ПТРФ

КАВИН1
Идентификаторы
Псевдонимы	CAVIN1 , CAVIN, CGL4, cavin-1, FKSG13, PTRF, полимераза I и фактор высвобождения транскрипта, белок 1, связанный с кавеолами
Внешние идентификаторы	Опустить : 603198 ; МГИ : 1277968 ; Гомологен : 7499 ; Генные карты : CAVIN1 ; OMA : CAVIN1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	42,423,256 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	100,861,713 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right coronary artery; ; tendon of biceps brachii; ; popliteal artery; ; tibial arteries; ; Descending thoracic aorta; ; saphenous vein; ; ascending aorta; ; left coronary artery; ; body of uterus; ; gastric mucosa;
	Top expressed in
	lactiferous gland; ; ascending aorta; ; aortic valve; ; belly cord; ; white adipose tissue; ; ankle joint; ; gastrula; ; subcutaneous adipose tissue; ; plantaris muscle; ; tunica media of zone of aorta;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	rRNA binding; rRNA primary transcript binding; protein binding; RNA binding; identical protein binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; membrane; nucleoplasm; endoplasmic reticulum; mitochondrion; caveola; membrane raft; nucleus; plasma membrane; intracellular membrane-bounded organelle; protein-containing complex;
Biological process	termination of RNA polymerase I transcription; regulation of transcription, DNA-templated; transcription initiation from RNA polymerase I promoter; DNA-templated transcription, termination; transcription, DNA-templated; rRNA transcription; positive regulation of cell motility; protein secretion;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	284119
	19285
	ENSG00000177469
	ENSMUSG00000004044
	Q6NZI2
	О54724
	НМ_012232
	НМ_008986 ; НМ_001359105 ; НМ_027160
	НП_036364
	НП_033012 ; НП_001346034
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Полимераза I и фактор высвобождения транскрипта , также известный как Cavin1 , Cavin-1 или PTRF , представляет собой белок , который у человека кодируется PTRF геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Было показано, что PTRF (Cavin1) имеет решающее значение для формирования и функционирования кавеол . ^{[ 7 ]} Деформация кавеол способствует перемещению кавина-1 из кавеол в ядро. ^{[ 8 ]}

Терминация РНК-полимеразой I, , катализируемой транскрипции представляет собой двухэтапный процесс, который включает приостановку элонгации транскрипции и высвобождение как прерибосомальной РНК , так и Pol I из матрицы ДНК . Пауза опосредована TTF1 и PTRF. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

PTRF представляет собой растворимый белок, содержащий предполагаемую лейциновую застежку , сигнал ядерной локализации и PEST домены . ^{[ 11 ]}

Взаимодействия

PTRF (Cavin1) образует тримеры с Cavin2 и Cavin3 при формировании кавеолы и, как было показано, взаимодействует с другими белками, ассоциированными с мембраной, такими как EHD2 и кавеолины . ^{[ 12 ]}

