✖


Jump to content

Секвенирование микроРНК

Add links

Секвенирование микроРНК (miRNA-seq) , тип RNA-Seq , представляет собой использование секвенирования следующего поколения или массово-параллельного высокопроизводительного секвенирования ДНК для секвенирования микроРНК , также называемых микроРНК. miRNA-seq отличается от других форм RNA-seq тем, что входной материал часто обогащен малыми РНК. miRNA-seq позволяет исследователям изучать тканеспецифические закономерности экспрессии, ассоциации заболеваний и изоформы miRNA, а также обнаруживать ранее не охарактеризованные miRNA. Доказательства того, что дисрегуляция микроРНК играет роль в таких заболеваниях, как рак [1] позиционирует miRNA-seq как потенциально важный инструмент для диагностики и прогнозирования в будущем, поскольку затраты продолжают снижаться. [2] Как и другие технологии профилирования микроРНК, микроРНК-Seq имеет как преимущества (независимость от последовательности, охват), так и недостатки (высокая стоимость, требования к инфраструктуре, длина серии и потенциальные артефакты ). [3]

Введение

[ редактировать ]

МикроРНК (миРНК) представляют собой семейство небольших рибонуклеиновых кислот длиной 21–25 нуклеотидов, которые модулируют экспрессию белка посредством деградации транскриптов, ингибирования трансляции или секвестрации транскриптов. [4] [5] [6] Первая обнаруженная микроРНК, lin-4 , была обнаружена в ходе генетического мутагенеза с целью идентификации молекулярных элементов, контролирующих постэмбриональное развитие нематоды Caenorhabditis elegans . [7] Ген lin-4 кодировал 22-нуклеотидную РНК с консервативными комплементарными сайтами связывания в 3'-нетранслируемой области lin-14. мРНК транскрипта [8] и снижение экспрессии белка LIN-14. [9] В настоящее время считается, что микроРНК участвуют в регуляции многих процессов развития и биологических процессов, включая кроветворение ( миР-181 в Mus musculus [10] ), липидный обмен ( миР-14 у Drosophila melanogaster [11] ) и развитие нейронов ( lsy-6 у Caenorhabditis elegans [12] ). [6] Эти открытия потребовали разработки методов, способных идентифицировать и охарактеризовать микроРНК, таких как miRNA-seq.

История

[ редактировать ]

Секвенирование микроРНК (miRNA-seq) было разработано с целью использования преимуществ секвенирования нового поколения или технологий массово-параллельного высокопроизводительного секвенирования для поиска новых микроРНК и профилей их экспрессии в данном образце. Секвенирование микроРНК само по себе не является новой идеей, первоначальные методы секвенирования использовали методы секвенирования Сэнгера . Подготовка к секвенированию включала создание библиотек путем клонирования ДНК , обратной транскрипции из эндогенных малых РНК размером 21–25 п.н., отобранных с помощью колоночного и гель-электрофореза . [13] Однако этот метод является исчерпывающим с точки зрения времени и ресурсов, поскольку каждый клон необходимо индивидуально амплифицировать и готовить к секвенированию. Этот метод также непреднамеренно благоприятствует микроРНК с высокой экспрессией. [6] Секвенирование нового поколения устраняет необходимость в гибридизационных зондах, специфичных для последовательности, необходимых при анализе микрочипов ДНК , а также в трудоемких методах клонирования, необходимых в методе секвенирования по Сэнгеру. Кроме того, платформы секвенирования нового поколения в методе miRNA-SEQ облегчают секвенирование больших пулов малых РНК за один цикл секвенирования. [14]

miRNA-seq можно проводить с использованием различных платформ секвенирования. В первом анализе малых РНК с использованием методов микроРНК-секвенирования было изучено около 1,4 миллиона малых РНК из модельного растения Arabidopsis thaliana с использованием платформы секвенирования массового параллельного сигнатурного секвенирования (MPSS) компании Lynx Therapeutics . Это исследование продемонстрировало потенциал новых технологий высокопроизводительного секвенирования для изучения малых РНК и показало, что геномы генерируют большое количество малых РНК, а растения являются особенно богатыми источниками малых РНК. [15] В более поздних исследованиях использовались другие технологии секвенирования, например, исследование на C. elegans , в ходе которого было идентифицировано 18 новых генов микроРНК, а также новый класс малых РНК нематод, названных 21U-РНК . [16] В другом исследовании, сравнивающем профили малых РНК опухолей шейки матки человека и нормальных тканей, использовался анализатор генома Illumina (компания) для идентификации 64 новых генов микроРНК человека, а также 67 дифференциально экспрессируемых микроРНК. [17] Платформа секвенирования SOLiD компании Applied Biosystems также использовалась для изучения прогностической ценности микроРНК при выявлении рака молочной железы человека. [18]

Методы

[ редактировать ]
Подготовка библиотеки микроРНК

Препарат малой РНК

[ редактировать ]
См. также: Экстракция РНК , Фенол-хлороформная экстракция , Гель-электрофорез , ДНК-лигаза , Обратная транскриптаза и Полимеразная цепная реакция.

Создание библиотеки последовательностей может быть выполнено с использованием множества различных наборов в зависимости от используемой высокопроизводительной платформы секвенирования. Тем не менее, есть несколько общих этапов подготовки к секвенированию малой РНК. [19] [20]

Полное выделение РНК

В данном образце вся РНК экстрагируется и выделяется с использованием метода изотиоцианат/фенол/хлороформ (GITC/фенол) или коммерческого продукта, такого как Trizol ( Invitrogen реагент ). Для очистки геля и выбора размера обычно требуется стартовое количество 50–100 мкг общей РНК (1 г ткани обычно дает 1 мг общей РНК). [20] Также измеряется контроль качества РНК, например, с помощью чипа РНК на Caliper LabChipGX ( Caliper Life Sciences ).

