Фервидобактерия островикум

Фервидобактерия островикум
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Термотогота
Сорт:	Термотоги
Заказ:	Термотогалес
Семья:	Термотоговые
Род:	Фервидобактерия
Разновидность:	Ф. Исландский
Биномиальное имя
	Фервидобактерия островикум ; Хубер и др. 1991 год

Fervidobacterium Islandicum — вид чрезвычайно термофильных анаэробных бактерий, впервые выделенных из исландского горячего источника.

Биология и биохимия

Морфология

F. Islandicum Клетки представляют собой грамотрицательные подвижные палочки длиной около 1,8 мкм и шириной 0,6 мкм, встречающиеся поодиночке или парами. ^{[ 1 ]} Около 50% клеток образуют на одном конце большие сфероиды, известные как «тога», обычно встречающиеся у представителей типа Thermotogota (ранее Thermotogae ). ^{[ 2 ]}

Физиология

F. Islandicum Изолят H21 растет в диапазоне pH от 6,0 до 8,0 с оптимумом около 7,2. ^{[ 1 ]} Рост наблюдается в диапазоне температур от 40°C до 80°C, оптимум составляет 70°C. ^{[ 3 ]} При температуре 65 °C время удвоения штамма H21 составляет 150 минут. ^{[ 1 ]}

Рост культуры

Для роста изолята H21 требуется небольшое количество (0,3%) дрожжевого экстракта . Когда он используется в качестве единственного источника углерода и энергии, конечная концентрация клеток составляет 1x10. ⁷ клеток/мл. ^{[ 1 ]} Рост сильно усиливается при добавлении 0,2% пирувата , рибозы , глюкозы , мальтозы , раффинозы , крахмала и, что менее эффективно, целлюлозы . Конечная концентрация клеток с этими добавками может варьироваться от 2 до 5x10. ⁸. ^{[ 1 ]} В присутствии глюкозы F. Islandicum производит следующие конечные продукты: L(+) лактат , ацетат , этанол , H ₂ и CO ₂ . ^{[ 1 ]} Изолят Н21 проявляет чувствительность к обычным антибиотикам, его рост ингибируется добавлением ванкомицина , стрептомицина , ампициллина , хлорамфеникола и рифампицина на 10%. $\mu$ г/мл. ^{[ 1 ]}

Геномика

Штамм F. Islandicum AW-1 имеет общий размер генома 2,4 миллиона пар оснований , что немного больше, чем геномы других штаммов Fervidobacterium . ^{[ 3 ]} Он имеет содержание G + C 40,7%. ^{[ 3 ]} Он содержит 2184 гена, кодирующих белок , всего 2248 генов. ^{[ 3 ]}

Среда

F. Islandicum первоначально был выделен из исландского горячего источника на берегу реки Варма недалеко от Хверагера. $\eth$ я , Исландия. Анаэробные . пробы были взяты из горячих вод и илов ^{[ 1 ]} Здесь температура составляла от 70 °C до 102 °C, а pH — от 1,5 до 9. ^{[ 1 ]}

Биотехнологические приложения

F. Islandicum AW-1 способен к полной деградации перьев при температуре 70 °C и pH 7. ^{[ 4 ]} Кератин перьев имеет очень высокое содержание цистеина, что делает его очень жестким и трудно перевариваемым. ^{[ 5 ]} Ежегодно птицеводство производит 5 миллионов тонн куриных перьев, что делает куриные перья серьезной проблемой твердых отходов. ^{[ 4 ]} Таким образом, способность F. Islandicum разрушать местные куриные перья очень привлекательна. ^{[ нужна ссылка ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я Хубер, Роберт; Вёзе, Карл Р.; Лэнгуорси, Томас А.; Кристьянссон, Якоб К.; Стеттер, Карл О. (1990). «Fervidobacterium Islandicum sp. nov., новая чрезвычайно термофильная эубактерия, принадлежащая к семейству «Thermotogales?». Архив микробиологии . 154 (2): 105–111. дои : 10.1007/BF00423318 . ISSN 0302-8933 . S2CID 40470196 .
^ Бхандари, Вайбхав; Гупта, Рэдхи С. (2014), Розенберг, Юджин; Делонг, Эдвард Ф.; Лори, Стивен; Штакебрандт, Эрко (ред.), «Тип Thermotogae» , «Прокариоты: другие основные линии бактерий и архей» , Берлин, Гейдельберг: Springer, стр. 989–1015, doi : 10.1007/978-3-642-38954- 2_118 , ISBN 978-3-642-38954-2 , получено 11 октября 2021 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Ли, Ён Джик; Чон, Хэён; Пак, Гун-Сок; Квак, Юнён; Ли, Сан-Дже; Ли, Сан Джун; Пак, Мин-Кю; Ким, Джи Ён; Кан, Хван Ку; Шин, Джэ-Хо; Ли, Дон Ву (декабрь 2015 г.). «Последовательность генома чрезвычайно термофильной Eubacterium, Fervidobacterium Islandicum AW-1, разлагающей нативные перья» . Стандарты в геномных науках . 10 (1): 71. дои : 10.1186/s40793-015-0063-4 . ISSN 1944-3277 . ПМЦ 4587914 . ПМИД 26421103 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Нам, Гэ-Вон; Ли, Дон Ву; Ли, Хан-Сын; Ли, Нам-Джу; Ким, Бён Чан; Чхве, Ын-А; Хван, Джэ-Кван; Сухартоно, Мэгги; Пюн, Ю-Рян (01 декабря 2002 г.). «Разрушение нативного пера под действием Fervidobacterium Islandicum AW-1, недавно выделенного термофильного анаэроба, продуцирующего кератиназу» . Архив микробиологии . 178 (6): 538–547. дои : 10.1007/s00203-002-0489-0 . ISSN 0302-8933 . ПМИД 12420177 . S2CID 39043722 .
^ Грегг, Кейт; Роджерс, Джордж Э. (1986), Берейтер-Хан, Юрген; Матольцы, А. Гедеон; Ричардс, К. Сильвия (ред.), «Кератин перьев: состав, структура и биогенез» , Биология покровов , Берлин, Гейдельберг: Springer Berlin Heidelberg, стр. 666–694, номер документа : 10.1007/978-3-662- 00989-5_33 , ISBN 978-3-662-00991-8 , получено 11 октября 2021 г.

