Ка. Рабдохламидийные "

Роды

« Ca. Accumulibacter » Hesselmann et al. 1999 год ^{[ 10 ]}
« Ca. Allobeggiatoa » Hinck et al. 2011 год ^{[ 10 ]}
« Ca. Arthromitus » Snel et al. 1995 год ^{[ 10 ]}
« Ca. Bacilloplasma » Костаньшек и др. 2007 год ^{[ 10 ]}
« Ca. Baumannia » Moran et al. 2003 г. ^{[ 10 ]}
« Ca. Blochmannia » Sauer et al. 2000 г. ^{[ 10 ]}
« Ca. Carsonella » Thao et al. 2000 г. ^{[ 10 ]}
« Ка. Хлоротрикс » Клаппенбах и Пирсон, 2004 г. ^{[ 10 ]}
« Ca. Competibacter » Crocetti et al. 2002 г. ^{[ 10 ]}
« Ca. Contubernalis » Жилина и др. 2005 г. ^{[ 10 ]}
" Ка. Десульфорудис "
« Ca. Endomicrobium » Stingl et al. 2005 г. ^{[ 10 ]}
" Ка. Эпиксеносома "
Просвечивающая электронная микрофотография II стадии эпиксеносом .
" Ка Гигантаума "
« Ca. Glomeribacter » Bianciotto et al. 2003 г. ^{[ 10 ]}
« Ca. Kleidoceria » Kuechler et al. 2010 год ^{[ 10 ]}
« Распространение » . Schmid et al 2000 г. ^{[ 10 ]}
" Ка. Либерибактер "
" Ка. Локиархеум "
« Ca. Lumbricincola » Нечитайло и др. 2009 год ^{[ 10 ]}
« Ca. Magnetobacterium » Мюррей и Стакебрандт, 1995 г. ^{[ 10 ]}
" Ка. Метанорегула "
" Ка. Микротрикс "
« Ка. Нардонелла » Лефевр и др. 2004 г. ^{[ 10 ]}
« Ca. Nitrosoarchaeum » Blainey et al. 2011 год ^{[ 10 ]}
« Ca. Nitrosopumilus » Könneke et al. 2005 г. ^{[ 10 ]}
« Ca. Pelagibacter » Rappe et al. 2002 г. ^{[ 10 ]}
" Ca. Photodesmus " Хендри и Данлэп, 2011 г. ^{[ 10 ]}
« Ca. Phytoplasma » Firrao et al. 2004 г. ^{[ 10 ]}
« Ка. Портьера » Тао и Бауманн, 2004 г. ^{[ 10 ]}
« Ca. Procabacter » Horn et al. 2002 г. ^{[ 10 ]}
" Ка. Рабдохламидии "
« Ca. Riegeria » Gruber-Vodicka et al. 2011 год ^{[ 10 ]}
« Ca. Rohrkolberia » Kuechler et al. 2011 год ^{[ 10 ]}
« Ca. Salinibacter » Антон и др. 2000 г. ^{[ 10 ]}
« Ка. Савагелла » Томпсон и др. 2012 год ^{[ 10 ]}
" Ка. Скалиндуа "
« Ca. Similichlamydia » Stride et al. 2013 год ^{[ 10 ]}
« Ca. Symbiothrix » Hongoh et al. 2007 год ^{[ 10 ]}
« Ка. Тремблайя » Тао и др. 2002 г. ^{[ 10 ]}
« Ca. Xiphinematobacter » Vandekerckhove et al. ^{[ 10 ]}

Виды и подвиды

Если не указано иное (♦), эти записи взяты из LPSN. ^{[ 10 ]}

« Ca. Acaryochromis bahamiensis » López-Legentil et al. 2011 год
« Ca. Acidianus copahuensis » Giaveno et al. 2013 год
« Ca. Aciduliprofundum boonei » Schouten et al. 2008 год