Фракционирование малых РНК по размеру с помощью гель-электрофореза

Изолированную РНК обрабатывают в денатурирующем полиакриламидном геле. Метод визуализации, такой как радиоактивные 5'-32P-меченные олигонуклеотиды вместе с лестницей размеров, используется для идентификации участка геля, содержащего РНК соответствующего размера, что уменьшает количество секвенируемого материала. Этот этап не обязательно должен выполняться перед этапами лигирования и обратной транскрипции, описанными ниже. [19] [20]

Лигирование

На этапе лигирования к обоим концам малых РНК добавляются адаптеры ДНК, которые действуют как сайты связывания праймеров во время обратной транскрипции и ПЦР- амплификации. Аденилированный 3'-адаптер одноцепочечной ДНК, за которым следует 5'-адаптер, лигируют с малыми РНК с помощью лигирующего фермента, такого как РНК-лигаза Т4. Адаптеры также предназначены для захвата небольших РНК с 5'-фосфатной группой, характерных микроРНК, а не продуктов деградации РНК с 5'-гидроксильной группой. [19] [20]

Обратная транскрипция и ПЦР-амплификация

На этом этапе малые РНК, лигированные с адаптером, преобразуются в клоны кДНК, используемые в реакции секвенирования. Существует множество коммерческих наборов, которые позволяют выполнить этот этап с использованием той или иной формы обратной транскриптазы . Затем проводят ПЦР для амплификации пула последовательностей кДНК. Праймеры, разработанные с уникальными нуклеотидными метками, также можно использовать на этом этапе для создания идентификационных меток при мультиплексном секвенировании объединенной библиотеки. [19] [20]

Секвенирование

[ редактировать ]
Смотрите также: секвенирование ДНК

Фактическое секвенирование РНК значительно варьируется в зависимости от используемой платформы. Три распространенных метода секвенирования следующего поколения [21] платформы проводят пиросеквенирование на платформе 454 Life Sciences , [22] последовательный синтез на основе полимеразы на платформе Illumina (компания) , [23] или секвенирование путем лигирования на платформе ABI Solid Sequencing . [24]

Анализ данных

[ редактировать ]

Центральное место в анализе данных микроРНК-секвенирования занимает способность 1) получать уровни распространенности микроРНК на основе считывания последовательностей, 2) обнаруживать новые микроРНК, а затем иметь возможность 3) определять дифференциально экспрессируемые микроРНК и 4) ассоциированные с ними гены-мишени мРНК.

Анализ данных miRNA-seq

Выравнивание микроРНК и количественная оценка численности

[ редактировать ]

микроРНК могут преимущественно экспрессироваться в определенных типах клеток, тканях, на стадиях развития или в определенных болезненных состояниях, таких как рак. [1] Поскольку глубокое секвенирование (miRNA-seq) генерирует миллионы прочтений из данного образца, оно позволяет нам профилировать микроРНК; возможно ли путем количественной оценки их абсолютного количества обнаружить их варианты (известные как изомиры) [25] ) Обратите внимание, что, учитывая, что средняя длина прочтений последовательности больше, чем средняя длина микроРНК (17-25 нт), 3'- и 5'-концы микроРНК должны находиться в одном и том же прочтении. Существует несколько алгоритмов количественного определения содержания микроРНК. [21] [26] Их общие этапы следующие: [27]

  1. После секвенирования необработанные считывания последовательности фильтруются по качеству. Последовательности адаптера также обрезаются из считанных необработанных последовательностей.
  2. Полученные в результате чтения затем форматируются в файл fasta, где для каждого уникального тега записываются номер копии и последовательность.
  3. Последовательности, которые могут представлять контаминацию E. Coli, идентифицируются с помощью поиска BLAST в базе данных E. Coli и удаляются из анализа.
  4. Каждую из оставшихся последовательностей сравнивают с базой данных последовательностей микроРНК (например, miRBase [28] ) Чтобы учесть несовершенную обработку DICER, допускается выступ в 6 нт на 3-м конце и 3 нт на 5-конце.
  5. Считывания, которые не совпадают с базой данных микроРНК, затем слабо совмещаются с предшественниками микроРНК для обнаружения микроРНК, которые могут нести мутации или те, которые прошли редактирование РНК .
  6. Затем количество считываний для каждой микроРНК нормализуется на общее количество картированных микроРНК, чтобы сообщить об обилии каждой микроРНК.

Новое открытие микроРНК

[ редактировать ]

Еще одним преимуществом микроРНК-секвенирования является то, что он позволяет обнаруживать новые микроРНК, которые, возможно, ускользнули от традиционных методов скрининга и профилирования. [27] Существует несколько новых алгоритмов обнаружения микроРНК. Их общие этапы следующие:

  1. Получите чтения, которые не совпадают с известными последовательностями микроРНК, и сопоставьте их с геномом.
  2. Метод сворачивания РНК
    1. Для последовательностей микроРНК, в которых обнаружено точное совпадение, получите геномную последовательность, включающую ~ 100 пар оснований фланкирующей последовательности с каждой стороны, и пропустите РНК через программное обеспечение для сворачивания РНК, такое как пакет Vienna. [29]
    2. Свернутые последовательности, которые лежат на одном плече шпильки микроРНК и имеют минимальную свободную энергию менее ~ 25 ккал/моль, включаются в короткий список предполагаемых микроРНК.
    3. Последовательности, включенные в короткий список, обрезаются, чтобы включить только возможную последовательность-предшественник, а затем повторно сворачиваются, чтобы гарантировать, что предшественник не был искусственно стабилизирован соседними последовательностями.
    4. Полученные свернутые последовательности считаются новыми микроРНК, если последовательность микроРНК попадает в пределах одного плеча шпильки и высоко консервативны между видами.
  3. Метод экспрессии звездчатых нитей (miRdeep [30] )
    1. Новые последовательности микроРНК идентифицируются на основе характерного паттерна экспрессии, который они проявляют вследствие процессинга DICER: более высокая экспрессия зрелой микроРНК по сравнению с последовательностями звездообразной цепи и петли.

Дифференциальный экспрессионный анализ

[ редактировать ]

После количественной оценки содержания микроРНК для каждого образца их уровни экспрессии можно сравнить между образцами. Тогда можно будет идентифицировать микроРНК, которые преимущественно экспрессируются в определенные моменты времени или в определенных тканях или болезненных состояниях. После нормализации количества сопоставленных чтений между образцами можно использовать множество статистических тестов (например, тех, которые используются при профилировании экспрессии генов ) для определения дифференциальной экспрессии.

