HLA-A*02
| HLA-A2 | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ( MHC класса I , антиген клеточной поверхности) | |||||||||||||||||||
 | |||||||||||||||||||
| О | |||||||||||||||||||
| Белок | трансмембранный рецептор / лиганд | ||||||||||||||||||
| Структура | αβ гетеродимер | ||||||||||||||||||
| Субъединицы | HLA-A *02--, β 2 -микроглобулин | ||||||||||||||||||
| Старые имена | HL-A2 | ||||||||||||||||||
| Подтипы | |||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| Редкие аллели | |||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||
| Связь аллелей с базой данных IMGT/HLA в EBI | |||||||||||||||||||
HLA-A*02 (A*02) представляет собой человеческого лейкоцитарного антигена серотип в группе серотипов HLA-A . Серотип определяется по распознаванию антителами домена α2 α-цепи HLA-A. Для A*02 α-цепь кодируется геном HLA-A*02, а β-цепь кодируется B2M локусом . [ 1 ] В 2010 году Комитет Всемирной организации здравоохранения по наименованию факторов системы HLA пересмотрел номенклатуру HLA. До этой редакции HLA-A*02 также назывался HLA-A2, HLA-A02 и HLA-A*2. [ 2 ]
HLA-A*02 представляет собой одну конкретную группу аллелей главного комплекса гистосовместимости (MHC) класса I в локусе HLA-A . Группа аллелей A*02 может кодировать многие белки; по состоянию на декабрь 2013 г. существует 456 различных белков HLA-A*02. [ 3 ] Серотипирование позволяет идентифицировать HLA-A*02, чего обычно достаточно для предотвращения отторжения трансплантата (первоначальная мотивация для идентификации HLA). Гены можно дополнительно разделить с помощью генетического секвенирования и анализа. HLA можно идентифицировать с помощью девяти цифр и буквы (например, HLA-A*02:101:01:02N). [ 2 ] HLA-A*02 распространен во всем мире, но отдельные варианты аллеля могут быть разделены по географическому расположению.
Серотип
[ редактировать ]Серотипирование наиболее распространенных аллелей А*02 хорошее. Для A*02:03, A*02:06, A*02:07 серотипирование крайне полезно. Существует отдельное серотипирование для А203 и А210. По состоянию на декабрь 2013 года было идентифицировано 456 аллелей (в основном по гомологии последовательностей) как A2, из них 27 являются нулевыми, и подавляющее большинство имеет неизвестные серотипы, хотя весьма вероятно, что все они вернутся к серотипам A2. [ 3 ]
| А*02 | А2 | Образец |
| аллель | % | размер (Н) |
| *02:01 | 98 | 6315 |
| *02:02 | 81 | 859 |
| *02:03 | 64 | 472 |
| *02:05 | 81 | 462 |
| *02:06 | 68 | 636 |
| *02:07 | 80 | 135 |
| *02:11 | 74 | 228 |
Ассоциации заболеваний
[ редактировать ]HLA служат основным связующим звеном между иммунной системой и внутренней частью клеток. Таким образом, любое изменение HLA, которое вызывает снижение связывания с определенным пептидом или увеличение связывания с определенным пептидом, выражается, соответственно, в увеличении восприимчивости к заболеванию или снижении восприимчивости к заболеванию. Другими словами, некоторые HLA могут быть неспособны связывать какие-либо короткие пептиды, образующиеся в результате протеолиза патогенных белков. Если HLA не связывают ни один из пептидов, вырабатываемых патогеном, иммунная система не может определить, что клетка инфицирована. Таким образом, инфекция может распространяться практически беспрепятственно. Это работает и в другую сторону. Некоторые HLA связывают фрагменты патогенных пептидов с очень высоким сродством. По сути, это «перегружает» их иммунную систему в отношении этого конкретного патогена, позволяя им легко контролировать инфекцию, которая в противном случае могла бы оказаться разрушительной. [ 5 ]
Самопроизвольный аборт
[ редактировать ]Антиген HLA-A*02 связан со спонтанными абортами у бесплодных пар. По сути, есть признаки, хотя и из небольшого исследования, сравнивающего экспрессию HLA в фертильных и бесплодных парах, что HLA-A*02 может индуцировать повышенный материнский иммунный ответ на плод. Этот иммунный ответ можно сравнить с аллергической реакцией, и, если он достаточно серьезен, он вызывает аборт плода. [ 6 ] Хотя это очень интересная корреляция, исследование, которое впервые выявило эту связь, было довольно небольшим, и для проверки этой гипотезы необходимо провести дополнительную работу.