« Ca. Accumulibacter phosphatis » Hesselmann et al. 1999 год
FISH - лабораторного изображение хлопьев реактора EBPR . Зонд PAOmix (Cy5) использовался для окрашивания Ca. Accumulibacter phosphatis , который отображается синим цветом.
« Ca. Actinobaculum timonae » Drancourt et al. 2004 г.
« Ca. Adiaceo aphidicola » Darby et al. 2005 г.
« Ca. Allobeggiatoa salina » Hinck et al. 2011 год
« Ca. Alysiomicrobium bavaricum » Kragelund et al. 2006 г.
« Ca. Alysiosphaera europaea » Kragelund et al. 2006 г.
« Ca. Amoebinatus Massiliae » Greub et al. 2004 г.
« Ca. Amoebophilus asiaticus » Horn et al. 2001 г.
« Ca. Лягушки Amphibiichlamydia » Martel et al. 2013 год
« Ca. Anadelfobacter veles » Vannini et al. 2010 год
« Ca. Ancillula trichonymphae » Strassert et al. 2012 год
« Ca. Anammoxoglobus propionicus » Kartal et al. 2007 год
" Ca. Aquiluna Rubra " Хан, 2009 г.
« Ca. Aquirestis Calciphila » Хан и Шауэр, 2007 г.
« Ca. Arcobacter sulfidicus » Wirsen et al. 2002 г.
« Ca. Arsenophon Arthropodus » Dale et al. 2002 г.
« Ca. Arsenophonus phytopathogenicus » Bressan et al. 2012 год
" Ca. Arsenophonus triatominarum " Гипса и Дейл, 1997 г.
« Ca. Aschnera chinzeii » Hosokawa et al. 2012 год
« Ca. Atelocyanobacterium thalassa (♦)
« Ca. Azoamicus ciliaticola » Graf et al. 2021 год ^{[ 24 ]}
« Ca. Bacteroides Massiliae » Drancourt et al. 2004 г.
« Ca. Bartonella ancashi » Blazes et al. 2013 год
« Ca. Bartonella antechini » Kaewmongkol et al. 2011 год
» Прим. Бартонелла широкая Schwerttii (♦)
« Ca. Bartonellabandicootii » Kaewmongkol et al. 2011 год
« Ca. Bartonella durdenii (♦)
« Ка. Bartonella eldjazairii (♦)
« Ca. Bartonella mayotimonensis » Lin et al. 2010 год
« Ca. Bartonella melophagi (♦)
« Ca. Bartonella merieuxii » Chomel et al. 2012 год
« Ка. Bartonella monaxi (♦)
« Ca. Bartonella rudakiii (♦)
« Ca. Bartonella thailandensis » Saisongkorh et al. 2009 год
« Ка. Bartonella volans (♦)
« Ca. Bartonella woyliei » Kaewmongkol et al. 2011 год
« Ca. Baumannia cicadellinicola » Moran et al. 2003 г.
« Ca. benitsurchiphilus tojoi » Hosokawa et al. 2010 год
« Ca. Berkiella aquae » Mehari et al. 2016 год
« Ca. Berkiella Cookevilleensis » Mehari et al. 2016 год
« Ca. Blochmannia floridanus » Sauer et al. 2000 г.
« Ca. Blochmannia herculeanus » Sauer et al. 2000 г.
« Ca. Blochmannia rufipes » Sauer et al. 2000 г.
« Ca. Borrelia tachyglossi » Loh et al. 2017 год
« Ca. Borrelia texasensis » Lin et al. 2005 г.
« Ca. Branchiomonas Cysticola » Toenshoff et al. 2012 год
« Ca. Brocadia anammoxydans » Jetten et al. 2001 г.
« Ca. Brocadia caroliniensis » Magrí et al. 2012 год
« Ca. Brocadia fulgida » Картал и др. 2004 г.
« Ca. Brocadia sinica » Hu et al. 2010 год
« Ca. Brownia rhizoecola » Gruwell et al. 2010 год
« Ca. Burkholderia andongensis » Lemaire et al. 2011 год
« Ca. Burkholderia Calva » Van Oevelen et al. 2004 г.
" Ca. Burkholderia crenata (♦)
« Ca. Burkholderia hispidae » Lemaire et al. 2012 год
В « Ca. Burkholderia kirkii » Van Oevelen et al. 2002 г.
« Ca. Burkholderia mammillata (♦)
« Ca. Burkholderia nigropunctata » Van Oevelen et al. 2004 г.
« Ca. Burkholderia petitii » Lemaire et al. 2011 год
« Ca. Burkholderiarigidae » Lemaire et al. 2012 год
« Ca. Burkholderia schumannianae » Lemaire et al. 2012 год
« Ca. Burkholderia verschuerenii (♦)
« Ca. Burkholderia virens (♦)
« Caedibacter acanthamoeba » Horn et al. 1999 год
« Ca. subterranean Caldiarchaeum » Nunoura et al. 2011 год
« Ca. Campylobacter humanis » Lawson et al. 1998 год
« Ca. Captive acidiprotista » Baker et al. 2003 г.
« Ca. Cardinium hertigii » Zchori-Fein et al. 2004 г.
« Ca. Carsonella ruddii » Thao et al. 2000 г.
« Ca. Chloracidobacterium thermophilum » Bryant et al. 2007 год
« Ca. Chlorothrix halophila » Клаппенбах и Пирсон, 2004 г.
« Ca. Chryseobacterium Massiliae » Greub et al. 2004 г.
« Ca. Chryseobacterium timonae » Drancourt et al. 2004 г.
« Ca. Clavochlamydia Salmonicola » Karlsen et al. 2008 год
« Ca. Cloacamonas acidaminovorans » Pelletier et al. 2008 год
« Приблизительно сопровождающее » Jacobi et al. 1996 год
« Ca. Competibacter phosphatis » Crocetti et al. 2002 г.
« Ca. Consessoris aphidicola » Darby et al. 2005 г.
« Ca. Contubernalis alkalaceticum » Жилина и др. 2005 г.
« Ca. Cryptoprodotis polytropus » Ferrantini et al. 2009 год
« Ca. Curculioniphilus buchneri » Toju et al. 2009 год
» Количество Ca. Cyrtobacter « Vannini et al. 2010 год
« Ca. Cyrtobacter zanobii » Boscaro et al. 2013 год
« Ca. Defluviella procrastinata » Boscaro et al. 2013 год
« Ca. Desulforudis audaxviator » Chivian et al. 2008 год
колония Ca. Desulforudis audaxviator, обнаруженная на золотом руднике недалеко от Йоханнесбурга , Южная Африка .
« Ca. Desulfovibrio trichonymphae » Sato et al. 2009 год
« Ca. Devosia euplotis » Vannini et al. 2004 г.
« Ca. Ecksteinia adelgidicola » Toenshoff et al. 2012 год
« Ca. Ehrlichia walkerii » Brouqui et al. 2003 г.
« Ca. Endobugula glebosa » Лим и Хейгуд, 2004 г.
" Ca. Endobugula sertula " Хейгуд и Дэвидсон, 1997 г.
« Ca. Endolissoclinum faulkneri » Kwan et al. 2012 год
« Ca. Endoecteinascidia Grainensis » Перес-Матос и др. 2007 год