Целевое предсказание

[ редактировать ]

Идентификация мишеней мРНК микроРНК обеспечит понимание генов или сетей генов, экспрессию которых они регулируют. [31] Публичные базы данных предоставляют прогнозы целей микроРНК. Но чтобы лучше отличать истинно положительные прогнозы от ложноположительных, данные секвенирования микроРНК можно интегрировать с данными секвенирования мРНК для наблюдения за функциональными парами микроРНК:мРНК. РНК22, [32] ТаргетСкан , [33] [34] [35] [36] [37] [38] миРанда, [39] и ПикТар [40] программное обеспечение, предназначенное для этой цели. Список программ для прогнозирования приведен здесь . Общие шаги:

  1. Определите пары связывания микроРНК:мРНК, определите комплементарность между последовательностями микроРНК в 3'-UTR последовательности мРНК.
  2. Определите степень консервативности пар связывания микроРНК: мРНК у разных видов. Как правило, пары с более высокой степенью связывания с меньшей вероятностью будут давать ложноположительные результаты прогнозирования.
  3. Наблюдайте за доказательствами нацеливания микроРНК в данных мРНК-seq или экспрессии белка: там, где экспрессия микроРНК высока, экспрессия гена и белка его целевого гена должна быть низкой.

Проверка цели для мишеней расщепленной мРНК

[ редактировать ]

Многие микроРНК функционируют, направляя расщепление своих мишеней мРНК; это особенно верно для растений, и поэтому были разработаны методы высокопроизводительного секвенирования, позволяющие воспользоваться этим свойством микроРНК путем секвенирования непокрытых 3'-концов расщепленных или деградированных мРНК. Эти методы известны как секвенирование деградома или PARE. [41] [42] Проверка целевого расщепления в специфических мРНК обычно выполняется с использованием модифицированной версии 5'- быстрой амплификации концов кДНК с ген-специфичным праймером.

Приложения

[ редактировать ]

Идентификация новых микроРНК

[ редактировать ]

miRNA-seq выявил новые микроРНК, которые ранее ускользали от традиционных методов профилирования микроРНК. Примеры таких результатов можно найти в эмбриональных стволовых клетках. [25] куриные эмбрионы, [43] острый лимфобластный лейкоз, [44] диффузная крупноклеточная В-клеточная лимфома и В-клетки, [45] острый миелолейкоз, [46] и рак легких. [47]

Биомаркеры заболеваний

[ редактировать ]

МикроРНК являются важными регуляторами почти всех клеточных процессов, таких как выживание, пролиферация и дифференцировка . Следовательно, неудивительно, что микроРНК участвуют в различных аспектах рака посредством регуляции экспрессии генов-супрессоров онко- и опухолей . В сочетании с разработкой методов высокопроизводительного профилирования микроРНК были идентифицированы как биомаркеры для классификации рака, ответа на терапию и прогноза. [48] Кроме того, поскольку микроРНК регулируют экспрессию генов, они также могут выявлять нарушения в важных регуляторных сетях, которые могут быть причиной определенного расстройства. [48] Ниже приведены некоторые применения микроРНК в качестве биомаркеров и предикторов заболеваний.

Таблица 1. Подтипы рака, различаемые микроРНК
Тип рака микроРНК а Ссылка.
Грудь
Статус скорой помощи миР-26а/b, семейство миР-30, миР-29b, миР-155, миР-342, миР-206, миР-191 [49] [50] [51] [52]
PR-статус let-7c, миР-29b, миР-26а, семейство миР-30, миР-520g [52] [53]
HER2/ или статус миР-520д, миР-181с, миР-302с, миР-376б, миР-30е [49] [53]
Легкое
Плоскоклеточный и неплоскоклеточный миР-205 [54]
Мелкая ячейка против немелкой ячейки миР-17-5п, миР-22, миР-24, миР-31 [48]
Желудочный
Диффузный против кишечного миР-29b/c, семейство миР-30, миР-135a/b [55]
эндометриальный
Эндометриоид против папиллярного матки миР-19а/b, миР-30е-5р, миР-101, миР-452, миР-382, миР-15а, миР-29с [56]
Реналь
Прозрачная клетка против папиллярной миР-424, миР-203, миР-31, миР-126 [57]
Онкоцитома против хромофоба миР-200с, миР-139-5п [57]
Миелома
с т(14;16) миР-1, миР-133а [58]
с т(4;14) миР-203, миР-155, миР-375 [58]
с т(11;14) миР-125а, миР-650, миР-184 [58]
Острый миелоидный лейкоз
с т(15;17) миР-382, миР-134, миР-376а, миР-127, миР-299-5п, миР-323 [59]
с t(8;21) или inv(16) лет-7б/с, миР-127 [59]
с NPM1 мутациями миР-10а/b, let-7, миР-29, миР-204, миР-128а, миР-196а/b [59] [60]
с FLT3 ITD миР-155 [59] [60] [61]
Хронический лимфоцитарный лейкоз
Уровни ZAP-70 и статус IgVH миР-15а, миР-195, миР-221, миР-155, миР-23б [62]
Меланома
с BRAF V600E миР-193а, миР-338, миР-565 [63]
Лимфома
Диффузная крупноклеточная В-клеточная лимфома имеет-миР-128, имеет-миР-129-3p, имеет-миР-152, имеет-миР-155, имеет-миР-185, имеет-миР-193а-5p, имеет-миР-196b, имеет-миР- 199b-3p, имеет-миР-20b, имеет-миР-23а, имеет-миР-27а, имеет-миР-28-5p, имеет-миР-301а, имеет-миР-331-3p, имеет-миР-365, имеет-миР-625, имеет-миР-9 [45]

а Это не полный список микроРНК, участвующих в этих злокачественных новообразованиях.

Сравнение с другими методами профилирования микроРНК

[ редактировать ]

Недостатками использования miRNA-seq по сравнению с другими методами определения профиля miRNA являются то, что он дороже, обычно требует большего количества общей РНК, требует обширной амплификации и требует больше времени, чем методы микрочипов и qPCR. [3] Кроме того, методы подготовки библиотеки miRNA-seq, по-видимому, имеют систематическое предпочтительное представление комплемента miRNA, и это препятствует точному определению содержания miRNA. [64] В то же время этот подход не зависит от гибридизации и, следовательно, не требует априорной информации о последовательности. Благодаря этому можно получать последовательности новых микроРНК и изоформ микроРНК (изоМирс), различать последовательно сходные микроРНК и выявлять точечные мутации. [65]

Сравнение платформ для профилирования микроРНК

[ редактировать ]

[3]

Таблица 2: Сравнение платформ для профилирования микроРНК
кПЦР Микрочип Секвенирование
Время обработки ~6 часов ~2 дня 1–2 недели
Требуется общая РНК 500 из 100-1000 из 500-5000 из
Обнаружен динамический диапазон Шесть порядков величины Четыре порядка величины Пять и более порядков величины
Инфраструктура и технические требования Немного Умеренный Существенный
Стоимость за образец (долл. США) $400 $250–$350 $500–$700

