МФРД1

МФРД1
Идентификаторы
Псевдонимы	IFRD1 , PC4, TIS7, интерферон-связанный регулятор развития 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 603502 ; МГИ : 1316717 ; Гомологен : 31043 ; GeneCards : IFRD1 ; OMA : IFRD1 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 7 (human)
End	112,481,017 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	40,298,503 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	body of pancreas; ; jejunal mucosa; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; Epithelium of choroid plexus; ; germinal epithelium; ; vena cava; ; amniotic fluid; ; gastric mucosa; ; saphenous vein; ; right lung;
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; granulocyte; ; zygote; ; parotid gland; ; muscle of thigh; ; lip; ; ventricular zone; ; superior cervical ganglion; ; intercostal muscle; ; cumulus cell;
	More reference expression data
	More reference expression data
hideОртологи
	3475
	15982
	ENSG00000006652
	ENSMUSG00000001627
	О00458
	P19182
	НМ_001007245 ; НМ_001197079 ; НМ_001197080 ; НМ_001550
	НМ_013562
	НП_001007246 ; НП_001184008 ; НП_001184009 ; НП_001541
	НП_038590
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Регулятор развития 1, связанный с интерфероном, представляет собой белок , который у человека кодируется IFRD1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Ген экспрессируется в основном в нейтрофилах , скелетных и сердечных мышцах, головном мозге и поджелудочной железе. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Гены-гомологи гена регулятора развития 1, связанного с интерфероном, крысы и мыши (и их белки) также известны под названием PC4. ^{[ 7 ]} и Tis21 соответственно. IFRD1 является членом семейства генов, которое включает второй ген, IFRD2, также известный как SKmc15. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Клиническое значение

IFRD1 был идентифицирован как ген-модификатор заболевания легких муковисцидозом . У человека эффекторная функция нейтрофилов зависит от типа полиморфизма IRFD1, присутствующего у человека. Данные на людях и мышах показывают, что IFRD1 оказывает значительное влияние на патогенез муковисцидоза путем регулирования эффекторной функции нейтрофилов. ^{[ 8 ]}

Стимулятор регенерации мышц

IFRD1 (также известный как PC4 или Tis7, см. выше) участвует в процессе дифференцировки клеток скелетных мышц. Фактически, ингибирование функции IFRD1 в миобластах C2C12 путем трансфекции антисмысловой кДНК IFRD1 или микроинъекции антител против IFRD1 предотвращает их морфологическую и биохимическую дифференцировку путем ингибирования экспрессии MyoD и миогенина , ключевых главных генов развития мышц. ^{[ 9 ]} Роль IFRD1 в дифференцировке мышц наблюдалась также in vivo. В мышцах мышей, лишенных IFRD1, наблюдалось снижение уровня белка и мРНК MyoD и миогенина, а после повреждения мышц у молодых мышей наблюдалась задержка регенерации. ^{[ 10 ]}

Недавно было показано, что активация IFRD1 in vivo в поврежденных мышцах усиливает регенерацию мышц за счет увеличения выработки тычиночных мышечных клеток (клеток-сателлитов). ^{[ 11 ]} Основной молекулярный механизм заключается в способности IFRD1 сотрудничать с MyoD при индукции транскрипционной активности MEF2C . Это зависит от способности IFRD1 избирательно связывать MEF2C, ингибируя тем самым его взаимодействие с HDAC4. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} Таким образом, IFRD1, по-видимому, действует как положительный кофактор MyoD. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} Совсем недавно было показано, что IFRD1 усиливает регенерацию мышц посредством второго механизма, который усиливает MyoD, т.е. путем подавления транскрипционной активности NF-κB, который, как известно, ингибирует накопление мРНК MyoD. IFRD1 подавляет активность NF-κB p65 путем усиления HDAC-опосредованного деацетилирования субъединицы p65, способствуя привлечению HDAC3 к p65. Фактически IFRD1 образует тримолекулярные комплексы с p65 и HDAC3. ^{[ 11 ]}

Таким образом, IFRD1 может вызывать регенерацию мышц, выступая в качестве основного регулятора пути MyoD посредством множества механизмов. Учитывая резкое уменьшение количества миогенных клеток, происходящее при мышечных дегенеративных патологиях, таких как дистрофия Дюшенна, способность IFRD1 потенцировать регенеративный процесс позволяет предположить, что IFRD1 может быть терапевтической мишенью.