« Ca. Endomicrobiumpyrsonymphae » Stingl et al. 2005 г.
« Ca. Endomicrobium trichonymphae » Stingl et al. 2005 г.
« Ca. Endonucleobacter Bathymodioli » Zielinski et al. 2009 год
« Ca. Endoriftia persephone » Робидарт и др. 2008 год
« Ca. Endowatersipora palomitas » Андерсон и Хейгуд, 2007 г.
« Ca. Endowatersipora Rubus » Андерсон и Хейгуд, 2007 г.
« Ca. Entotheonella palauensis » Schmidt et al. 2000 г.
« Ca. Epiflobacter spp. » Xia et al. 2008 год
« Ca. Erwinia dacicola » Capuzzo et al. 2005 г.
« Ca. Evansia muelleri » Kuechler et al. 2013 год
" Ка Озеро Флавилуна " Хан 2009 г.
" Ca. Fodinabacter общается " Bertin et al. 2011 год
« Ca.Francisella noatunensis subsp.endociliophora » Schrallhammer et al. 2011 год
« Ca. Frankia datiscae » Persson et al. 2011 год
« Ca. Fritschea bemisiae » Everett et al. 2005 г.
« Ca. Fritschea eriococci » Everett et al. 2005 г.
« Ca. Gillettellia Cooleyia » Toenshoff et al. 2012 год
« Ca. Gilliamella apicola » Martinson et al. 2012 год
« Ca. Гигаспоры Glomeribacter » Bianciotto et al. 2003 г.
« Ca. Инфекционная Gortzia » Boscaro et al. 2012 год
« Ca. Halicomenobacter Calcifugiens » Хан и Шауэр, 2007 г.
« Ca. Halomonas phosphatis » Nguyen et al. 2012 год
« Ca. Hamiltonella defensa » Moran et al. 2005 г.
« Ca. Helicobacter bovis » De Groote et al. 1999 год
« Ca. Helicobacter heilmannii » O'Rourke et al. 2004 г.
« Ca. Helicobacter suis » De Groote et al. (включает штаммы, ранее известные как Helicobacter heilmannii type one)
« Ca. Heliomonas lunata » Asao et al. 2012 год
« Ca. Hemipteriphilus asiaticus » Bing et al. 2013 год
« Ca. Hemobacterium ranarum » Чжан и Рикихиса, 2004 г. (ранее известная как Aegyptianella ranarum )
« Ca. Hepatincola porcellionum » Wang et al. 2004 г.
« Ca. Hepatobacter penaei » Numan et al. 2013 год
« Ca. Hepatoplasma crinochetorum » Wang et al. 2004 г.
« Ca. Hodgkinia cicadicola » McCutcheon et al. 2009 год
" Ca. Holdemania Massiliensis (♦)
« Ca. Ishikawaella capsulata » Hosokawa et al. 2006 г.
« Ca. Isobeggiatoa divolgata » Салман и др. 2011 год
« Ca. Jettenia asiatica » Quan et al. 2008 год
« Ca. Kinetoplastibacterium blastocrithidii » Du et al. 1994 г.
« Ca. Kinetoplastibacterium crithidii » Du et al. 1994 г.
« Ca. Kleidoceria schneideri » Kuechler et al. 2010 год
« Ca. Kopriimonas aquarianus » Quinn et al. 2012 год
« Ca. Korarchaeum cryptofilum » Elkins et al. 2008 год
« Ca. Koribacter Universalis » Ward et al. 2009 год
« Ca. Kuenenia stuttgartiensis » Schmid et al. 2000 г.
« Ca. Lariskella arthropodarum » Matsuura et al. 2012 год
« Ca. Legionella jeonii » Park et al. 2004 г.
« Ca. Liberibacter americanus » Teixeira et al. 2005 г. - одна из причин болезни позеленения цитрусовых.
Болезнь позеленения цитрусовых мандаринов
« Ca. Liberibacter africanus » Roberts et al. 2015 г. - одна из причин болезни позеленения цитрусовых.
« Ca. Liberibacter africanus » корриг. Жагуэ и др. 1994 (ранее «Ca. Liberobacter africanum »)
« Ca. Liberibacter africanus subsp. capensis » Garnier et al. 2000 г.
« Ca. Liberibacter asiaticus » корриг. Жагуэ и др. 1994 г. (ранее «Ca. Liberobacter asiaticum» ) — одна из причин болезни позеленения цитрусовых.
« Ca. Liberibacter europaeus » Raddadi et al. 2011 год
« Ca. Liberibacter psyllaurous » Hansen et al. 2008 год
« Ca. Liberibacter solanacearum » Liefting et al. 2009 г. - причина появления желтых листочков и чипов зебры.
Картофельные чипсы с чипом Zebra
" Ca. Limnoluna Rubra " Хан 2009 г.
« Ca. Macropleicola Appiculatae » Kölsch et al. 2009 год
« Ca. Macropleicola muticae » Kölsch et al. 2009 год
« Ca. Magnetobacterium bavaricum » Spring et al. 1993 год
« Ca. Magnetoglobus multicellis » Abreu et al. 2007 год
« Ca. Magnospira bakii » Snaidr et al. 1999 год
« Ca. Maribeggiatoa vulgaris » Salman et al. 2011 год
« Ca. Marispirochaeta связана » Shivani et al. 2016 год
« Ca. Marithioploca araucae » Салман и др.
« Ca. Marithrix sessilis » Салман и др. 2011 год
« Ca. Mesochlamydia elodeae » Corsaro et al. 2013 год
« Ca. Metachlamydia lacustris » Corsaro et al. 2010 год
« Ca. Methanogranum ceinicola » Iino et al. 2013 год
« Ca. Methanomethylophilus alvus » Borrel et al. 2012 год
« Ca. Methanoregula boonei » Bräuer et al. 2006 г.
« Ca. Mmethylacidiphilum infernorum » Hou et al. 2008 год
« Ca. Mmethylomirabilis oxyfera » Ettwig et al. 2010 год
« Ca. Micrarchaeum acidiphilum (♦)
« Ca. Microthrix Calida » Levantesi et al. 2006 г.
« Ca. Microthrix parvicella » Blackall et al. 1996 год
« Ca. Midichromia mitochondrii » Sassera et al. 2006 г.
« Ca. Monilibacter batavus » Kragelund et al. 2006 г.
« Ca. Moranella endobia » Маккатчеон и фон Долен, 2011 г.
« Ca. Mycoplasma aoti » Barker et al. 2011 год
« Ca. Mycoplasma corallicola » Neulinger et al. 2009 год
« Ca. Mycoplasma haematoparvum » Sykes et al. 2005 г.
« Ca. Mycoplasma haemobos » Tagawa et al. 2008 год
« Ca. Mycoplasma haemodidelphidis » Messik et al. 2002 г.
« Ca. Mycoplasma haemofelis » Neimark et al. 2001 (синоним Haemobartonella felis )
« Ca. Mycoplasma haemofelis » с окраской по Райту-Гимзе.
« Ca. Mycoplasma hamolamae » Messik et al. 2002 г.