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б Фарази, Талия А; Спитцер, Джессика I; Морозов, Павел; Тушль, Томас (2011). «миРНК при раке человека» . Журнал патологии . 223 (2): 102–115. дои : 10.1002/путь.2806 . ISSN   0022-3417 . ПМК   3069496 . ПМИД   21125669 .
  2. ^ Сандху, С.; Гарсон, Р. (2011). «Потенциальные применения микроРНК в диагностике, прогнозировании и лечении рака». Семин Онкол . 38 (6): 781–787. doi : 10.1053/j.seminoncol.2011.08.007 . ПМИД   22082764 .
  3. ^ Jump up to: а б с Бейкер, Моня (2010). «Профилирование микроРНК: отделение сигнала от шума» . Природные методы . 7 (9): 687–692. дои : 10.1038/nmeth0910-687 . ISSN   1548-7091 . ПМИД   20805796 . S2CID   6853222 .
  4. ^ Ким, В. Нарри ; Хан, Чинджу; Сиоми, Микико С. (2009). «Биогенез малых РНК у животных». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 10 (2): 126–139. дои : 10.1038/nrm2632 . ISSN   1471-0072 . ПМИД   19165215 . S2CID   8360619 .
  5. ^ Бартель, Д. (2004). «МикроРНКГеномика, биогенез, механизм и функции» . Клетка . 116 (2): 281–297. дои : 10.1016/S0092-8674(04)00045-5 . ISSN   0092-8674 . ПМИД   14744438 . S2CID   2669459 .
  6. ^ Jump up to: а б с Он, Лин; Хэннон, Грегори Дж. (2004). «МикроРНК: малые РНК, играющие большую роль в регуляции генов». Обзоры природы Генетика . 5 (7): 522–531. дои : 10.1038/nrg1379 . ISSN   1471-0056 . ПМИД   15211354 . S2CID   86602746 .
  7. ^ Амброс, Виктор (1989). «Иерархия регуляторных генов контролирует переключение развития от личинки к взрослой особи у C. elegans». Клетка . 57 (1): 49–57. дои : 10.1016/0092-8674(89)90171-2 . ISSN   0092-8674 . ПМИД   2702689 . S2CID   13103224 .
  8. ^ Ли, Розалинда К.; Фейнбаум, Ронда Л.; Амброс, Виктор (1993). «Гетерохронный ген lin-4 C. elegans кодирует малые РНК, антисмысловые, комплементарные lin-14» . Клетка . 75 (5): 843–854. дои : 10.1016/0092-8674(93)90529-Y . ISSN   0092-8674 . ПМИД   8252621 .
  9. ^ Вайтман, Брюс; Ха, Ильо; Рувкун, Гэри (1993). «Посттранскрипционная регуляция гетерохронного гена lin-14 с помощью lin-4 опосредует формирование временного паттерна у C. elegans» . Клетка . 75 (5): 855–862. дои : 10.1016/0092-8674(93)90530-4 . ISSN   0092-8674 . ПМИД   8252622 .
  10. ^ Чен, К.-З. (2004). «МикроРНК модулируют дифференцировку гемопоэтических линий» (PDF) . Наука . 303 (5654): 83–86. Бибкод : 2004Sci...303...83C . дои : 10.1126/science.1091903 . hdl : 1721.1/7483 . ISSN   0036-8075 . ПМИД   14657504 . S2CID   7044929 .
  11. ^ Сюй, Пэйчжан; Вернуй, Стефани Ю.; Го, Мин; Хэй, Брюс А. (2003). «МикроРНК Мир-14 дрозофилы подавляет гибель клеток и необходима для нормального жирового метаболизма» (PDF) . Современная биология . 13 (9): 790–795. дои : 10.1016/S0960-9822(03)00250-1 . ISSN   0960-9822 . ПМИД   12725740 . S2CID   6391484 .
  12. ^ Джонстон, Роберт Дж.; Хоберт, Оливер (2003). «МикроРНК, контролирующая асимметрию левых/правых нейронов у Caenorhabditis elegans». Природа . 426 (6968): 845–849. Бибкод : 2003Natur.426..845J . дои : 10.1038/nature02255 . ISSN   0028-0836 . ПМИД   14685240 . S2CID   4410288 .
  13. ^ Ли, RC (2001). «Обширный класс малых РНК Caenorhabditis elegans». Наука . 294 (5543): 862–864. Бибкод : 2001Sci...294..862L . дои : 10.1126/science.1065329 . ISSN   0036-8075 . ПМИД   11679672 . S2CID   33480585 .
  14. ^ Олдридж, Сара; Хэдфилд, Джеймс (2012). «Введение в технологии профилирования микроРНК и межплатформенное сравнение». Технология профилирования экспрессии микроРНК нового поколения . Методы молекулярной биологии. Том. 822. Технология профилирования экспрессии микроРНК следующего поколения. стр. 19–31. дои : 10.1007/978-1-61779-427-8_2 . ISBN  978-1-61779-426-1 . ISSN   1064-3745 . ПМИД   22144189 .
  15. ^ Лу, С; Тедж, СС; Ло, С; Хауденшильд, CD; Мейерс, Британская Колумбия; Грин, Пи Джей (2 сентября 2005 г.). «Выяснение компонента малой РНК транскриптома». Наука . 309 (5740): 1567–9. Бибкод : 2005Sci...309.1567L . дои : 10.1126/science.1114112 . ПМИД   16141074 . S2CID   1651848 .
  16. ^ Руби, Дж. Грэм; Ян, Кальвин; Игрок, Кристофер; Экстелл, Майкл Дж.; Ли, Уильям; Нусбаум, Чад; Ге, Хуэй; Бартель, Дэвид П. (2006). «Крупномасштабное секвенирование выявляет 21U-РНК, а также дополнительные микроРНК и эндогенные миРНК у C. elegans» . Клетка . 127 (6): 1193–1207. дои : 10.1016/j.cell.2006.10.040 . ISSN   0092-8674 . ПМИД   17174894 . S2CID   16838469 .
