Стрептобактерии moniliformis
Стрептобактерии moniliformis | |
---|---|
Стрептобактерии moniliformis | |
Научная классификация | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Фузобактериота |
Сорт: | Фузобактерии |
Заказ: | Фузобактериалы |
Семья: | Лептотриховые |
Род: | стрептобактерии |
Разновидность: | С. moniliformis
|
Биномиальное имя | |
Стрептобактерии moniliformis |
Streptobacillus moniliformis — неподвижная грамотрицательная палочковидная бактерия , принадлежащая к семейству Leptotrichiaceae . [ 2 ] Геном собой представляет S. moniliformis одну из двух завершенных последовательностей порядка Fusobacteriales . [ 3 ]
Этимология
[ редактировать ]Название его рода происходит от древнегреческого слова στρεπτός: streptós, означающего «изогнутый» или «скрученный», и латинского слова bacillus, означающего «маленький стержень». Видовое название moniliformis означает «ожерелье». [ 4 ] S. moniliformis является микроаэрофилом , которому требуется меньше кислорода , чем содержится в атмосфере . для роста [ 5 ]
Фон
[ редактировать ]История
[ редактировать ]S. moniliformis был впервые выделен от укушенного крысой человека в 1914 году немецким микробиологом Х. Шоттмюллером, который описал его как Streptothrix muris ratti . [ 6 ] В 1916 году в США было установлено, что S. moniliformis является возбудителем лихорадки, вызванной укусами крыс . [ 7 ]
Микробиология
[ редактировать ]Некоторые изоляты S. moniliformis были собраны из верхних дыхательных путей домашних и диких крыс . [ 8 ] два известных варианта S. moniliformis Идентифицированы . Бактериальный тип – патогенный . [ 5 ] Напротив, спонтанно возникающая L-форма, у которой отсутствует клеточная стенка и чьи колонии растут в форме «жареного яйца», непатогенна. [ 5 ]
Морфология
[ редактировать ]Бактерия S. moniliformis представляет собой грамотрицательную плеоморфную палочку, часто встречающуюся в виде цепочек и спутанных нитей с луковицеобразными или монилиоподобными вздутиями. Фенотипически микроорганизм представляет собой факультативно анаэробный, неподвижный, слабо ферментирующий глюкозу и мальтозу, каталазо- и оксидазо-отрицательный, не восстанавливающий нитраты и не проявляющий роста на агаре МакКонки. Морфологически колонии S. moniliformis имеют размер 1–2 мм, гладкие, выпуклые, негемолитические (нередка вариабельная картина с α-гемолизом), серого цвета. При культивировании в бульоне наблюдается типичный вид «слоеного шарика». [ 9 ]
Таксономия
[ редактировать ]Streptobacillus moniliformis ранее относили к семейству Fusobacteriaceae . [ 10 ] Позже он был перегруппирован с тремя другими родами : Sebaldella , Sneathia и Leptotrichia . [ 2 ] [ 3 ] [ 11 ] Эти четыре рода были отнесены к семейству Leptotrichiaceae после сравнительного анализа 16S рибосомальной РНК. последовательностей генов [ 12 ] и последовательности 16S-23S рДНК внутренние транскрибируемые спейсерные среди представителей типа Fusobacteria. [ 11 ] Идентификация консервативных сигнатурных инделей, уникальных для Fusobacteria и ее первичных клад, а также филогенетический анализ членов Fusobacteria на основе конкатенированных последовательностей 17 консервативных белков еще раз подтверждают различие между двумя семействами. [ 11 ]
S. moniliformis ранее считался единственным представителем рода Streptobacillus . [ 2 ] Однако Streptobacillus штаммы HKU33T и HKU34 были выделены в Гонконге в сентябре 2014 года. [ 2 ] Стрептобактерии HKU33T обнаружены в гное , выделенном из абсцесса 38-летнего больного ангиной , и HKU34 в жидкости локтевого сустава 64-летнего больного септическим артритом . [ 2 ] После анализа последовательностей генов 16S рРНК, обнаруженных у представителей Leptotrichiaceae, и частичных последовательностей генов Rec A , gro El и gyr B, присутствующих в обоих изолятах, два штамма были таксономически сгруппированы в новый вид Streptobacillus hongkongensis sp. ноябрь [ 2 ]