« Ca. Mycoplasma haemomacacque » Maggi et al. 2013 год
« Ca. Mycoplasma haemominutum » Foley and Pedersen 2001 (ранее « Haemobartonella felis small form (Hfsm)»)
« Ca. Mycoplasma haemomuris » Neimark et al. 2001 (синоним Haemobartonella muris )
« Ca. Mycoplasma haemomuris subsp. musculi » Harasawa et al. 2015 год
« Ca. Mycoplasma haemomuris subsp. ratti » Harasawa et al. 2015 год
« Ca. Mycoplasma haemosuis » Neimark et al. 2001 (синоним Eperythrozoon suis и Mycoplasma suis )
« Ca. Mycoplasma haemovis » Hornok et al. 2009 год
« Ca. Mycoplasma haemozalophi » Волохов и др. 2011 год
« Ca. Mycoplasma kahanei » Neimark et al. 2002 г.
« Ca. Mycoplasma ravipulmonis » Neimark et al. 1998 год
« Ca. Mycoplasma turicensis » Willi et al. 2006 г.
« Ca. Mycoplasma wenyonii » Neimark et al. 2001 (синоним Eperythrozoon wenyonii )
« Ca. Nebulobacter yamunensis » Boscaro et al. 2012 год
« Ca. Neoehrlichia arcana » Gofton et al. 2016 год
« Ca. Neoehrlichia australis » Gofton et al. 2016 год
« Ca. Neoehrlichia лоторис » Yabsley et al. 2008 год
« Ca. Neoehrlichia mikurensis » Kawahara et al. 2004 г.
« Ca. Nitrosoarchaeus koreensis » Kim et al. 2011 год
« Ca. Nitrosoarchaeum limnia » Blainey et al. 2011 год
« Ca. Nitrosocaldus Yellowstonii » de la Torre et al. 2008 год
« Ca. Nitrosopelagicus brevis (♦)
« Ca. Nitrosopumilus koreensis » Park et al. 2012 год
« Ca. Nitrosopumilus maritimus » Könneke et al. 2005 г.
« Ca. Nitrosopumilus salaria » Mosier et al. 2012 год
« Ca. Nitrosopumilus sediminis » Park et al. 2012 год
« Ca. Nitrososphaera gargensis » Hatzenpichler et al. 2008 год
« Ca. Nitrososphaera vienensis » Tourna et al. 2011 год
" Ca. Nitrospira bockiana " Lebedeva et al. 2008
« Ca. Nitrospira fluvii » Spieck et al. 2006 г.
« Ca. Nitrosotalea devanaterra » Lehtovirta-morley et al. 2011 год
« Ca. Nitrotoga arctica » Alawi et al. 2007 год
« Ca. Nostocoida limicola » Blackall et al. 2000 г. (штаммы Ben 17, Ben 18, Ben 67, Ben 68 и Ben 74 теперь называются Tetrasphaera jenkinsii , штамм Ben 70 — Tetrasphaera vanveenii , а штаммы Ver 1 и Ver 2 — Tetrasphaera veronensis )
« Ca. Odyssella thessalonica » Birtles et al. 2000 г.
« Ca. Ovobacter propellens » Фенчел и Тар, 2004 г.
« Ca. Paenicardinium endonii » Ноэль и Атибалентя, 2006 г.
« Ca. Parabeggiatoa communis » Салман и др. 2011 год
« Ca. Paracaedibacter acanthamoeba » Horn et al. 1999 год
« Ca. Paracaedibacter symbiosus » Horn et al. 1999 год
« Ca. Paraholospora Nuclearivisitans » Eschbach et al. 2009 год
« Ca. Parilichlamydia carangidicola » Stride et al. 2013 год
« Ca. Parvarchaeum acidophilus (♦)
« Ca. Pasteuria aldrichii » Giblin-Davis et al. 2011 год
« Ca. Pasteuria usgae » Giblin-Davis et al. 2003 г.
« Ca. Pelagibacter повсюду » Rappe et al. 2002 г.
« Ca. Peptostreptococcus Massiliae » Drancourt et al. 2004 г.
« Ca. Phlomobacter fragariae » Zreik et al. 1998 год
« Катоптрон Ca. Photodesmus » Хендри и Данлэп, 2011 г.
« Ca. Phytoplasma 16SrII-U » Yang et al. 2016 год
« Ca. Phytoplasma allocasuarinae » Marcone et al. 2004 г.
« Ca. Phytoplasma americanum » Lee et al. 2006 г.
« Ca. Phytoplasma asteris » Lee et al. 2004 г.
« Ca. Phytoplasma aurantifolia » Zreik et al. 1995 год
« Ca. Phytoplasma australiense » Davis et al. 1997 год
« Ca. Phytoplasma balanitae » Win et al. 2013 год
« Ca. Phytoplasma brasiliense » Montano et al. 2001 г.
« Ca. Phytoplasma caricae » Arocha et al. 2005 г.
« Ca. Phytoplasma castaneae » Jung et al. 2002 г.
« Ca. Phytoplasma cirsii » Сафарова и др. 2016 год
« Ca. Phytoplasma convolvuli » Martini et al. 2012 год
« Ca. Phytoplasma costaricanum » Lee et al. 2011 год
« Ca. Phytoplasma cynodontis » Marcone et al. 2004 г.
« Ca. Phytoplasma fragariae » Valiunas et al. 2006 г.
« Ca. Phytoplasma fraxini » Griffiths et al. 1999 - Дело Сиреневой ведьмы-метлы
Симптомы болезни пепельно-желтой окраски, вызванной Ca. Phytoplasma fraxini на зеленом ясене.
« Ca. Phytoplasma gramini » Arocha et al. 2005 г.
« Ca. Phytoplasma hispanicum » Davis et al. 2016 год
« Ca. Phytoplasma japonicum » Sawayanagi et al. 1999 год
« Ca. Phytoplasma licopersici » Arocha et al. 2007 год
« Ca. Phytoplasma malaysianum » Nejat et al. 2013 год
« Ca. Phytoplasma mali » Зеемюллер и Шнайдер, 2004 г.
« Ca. Phytoplasma meliae » Fernandez et al. 2016 год
« Ca. Phytoplasma omanense » Al-Saady et al. 2008 год
« Ca. Phytoplasma oryzae » Jung et al. 2003 г.
« Ca. Phytoplasma palmicola » Harrison et al. 2014 год
« Ca. Phytoplasma phoenicium » Verdin et al. 2003 г.
« Ca. Phytoplasma pini » Schneider et al. 2005 г.
« Ca. Phytoplasma pruni » Davis et al. 2013 год
« Ca. Phytoplasma prunorum » Зеемюллер и Шнайдер, 2004 г.
« Ca. Phytoplasmapyri » Зеемюллер и Шнайдер, 2004 г.
« Ca. Phytoplasma rhamni » Marcone et al. 2004 г.
« Ca. Phytoplasma Rubi » Malembic-Maher et al. 2011 год
« Ca. Phytoplasma Rubi » Франова и др. 2016 год
« Ca. Phytoplasma solani » Quaglino et al. 2013 год
« Ca. Phytoplasma spartii » Marcone et al. 2004 г.
« Ca. Phytoplasma sudamericanum » Davis et al. 2012 год
« Ca. Phytoplasma tamaricis » Чжао и др.
« Ca. Phytoplasma trifolii » Хируки и Ван, 2004 г.