  17. ^ Виттен, Даниэла; Тибширани, Роберт; Гу, Сэм; Огонь, Эндрю; Луи, Венг-Онн (2010). «Обнаружение малых РНК на основе сверхвысокопроизводительного секвенирования и дискретный статистический анализ биомаркеров в коллекции опухолей шейки матки и соответствующих контрольных группах» . БМК Биология . 8 (1): 58. дои : 10.1186/1741-7007-8-58 . ISSN   1741-7007 . ПМК   2880020 . ПМИД   20459774 .
  18. ^ Ву, Цянь; Лу, Цзухун; Ли, Приветствую; Лу, Цзяфэн; Го, Ли; Ге, Цинью (2011). «Секвенирование микроРНК нового поколения для обнаружения рака молочной железы» . Журнал биомедицины и биотехнологии . 2011 : 1–7. дои : 10.1155/2011/597145 . ISSN   1110-7243 . ПМЦ   3118289 . ПМИД   21716661 .
  19. ^ Jump up to: а б с д Лу, С; Мейерс, Британская Колумбия; Грин, П.Дж. (октябрь 2007 г.). «Создание малых библиотек кДНК РНК для глубокого секвенирования». Методы . 43 (2): 110–7. дои : 10.1016/j.ymeth.2007.05.002 . ПМИД   17889797 .
  20. ^ Jump up to: а б с д и Хафнер, Маркус; Ландграф, Пабло; Людвиг, Янош; Райс, Аманда; Оджо, Толулопа; Лин, Каролина; Холох, Дэниел; Лим, Синди; Тушль, Томас (2008). «Идентификация микроРНК и других малых регуляторных РНК с использованием секвенирования библиотеки кДНК» . Методы . 44 (1): 3–12. дои : 10.1016/j.ymeth.2007.09.009 . ISSN   1046-2023 . ПМК   2847350 . ПМИД   18158127 .
  21. ^ Jump up to: а б Шендюр, Джей; Джи, Ханли (2008). «Секвенирование ДНК нового поколения». Природная биотехнология . 26 (10): 1135–1145. дои : 10.1038/nbt1486 . ISSN   1087-0156 . ПМИД   18846087 . S2CID   6384349 .
  22. ^ «Приложения — секвенирование транскриптома: 454 Life Sciences, компания Roche» . Архивировано из оригинала 26 мая 2011 г. Проверено 1 марта 2012 г.
  23. ^ «Иллюмина ДизайнСтудия» .
  24. ^ «Архивная копия» . Архивировано из оригинала 16 мая 2008 г. Проверено 16 мая 2008 г. {{cite web}}: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка )
  25. ^ Jump up to: а б Морин, РД; О'Коннор, доктор медицины; Гриффит, М.; Кухенбауэр, Ф.; Делани, А.; Прабху, А.-Л.; Чжао, Ю.; Макдональд, Х.; Цзэн, Т.; Херст, М.; Ивз, CJ; Марра, Массачусетс (2008). «Применение массового параллельного секвенирования для профилирования и открытия микроРНК в эмбриональных стволовых клетках человека» . Геномные исследования . 18 (4): 610–621. дои : 10.1101/гр.7179508 . ISSN   1088-9051 . ПМК   2279248 . ПМИД   18285502 .
  26. ^ Бернингер, Филипп; Гайдацис, Димос; ван Нимвеген, Эрик; Заволан, Михаэла (2008). «Вычислительный анализ данных клонирования малых РНК». Методы . 44 (1): 13–21. дои : 10.1016/j.ymeth.2007.10.002 . ISSN   1046-2023 . ПМИД   18158128 .
  27. ^ Jump up to: а б Крейтон, CJ; Рид, Дж. Г.; Гунаратне, PH (2009). «Профиль экспрессии микроРНК путем глубокого секвенирования» . Брифинги по биоинформатике . 10 (5): 490–497. дои : 10.1093/bib/bbp019 . ISSN   1467-5463 . ПМЦ   2733187 . ПМИД   19332473 .
  28. ^ Козомара, А.; Гриффитс-Джонс, С. (2010). «miRBase: интеграция аннотаций микроРНК и данных глубокого секвенирования» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (База данных): D152–D157. дои : 10.1093/нар/gkq1027 . ISSN   0305-1048 . ПМК   3013655 . ПМИД   21037258 .
  29. ^ Хофакер, Иллинойс; Фонтана, В.; Стадлер, ПФ; Бонхёффер, Л.С.; Такер, М.; Шустер, П. (1994). «Быстрое сворачивание и сравнение вторичных структур РНК». Monatshefte für Chemie . 125 (2): 167–188. дои : 10.1007/BF00818163 . ISSN   0026-9247 . S2CID   19344304 .
  30. ^ Ян, X.; Ли, Л. (2011). «miRDeep-P: вычислительный инструмент для анализа транскриптома микроРНК в растениях» . Биоинформатика . 27 (18): 2614–5. doi : 10.1093/биоинформатика/btr430 . ISSN   1367-4803 . ПМИД   21775303 .
  31. ^ Клунан, Николь; Вани, Шиванги; Сюй, Циньин; Гу, Цзянь; Лия, Кристи; Хитер, Шейла; Барбачору, Кэтрин; Стептоу, Анита Л; Мартин, Хилари С; Нурбахш, Эхсан; Кришнан, Киртана; Гардинер, Брук; Ван, Сяохуэй; Нонес, Катя; Стин, Джейсон А; Мэтиган, Ник; Вуд, Дэвид Л; Кассан, Карин С; Уодделл, Ник; Шепард, Джилл; Ли, Кларенс; Итикава, Джефф; МакКернан, Кевин; Брамлетт, Келли; Куерстен, Скотт; Гриммонд, Шон М. (2011). «МикроРНК и их изомиР действуют совместно, воздействуя на общие биологические пути» . Геномная биология . 12 (12):R1 дои : 10.1186/gb-2011-12-12-r126 . ISSN   1465-6906 . ПМЦ   3334621 . ПМИД   22208850 .
  32. ^ Миранда К.С., Хюинь Т., Тай Ю., Анг Ю.С., Там В.Л., Томсон А.М., Лим Б., Ригуцос I (2006). «Метод, основанный на шаблонах, для идентификации сайтов связывания микроРНК и соответствующих им гетеродуплексов» . Клетка . 126 (6): 1203–17. дои : 10.1016/j.cell.2006.07.031 . ПМИД   16990141 . S2CID   12749133 .
