предшественник микроРНК lin-4
| предшественник микроРНК lin-4 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности lin-4 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | лин-4 |
| Рфам | RF00052 |
| miRBase | МИ0000002 |
| семейство miRBase | МИПФ0000303 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Гены ; микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0035195 ПОЙДИТЕ: 0035068 |
| ТАК | ТАК: 0001244 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии lin-4 представляет собой микроРНК (миРНК), которая была идентифицирована в результате изучения сроков развития нематоды Caenorhabditis elegans . [ 1 ] [ 2 ] Это была первая открытая микроРНК — класс некодирующих РНК, участвующих в регуляции генов. [ 3 ] микроРНК транскрибируются как предшественники из ~70 нуклеотидов и впоследствии обрабатываются ферментом Dicer с образованием продукта из 21 нуклеотида. Размеры предшественников шпилек обычно не известны и оцениваются на основе предсказания шпилек. Считается, что эти продукты играют регуляторную роль за счет полной или частичной комплементарности мРНК. [ 1 Было обнаружено, что ген lin-4 находится в интроне размером 4,11 т.п.н. отдельного гена-хозяина (см. также ] ).
Транскрипция
[ редактировать ]lin-4 транскрибируется с автономных промоторов микроРНК и регулируется в процессе развития, при этом накопление микроРНК lin-4 происходит на стадии L2 постэмбрионального развития. В дополнение к этому происходит активация эндогенных первичных транскриптов lin-4 при появлении зрелой формы lin-4. [ 4 ] lin-4 обнаружен на хромосоме II у C. elegans и комплементарен последовательностям в 3'-нетранслируемой области (UTR) мРНК lin-14, этот комплементарный транскрипт содержит семь сайтов связывания вместе с 9-нуклеотидным коровым элементом CUCAGGGAA. Видно, что дуплекс lin-4:lin-14 имеет необычную изогнутую структуру, вызванную изменениями размеров канавок и укладки оснований из-за несовпадающих пар оснований. [ 4 ] Эта пара lin-4:lin-14 связана с путем IGF-1 у C. elegans в отношении их модификации развития. [ 5 ]
Влияние на развитие
[ редактировать ]lin-4 диктует начало личиночных стадий развития у C. elegans . Мутации потери функции (lf) lin-4 приводят к задержке развития, от первоначально ранних до более поздних личиночных стадий. Последствия включают гетерохронные модели развития с потерей таких структур, как вульва и кутикула взрослого человека. [ 1 ] lin-4 действует как отрицательный регулятор lin-14. [ 6 ] [ 7 ] и подавляет накопление белка LIN-14. [ 8 ] Он также нацелен на lin-28 и снижает экспрессию его белка за счет ингибирования трансляции. [ 9 ] Спаривание оснований между lin-4 и рассматриваемой мишенью является прерывистым и состоит из двух коротких спиралей. [ 10 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Ли Р.К., Фейнбаум Р.Л., Амброс В. (1993). C. elegans «Гетерохронный ген lin-4 кодирует малые РНК с антисмысловой комплементарностью к lin-14 » . Клетка . 75 (5): 843–854. дои : 10.1016/0092-8674(93)90529-Y . ПМИД 8252621 .
- ^ Ругви, А.Е. (2001). «Контроль сроков развития животных». Нат преподобный Жене . 2 (9): 690–701. дои : 10.1038/35088566 . ПМИД 11533718 .
- ^ Амброс, В. (2001). «микроРНК: крошечные регуляторы с огромным потенциалом» . Клетка . 107 (7): 823–826. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . ПМИД 11779458 .
- ^ Jump up to: а б Баласубраманян С., Оджа Р.П., Маити С., Дезидери А. (2010). «Отбор структуры неканонического комплекса микроРНК:мРНК lin-4:lin-14 с помощью молекулярно-динамического моделирования» . J Phys Chem B. 114 (49): 16443–9. дои : 10.1021/jp104193r . ПМИД 21090710 .
- ^ Бём М., Слэк Ф. (2005). «МикроРНК времени развития и ее мишень регулируют продолжительность жизни C. elegans» . Наука . 310 (5756): 1954–7. дои : 10.1126/science.1115596 . ПМИД 16373574 .
- ^ Амброс В., Хорвиц Х.Р. (1987). «Локус lin-14 Caenorhabditis elegans контролирует время проявления специфических событий постэмбрионального развития» . Генс Дев . 1 (4): 398–414. дои : 10.1101/gad.1.4.398 . ПМИД 3678829 .
- ^ Амброс V (1989). «Иерархия регуляторных генов контролирует переключение развития от личинки к взрослой особи у C. elegans» . Клетка . 57 (1): 49–57. дои : 10.1016/0092-8674(89)90171-2 . ПМИД 2702689 .
- ^ Олсен П.Х., Амброс В. (1999). «Регуляторная РНК lin-4 контролирует сроки развития Caenorhabditis elegans, блокируя синтез белка LIN-14 после инициации трансляции» . Дев Биол . 216 (2): 671–80. дои : 10.1006/dbio.1999.9523 . ПМИД 10642801 .
- ^ Багга С., Брахт Дж., Хантер С., Массирер К., Хольц Дж., Иакус Р. и др. (2005). «Регуляция с помощью микроРНК let-7 и lin-4 приводит к деградации целевой мРНК» . Клетка . 122 (4): 553–63. дои : 10.1016/j.cell.2005.07.031 . ПМИД 16122423 .
- ^ Амброс V (2001). «микроРНК: крошечные регуляторы с огромным потенциалом» . Клетка . 107 (7): 823–6. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . ПМИД 11779458 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]