« Ca. Phytoplasma ulmi » Lee et al. 2004 г.
« Ca Phytoplasma vitis » Marzorati et al. 2006 - причина Золотого флавесенса
Золотое румянец на виноградной лозе
« Ca. Phytoplasma ziziphi » Jung et al. 2003 г.
« Ca. Piscichlamydia Salmonis » Draghi et al. 2004 г.
« Ca. Planktoluna трудный » Хан 2009 г.
« Ca. Planktomarina умеренный климат » Giebel et al. 2011 год
« Ca. Planktophila limnetica » Джезбера и др. 2009 год
« Ca. Portiera aleyrodidarum » Тао и Бауманн, 2004 г.
« Ca. Prevotella Massiliensis » Drancourt et al. 2004 г.
« Ca. Procabacter acanthamoebae » Horn et al. 2002 г.
" Ca. Proftia Tarda " Toenshoff et al. 2012 год
« Ca. Profftia virida » Toenshoff et al. 2012 год
« Ca. Protochlamydia amoebophila » Collingro et al. 2005 г.
« Ca. Puchtella pedicinophila » Fukatsu et al. 2009 год
« Ca. Puniceispirillum marinus » Oh et al. 2010 год
« Ca. Purcelliella pentastyrinorum » Bressan et al. 2009 год
« Ca. Regiella Insecticola » Moran et al. 2005 г.
" Ca. Reniclamydia lutjani " Корсаро и работа 2012 г.
« Утолщение Ca. Rhabdochlamydia » Corsaro et al. 2006 г.
« Ca. Rhabdochlamydia porcellionis » Костаньшек (морфология соответствует описанию Chlamydia isopodii )
« Ca. Rhizobium Massiliae » Greub et al. 2004 г.
" Ca. Rhodoluna limnophila " Хан 2009 г.
" Ca. Rhodoluna planktonica " Хан 2009 г.
« Ca. Rickettsia amblyommii » Labruna et al. 2004 г.
« Ca. Rickettsia andeanae » Jiang et al. 2005 г.
« Ca. Rickettsia asemboensis » Jiang et al. 2013 год
« Ca. Rickettsia barbariae » Mura et al. 2008 год
« Ca. Rickettsia hebeiii » Yaxue et al. 2011 год
« Ca. Rickettsia hungarica » Hornok et al. 2010 год
« Ca. Rickettsia hoogstralii » Mattila et al. 2007 год ^{[ 25 ]}
« Ca. Rickettsia kellyi » Rolain et al. 2006 г.
« Ca. Rickettsia kingi » Анстед и Чилтон, 2013 г.
« Ca. Rickettsia kotlanii » Sréter-Lancz et al. 2006 г.
« Ca. Rickettsia liberiensis » Медианников и др. 2012 год
« Ca. Rickettsia principis » Медианников и др. 2006 г.
« Ca. Rickettsia senegalensis » Медианников, Обади-Ладрикс и Рауль, 2015 г. ^{[ 26 ]}
« Ca. Rickettsia tarasevichiae » Шпынов и др. 2003 г.
« Ca. Rickettsia tasmanensis » Izzard et al. 2009 год
« Ca. Rickettsia vini » Palomar et al. 2012 год
« Ca. Riegeria galateiae » Gruber-Vodikka et al. 2011 год
« Ca. Riesia pediculicola » Sasaki-Fukatsu et al. 2006 г.
« Пояс Ca. Rohrkolberia » Kuechler et al. 2011 год
« Ca. Roseomonas Massiliae » Greub et al. 2004 г.
« Ca. Ruthia Magnifica » Newton et al. 2007 год
« Ca. Scalindua arabica » Woebken et al. 2008 год
« Ca. Scalindua brodae » Schmid et al. 2003 г.
« Ca. Scalindua pacifica » Данг и др. 2003 г.
« Ca. Scalindua profunda » Ван Де Воссенберг и др. 2008 г.
« Ca. Scalindua richardsii » Fuchsman et al. 2012 год
« Ca. Scalindua sorokinii » Kuypers et al. 2003 г.
« Ca. Scalindua wagneri » Schmid et al. 2003 г.
« Ca. Serratia symbiotica » Moran et al. 2005 г.
« Ca. Similichlamydia latridicola » Stride et al. 2013 год
« Ca. Snodgrassella alvi » Martinson et al. 2012 год
« Ca. Snodgrassella alvi » Martinson et al. 2012 год
« Приблизительно член мелофага » Chrudimsky et al. 2012 год
« Ca. Sodalis pierantonius » Oakeson et al. 2014 год
« Ca. Sphaeronema italicum » Kragelund et al. 2006 г.
« Ca. Stammerula tephritidis » Mazzon et al. 2008 год
« Ca. Steffania adelgidicola » Toenshoff et al. 2012 год
« Ca. Streptomyces philanthi » Kaltenpoth et al. 2006 г.
« Ca. Sulcia muelleri » Moran et al. 2005 г.
« Приблизительно серные отложения » Park et al. 2012 год
« Ca. Symbiothrix dinenymphae » Hongoh et al. 2007 год
« Ca. Synechococcus spongiarum » Usher et al. 2004 г.
« Ca. Tammella caduceus » Hongoh et al. 2007 год
« Ca. Tenderia Electrophaga » Eddie et al. 2016 год
« Ca. Thermochromobacter aerophilum » Liu et al. 2012 год
« Ca. Thiobios Zoothamnicoli » Rinke et al. 2006 г.
« Ca. Thiodictyon Syntropicum » Peduzzi et al. 2012 год
« Ca. Thioglobus uniqueis » Маршалл и Моррис, 2013 г.
« Ca. Thiomargarita joergensenii » Salman et al. 2011 год
« Ca. Thiomargarita nelsonii » Salman et al. 2011 год
« Ca. Thiophysa hinzei » Salman et al. 2011 год
« Совокупность Ca. Thiopillus » Salman et al. 2011 год
« Ca. Thioturbo danicus » Muyzer et al. 2005 г.
« Ca. Tremblaya phenacola » Gruwell et al. 2010 год
« Ка. Принц Тремблайя » Тао и др. 2002 г.
« Ca. Troglogloea absoloni » Костаньшек и др. 2013 год
« Ca. Uzinura diaspidicola » Gruwell et al. 2007 год
« Ca. Vallotia Cooleyia » Toenshoff et al. 2012 год
" Ca. Vallotiatarda " Toenshoff et al. 2012 год
« Ca. Vallotia virida » Toenshoff et al. 2012 год
« Ca. Veillonella atypica » Drancourt et al. 2004 г.
« Ca. Vesicomyosocius otanii » Kuwahara et al. 2007 год
« Ca. Vestibaculum несвязанный » Stingl et al. 2004 г.
« Ca. Vidania fulgoroidae » Gonella et al. 2011 год
« Ca. Wolinella africanus » Bohr et al. 2003 г.
« Ca. Xenohaliotis Californiensis » Friedman et al. 2000 г.
« Ca. Xiphinematobacter americani » Vandekerckhove et al.
« Ca. Xiphinematobacter brevicolli » Vandekerckhove et al.
« Ca. Xiphinematobacter rivesi » Vandekerckhove et al. 2000 г.
« Ca. Zinderia Insecticola » Маккатчеон и Моран, 2010 г.