Было показано, что PTRF взаимодействует с ZNF148 . ^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000177469 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004044 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: PTRF-полимераза I и фактор высвобождения транскрипта» .
^ «Отчет о символах CAVIN1 | Комитет по генной номенклатуре HUGO» . www.gennamemes.org . Проверено 30 мая 2017 г.
^ Хилл М.М., Бастиани М., Лютерфорст Р., Киркхэм М., Киркхэм А., Никсон С.Дж. и др. (январь 2008 г.). «PTRF-Cavin, консервативный цитоплазматический белок, необходимый для формирования и функционирования кавеолы» . Клетка . 132 (1): 113–124. дои : 10.1016/j.cell.2007.11.042 . ПМК 2265257 . ПМИД 18191225 .
^ Кифти А., Баладжи С., Скарлата С. (июнь 2022 г.). «Деформация кавеол влияет на глобальные процессы транскрипции и трансляции посредством перемещения кавина-1» . Журнал биологической химии . 298 (6): 102005. doi : 10.1016/j.jbc.2022.102005 . ПМЦ 9168624 . ПМИД 35513070 .
^ Мейсон С.В., Сандер Э.Э., Груммт I (январь 1997 г.). «Идентификация активности высвобождения транскрипта, действующего на тройные транскрипционные комплексы, содержащие мышиную РНК-полимеразу I» . Журнал ЭМБО . 16 (1): 163–172. дои : 10.1093/emboj/16.1.163 . ПМЦ 1169623 . ПМИД 9009277 .
^ Янса П., Мейсон С.В., Хоффманн-Рорер У., Груммт I (май 1998 г.). «Клонирование и функциональная характеристика PTRF, нового белка, который индуцирует диссоциацию приостановленных тройных транскрипционных комплексов» . Журнал ЭМБО . 17 (10): 2855–2864. дои : 10.1093/emboj/17.10.2855 . ПМК 1170626 . ПМИД 9582279 .
^ Абулайх Н., Вайнонен Дж.П., Стролфорс П., Венер А.В. (октябрь 2004 г.). «Векторная протеомика выявляет нацеливание, фосфорилирование и специфическую фрагментацию полимеразы I и фактора высвобождения транскрипта (PTRF) на поверхности кавеол в адипоцитах человека» . Биохимический журнал . 383 (Часть 2): 237–248. дои : 10.1042/BJ20040647 . ПМК 1134064 . ПМИД 15242332 .
^ Ковтун О., Тиллу В.А., Ариотти Н., Партон Р.Г., Коллинз Б.М. (апрель 2015 г.). «Белки семейства кавинов и сборка кавеол» . Журнал клеточной науки . 128 (7): 1269–1278. дои : 10.1242/jcs.167866 . ПМЦ 4379724 . ПМИД 25829513 .
^ Хасэгава Т., Такеучи А., Мияиси О., Сяо Х., Мао Дж., Исобе К. (апрель 2000 г.). «PTRF (полимераза I и фактор высвобождения транскрипта) является тканеспецифичным и взаимодействует с BFCOL1 (связывающим фактором промотора коллагена типа I) фактором транскрипции цинковых пальцев, который связывается с двумя промоторами гена коллагена I типа мыши» . Биохимический журнал . 347 Ч. 1 (Часть 1): 55–59. дои : 10.1042/0264-6021:3470055 . ПМК 1220930 . ПМИД 10727401 .

Дальнейшее чтение

Янса П., Мейсон С.В., Хоффманн-Рорер У., Груммт I (май 1998 г.). «Клонирование и функциональная характеристика PTRF, нового белка, который индуцирует диссоциацию приостановленных тройных транскрипционных комплексов» . Журнал ЭМБО . 17 (10): 2855–2864. дои : 10.1093/emboj/17.10.2855 . ПМК 1170626 . ПМИД 9582279 .
Хасэгава Т., Такеучи А., Мияиси О., Сяо Х., Мао Дж., Исобе К. (апрель 2000 г.). «PTRF (полимераза I и фактор высвобождения транскрипта) является тканеспецифичным и взаимодействует с BFCOL1 (связывающим фактором промотора коллагена типа I) фактором транскрипции цинковых пальцев, который связывается с двумя промоторами гена коллагена I типа мыши» . Биохимический журнал . 347 Ч. 1 (Часть 1): 55–59. дои : 10.1042/0264-6021:3470055 . ПМК 1220930 . ПМИД 10727401 .
Абулайх Н., Вайнонен Дж.П., Стролфорс П., Венер А.В. (октябрь 2004 г.). «Векторная протеомика выявляет нацеливание, фосфорилирование и специфическую фрагментацию полимеразы I и фактора высвобождения транскрипта (PTRF) на поверхности кавеол в адипоцитах человека» . Биохимический журнал . 383 (Часть 2): 237–248. дои : 10.1042/BJ20040647 . ПМК 1134064 . ПМИД 15242332 .
Раш Дж., Мориц А., Ли К.А., Го А., Госс В.Л., Спек Э.Дж. и др. (январь 2005 г.). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Природная биотехнология . 23 (1): 94–101. дои : 10.1038/nbt1046 . ПМИД 15592455 . S2CID 7200157 .
Чжан Ю., Вольф-Ядлин А., Росс П.Л., Паппин DJ, Раш Дж., Лауффенбургер Д.А., White FM (сентябрь 2005 г.). «Масс-спектрометрия с временным разрешением участков фосфорилирования тирозина в сигнальной сети рецептора эпидермального фактора роста выявляет динамические модули» . Молекулярная и клеточная протеомика . 4 (9): 1240–1250. дои : 10.1074/mcp.M500089-MCP200 . ПМИД 15951569 .
Абулайх Н., Ортегрен У., Венер А.В., Стралфорс П. (ноябрь 2006 г.). «Ассоциация и регулируемая инсулином транслокация гормон-чувствительной липазы с PTRF». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 350 (3): 657–661. дои : 10.1016/j.bbrc.2006.09.094 . ПМИД 17026959 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–648. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 17 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000177469 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004044 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: PTRF-полимераза I и фактор высвобождения транскрипта» .