  33. ^ Льюис, BP; Бердж CB; Бартель Д.П. (14 января 2005 г.). «Консервативные пары семян, часто окруженные аденозинами, указывают на то, что тысячи человеческих генов являются мишенями микроРНК» . Клетка . 120 (1): 15–20. дои : 10.1016/j.cell.2004.12.035 . ПМИД   15652477 . S2CID   17316349 .
  34. ^ Гримсон, А; Фарх, КК; Джонстон, Западная Келли; Гаррет-Энгеле, П; Лим, LP; Бартель, ДП (6 июля 2007 г.). «Специфичность нацеливания микроРНК у млекопитающих: детерминанты, выходящие за рамки спаривания семян» . Молекулярная клетка . 27 (1): 91–105. doi : 10.1016/j.molcel.2007.06.017 . ПМК   3800283 . ПМИД   17612493 .
  35. ^ Фридман, Р.К.; Фарх, КК; Бердж, CB; Бартель, ДП (январь 2009 г.). «Большинство мРНК млекопитающих являются консервативными мишенями микроРНК» . Геномные исследования . 19 (1): 92–105. дои : 10.1101/гр.082701.108 . ПМЦ   2612969 . ПМИД   18955434 .
  36. ^ Гарсия, DM; Бэк, Д; Шин, С; Белл, ГВ; Гримсон, А; Бартель, ДП (11 сентября 2011 г.). «Слабая стабильность спаривания семян и большое количество целевых сайтов снижают эффективность lsy-6 и других микроРНК» . Структурная и молекулярная биология природы . 18 (10): 1139–46. дои : 10.1038/nsmb.2115 . ПМК   3190056 . ПМИД   21909094 .
  37. ^ Агарвал, Викрам; Белл, Джордж В.; Нам, Джин-Ву; Бартель, Дэвид П. (12 августа 2015 г.). «Прогнозирование эффективных целевых участков микроРНК в мРНК млекопитающих» . электронная жизнь . 4 : e05005. doi : 10.7554/eLife.05005 . ISSN   2050-084X . ПМЦ   4532895 . ПМИД   26267216 .
  38. ^ Агарвал, В.; Субтельный, АО; Тиру, П; Улицкий, И; Бартель, ДП (4 октября 2018 г.). «Прогнозирование эффективности нацеливания микроРНК на дрозофилу» . Геномная биология . 19 (1): 152. дои : 10.1186/s13059-018-1504-3 . ПМК   6172730 . ПМИД   30286781 .
  39. ^ Мазьер, П; Энрайт, А. (2007). «Прогнозирование мишеней микроРНК». Открытие наркотиков сегодня . 12 (11–12): 452–458. дои : 10.1016/j.drudis.2007.04.002 . ISSN   1359-6446 . ПМИД   17532529 .
  40. ^ Крек, А. Идентификация мишеней микроРНК. ДАИ-Б 70/07, (2010).
  41. ^ Герман М.А., Пиллэй М., Чон Д.Х., Хетавал А., Луо С., Джанарданан П., Каннан В., Римаркис Л.А., Нобута К., Герман Р., Де Паоли Э., Лу С., Шрот Г., Мейерс Б.С., Грин П.Дж. (2008). «Глобальная идентификация пар микроРНК-РНК-мишень путем параллельного анализа концов РНК». Нат. Биотехнология . 26 (8): 941–946. дои : 10.1038/nbt1417 . ПМИД   18542052 . S2CID   13187064 .
  42. ^ Аддо-Квай С., Эшу Т.В., Бартель Д.П., Экстелл М.Дж. (2008). «Эндогенные мишени миРНК и микроРНК, идентифицированные путем секвенирования деградома Arabidopsis» . Курс. Биол . 18 (10): 758–762. дои : 10.1016/j.cub.2008.04.042 . ПМК   2583427 . ПМИД   18472421 .
  43. ^ Буерманс, Хенк П.Дж.; Ариюрек, Явуз; ван Оммен, Гертьян; ден Даннен, Йохан Т; 'т Хоэн, Питер AC (2010). «Новые методы определения профиля экспрессии микроРНК на основе секвенирования следующего поколения» . БМК Геномика . 11 (1): 716. дои : 10.1186/1471-2164-11-716 . ISSN   1471-2164 . ПМК   3022920 . ПМИД   21171994 .
  44. ^ Чжан, Баохун, Ян, Цзянь-Хуа; Чжан, Чэнь, Сяо; Ло, Сюэ-Цюнь; Хуэй, Лян-Ху; Чен, Юэ-Цинь (2009). Полногеномный анализ малых РНК и новых микроРНК при остром лимфобластном лейкозе человека на основе подхода . экстенсивного « » секвенирования e6849 . Бибкод : 2009PLoSO...4.6849Z doi : 10.1371 / . ISSN   1932-6203 . .   journal.pone.0006849 : PMID   19724645 .
  45. ^ Jump up to: а б Джима, Д.Д.; Чжан, Дж.; Джейкобс, К.; Ричардс, КЛ; Данфи, Швейцария; Чой, WWL; Ян Ау, В.; Шривастава, Г.; Чадер, МБ; Риццери, Д.А.; Лагу, AS; Лугар, Польша; Манн, КП; Цветы, ЧР; Берналь-Мизрачи, Л.; Нареш, КН; Эвенс, А.М.; Гордон, Л.И.; Люфтиг, М.; Фридман, доктор медицинских наук; Вайнберг, Дж.Б.; Томпсон, Массачусетс; Гилл, Дж.И.; Лю, К.; Как, Т.; Грубор, В.; Гао, Ю.; Патель, А.; Ву, Х.; Чжу, Дж.; Блоб, GC; Липский, ЧП; Чадберн, А.; Дэйв, СС (2010). «Глубокое секвенирование транскриптома малой РНК нормальных и злокачественных В-клеток человека идентифицирует сотни новых микроРНК» . Кровь . 116 (23): е118–е127. doi : 10.1182/blood-2010-05-285403 . ISSN   0006-4971 . ПМК   3012600 . ПМИД   20733160 .
  46. ^ Старчиновский, Д.Т.; Морен, Р.; Макферсон, А.; Лам, Дж.; Чари, Р.; Вегжин, Дж.; Кухенбауэр, Ф.; Херст, М.; Тохьяма, К.; Хамфрис, РК; Лам, WL; Марра, М.; Карсан, А. (2010). «Полногеномная идентификация микроРНК человека, расположенных в геномных изменениях, связанных с лейкозом» . Кровь . 117 (2): 595–607. дои : 10.1182/кровь-2010-03-277012 . ISSN   0006-4971 . ПМИД   20962326 .