Бывший кандидат в налоговые органы

Арматимонадота , ранее тип кандидата OP10 ^{[ 6 ]}^{[ 27 ]}^{[ 28 ]}
Atrobacterota (ранее тип кандидата OP9 или JS1 ) ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 2 ]}^{[ 6 ]}
Caldisericota , ранее тип кандидата OP5 ^{[ 6 ]}^{[ 29 ]}
Элюзимикробиота , ранее группа термитов 1 ^{[ 30 ]}
Игнавибактериота (ранее кандидатский тип ZB1) ^{[ 5 ]}^{[ 31 ]}
Lentisphaerota , ранее vadinBE97 ^{[ 6 ]}^{[ 32 ]}
Нитроспинота ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 33 ]}

См. также

Некультивируемые бактериальные типы и метагеномика
Открытая номенклатура — система обозначений, используемая в таксономии для обозначения суждения систематика о сходстве таксонов.
Глоссарий научных названий
incertae sedis — таксон неопределенного положения в классификации.
nomen dubium , имя неизвестного или сомнительного применения.

Ссылки

^ Орен, А. (ноябрь 2021 г.). «Номенклатура прокариотических таксонов Candidatus: наведение порядка в современном хаосе» . Новые микробы и новые инфекции . 44 : 100932. дои : 10.1016/j.nmni.2021.100932 . ПМЦ 8487987 . ПМИД 34631108 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Обниму Лос-Анджелес; и др. (2016). «Новый взгляд на древо жизни» . Природная микробиология . Статья 16048 (5): 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . ПМИД 27572647 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и «ARB-Сильва: обширная база данных рибосомальных РНК» . Команда разработчиков АРБ . Проверено 2 января 2016 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} ^а ^к ^ап ^ак ^с ^как ^в ^В ^из ^хорошо ^топор ^{является} ^тот ^нет ^бб ^{до нашей эры} ^др. ^быть ^парень ^бг ^чб ^с ^минет ^БК ^с ^бм ^млрд ^быть ^б.п. ^БК ^бр ^бс ^БТ ^этот ^бв ^б ^бх ^к ^бз ^что ^CB ^копия ^{компакт-диск} ^Этот ^см. ^cg ^ч ^Там ^СиДжей «Браузер таксономии» . НКБИ . Проверено 2 января 2016 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с «Иерархический браузер» . Проект рибосомальной базы данных . Архивировано из оригинала 21 ноября 2008 года . Проверено 2 января 2016 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и Раппе, Майкл С.; Джованнони, Стивен Дж. (2003). «Некультурное микробное большинство». Ежегодный обзор микробиологии . 57 : 369–94. дои : 10.1146/annurev.micro.57.030502.090759 . ПМИД 14527284 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Кенли А. Хиллер, Кеннет Х. Форман, Дэвид Вейсман, Дженнифер Л. Боуэн: Проницаемые реактивные барьеры, предназначенные для смягчения последствий эвтрофикации, изменяющие состав бактериального сообщества и окислительно-восстановительные условия водоносного горизонта. В: Appl Environ Microbiol v.81(20); 2015 октябрь; стр.7114–7124. дои:10.1128/АЕМ.01986-15 . ПМК 4579450 . ПМИД 26231655 .
^ Райтон К.С.; и др. (2014). «Метаболические взаимозависимости между филогенетически новыми ферментерами и респираторными организмами в неограниченном водоносном горизонте» . Журнал ISME . 8 (7): 1452–1463. дои : 10.1038/ismej.2013.249 . ПМК 4069391 . ПМИД 24621521 .
^ Да, ЙК; и др. (2015). «Сравнительная геномика кандидатского типа TM6 предполагает, что паразитизм широко распространен и является наследственным в этой линии» . Мол Биол Эвол . 33 (4): 915–927. дои : 10.1093/molbev/msv281 . ПМЦ 4776705 . ПМИД 26615204 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль Парте, AC; Эузеби, Япония (2017). «Имена, включенные в категорию Кандидат» . Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре . Проверено 4 января 2018 г.
^ Киркегор, Расмус Хансен; Дюхольм, Мортен Симонсен; Макилрой, Саймон Джон; Нерихло, Марта; Карст, Сорен Михаэль; Альбертсен, Мэдс; Нильсен, Пер Халкьер (01 октября 2016 г.). «Геномная информация о членах кандидатного типа Hyd24-12, распространенного в мезофильных анаэробных ферментерах» . Журнал ISME . 10 (10): 2352–2364. дои : 10.1038/ismej.2016.43 . ISSN 1751-7370 . ПМК 5030696 . ПМИД 27058503 .
^ NCBI: Кандидат в подразделение ZB3 (класс), группа «Цианобактерии» / «Мелайнабактерии».
^ Секигути Ю; и др. (2015). «Первые геномные данные о членах потенциального бактериального типа, ответственного за накопление сточных вод» . ПерДж . 3 : е740. дои : 10.7717/peerj.740 . ПМК 4312070 . ПМИД 25650158 .
^ Кристофер Т. Браун, Лаура А. Хаг, Брайан С. Томас и др. ; и др. (2015). «Необычная биология группы, включающей более 15% доменных бактерий» (PDF) . Природа . 523 (7559): 208–11. Бибкод : 2015Natur.523..208B . дои : 10.1038/nature14486 . ОСТИ 1512215 . ПМИД 26083755 . S2CID 4397558 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
^ NCBI: Candida Peregrinibacteria (тип)
^ UniProt: Таксономия - перегринибактерии-кандидаты (ТИП)
^ Картик Анантараман, Кристофер Т. Браун, Дэвид Бурштейн, Синди Кастель: Анализ пяти полных последовательностей генома членов класса Peribacteria недавно признанного бактериального типа Peregrinibacteria . В: PeerJ 4(8):e1607; январь 2016 г.; doi:10.7717/peerj.1607
^ Физелер Л; и др. (2004). «Открытие нового типа-кандидата «порибактерии» в морских губках» . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (6): 3724–32. Бибкод : 2004ApEnM..70.3724F . дои : 10.1128/АЕМ.70.6.3724-3732.2004 . ПМК 427773 . ПМИД 15184179 .
^ Альбертсен М; и др. (2013). «Последовательности генома редких некультивируемых бактерий, полученные путем объединения нескольких метагеномов с дифференциальным покрытием». Нат. Биотехнология . 31 (6): 533–8. дои : 10.1038/nbt.2579 . ПМИД 23707974 . S2CID 11038964 .
^ Гугенгольц П; и др. (1998). «Влияние независимых от культуры исследований на формирующийся филогенетический взгляд на бактериальное разнообразие» . Журнал бактериологии . 180 (18): 4765–74. дои : 10.1128/JB.180.18.4765-4774.1998 . ПМЦ 107498 . ПМИД 9733676 .
^ Марси Ю; и др. (2007). «Рассечение биологической «темной материи» с помощью одноклеточного генетического анализа редких и некультивируемых микробов TM7 изо рта человека» . Proc Natl Acad Sci США . 104 (29): 11889–94. дои : 10.1073/pnas.0704662104 . ЧВК 1924555 . ПМИД 17620602 .
^ Уилсон MC; и др. (2014). «Таксон экологических бактерий с большим и своеобразным метаболическим репертуаром» (PDF) . Природа . 506 (7486): 58–62. Бибкод : 2014Natur.506...58W . дои : 10.1038/nature12959 . ПМИД 24476823 .
^ Дойка М.А.; и др. (2000). «Расширение известного разнообразия и распространения в окружающей среде некультивируемого филогенетического подразделения бактерий» . Прикладная и экологическая микробиология . 66 (4): 1617–21. Бибкод : 2000ApEnM..66.1617D . дои : 10.1128/АЕМ.66.4.1617-1621.2000 . ПМК 92031 . ПМИД 10742250 .
^ Джон С. Граф, Сина Шорн, Катарина Китцингер, Соерен Ахмеркамп, Кристиан Вёле, Бруно Хюттель, Карстен Дж. Шуберт, Марсель М. М. Кайперс и Яна Милука: Анаэробный эндосимбионт генерирует энергию для инфузорного хозяина путем денитрификации . В: Природа (3 марта 2021 г.). doi:10.1038/s41586-021-03297-6 .
^ Маттила, Дж.Т., Нью-Йорк Буркхардт, Хатчесон Х.Дж., Мундерло У.Г. и Куртти Т.Дж. 2007. Выделение клеточных линий и риккетсиального эндосимбионта из мягкого клеща Carios capensis (Neumann) (Acari: Argasidae: Ornithodorinae). Журнал медицинской энтомологии 44:1091–1101. «Мы предлагаем назвать изолят RCCE3 « Candidatus Rickettsia hoogstraalii» в честь Гарри Хугстраала, который внес большой вклад в наши знания о клещах».
^ О. Медианников О., Обади-Ладрикс М., Рауль Д. (2015). «Candidatus 'Rickettsia senegalensis' от кошачьих блох в Сенегале» . Новые микробы, новые инфекции . 3 : 24–8. дои : 10.1016/j.nmni.2014.10.005 . ПМЦ 4337942 . ПМИД 25755888 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько названий: список авторов ( ссылка ) : «Мы выделили три штамма риккетсиозов, и генетический анализ показал, что эти штаммы представляют собой вероятный новый вид, условно названный здесь Candidatus Rickettsia senegalensis ».
^ Тамаки Х; и др. (2010). « Artimonas rosea gen. nov., sp. nov., грамотрицательная, аэробная, хемогетеротрофная бактерия нового бактериального типа, Armatimonadetes phyl. nov., формально называемая типом-кандидатом OP10» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (Часть 6): 1442–7. дои : 10.1099/ijs.0.025643-0 . ПМИД 20622056 .
^ Ли КСИ; и др. (2010). « Chthonomonascalidirosea gen. nov., sp. nov., аэробный, пигментированный, термофильный микроорганизм нового бактериального класса, Chthonomonadetes classis. nov., недавно описанного типа Armatimonadetes, первоначально обозначенного как кандидат в подразделение OP10» (PDF) . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (Часть 10): 2482–90. дои : 10.1099/ijs.0.027235-0 . ПМИД 21097641 .
^ Мори К; и др. (2009). « Caldisericum exile gen. nov., sp. nov., анаэробная, термофильная, нитчатая бактерия нового бактериального типа Caldiserica phyl. nov и Caldisericia classis nov ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (Пт 11): 2894–8. дои : 10.1099/ ijs.0.010033-0 ПМИД 19628600 .
^ Гейсингер О; и др. (2009). «Ultramicrobacterium Elusimicrobium minutum gen. nov., sp. nov., первый культивируемый представитель термитной группы 1 типа» . Прикладная и экологическая микробиология . 75 (9): 2831–40. Бибкод : 2009ApEnM..75.2831G . дои : 10.1128/АЕМ.02697-08 . ПМЦ 2681718 . ПМИД 19270135 .
^ Подосокорская О.А.; и др. (2013). «Характеристика Melioribacter roseus gen. nov., sp. nov., новой факультативно анаэробной термофильной целлюлолитической бактерии из класса Ignavibacteria , и предложение нового бактериального типа Ignavibacteriae ». Окружающая среда. Микробиол . 15 (6): 1759–71. дои : 10.1111/1462-2920.12067 . ПМИД 23297868 .
^ Чо Дж.К.; и др. (2004). « Lentisphaera araneosa gen. nov., sp. nov., прозрачный экзополимер, продуцирующий морские бактерии, и описание нового бактериального типа Lentisphaerae». Экологическая микробиология . 6 (6): 611–21. дои : 10.1111/j.1462-2920.2004.00614.x . ПМИД 15142250 .
^ Лакер С; и др. (2013). «Геном Nitrospina gracilis проливает свет на метаболизм и эволюцию основного морского окислителя нитритов» . Передний. Микробиол . 4 : 27. doi : 10.3389/fmicb.2013.00027 . ПМК 3578206 . ПМИД 23439773 .