Геномика
[ редактировать ]Министерства энергетики США Объединенный институт генома (DOE JGI) секвенировал полный геном S. moniliformis DSM 12112. [ 3 ] Он состоит из одной кольцевой хромосомы , состоящей из 1 673 280 пар оснований , как это определено с помощью комбинации секвенирования Сэнгера и 454 . [ 3 ] Мольный процент гуанина кодирующих белок и цитозина в ДНК составляет 26,3% при 1511 генах, , из 1566 предсказанных генов. [ 3 ] Эти низкие значения G+C ранее наблюдались только у представителей отряда Mycoplasmatales, который включает род Mycoplasma , что указывает на родство между Mycoplasma и S. moniliformis . [ 3 ] [ 13 ] Однако анализ гена 16S рРНК показал, что эта связь неверна. [ 12 ] S. moniliformis также имеет одну кольцевую плазмиду pSMON01 длиной 10 702 пары оснований с 1511 генами, кодирующими белок. [ 3 ]
Изоляция и идентификация
[ редактировать ]Привередливая природа Streptobacillus moniliformis затрудняет культивирование, а в текущих опубликованных рекомендациях говорится, что для роста требуется среда с добавлением 20% сыворотки, асцитической жидкости или цельной крови. В многочисленных опубликованных отчетах также утверждается, что микроорганизм подавляется полианионным детергентом полианетолсульфонатом натрия (торговое название SPS; Liquoid; Hoffman-La Roche, Inc., Натли, Нью-Джерси), основным антикоагулянтом в современных коммерчески доступных флаконах для посева крови, используемом в автоматизированных инструментах непрерывного культивирования крови. [ 9 ]
Оптимизация наилучших шансов на выздоровление организма должна включать асептический сбор крови или стерильных жидкостей организма в коммерческие флаконы для гемокультуры (с документированием количества крови, взятой у пациента, если применимо) во время острой фазы инфекции и сбор в двух экземплярах с оптимальными условиями. объемы инокуляции для выделения и роста S. moniliformis составляют 10 мл для пациентов от подросткового до взрослого возраста. В педиатрической популяции следует экстраполировать 4–5 мл. Бутылки следует инкубировать минимум в течение 7 дней, чтобы обеспечить наилучшие шансы на выздоровление организма при работе с низким уровнем бактериемии. Если к 7-му дню они еще не обнаружены, их следует провести слепой субкультив, чтобы исключить ложноотрицательный результат посева крови. Данные о росте и флуоресцентном обнаружении, полученные с помощью автоматизированного оборудования для непрерывного культивирования крови, следует проверять вручную в ходе инкубации, чтобы исключить пропущенные ложноотрицательные образцы. [ 9 ]
Как только в бутылке появляются признаки роста и обнаружения микроорганизмов, следует провести окраску по Граму с последующим инокуляцией крови на агар с кроличьей или овечьей кровью и бульон с мозговым сердцем и инкубировать в аэробных условиях при 35 °C, 35–37 °C или 5% Обогащенная CO 2 (микроаэрофильная) среда в течение минимум 3–4 дней. [ 9 ]
Хотя сообщалось, что микроорганизм подавляется определенными добавками для культуры крови, в частности SPS, в клинической лаборатории, текущие исследования предложили методы преодоления этого ограничения с помощью «100% культуры и показателей успешного роста». По словам Шевца и др., их исследование «сообщаемой» привередливой природы S. moniliformis и ее ингибирования антикоагулянтом SPS показало, что при использовании определенного объема крови для инокулята это приводило к 100% выздоровлению и успешному росту. этого организма и, по-видимому, преодолел запреты и ограничения, которые исторически наблюдались при использовании SPS для культивирования крови и выделения S. moniliformis в клинических условиях. [ 9 ]
Актуальность
[ редактировать ]Лихорадка от укуса крысы и лихорадка Хаверхилла.