Взаимодействия

Было показано, что IFRD1 взаимодействует с несколькими белками комплекса SIN3, включая SIN3B , SAP30 , NCOR1 и HDAC1 . ^{[ 13 ]} Более того, белок IFRD1 связывает MyoD , MEF2C , HDAC4 , HDAC3 и субъединицу p65 NF-κB , образуя тримолекулярные комплексы с белками HDAC3 и p65 NF-κB . ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} Белок IFRD1 также образует гомодимеры. ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000006652 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001627 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Буанне П., Инчерти Б., Гуардаваккаро Д., Аввантаджиато В., Симеоне А., Тироне Ф. (ноябрь 1998 г.). «Клонирование гена человеческого регулятора развития, связанного с интерфероном (IFRD1), кодирующего белок PC4, члена нового семейства генов, регулируемых развитием». Геномика . 51 (2): 233–42. дои : 10.1006/geno.1998.5260 . ПМИД 9722946 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: регулятор развития 1, связанный с интерфероном IFRD1» .
^ Тирон Ф., Шутер EM (март 1989 г.). «Ранняя регуляция генов с помощью фактора роста нервов в клетках PC12: индукция гена, связанного с интерфероном» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 86 (6): 2088–92. Бибкод : 1989PNAS...86.2088T . дои : 10.1073/pnas.86.6.2088 . ПМК 286853 . ПМИД 2467301 .
^ Га Й, Харли ИТ, Хендерсон Л.Б., Аронов Б.Дж., Виетор И, Хубер Л.А., Харли Дж.Б., Килпатрик младший, Лангефельд К.Д., Уильямс А.Х., Джегга А.Г., Чен Дж., Уиллс-Карп М., Аршад Ш., Юарт С.Л., Тио КЛ, Флик Л.М., Филиппи М.Д., Граймс Х.Л., Драмм М.Л., Каттинг Г.Р., Ноулз М.Р., Карп К.Л. (апрель 2009 г.). «Идентификация IFRD1 как гена-модификатора муковисцидоза легких» . Природа . 458 (7241): 1039–42. Бибкод : 2009Natur.458.1039G . дои : 10.1038/nature07811 . ПМК 2841516 . ПМИД 19242412 .
^ Монтаньоли А., Гуардаваккаро Д., Стараче Дж., Тироне Ф. (октябрь 1996 г.). «Сверхэкспрессия раннего раннего гена PC3, индуцируемого фактором роста нервов, связана с ингибированием роста». Рост клеток отличается . 7 (10): 1327–36. ПМИД 8891336 .
^ Вадивелу С.К., Курцбауэр Р., Диплингер Б., Цвайер М., Шафер Р., Верниг А., Виетор И., Хубер Л.А. (апрель 2004 г.). «Дефекты регенерации мышц и миогенной дифференцировки у мышей, лишенных TIS7» . Мол. Клетка. Биол . 24 (8): 3514–25. дои : 10.1128/mcb.24.8.3514-3525.2004 . ПМК 381666 . ПМИД 15060170 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Микели Л., Леонарди Л., Конти Ф., Мареска Г., Колазингари С., Маттеи Е., Лира С.А., Фариоли-Веккьоли С., Карузо М., Тироне Ф. (февраль 2011 г.). «PC4/Tis7/IFRD1 стимулирует регенерацию скелетных мышц и участвует в дифференцировке миобластов в качестве регулятора MyoD и NF-kappaB» . Ж. Биол. Хим . 286 (7): 5691–707. дои : 10.1074/jbc.M110.162842 . ПМК 3037682 . ПМИД 21127072 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Микели Л., Леонарди Л., Конти Ф., Буанне П., Кану Н., Карузо М., Тироне Ф. (март 2005 г.). «PC4 коактивирует MyoD, снимая опосредованное гистондеацетилазой 4 ингибирование фактора 2C энхансера миоцитов» . Мол. Клетка. Биол . 25 (6): 2242–59. дои : 10.1128/MCB.25.6.2242-2259.2005 . ПМЦ 1061592 . ПМИД 15743821 .
^ Виетор И., Вадивелу С.К., Вик Н., Хоффман Р., Коттен М., Зайзер С., Фиалка И., Вундерлих В., Хаасе А., Коринкова Г., Брош Г., Хубер Л.А. (сентябрь 2002 г.). «TIS7 взаимодействует с комплексом гистондеацетилазы SIN3 млекопитающих в эпителиальных клетках» . ЭМБО Дж . 21 (17): 4621–31. дои : 10.1093/emboj/cdf461 . ПМК 125408 . ПМИД 12198164 .