[pmid34631108-1] Орен, А. (ноябрь 2021 г.). «Номенклатура прокариотических таксонов Candidatus: наведение порядка в современном хаосе» . Новые микробы и новые инфекции . 44 : 100932. дои : 10.1016/j.nmni.2021.100932 . ПМЦ 8487987 . ПМИД 34631108 .

[Hug-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с Обниму Лос-Анджелес; и др. (2016). «Новый взгляд на древо жизни» . Природная микробиология . Статья 16048 (5): 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . ПМИД 27572647 .

[arbsilva-3] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и «ARB-Сильва: обширная база данных рибосомальных РНК» . Команда разработчиков АРБ . Проверено 2 января 2016 г.

[NCBI-4] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль ^{являюсь} ^а ^к ^ап ^ак ^с ^как ^в ^В ^из ^хорошо ^топор ^{является} ^тот ^нет ^бб ^{до нашей эры} ^др. ^быть ^парень ^бг ^чб ^с ^минет ^БК ^с ^бм ^млрд ^быть ^б.п. ^БК ^бр ^бс ^БТ ^этот ^бв ^б ^бх ^к ^бз ^что ^CB ^копия ^{компакт-диск} ^Этот ^см. ^cg ^ч ^Там ^СиДжей «Браузер таксономии» . НКБИ . Проверено 2 января 2016 г.

[RDP10-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с «Иерархический браузер» . Проект рибосомальной базы данных . Архивировано из оригинала 21 ноября 2008 года . Проверено 2 января 2016 г.

[Rappe-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и Раппе, Майкл С.; Джованнони, Стивен Дж. (2003). «Некультурное микробное большинство». Ежегодный обзор микробиологии . 57 : 369–94. дои : 10.1146/annurev.micro.57.030502.090759 . ПМИД 14527284 .

[Hiller2015-7] Перейти обратно: ^а ^б Кенли А. Хиллер, Кеннет Х. Форман, Дэвид Вейсман, Дженнифер Л. Боуэн: Проницаемые реактивные барьеры, предназначенные для смягчения последствий эвтрофикации, изменяющие состав бактериального сообщества и окислительно-восстановительные условия водоносного горизонта. В: Appl Environ Microbiol v.81(20); 2015 октябрь; стр.7114–7124. дои:10.1128/АЕМ.01986-15 . ПМК 4579450 . ПМИД 26231655 .

[8] Райтон К.С.; и др. (2014). «Метаболические взаимозависимости между филогенетически новыми ферментерами и респираторными организмами в неограниченном водоносном горизонте» . Журнал ISME . 8 (7): 1452–1463. дои : 10.1038/ismej.2013.249 . ПМК 4069391 . ПМИД 24621521 .

[Yeoh-9] Да, ЙК; и др. (2015). «Сравнительная геномика кандидатского типа TM6 предполагает, что паразитизм широко распространен и является наследственным в этой линии» . Мол Биол Эвол . 33 (4): 915–927. дои : 10.1093/molbev/msv281 . ПМЦ 4776705 . ПМИД 26615204 .

[LPSN-10] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также ^и ^аль Парте, AC; Эузеби, Япония (2017). «Имена, включенные в категорию Кандидат» . Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре . Проверено 4 января 2018 г.

[Kirkegaard_2352–2364-11] Киркегор, Расмус Хансен; Дюхольм, Мортен Симонсен; Макилрой, Саймон Джон; Нерихло, Марта; Карст, Сорен Михаэль; Альбертсен, Мэдс; Нильсен, Пер Халкьер (01 октября 2016 г.). «Геномная информация о членах кандидатного типа Hyd24-12, распространенного в мезофильных анаэробных ферментерах» . Журнал ISME . 10 (10): 2352–2364. дои : 10.1038/ismej.2016.43 . ISSN 1751-7370 . ПМК 5030696 . ПМИД 27058503 .

[12] NCBI: Кандидат в подразделение ZB3 (класс), группа «Цианобактерии» / «Мелайнабактерии».

[Sekiguchi-13] Секигути Ю; и др. (2015). «Первые геномные данные о членах потенциального бактериального типа, ответственного за накопление сточных вод» . ПерДж . 3 : е740. дои : 10.7717/peerj.740 . ПМК 4312070 . ПМИД 25650158 .