[6] «Отчет о символах CAVIN1 | Комитет по генной номенклатуре HUGO» . www.gennamemes.org . Проверено 30 мая 2017 г.

[7] Хилл М.М., Бастиани М., Лютерфорст Р., Киркхэм М., Киркхэм А., Никсон С.Дж. и др. (январь 2008 г.). «PTRF-Cavin, консервативный цитоплазматический белок, необходимый для формирования и функционирования кавеолы» . Клетка . 132 (1): 113–124. дои : 10.1016/j.cell.2007.11.042 . ПМК 2265257 . ПМИД 18191225 .

[8] Кифти А., Баладжи С., Скарлата С. (июнь 2022 г.). «Деформация кавеол влияет на глобальные процессы транскрипции и трансляции посредством перемещения кавина-1» . Журнал биологической химии . 298 (6): 102005. doi : 10.1016/j.jbc.2022.102005 . ПМЦ 9168624 . ПМИД 35513070 .

[pmid9009277-9] Мейсон С.В., Сандер Э.Э., Груммт I (январь 1997 г.). «Идентификация активности высвобождения транскрипта, действующего на тройные транскрипционные комплексы, содержащие мышиную РНК-полимеразу I» . Журнал ЭМБО . 16 (1): 163–172. дои : 10.1093/emboj/16.1.163 . ПМЦ 1169623 . ПМИД 9009277 .

[pmid9582279-10] Янса П., Мейсон С.В., Хоффманн-Рорер У., Груммт I (май 1998 г.). «Клонирование и функциональная характеристика PTRF, нового белка, который индуцирует диссоциацию приостановленных тройных транскрипционных комплексов» . Журнал ЭМБО . 17 (10): 2855–2864. дои : 10.1093/emboj/17.10.2855 . ПМК 1170626 . ПМИД 9582279 .

[pmid15242332-11] Абулайх Н., Вайнонен Дж.П., Стролфорс П., Венер А.В. (октябрь 2004 г.). «Векторная протеомика выявляет нацеливание, фосфорилирование и специфическую фрагментацию полимеразы I и фактора высвобождения транскрипта (PTRF) на поверхности кавеол в адипоцитах человека» . Биохимический журнал . 383 (Часть 2): 237–248. дои : 10.1042/BJ20040647 . ПМК 1134064 . ПМИД 15242332 .

[12] Ковтун О., Тиллу В.А., Ариотти Н., Партон Р.Г., Коллинз Б.М. (апрель 2015 г.). «Белки семейства кавинов и сборка кавеол» . Журнал клеточной науки . 128 (7): 1269–1278. дои : 10.1242/jcs.167866 . ПМЦ 4379724 . ПМИД 25829513 .

[pmid10727401-13] Хасэгава Т., Такеучи А., Мияиси О., Сяо Х., Мао Дж., Исобе К. (апрель 2000 г.). «PTRF (полимераза I и фактор высвобождения транскрипта) является тканеспецифичным и взаимодействует с BFCOL1 (связывающим фактором промотора коллагена типа I) фактором транскрипции цинковых пальцев, который связывается с двумя промоторами гена коллагена I типа мыши» . Биохимический журнал . 347 Ч. 1 (Часть 1): 55–59. дои : 10.1042/0264-6021:3470055 . ПМК 1220930 . ПМИД 10727401 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]