Вирус иммунодефицита человека
[ редактировать ]HLA-A*02, по-видимому, стимулирует мононуклеарные клетки периферической крови таким образом, что ингибирует репликацию ВИЧ. Это может быть причиной документально подтвержденного 9-кратного снижения риска передачи ВИЧ младенцам во время родов. [ 7 ] ВИЧ разработал механизмы борьбы с иммунным распознаванием. ВИЧ вырабатывает белок Nef , который связывается с цитоплазматическим хвостом HLA-A и B и направляет его в лизосомы для разрушения. Это предотвращает экспрессию HLA на поверхности клеток и их правильное функционирование. [ 8 ] Кроме того, существует несколько гаплотипов HLA-A*02, которые, по-видимому, в значительной степени способствуют повышению или понижению вирусной нагрузки у пациентов с ВИЧ. Было показано, что HLA-A*02-C*16 и HLA-A*02-B*45 способствуют значительному увеличению вирусной нагрузки (более 100 000 копий на миллилитр). [ 9 ] Подводя итог, HLA-A*02 оказывается несколько менее эффективным, чем другие HLA-As, для защиты от ВИЧ-инфекции.
Лимфома Ходжкина
[ редактировать ]HLA-A*02 связан со снижением риска развития вируса Эпштейна-Барра (EBV)-положительной лимфомы Ходжкина (HL). Среди пациентов с EBV+HL только 35,5% людей экспрессировали HLA-A*02 по сравнению с 50,9% в группе EBV-HL и 53% в контрольной группе. Это значительное снижение почти наверняка является результатом аномально эффективного связывания HLA-A*02 с пептидами, происходящими от EBV. [ 10 ] Такое высокое сродство увеличивает вероятность распознавания CD8+ Т-клетками пептидов EBV, удерживаемых комплексами HLA-A*02. Это, в свою очередь, повышает способность иммунной системы контролировать и уничтожать ВЭБ, что снижает риск развития лимфомы Ходжкина в результате инфекции.
По гаплотипу
[ редактировать ]A*02:Cw*16 связан с увеличением вирусной нагрузки при ВИЧ. [ 9 ]
Аллели
[ редактировать ]| Частота аллеля A*02:01 |
|---|
| Частота аллеля A*02:02 |
|---|
| Частота аллеля A*02:03 |
|---|
| A*02:05 частота аллеля |
|---|
| Частота аллеля A*02:06 |
|---|
| Частота аллеля A*02:07 |
|---|
| Частота аллеля A*02:11 |
|---|
Гаплотипы A2-B
[ редактировать ]A2-B7 (узел в Нидерландах) А2-В5
- А2-Б51
- А2-Б52
А2-В8
А2-Б13
А2-Б14
- А2-Б64
- А2-Б65
А2-Б15
- А2-Б62
- А2-Б63
- А2-Б70,71,75,76
- A2-B46 (узел в Южном Китае, возможно, самый распространенный гаплотип)
А2-Б16
- А2-Б44
- А2-Б45
А2-Б18
А2-Б27
А2-Б35
А2-Б37
A2-B39 (узел в североамериканских америндах)
А2-Б40
- А2-Б60
- А2-Б61
A2-Cw5-B44
[ редактировать ]| частота | Место в | |||
| исх. | Население | (%) | Поп. | |
| [ 12 ] | Корнуолл | 11.4 | 1 | 1 |
| [ 13 ] | Ирландия | 9.2 | 2 | |
| [ 14 ] | Северная Ирландия | 8.0 | 1 | 2 |
| [ 12 ] | Швеция | 7.2 | 2 | |
| [ 15 ] | швейцарский | 6.9 | 2 | |
| [ 12 ] | Польский | 6.2 | 1 | |
| [ 12 ] | испанский | 5.9 | 1 | |