Дальнейшее чтение

Раво, Жиль и др. «Производство L-аланина в результате ферментации глюкозы гипертермофильными представителями доменов бактерий и архей: остаток наследственного метаболизма?». Прикладная и экологическая микробиология 62.7 (1996): 2657-2659.
Дворкин, Мартин и Стэнли Фалькоу, ред. Прокариоты: Том. 7: Протеобактерии: подклассы Дельта и Эпсилон. Глубоко укореняющиеся бактерии. Том. 7. Спрингер, 2006.
Гёдде Дж., Сам К., Браунс С.Дж., Клускенс Л.Д., ван дер Оост Дж., де Вос В.М. и др. (2005). «Клонирование и экспрессия островизина, нового термостабильного субтилизина из Fervidobacterium Islandicum, в Escherichia coli» . Appl Environ Microbiol . 71 (7): 3951–8. дои : 10.1128/АЕМ.71.7.3951-3958.2005 . ПМК 1168981 . ПМИД 16000809 .
Нам Г.В., Ли Д.В., Ли Х.С., Ли Н.Дж., Ким Б.С., Чой Э.А. и др. (2002). «Разрушение нативного пера под действием Fervidobacterium Islandicum AW-1, недавно выделенного термофильного анаэроба, продуцирующего кератиназу». Арка Микробиол . 178 (6): 538–47. дои : 10.1007/s00203-002-0489-0 . ПМИД 12420177 . S2CID 39043722 .
Джаббур, Дина; Клиппель, Барбара; Антраникян, Гарабед (2011). «Новая термостабильная и толерантная к глюкозе β-глюкозидаза из Fervidobacterium Islandicum». Прикладная микробиология и биотехнология . 93 (5): 1947–1956. дои : 10.1007/s00253-011-3406-0 . ISSN 0175-7598 . ПМИД 22146852 . S2CID 18254613 .
де ла Тур, Клэр Бутье; Портемер, Кристиана; Фортерре, Патрик; Хубер, Роберт; Дюге, Мишель (1993). «АТФ-независимая ДНК-топоизомераза Fervidobacterium Islandicum». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1216 (2): 213–220. дои : 10.1016/0167-4781(93)90147-6 . ISSN 0167-4781 . ПМИД 8241262 .

Внешние ссылки

[HuberWoese1990-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я Хубер, Роберт; Вёзе, Карл Р.; Лэнгуорси, Томас А.; Кристьянссон, Якоб К.; Стеттер, Карл О. (1990). «Fervidobacterium Islandicum sp. nov., новая чрезвычайно термофильная эубактерия, принадлежащая к семейству «Thermotogales?». Архив микробиологии . 154 (2): 105–111. дои : 10.1007/BF00423318 . ISSN 0302-8933 . S2CID 40470196 .

[2] Бхандари, Вайбхав; Гупта, Рэдхи С. (2014), Розенберг, Юджин; Делонг, Эдвард Ф.; Лори, Стивен; Штакебрандт, Эрко (ред.), «Тип Thermotogae» , «Прокариоты: другие основные линии бактерий и архей» , Берлин, Гейдельберг: Springer, стр. 989–1015, doi : 10.1007/978-3-642-38954- 2_118 , ISBN 978-3-642-38954-2 , получено 11 октября 2021 г.

[:0-3] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Ли, Ён Джик; Чон, Хэён; Пак, Гун-Сок; Квак, Юнён; Ли, Сан-Дже; Ли, Сан Джун; Пак, Мин-Кю; Ким, Джи Ён; Кан, Хван Ку; Шин, Джэ-Хо; Ли, Дон Ву (декабрь 2015 г.). «Последовательность генома чрезвычайно термофильной Eubacterium, Fervidobacterium Islandicum AW-1, разлагающей нативные перья» . Стандарты в геномных науках . 10 (1): 71. дои : 10.1186/s40793-015-0063-4 . ISSN 1944-3277 . ПМЦ 4587914 . ПМИД 26421103 .

[:1-4] Перейти обратно: ^а ^б Нам, Гэ-Вон; Ли, Дон Ву; Ли, Хан-Сын; Ли, Нам-Джу; Ким, Бён Чан; Чхве, Ын-А; Хван, Джэ-Кван; Сухартоно, Мэгги; Пюн, Ю-Рян (01 декабря 2002 г.). «Разрушение нативного пера под действием Fervidobacterium Islandicum AW-1, недавно выделенного термофильного анаэроба, продуцирующего кератиназу» . Архив микробиологии . 178 (6): 538–547. дои : 10.1007/s00203-002-0489-0 . ISSN 0302-8933 . ПМИД 12420177 . S2CID 39043722 .

[5] Грегг, Кейт; Роджерс, Джордж Э. (1986), Берейтер-Хан, Юрген; Матольцы, А. Гедеон; Ричардс, К. Сильвия (ред.), «Кератин перьев: состав, структура и биогенез» , Биология покровов , Берлин, Гейдельберг: Springer Berlin Heidelberg, стр. 666–694, номер документа : 10.1007/978-3-662- 00989-5_33 , ISBN 978-3-662-00991-8 , получено 11 октября 2021 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]