  47. ^ Келлер, Андреас; Бэкес, Кристина; Лейдингер, Петра; Кефер, Натали; Буагерен, Валеска; Барбачору, Каталин; Фогель, Бритта; Мацас, Марк; Хувер, Ханно; Катус, Хьюго А.; Сталер, Корд; Медер, Бенджамин; Миз, Эккарт (2011). «Секвенирование следующего поколения идентифицирует новые микроРНК в периферической крови больных раком легких». Молекулярные биосистемы . 7 (12): 3187–99. дои : 10.1039/c1mb05353a . ISSN   1742-206X . ПМИД   22027949 .
  48. ^ Jump up to: а б с Чан, Элси; Прадо, Даниэль Эстевес; Вайдхас, Джоан Барнс (2011). «Раковые микроРНК: от профилирования подтипов к предикторам ответа на терапию» . Тенденции молекулярной медицины . 17 (5): 235–243. doi : 10.1016/j.molmed.2011.01.008 . ISSN   1471-4914 . ПМК   3092835 . ПМИД   21354374 .
  49. ^ Jump up to: а б Бленкирон, Шери; Гольдштейн, Леонард Д.; Торн, Натали П; Спитери, Инмакулада; Чин, Сует-Феунг; Даннинг, Марк Дж; Барбоза-Морайш, Нуно Л; Тешендорфф, Эндрю Э; Грин, Эндрю Р.; Эллис, Ян О; Таваре, Симон ; Кальдас, Карлос; Миска, Эрик А. (2007). «Профилирование экспрессии микроРНК рака молочной железы человека идентифицирует новые маркеры подтипа опухоли» . Геномная биология . 8 (10): Р214. дои : 10.1186/gb-2007-8-10-r214 . ISSN   1465-6906 . ПМК   2246288 . ПМИД   17922911 .
  50. ^ Семпере, LF; Кристенсен, М.; Силахтароглу, А.; Бак, М.; Хит, резюме; Шварц, Г.; Уэллс, В.; Кауппинен, С.; Коул, Китай (2007). «Измененная экспрессия микроРНК, ограниченная определенными субпопуляциями эпителиальных клеток при раке молочной железы» . Исследования рака . 67 (24): 11612–11620. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-07-5019 . ISSN   0008-5472 . ПМИД   18089790 .
  51. ^ Мэтти, Майкл Д.; Бенц, Кристофер С; Бауэрс, Джессика; Сенсингер, Келли; Вонг, Линда; Скотт, Гэри К; Феделе, Вита; Гинзингер, Дэвид; Геттс, Роберт; Хакк, Крис (2006). «Оптимизированное высокопроизводительное профилирование экспрессии микроРНК обеспечивает новую оценку биомаркеров клинических биопсий рака простаты и молочной железы» . Молекулярный рак . 5 (1): 24. дои : 10.1186/1476-4598-5-24 . ISSN   1476-4598 . ПМЦ   1563474 . ПМИД   16784538 .
  52. ^ Jump up to: а б Иорио, МВ; Феррацин, М.; Лю, К.-Г.; Веронезе, А.; Спиццо, Р.; Саббиони, С.; Магри, Э.; Педриали, М.; Фаббри, М.; Кампильо, М.; Менар, С.; Палаццо, JP; Розенберг, А.; Мусиани, П.; Волынь, С.; Ненци, И.; Калин, Джорджия; Керцоли, П.; Негрини, М.; Кросс, CM (2005). «Нарушение регуляции экспрессии генов микроРНК при раке молочной железы человека» . Исследования рака . 65 (16): 7065–7070. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-05-1783 . ISSN   0008-5472 . ПМИД   16103053 .
  53. ^ Jump up to: а б Лоури, Аойф Дж; Миллер, Никола; Девани, Аманда; Макнил, Ройзин Э; Даворен, Памела А; Леметр, Кристоф; Бенеш, Владимир; Шмидт, Сабина; Блейк, Джонатон; Болл, Грэм; Керин, Майкл Дж (2009). «Сигнатуры микроРНК предсказывают состояние рецептора эстрогена, рецептора прогестерона и статуса рецептора HER2/neu при раке молочной железы» . Исследование рака молочной железы . 11 (3): С27. дои : 10.1186/bcr2257 . ISSN   1465-5411 . ПМК   2716495 . ПМИД   19432961 .
  54. ^ Ливани, Д.; Бенджамин, Х.; Гилад, С.; Эзагури, М.; Дов, А.; Ашкенази, К.; Гефен, Н.; Израэли, С.; Речави, Г.; Пасс, Х.; Нонака, Д.; Ли, Дж.; Спектор, Ю.; Розенфельд, Н.; Чаджут, А.; Коэн, Д.; Ахаронов Р.; Мансухани, М. (2009). «Диагностический анализ, основанный на экспрессии hsa-miR-205, позволяет отличить плоскоклеточный рак легких от неплоскоклеточного немелкоклеточного рака легких» . Журнал клинической онкологии . 27 (12): 2030–2037. дои : 10.1200/JCO.2008.19.4134 . ISSN   0732-183X . ПМИД   19273703 .
  55. ^ Уэда, Тецуя; Волиния, Стефано; Окумура, Хироши; Симидзу, Масаеши; Таччоли, Кристиан; Росси, Симона; Ольдер, Хансюрг; Лю, Чан-гун; Оуэ, Наохиде; Ясуи, Ватару; Ёсида, Кадзухиро; Сасаки, Хироки; Номура, Сачиё; Сето, Ясуюки; Каминиси, Мичио; Калин, Джордж А; Кроче, Карло М (2010). «Связь между экспрессией микроРНК, прогрессированием и прогнозом рака желудка: анализ экспрессии микроРНК» . Ланцет онкологии . 11 (2): 136–146. дои : 10.1016/S1470-2045(09)70343-2 . ISSN   1470-2045 . ПМК   4299826 . ПМИД   20022810 .
  56. ^ Ратнер, Елена С.; Так, Дэвид; Рихтер, Кристина; Наллур, Сунита; Патель, Раджешвари М.; Шульц, Винс; Хуэй, Пей; Шварц, Питер Э.; Резерфорд, Томас Дж.; Вайдхас, Джоан Б. (2010). «Сигнатуры микроРНК различают подтипы опухолей рака матки» . Гинекологическая онкология . 118 (3): 251–257. дои : 10.1016/j.ygyno.2010.05.010 . ISSN   0090-8258 . ПМЦ   2918705 . ПМИД   20542546 .