| [ 12 ] | Украина | 5.9 | 1 | |
| [ 16 ] | Голландские Нидерланды | 5.9 | 3 | |
| [ 12 ] | датчанин | 4.8 | 1 | |
| [ 12 ] | чешский | 4.7 | 3 | |
| [ 12 ] | Баскский | 4.7 | 3 | |
| [ 12 ] | Греческий | 4.5 | 3 | |
| [ 12 ] | югославский | 4.4 | ||
| [ 12 ] | венгерский | 3.5 | ||
| [ 12 ] | Британский | 2.6 | 4 | |
| [1] | Румыния | 2.5 | ||
| [ 12 ] | Австрия | 2.4 | ||
| 1 Cw*0501 (Евр.) | ||||
A2-Cw5-B44 — это мультисеротипическое обозначение гаплотипа HLA-A*02:01~C*05:01~B*4402, части класса I предкового гаплотипа (A2~B44~ DR4 ~ DQ8 ). . Полный гаплотип (для относительных расстояний) см. в разделе « Человеческие лейкоцитарные антигены» :
А *02:01 ~ С *05:01 ~ Б *44:02 ~ ДРБ1 *04:01 ~ DQA1 *03:01 ~ DQB1 *03:02
Другой гаплотип, более распространенный в Центральной Европе, — это (A2-B44-DR7-DQ2).
А *02:01 ~ С *05:01 ~ Б *44:02 ~ ДРБ1 *07:01 ~ DQA1 *02:01 ~ DQB1 *02:02
Над северо-западной Европой A2-B44 показывает одного общего предка, который внес свой вклад. аллель Cw5 гаплотипа. Гаплотип, по-видимому, был введен в начале европейского доисторического периода, частоты гаплотипа обычно коррелируют с A1-Cw7-B8 и A2-B7. Гаплотип значительно более уравновешен по сравнению с A1-B8, и возможной причиной является поток генов из Иберии или востока с родственными гаплотипами после первоначальных миграций.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Арсе-Гомез Б., Джонс Э.А., Барнстейбл С.Дж., Соломон Э., Бодмер В.Ф. (февраль 1978 г.). «Генетический контроль антигенов HLA-A и B в гибридах соматических клеток: потребность в бета2-микроглобулине». Тканевые антигены . 11 (2): 96–112. дои : 10.1111/j.1399-0039.1978.tb01233.x . ПМИД 77067 .
- ^ Jump up to: а б «Номенклатура HLA @ hla.alleles.org» . Исследовательский институт Энтони Нолана. 10 ноября 2013 г. Проверено 8 декабря 2013 г.
- ^ Jump up to: а б «Инструмент поиска аллелей» . Европейская лаборатория молекулярной биологии. 2013 . Проверено 20 декабря 2013 г.
- ^ Форма запроса аллелей IMGT/HLA - Европейский институт биоинформатики
- ^ Дэниел М. Дэвис (2014). Ген совместимости. Как наши тела борются с болезнями, привлекают других и определяют себя . Оксфорд: Издательство Оксфордского университета . ISBN 978-0-19-931641-0 .
- ^ Комлос Л., Кляйн Т., Коростишевский М. (август 2007 г.). «Антигены HLA-A2 класса I у пар с привычными самопроизвольными абортами». Международный журнал иммуногенетики . 34 (4): 241–6. дои : 10.1111/j.1744-313X.2007.00682.x . ПМИД 17627758 . S2CID 12367668 .
- ^ Грене Э., Пинто Л.А., Коэн С.С., Триветт М.Т., Симонис Т.Б., Ливер Д.Д., Стейнберг С.М., Ширер Г.М. (февраль 2001 г.). «Поколение аллоантиген-стимулированной активности вируса иммунодефицита человека связано с экспрессией HLA-A * 02». Журнал инфекционных болезней . 183 (3): 409–16. дои : 10.1086/318085 . ПМИД 11133372 .