[CPR-14] Кристофер Т. Браун, Лаура А. Хаг, Брайан С. Томас и др. ; и др. (2015). «Необычная биология группы, включающей более 15% доменных бактерий» (PDF) . Природа . 523 (7559): 208–11. Бибкод : 2015Natur.523..208B . дои : 10.1038/nature14486 . ОСТИ 1512215 . ПМИД 26083755 . S2CID 4397558 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

[15] NCBI: Candida Peregrinibacteria (тип)

[16] UniProt: Таксономия - перегринибактерии-кандидаты (ТИП)

[17] Картик Анантараман, Кристофер Т. Браун, Дэвид Бурштейн, Синди Кастель: Анализ пяти полных последовательностей генома членов класса Peribacteria недавно признанного бактериального типа Peregrinibacteria . В: PeerJ 4(8):e1607; январь 2016 г.; doi:10.7717/peerj.1607

[Pori-18] Физелер Л; и др. (2004). «Открытие нового типа-кандидата «порибактерии» в морских губках» . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (6): 3724–32. Бибкод : 2004ApEnM..70.3724F . дои : 10.1128/АЕМ.70.6.3724-3732.2004 . ПМК 427773 . ПМИД 15184179 .

[19] Альбертсен М; и др. (2013). «Последовательности генома редких некультивируемых бактерий, полученные путем объединения нескольких метагеномов с дифференциальным покрытием». Нат. Биотехнология . 31 (6): 533–8. дои : 10.1038/nbt.2579 . ПМИД 23707974 . S2CID 11038964 .

[pace-20] Гугенгольц П; и др. (1998). «Влияние независимых от культуры исследований на формирующийся филогенетический взгляд на бактериальное разнообразие» . Журнал бактериологии . 180 (18): 4765–74. дои : 10.1128/JB.180.18.4765-4774.1998 . ПМЦ 107498 . ПМИД 9733676 .

[21] Марси Ю; и др. (2007). «Рассечение биологической «темной материи» с помощью одноклеточного генетического анализа редких и некультивируемых микробов TM7 изо рта человека» . Proc Natl Acad Sci США . 104 (29): 11889–94. дои : 10.1073/pnas.0704662104 . ЧВК 1924555 . ПМИД 17620602 .

[Tect-22] Уилсон MC; и др. (2014). «Таксон экологических бактерий с большим и своеобразным метаболическим репертуаром» (PDF) . Природа . 506 (7486): 58–62. Бибкод : 2014Natur.506...58W . дои : 10.1038/nature12959 . ПМИД 24476823 .

[23] Дойка М.А.; и др. (2000). «Расширение известного разнообразия и распространения в окружающей среде некультивируемого филогенетического подразделения бактерий» . Прикладная и экологическая микробиология . 66 (4): 1617–21. Бибкод : 2000ApEnM..66.1617D . дои : 10.1128/АЕМ.66.4.1617-1621.2000 . ПМК 92031 . ПМИД 10742250 .

[24] Джон С. Граф, Сина Шорн, Катарина Китцингер, Соерен Ахмеркамп, Кристиан Вёле, Бруно Хюттель, Карстен Дж. Шуберт, Марсель М. М. Кайперс и Яна Милука: Анаэробный эндосимбионт генерирует энергию для инфузорного хозяина путем денитрификации . В: Природа (3 марта 2021 г.). doi:10.1038/s41586-021-03297-6 .

[MattilaEtAl2007-25] Маттила, Дж.Т., Нью-Йорк Буркхардт, Хатчесон Х.Дж., Мундерло У.Г. и Куртти Т.Дж. 2007. Выделение клеточных линий и риккетсиального эндосимбионта из мягкого клеща Carios capensis (Neumann) (Acari: Argasidae: Ornithodorinae). Журнал медицинской энтомологии 44:1091–1101. «Мы предлагаем назвать изолят RCCE3 « Candidatus Rickettsia hoogstraalii» в честь Гарри Хугстраала, который внес большой вклад в наши знания о клещах».

[MA-L&R2015-26] О. Медианников О., Обади-Ладрикс М., Рауль Д. (2015). «Candidatus 'Rickettsia senegalensis' от кошачьих блох в Сенегале» . Новые микробы, новые инфекции . 3 : 24–8. дои : 10.1016/j.nmni.2014.10.005 . ПМЦ 4337942 . ПМИД 25755888 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько названий: список авторов ( ссылка ) : «Мы выделили три штамма риккетсиозов, и генетический анализ показал, что эти штаммы представляют собой вероятный новый вид, условно названный здесь Candidatus Rickettsia senegalensis ».

[27] Тамаки Х; и др. (2010). « Artimonas rosea gen. nov., sp. nov., грамотрицательная, аэробная, хемогетеротрофная бактерия нового бактериального типа, Armatimonadetes phyl. nov., формально называемая типом-кандидатом OP10» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (Часть 6): 1442–7. дои : 10.1099/ijs.0.025643-0 . ПМИД 20622056 .

[28] Ли КСИ; и др. (2010). « Chthonomonascalidirosea gen. nov., sp. nov., аэробный, пигментированный, термофильный микроорганизм нового бактериального класса, Chthonomonadetes classis. nov., недавно описанного типа Armatimonadetes, первоначально обозначенного как кандидат в подразделение OP10» (PDF) . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 61 (Часть 10): 2482–90. дои : 10.1099/ijs.0.027235-0 . ПМИД 21097641 .

[29] Мори К; и др. (2009). « Caldisericum exile gen. nov., sp. nov., анаэробная, термофильная, нитчатая бактерия нового бактериального типа Caldiserica phyl. nov и Caldisericia classis nov ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (Пт 11): 2894–8. дои : 10.1099/ ijs.0.010033-0 ПМИД 19628600 .

[TG1-30] Гейсингер О; и др. (2009). «Ultramicrobacterium Elusimicrobium minutum gen. nov., sp. nov., первый культивируемый представитель термитной группы 1 типа» . Прикладная и экологическая микробиология . 75 (9): 2831–40. Бибкод : 2009ApEnM..75.2831G . дои : 10.1128/АЕМ.02697-08 . ПМЦ 2681718 . ПМИД 19270135 .

[31] Подосокорская О.А.; и др. (2013). «Характеристика Melioribacter roseus gen. nov., sp. nov., новой факультативно анаэробной термофильной целлюлолитической бактерии из класса Ignavibacteria , и предложение нового бактериального типа Ignavibacteriae ». Окружающая среда. Микробиол . 15 (6): 1759–71. дои : 10.1111/1462-2920.12067 . ПМИД 23297868 .

[32] Чо Дж.К.; и др. (2004). « Lentisphaera araneosa gen. nov., sp. nov., прозрачный экзополимер, продуцирующий морские бактерии, и описание нового бактериального типа Lentisphaerae». Экологическая микробиология . 6 (6): 611–21. дои : 10.1111/j.1462-2920.2004.00614.x . ПМИД 15142250 .

[Nitrospina-33] Лакер С; и др. (2013). «Геном Nitrospina gracilis проливает свет на метаболизм и эволюцию основного морского окислителя нитритов» . Передний. Микробиол . 4 : 27. doi : 10.3389/fmicb.2013.00027 . ПМК 3578206 . ПМИД 23439773 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]