  57. ^ Jump up to: а б Фридман, Эдди; Дотан, Зоар; Баршак, Ирис; Дэвид, Мириам Бен; Дов, Авиталь; Табак, Сарит; Сион, Орит; Бенджамин, Сима; Бенджамин, Хила; Кукер, Хагит; Авиви, Камила; Розенблатт, Кинерет; Полак-Чарсон, Сильви; Рамон, Джейкоб; Розенфельд, Ницан; Спектор, Яэль (2010). «Точная молекулярная классификация опухолей почек с использованием экспрессии микроРНК» . Журнал молекулярной диагностики . 12 (5): 687–696. дои : 10.2353/jmoldx.2010.090187 . ISSN   1525-1578 . ПМЦ   2928434 . ПМИД   20595629 .
  58. ^ Jump up to: а б с Гутьеррес, Северная Каролина; Сараскете, Мэн; Мисевич-Кшеминская, И; Дельгадо, М; Де Лас Ривас, Дж; Тикона, ФВ; Ферминьян, Э; Мартин-Хименес, П; Шильон, К; Рисуэно, А; Эрнандес, Дж.М.; Гарсия-Санс, Р; Гонсалес, М; Сан-Мигель, Дж. Ф. (2010). «Дерегуляция экспрессии микроРНК в различных генетических подтипах множественной миеломы и корреляция с профилированием экспрессии генов» . Лейкемия . 24 (3): 629–637. дои : 10.1038/leu.2009.274 . ISSN   0887-6924 . ПМИД   20054351 .
  59. ^ Jump up to: а б с д Йонген-Лавренсич, М.; Солнце, СМ; Дейкстра, МК; Валк, ПДжМ; Ловенберг, Б. (2008). «Профилирование экспрессии микроРНК в связи с генетической гетерогенностью острого миелолейкоза» . Кровь . 111 (10): 5078–5085. дои : 10.1182/blood-2008-01-133355 . ISSN   0006-4971 . ПМИД   18337557 .
  60. ^ Jump up to: а б Гарсон, Р.; Гарофало, М.; Мартелли, член парламента; Бризевитц, Р.; Ван, Л.; Фернандес-Саймеринг, К.; Волыня, С.; Лю, К.-Г.; Шнитгер, С.; Хаферлах, Т.; Лисо, А.; Диверио, Д.; Манчини, М.; Мелони, Дж.; Фоа, Р.; Мартелли, МФ; Мекуччи, К.; Кроче, СМ; Фалини, Б. (2008). «Отличительная микроРНК острого миелолейкоза, несущая цитоплазматический мутировавший нуклеофосмин» . Труды Национальной академии наук . 105 (10): 3945–3950. Бибкод : 2008PNAS..105.3945G . дои : 10.1073/pnas.0800135105 . ISSN   0027-8424 . ПМК   2268779 . ПМИД   18308931 .
  61. ^ Маркуччи, Гвидо; Радмахер, Майкл Д.; Махарри, Сейчас; Мрозек, Кшиштоф; Руперт, Эми С.; Пашка, Питер; Вукосавлевич Тамара; Уитмен, Сьюзен П.; Бальдус, Клаудия Д.; Лангер, Кристиан; Лю, Чанг-Гонг; Кэрролл, Эндрю Дж.; Пауэлл, Баярд Л.; Гарсон, Рамиро; Кроче, Чарльз М.; Колитц, Джонатан Э.; Калиджури, Майкл А.; Ларсон, Ричард А.; Блумфилд, Клара Д. (2008). «Экспрессия микроРНК при цитогенетически нормальном остром миелолейкозе» . Медицинский журнал Новой Англии . 358 (18): 1919–1928. doi : 10.1056/NEJMoa074256 . ISSN   0028-4793 . ПМИД   18450603 .
  62. ^ Калин, Джордж Адриан; Феррасин, Мануэла; Чимино, Амелия; Ди Лева, Джанпьеро; Симидзу, Масаеши; Войчик, Сильвия Э.; Иорио, Марилена В.; Норка, Розовый; Север, Нуреттин Ильфер; Фаббри, Мюллер; Юлиано, Родольфо; Палумбо, Тициана; Пичиорри, Флавия; Рольдо, Клаудия; Гарсон, Рамиро; Севиньяни, Чинция; Рассенти, Лаура; Ольдер, Хансюрг; Волынь, Стефан; Лю, Чанг Гун; Киппс, Томас Дж.; Негрини, Массимо; Кроче, Карло М. (2005). «Сигнатура микроРНК, связанная с прогнозом и прогрессированием хронического лимфоцитарного лейкоза» . Медицинский журнал Новой Англии . 353 (17): 1793–1801. doi : 10.1056/NEJMoa050995 . ISSN   0028-4793 . ПМИД   16251535 .
  63. ^ Карамута, Стефано; Эгихази, Сюзанна; Родольфо, Моника; Виттен, Даниэла; Ханссон, Йохан; Ларссон, Катарина; Луи, Венг-Онн (2010). «Профили экспрессии микроРНК, связанные с мутационным статусом и выживаемостью при злокачественной меланоме» . Журнал исследовательской дерматологии . 130 (8): 2062–2070. дои : 10.1038/jid.2010.63 . ISSN   0022-202X . ПМИД   20357817 .
  64. ^ Линсен, Сэм Э.В.; де Вит, Эльцо; Янссенс, Жорж; Хитер, Шейла; Чепмен, Лаура; Паркин, Рэйчел К; Фриц, Брайан; Вайман, Стейша К; де Брейн, Юарт; Воест, Эмиль Э; Куерстен, Скотт; Тевари, Муниш; Куппен, Эдвин (2009). «Ограничения и возможности профилирования цифровой экспрессии генов малых РНК». Природные методы . 6 (7): 474–476. дои : 10.1038/nmeth0709-474 . ISSN   1548-7091 . ПМИД   19564845 . S2CID   7953265 .
  65. ^ Гит, А.; Двинге, Х.; Салмон-Дивон, М.; Осборн, М.; Каттер, К.; Хэдфилд, Дж.; Бертоне, П.; Кальдас, К. (2010). «Систематическое сравнение технологий профилирования микрочипов, ПЦР в реальном времени и технологий секвенирования нового поколения для измерения дифференциальной экспрессии микроРНК» . РНК . 16 (5): 991–1006. дои : 10.1261/rna.1947110 . ISSN   1355-8382 . ПМЦ   2856892 . ПМИД   20360395 .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=MicroRNA_sequencing&oldid=1189503178"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: dec6e0cd5f28fe55c1c5793db0d6c8ab__1702355940
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/de/ab/dec6e0cd5f28fe55c1c5793db0d6c8ab.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
MicroRNA sequencing - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)