Семейство предшественников микроРНК mir-8/mir-141/mir-200
| Семейство предшественников микроРНК mir-8/mir-141/mir-200 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности mir-8 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мне-8 |
| Рфам | RF00241 |
| miRBase | МИ0000128 |
| семейство miRBase | МИПФ0000019 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Гены ; микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0035195 ПОЙДИТЕ: 0035068 |
| ТАК | ТАК: 0001244 |
| PDB Структуры | ПДБе |
Предшественник микроРНК миР-8 ( гомологичный миР-141, миР-200 , миР-236) представляет собой короткую некодирующую РНК . ген, участвующий в регуляции генов . миР-8 у Drosophila melanogaster [ 1 ] экспрессируется из 3'-плеча родственных шпилек-предшественников (представленных здесь) вместе с миР-200, [ 2 ] миР-236, [ 1 ] миР-429 и гомолог миР-141 человека и мыши. Члены этого семейства предшественников в настоящее время предсказаны или экспериментально подтверждены у широкого круга видов. Границы предшественников прогнозируются на основе сохранения и спаривания оснований и обычно не известны.
Семейство миР-200 высококонсервативно у двусторонних животных, при этом миР-8 является единственным гомологом у дрозофилы . Соответственно, этот вид активно использовался в работах по раскрытию биологической функции семейства миР-200. [ 3 ] миР-8 наблюдалась на всех стадиях развития эмбриона и присутствует в культивируемых клетках S2 D. melanogaster . [ 1 ] Было замечено, что его экспрессия сильно активируется у личинок, и эта экспрессия затем сохраняется до взрослой жизни.
Мишени миР-8
[ редактировать ]Было показано, что ген атрофина является мишенью миР-8 дрозофилы . [ 4 ] с предположением, что эта мишень также консервативна в миР-8 млекопитающих. Наблюдалась повышенная активность атрофина у мутантных фенотипов miR-8, что, в свою очередь, вызывало повышенный нейрональный апоптоз, а также поведенческие дефекты. Увеличение мРНК атрофина у мутантов miR-8 происходит посттранскрипционно, при этом связывание miR-8 приводит к дестабилизации мРНК атрофина. миР-8 контролирует экспрессию атрофина in vivo непосредственно через сайты миР-8 в ее 3'UTR . Действительно, статистически значимое увеличение числа выживших взрослых после удаления одной копии гена атрофина показало, что мРНК атрофина является функционально важной мишенью in vivo. Это подтверждает теорию о том, что неправильная регуляция атрофина способствует дефектам, наблюдаемым у мутантов miR-8. Кроме того, было обнаружено, что уровни белка атрофина заметно выше в мозге с мутантной miR-8. [ 4 ] Нейронные эффекты миР-8 в клетках, экспрессирующих миР-8, вероятно, будут сконцентрированы в нейронах, экспрессирующих миР-8, поэтому они воздействуют только на определенные функции нейронов.
Между уровнями атрофина и регуляцией миР-8 существует целевая взаимосвязь настройки. [ 4 ] Уровень атрофина ниже уровня, достигаемого при регуляции миР-8, вреден для дальнейшего функционирования клеток, экспрессирующих миР-8. Уровень атрофина здесь необходим на оптимальном уровне, чтобы избежать дефектов развития, возникающих из-за снижения экспрессии атрофина.
Человеческая миР-200c, вероятно, нацелена на ген фактора транскрипции 8 цинковых пальцев (TCF8). [ 5 ]
Регуляция передачи сигналов инсулина
[ редактировать ]миР-8 вместе с миР-200 была идентифицирована как регулятор передачи сигналов инсулина в жировом теле дрозофилы , эквиваленте печени и жировой ткани вместе взятых. [ 3 ] Это привело к предположениям о дальнейшей роли этих двух членов этого семейства предшественников микроРНК. mir-8 регулирует размер тела у дрозофилы в сочетании с его мишенью USH, а гомолог миР-200 работает таким же образом со своей соответствующей мишенью FOG2. Фосфоинозитид-3-киназа (PI3K) представляет собой киназу, участвующую в каскаде фосфорилирования, которая после активации усиливает рост и пролиферацию клеток. USH и FOG2 способны ингибировать активность PI3K посредством прямого взаимодействия с его регуляторными субъединицами, dp60 и p85α соответственно. Это предотвращает образование активного комплекса PI3K. Повышенные уровни USH/F0G2 наблюдаются у личинок с нулевой миР-8/200, что приводит к снижению активности PI3K этих личинок. В присутствии миР-8/200 передача сигналов инсулина в области жирового тела усиливается, а дальнейшее увеличение размера клеток наблюдается при сверхэкспрессии миР-8/200. [ 3 ] Было обнаружено, что влияние миР-8/200 на рост клеток посредством передачи сигналов инсулина различается в разных типах тканей.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Лагос-Кинтана М., Раухут Р., Лендекель В., Тушл Т. (2001). «Идентификация новых генов, кодирующих малые экспрессируемые РНК» . Наука . 294 (5543): 853–8. дои : 10.1126/science.1064921 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F65F-2 . ПМИД 11679670 .
- ^ Лагос-Кинтана М, Раухут Р, Мейер Дж, Боркхардт А, Тушл Т (2003). «Новые микроРНК мыши и человека» . РНК . 9 (2): 175–9. дои : 10.1261/rna.2146903 . ПМК 1370382 . ПМИД 12554859 .
- ^ Jump up to: а б с Хён С., Ли Дж.Х., Джин Х., Нам Дж., Намкун Б., Ли Дж. и др. (2009). «Консервативная микроРНК миР-8/миР-200 и ее целевая USH/FOG2 контролируют рост путем регулирования PI3K» . Клетка . 139 (6): 1096–108. дои : 10.1016/j.cell.2009.11.020 . ПМИД 20005803 .
- ^ Jump up to: а б с Каррес Дж.С., Хильгерс В., Каррера И., Трейсман Дж., Коэн С.М. (2007). «Консервативная микроРНК МиР-8 настраивает уровень атрофина для предотвращения нейродегенерации у дрозофилы» . Клетка . 131 (1): 136–45. дои : 10.1016/j.cell.2007.09.020 . ПМИД 17923093 .
- ^ Урто Г.Дж., Карлсон Дж.А., Спивак С.Д., Брок Г.Дж. (2007). «Сверхэкспрессия микроРНК hsa-miR-200c приводит к снижению экспрессии фактора транскрипции 8 и увеличению экспрессии E-кадгерина». Рак Рез . 67 (17): 7972–6. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-07-1058 . ПМИД 17804704 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Запись в MirBase для дрозофилы миР-8
- Запись в MirBase для миР-141 человека
- Запись MirBase для мыши miR-141
- Запись в MirBase для миР-200 человека
- Запись MirBase для мыши miR-200
- Запись в MirBase о C. elegans миР-236
- Запись в МирБасе для миР-429