- ^ Манн Дж.К., Бьяквага Х., Куанг Х.Т., Ле А.К., Брюмм Си.Дж., Мвиманзи П., Омарджи С., Мартин Е., Ли Г.К., Бараки Б., Данрот Р., Макклоски Р., Музура С., Бангсберг Д.Р., Хант П.В., Гулдер П.Дж., Уокер Б.Д. , Харриган П.Р., Мартин Дж.Н., Ндунгу Т., Брокман М.А., Брюмме З.Л. (16 сентября 2013). «Способность Nef ВИЧ-1 подавлять CD4 и HLA класса I различается в зависимости от подтипа вируса» . Ретровирусология . 10 (1): 100. дои : 10.1186/1742-4690-10-100 . ПМЦ 3849644 . ПМИД 24041011 .
- ^ Jump up to: а б Тан Дж., Тан С., Лобашевский Э., Миракл А.Д., Фидели Ю., Альдрованди Г., Аллен С., Мусонда Р., Каслоу Р.А. (август 2002 г.). «Благоприятные и неблагоприятные аллели и гаплотипы HLA класса I у замбийцев, преимущественно инфицированных вирусом иммунодефицита человека типа 1 клады C» . Журнал вирусологии . 76 (16): 8276–84. doi : 10.1128/JVI.76.16.8276-8284.2002 . ПМК 155130 . ПМИД 12134033 .
- ^ Ниенс М., Джарретт Р.Ф., Хепкема Б., Нолте И.М., Дипстра А., Платтел М., Купри Н., Делюри К.П., Галлахер А., Виссер Л., Поппема С., Те Меерман Г.Дж., ван ден Берг А. (ноябрь 2007 г.). «HLA-A*02 связан со сниженным риском, а HLA-A*01 — с повышенным риском развития EBV+ лимфомы Ходжкина» (PDF) . Кровь . 110 (9): 3310–5. doi : 10.1182/blood-2007-05-086934 . ПМИД 17630352 . S2CID 24567105 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Миддлтон, Д.; Менчака, Л.; Руд, Х.; Комерофски, Р. (2003). «Новая база данных частот аллелей: http://www.allerefrequency.net». Тканевые антигены . 61 (5): 403–407. дои : 10.1034/j.1399-0039.2003.00062.x . ПМИД 12753660 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м Сасадзуки, Такэхико; Цудзи, Кимиёси; Айзава, Мики (1992). HLA 1991: материалы одиннадцатого Международного семинара и конференции по гистосовместимости, состоявшихся в Иокогаме, Япония, 6-13 ноября 1991 г. Оксфорд [Оксфордшир]: Издательство Оксфордского университета. ISBN 0-19-262390-7 .
- ^ Финч Т., Лоулор Э., Бортон М., Барнс К.А., Макнамара С., О'Риордан Дж., Макканн С.Р., Дарк С. (1997). «Распределение генов и гаплотипов HLA-A, B и DR в ирландском населении». Экспериментальная и клиническая иммуногенетика . 14 (4): 250–63. ПМИД 9523161 .
- ^ Миддлтон Д., Уильямс Ф., Хэмилл М.А., Мина А. (декабрь 2000 г.). «Частота аллелей HLA-B в европеоидной популяции определяется с помощью двухэтапной стратегии типирования PCR-SSOP». Иммунология человека . 61 (12): 1285–97. дои : 10.1016/S0198-8859(00)00186-5 . ПМИД 11163085 .
- ^ Грундшобер С., Санчес-Масас А., Экскофье Л., Лангани А., Жаннет М., Тирси Дж. М. (июнь 1994 г.). «Полиморфизм ДНК HLA-DPB1 в швейцарской популяции: неравновесие по сцеплению с другими локусами HLA и генетическое сходство популяции». Европейский журнал иммуногенетики . 21 (3): 143–57. дои : 10.1111/j.1744-313X.1994.tb00186.x . ПМИД 9098428 . S2CID 29932752 .
- ^ Шиппер Р.Ф., Шредер Г.М., Д'Амаро Дж., Оудсхорн М. (ноябрь 1996 г.). «Частоты гена и гаплотипов HLA у голландских доноров крови». Тканевые антигены . 48 (5): 562–74. дои : 10.1111/j.1399-0039.1996.tb02670.x . ПМИД 8988539 .