Дальнейшее чтение

Тирон Ф., Шутер ЕМ (1989). «Ранняя регуляция генов с помощью фактора роста нервов в клетках PC12: индукция гена, связанного с интерфероном» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 86 (6): 2088–92. Бибкод : 1989PNAS...86.2088T . дои : 10.1073/pnas.86.6.2088 . ПМК 286853 . ПМИД 2467301 .
Варнум BC, Лим Р.В., Хершман HR (1989). «Характеристика TIS7, гена, индуцируемого в клетках Swiss 3T3 опухолевым промотором тетрадеканоилфорболацетатом». Онкоген . 4 (10): 1263–5. ПМИД 2797820 .
Гуардаваккаро Д., Чиотти М.Т., Шефер Б.В., Монтаньоли А., Тироне Ф. (1995). «Ингибирование дифференцировки миобластов, лишенных родственного интерферону белка PC4». Рост клеток отличается . 6 (2): 159–69. ПМИД 7756174 .
Гуардаваккаро Д., Монтаньоли А., Чиотти М.Т., Гатти А., Лотти Л., Ди Лаццаро С., Торриси М.Р., Тироне Ф. (1994). «Фактор роста нервов регулирует субклеточную локализацию белка PC4, индуцируемого фактором роста нервов, в клетках PC12». Дж. Нейроски. Рез . 37 (5): 660–74. дои : 10.1002/jnr.490370514 . ПМИД 8028043 . S2CID 20845428 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соареш М.Б. (1996). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Ge H, Si Y, Редер Р.Г. (1998). «Выделение кДНК, кодирующих новые коактиваторы транскрипции p52 и p75, раскрывает альтернативный регуляторный механизм активации транскрипции» . ЭМБО Дж . 17 (22): 6723–9. дои : 10.1093/emboj/17.22.6723 . ПМК 1171017 . ПМИД 9822615 .
Вистов Г., Бернштейн С.Л., Вятт М.К., Фарисс Р.Н., Бехал А., Тачман Дж.В., Буффард Г., Смит Д., Петерсон К. (2002). «Анализ выраженных меток последовательности РПЭ/сосудистой оболочки человека для проекта NEIBank: более 6000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Мол. Вис . 8 : 205–20. ПМИД 12107410 .
Виетор И, Вадивелу С.К., Вик Н., Хоффман Р., Коттен М., Зайзер С., Фиалка И., Вундерлих В., Хаазе А., Коринкова Г., Брош Г., Хубер Л.А. (2002). «TIS7 взаимодействует с комплексом деацетилазы гистонов SIN3 млекопитающих в эпителиальных клетках» . ЭМБО Дж . 21 (17): 4621–31. дои : 10.1093/emboj/cdf461 . ПМК 125408 . ПМИД 12198164 .
Рот А., Гилл Р., Серта У (2003). «Временные и пространственные закономерности экспрессии генов после экспериментального инсульта на модели крыс и характеристика PC4, потенциального регулятора транскрипции». Мол. Клетка. Нейроски . 22 (3): 353–64. дои : 10.1016/S1044-7431(02)00039-8 . ПМИД 12691737 . S2CID 2364009 .
Имабаяси Х., Мори Т., Годзё С., Киёно Т., Сугияма Т., Ирие Р., Исогай Т., Хата Дж., Тояма Ю., Умэдзава А. (2003). «Редифференциация дедифференцированных хондроцитов и хондрогенез стромальных клеток костного мозга человека посредством образования хондросфер с профилированием экспрессии с помощью крупномасштабного анализа кДНК». Эксп. Сотовый Res . 288 (1): 35–50. дои : 10.1016/S0014-4827(03)00130-7 . ПМИД 12878157 .
Микели Л., Леонарди Л., Конти Ф., Буанне П., Кану Н., Карузо М., Тироне Ф. (2005). «PC4 коактивирует MyoD, снимая опосредованное гистондеацетилазой 4 ингибирование фактора 2C энхансера миоцитов» . Мол. Клетка. Биол . 25 (6): 2242–59. дои : 10.1128/MCB.25.6.2242-2259.2005 . ПМЦ 1061592 . ПМИД 15743821 .
Виетор И., Курцбауэр Р., Брош Г., Хубер Л.А. (2005). «Регуляция TIS7 остеопонтина (OPN) гена-мишени бета-катенина/Tcf-4 зависит от гистондеацетилазы» . Ж. Биол. Хим . 280 (48): 39795–801. дои : 10.1074/jbc.M509836200 . ПМИД 16204248 .
Го Х, Гао С, Ми З, Чжан Дж, Куо ПК (2007). «Характеристика связывающего домена PC4 и его взаимодействия с HNF4альфа». Дж. Биохим . 141 (5): 635–40. дои : 10.1093/jb/mvm066 . ПМИД 17317687 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000006652 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001627 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9722946-5] Jump up to: ^а ^б ^с Буанне П., Инчерти Б., Гуардаваккаро Д., Аввантаджиато В., Симеоне А., Тироне Ф. (ноябрь 1998 г.). «Клонирование гена человеческого регулятора развития, связанного с интерфероном (IFRD1), кодирующего белок PC4, члена нового семейства генов, регулируемых развитием». Геномика . 51 (2): 233–42. дои : 10.1006/geno.1998.5260 . ПМИД 9722946 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: регулятор развития 1, связанный с интерфероном IFRD1» .

[pmid2467301-7] Тирон Ф., Шутер EM (март 1989 г.). «Ранняя регуляция генов с помощью фактора роста нервов в клетках PC12: индукция гена, связанного с интерфероном» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 86 (6): 2088–92. Бибкод : 1989PNAS...86.2088T . дои : 10.1073/pnas.86.6.2088 . ПМК 286853 . ПМИД 2467301 .

[pmid19242412-8] Га Й, Харли ИТ, Хендерсон Л.Б., Аронов Б.Дж., Виетор И, Хубер Л.А., Харли Дж.Б., Килпатрик младший, Лангефельд К.Д., Уильямс А.Х., Джегга А.Г., Чен Дж., Уиллс-Карп М., Аршад Ш., Юарт С.Л., Тио КЛ, Флик Л.М., Филиппи М.Д., Граймс Х.Л., Драмм М.Л., Каттинг Г.Р., Ноулз М.Р., Карп К.Л. (апрель 2009 г.). «Идентификация IFRD1 как гена-модификатора муковисцидоза легких» . Природа . 458 (7241): 1039–42. Бибкод : 2009Natur.458.1039G . дои : 10.1038/nature07811 . ПМК 2841516 . ПМИД 19242412 .

[pmid8891336-9] Монтаньоли А., Гуардаваккаро Д., Стараче Дж., Тироне Ф. (октябрь 1996 г.). «Сверхэкспрессия раннего раннего гена PC3, индуцируемого фактором роста нервов, связана с ингибированием роста». Рост клеток отличается . 7 (10): 1327–36. ПМИД 8891336 .

[pmid15060170-10] Вадивелу С.К., Курцбауэр Р., Диплингер Б., Цвайер М., Шафер Р., Верниг А., Виетор И., Хубер Л.А. (апрель 2004 г.). «Дефекты регенерации мышц и миогенной дифференцировки у мышей, лишенных TIS7» . Мол. Клетка. Биол . 24 (8): 3514–25. дои : 10.1128/mcb.24.8.3514-3525.2004 . ПМК 381666 . ПМИД 15060170 .

[pmid21127072-11] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Микели Л., Леонарди Л., Конти Ф., Мареска Г., Колазингари С., Маттеи Е., Лира С.А., Фариоли-Веккьоли С., Карузо М., Тироне Ф. (февраль 2011 г.). «PC4/Tis7/IFRD1 стимулирует регенерацию скелетных мышц и участвует в дифференцировке миобластов в качестве регулятора MyoD и NF-kappaB» . Ж. Биол. Хим . 286 (7): 5691–707. дои : 10.1074/jbc.M110.162842 . ПМК 3037682 . ПМИД 21127072 .

[pmid15743821-12] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Микели Л., Леонарди Л., Конти Ф., Буанне П., Кану Н., Карузо М., Тироне Ф. (март 2005 г.). «PC4 коактивирует MyoD, снимая опосредованное гистондеацетилазой 4 ингибирование фактора 2C энхансера миоцитов» . Мол. Клетка. Биол . 25 (6): 2242–59. дои : 10.1128/MCB.25.6.2242-2259.2005 . ПМЦ 1061592 . ПМИД 15743821 .

[pmid12198164-13] Виетор И., Вадивелу С.К., Вик Н., Хоффман Р., Коттен М., Зайзер С., Фиалка И., Вундерлих В., Хаасе А., Коринкова Г., Брош Г., Хубер Л.А. (сентябрь 2002 г.). «TIS7 взаимодействует с комплексом гистондеацетилазы SIN3 млекопитающих в эпителиальных клетках» . ЭМБО Дж . 21 (17): 4621–31. дои : 10.1093/emboj/cdf461 . ПМК 125408 . ПМИД 12198164 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]