[ редактировать ]В США лихорадка от укуса крысы в первую очередь вызвана передачей S. moniliformis через укус крысы. [ 14 ] Однако примерно 30% пациентов с диагнозом крысиной лихорадки не помнят, что их царапало или кусало инфицированное животное. [ 8 ] [ 15 ] Также известно, что передача бактерии происходит при употреблении зараженной воды, тесном контакте с крысами или обращении с ними. [ 14 ] [ 16 ] Лихорадка Хаверхилла , названная в честь вспышки болезни в 1926 году в Хаверхилле, штат Массачусетс , представляет собой форму лихорадки от укуса крысы, которая может возникнуть в результате употребления в пищу продуктов, зараженных S. moniliformis . [ 5 ] В 1986 году в школе-интернате в Великобритании была зарегистрирована еще одна вспышка лихорадки Хаверхилла. Сообщается, что пострадали около 304 человек. [ 17 ] Предполагалось, что заражение произошло в результате употребления непастеризованного молока или воды, загрязненной крысиными фекалиями. [ 18 ] Инфицированные люди описали симптомы, включая внезапное развитие рвоты, сильную головную боль и холодный пот с высокой температурой. [ 18 ] Паркер и Хадсон впервые выделили причину этой вспышки, которую они назвали Haverhilia multiformis . [ 15 ] этот организм был сопоставлен с S. moniliformis . Позже после дальнейших исследований [ 19 ]
Симптомы укусной лихорадки включают резкое начало лихорадки с температурой от 38°C до 41°C. [ 5 ] появляется сыпь Примерно у 75% инфицированных людей в дополнение к кровоизлияниям везикул . [ 14 ] Как сыпь, так и везикулы обычно располагаются на руках и ногах, хотя известно, что сыпь распространяется и на другие части тела. [ 10 ]
Микроаэрофильная природа S. moniliformis затрудняет идентификацию. [ 5 ] ПЦР- тестирование все чаще используется для его идентификации. [ 19 ] в нелеченых случаях по-прежнему составляет 13% Тем не менее, уровень смертности . [ 16 ] Лица с ослабленным иммунитетом , например ВИЧ -инфицированные, подвергаются большему риску смерти от этого заболевания. [ 20 ] Персонал лабораторий и работники зоомагазинов, которые ежедневно работают в тесном контакте с животными, также подвергаются повышенному риску заражения. [ 5 ]
Хотя считается, что S. moniliformis является частью комменсальных бактерий дыхательных путей крыс, [ 13 ] у крыс иногда проявлялись признаки заболевания. [ 5 ] Антибиотики, используемые для лечения инфекции, могут вызывать образование L-формы, которая персистирует в организме, хотя эта форма не является патогенной. [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Левадити, К.; Николау, С.; Пуанклу, П. (1925). «Об этиологической роли Streptobacillus moniliformis (нов. вид) в острой септической мультиформной эритеме». Еженедельные отчеты сессий Академии наук . 180 . Париж: 1188–1190.
- ^ Jump up to: а б с д и ж Ву, Патрик (2014). « Streptobacillus hongkongensis sp. nov., выделенный от пациентов с ангиной и септическим артритом, и дополненные описания рода Streptobacillus и Streptobacillus moniliformis » . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 64 (Часть 9): 3034–3039. дои : 10.1099/ijs.0.061242-0 . ПМИД 24912824 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Нолан, М.; Гронов, С.; Лапидус, А.; Иванова Н.; Коупленд, А.; Лукас, С.; Главина Дель Рио, Т.; Чен, Ф.; Тайс, Х.; и др. (2009). «Полная последовательность генома штамма Streptobacillus monoiliformis (9901T)» . Стандарты в геномных науках . 1 (3): 300–307. дои : 10.4056/sig.48727 . ISSN 1944-3277 . ПМК 3035246 . ПМИД 21304670 .
- ^ Скерман, ВБД; Макгоуэн, В.; Снит, PHA (1989). Утвержденные списки названий бактерий (с поправками) . Вашингтон, округ Колумбия: ASM Press. ISBN 978-1-55581-014-6 . ПМИД 20806452 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я Эллиот, Шон П. (2007). «Лихорадка от укуса крысы и Streptobacillus moniliformis » . Обзоры клинической микробиологии . 20 (1): 13–22. дои : 10.1128/CMR.00016-06 . ПМК 1797630 . ПМИД 17223620 .
- ^ Хагельскьяер, Лена; Соренсен, Ингер; Рандерс, Эльза (1998). « Инфекция Streptobacillus moniliformis : 2 случая и обзор литературы». Скандинавский журнал инфекционных заболеваний . 30 (3): 309–311. дои : 10.1080/00365549850161016 . ПМИД 9790145 .
- ^ Блейк, Ф.Г. (январь 1916 г.). «Этиология крысиной лихорадки» . Журнал экспериментальной медицины . 23 (1): 39–60. дои : 10.1084/jem.23.1.39 . ПМК 2125348 . ПМИД 19867970 .
- ^ Jump up to: а б Купман, JP; Бринк Ван Ден, Мэн; Венникс, PPCA; Кайперс, В.; Бут, Р.; Баккер, Р.Х. (1991). «Выделение Streptobacillus moniliformis из среднего уха крыс» . Лабораторные животные . 25 (1): 35–39. дои : 10.1258/002367791780808211 . ПМИД 1826334 .
- ^ Jump up to: а б с д и Шевц, AM; Белл, Мэн; Келли, Эй Джей; Хамригхаус, BW; МакКистон-младший (ноябрь 2021 г.). «Использование автоматизированной системы непрерывного культивирования крови BDFX40 для выделения и выделения Streptobacillus moniliformis в присутствии 0,05% SPS: 55-летнее ретроспективное исследование с 56 штаммами» . Лабораторная медицина . 52 (6): 536–549. дои : 10.1093/labmed/lmab009 . ПМИД 33693831 .
- ^ Jump up to: а б Гаастра, Вим; Бут, Рон; Хо, ТК; Липман, Лен Дж.А. (2009). «Крысиная лихорадка». Ветеринария . 133 (3): 211–228. дои : 10.1016/j.vetmic.2008.09.079 . ПМИД 19008054 .
- ^ Jump up to: а б с Гупта, Рэдхи С.; Сети, Мохит (август 2014 г.). «Филогения и молекулярные признаки типа Fusobacteria и его отдельных субкладов». Анаэроб . 28 : 182–198. дои : 10.1016/j.anaerobe.2014.06.007 . ПМИД 24969840 .
- ^ Jump up to: а б Стейли, Джеймс Т.; Уитмен, Уильям Б.; Криг, Ноэль Р.; Браун, Дэниел Р.; Хедлунд, Брайан П.; Пастер, Брюс Дж.; Уорд, Наоми Л.; Людвиг, Вольфганг (24 ноября 2010 г.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том 4 (2-е изд.). Спрингер. п. 789. ИСБН 978-0-387-95042-6 .
- ^ Jump up to: а б Вулленвебер, Майкл (1995). « Streptobacillus moniliformis – зоонозный возбудитель. Таксономические соображения, виды-хозяева, диагностика, терапия, географическое распространение» . Лабораторные животные . 29 (1): 1–15. дои : 10.1258/002367795780740375 . ПМИД 7707673 .
- ^ Jump up to: а б с Каннингем, BB; Паллер, А.С.; Кац, Б.З. (1998). «Крысиная лихорадка у любителя домашних животных». Журнал Американской академии дерматологии . 38 (2, часть 2): 330–332. дои : 10.1016/s0190-9622(98)70576-6 . ПМИД 9486709 .
- ^ Jump up to: а б Паркер, Р.Х. (1989). «Крысиная лихорадка». В Хёприхе, PD; Джордан, MC (ред.). Инфекционные болезни: современный трактат об инфекционных процессах (4-е изд.). Филадельфия: Липпинкотт. стр. 1310–1312. ISBN 0397508514 .
- ^ Jump up to: а б Гласман, Питер Джеймс; Турайсингам, Адриан (2009). «Лихорадка от крысиных укусов: неправильное название?» . Отчеты о случаях BMJ . 25 (2): 268–272. дои : 10.1136/bcr.04.2009.1795 . ПМЦ 265881 . ПМИД 3029161 .
- ^ Пилсворт, Р. (1983). «Лихорадка Хаверхилла». Ланцет . 2 (8345): 336–337. дои : 10.1016/s0140-6736(83)90308-2 . ПМИД 6135846 . S2CID 40022613 .
- ^ Jump up to: а б Шансон, округ Колумбия; Мидгли, Дж.; Газзард, Б.Г.; Дикси, Дж. (1983). « Streptobacillus moniliformis, выделенный из крови в четырех случаях лихорадки Хаверхилла – первая вспышка в Великобритании». Ланцет . 2 (8341): 92–94. дои : 10.1016/S0140-6736(83)90072-7 . ПМИД 6134972 . S2CID 38354599 .
- ^ Jump up to: а б Бут, Р.; Баккер, Р.Х.; Туис, Ш.; Винема, JL; ДеХу, Х. (1993). «Имуноферментный анализ (ИФА) для мониторинга колоний грызунов на антитела к S. moniliformis » . Лабораторные животные . 27 (4): 350–357. дои : 10.1258/002367793780745516 . ПМИД 8277708 .
- ^ Рордорф, Т.; Цугер, К.; Збинден, Р. (2000). « Эндокардит Streptobacillus moniliformis у ВИЧ-положительного пациента». Инфекция . 28 (6): 393–394. дои : 10.1007/s150100070012 . ПМИД 11139161 . S2CID 41626361 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Объединенный институт генома Министерства энергетики США S. moniliformis Портал генома
- KEGG (Киотская энциклопедия генов и геномов) S. moniliformis Информация о геноме
- Филогенетическое соседство S. moniliformis
- Типовой штамм Streptobacillus moniliformis в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию