предшественник микроРНК mir-6
| предшественник микроРНК mir-6 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности mir-6 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | я-6 |
| Рфам | RF00143 |
| miRBase | MI0000124 |
| семейство miRBase | МИПФ0000119 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Гены ; микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0035195 ПОЙДИТЕ: 0035068 |
| ТАК | ТАК: 0001244 |
| PDB Структуры | ПДБе |
Предшественник микроРНК mir -6 предшественник представляет собой микроРНК- , специфичный для Drosophila видов . У Drosophila melanogaster есть три паралога mir-6, называемые dme-mir-6-1, dme-mir-6-2, dme-mir-6-3, которые сгруппированы вместе в геноме. Размеры этих шпилек-предшественников оцениваются на основе предсказания шпилек. Каждый предшественник образуется после расщепления более длинного первичного транскрипта в ядре и экспортируется в цитоплазму. В цитоплазме предшественники далее обрабатываются ферментом Dicer , генерируя ~22 нуклеотидных продукта из каждого плеча шпильки. Продукты, полученные из 3'-плеча каждого предшественника mir-6, имеют идентичные последовательности. Как 5'-, так и 3'-зрелые продукты проверены экспериментально. Экспериментальные данные показывают, что зрелые продукты шпилек mir-6 экспрессируются в ранних эмбрионах дрозофилы и нацелены на апоптотические гены, такие как hid , grim и rpr . [ 1 ]
Ссылки на дополнительные микроРНК
[ редактировать ]и миР-6 наблюдалась почти идеальная комплементарность Между миР-5 по 20/21 нуклеотиду. [ 2 ] Однако миР-5 лишь на незначительном уровне связана с любой из трех соответствующих последовательностей миР-6. Гены miR-6 расположены в кластере генов, содержащем другие микроРНК семейства, не относящиеся к K-боксу, включая микроРНК-3 и -309, а также ген mir-4 семейства Brd-бокса . Сопоставление показало, что миР-6 имеет тот же семейный мотив, что и миР-11 и миР-2b , вместе составляющие клан миР-2. Однако между этими членами клана имеется небольшое сходство в 3'-концах.
Апоптотическая регуляция
[ редактировать ]mir-6 играет ключевую роль в регуляции раннего апоптоза . Действительно, частота апоптоза значительно выше у эмбрионов, обедненных miR-6, по сравнению с контрольными эмбрионами, что указывает на то, что mir-6 действует на подавление апоптоза. Проапоптотический фактор Hid контролируется исключительно миР-6, которая регулирует его на посттранскрипционном уровне. Было обнаружено, что эмбрионы, обедненные miR-6, демонстрируют самый сильный фенотип среди всех членов семейства miR-2, что объясняется их взаимодействием с hid , проапоптотическим геном с самой широкой экспрессией и сильнейшим проапоптотическим эффектом. [ 3 ] Эмбрионы, которым инъецировали антисмысловой mir-6, не смогли дифференцировать нормальные внутренние и внешние структуры, при этом количество апоптотических клеток значительно увеличилось по сравнению с клетками дикого типа. [ 1 ] Дальнейшие исследования на эмбрионах бластодермы с обедненным miR-6 обнаружили нарушение образования полюсных клеток на заднем конце переднезадней оси, несмотря на нормальность как клеточной структуры, так и формирования раннего паттерна. [ 1 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Лиман Д., Чен П.Ю., Фак Дж., Ялчин А., Пирс М., Уннерстолл Ю., Маркс Д.С., Сандер С., Тушл Т., Галл Ю. (июль 2005 г.). «Антисмысловое истощение раскрывает важные и специфические функции микроРНК в развитии дрозофилы». Клетка . 121 (7): 1097–108. дои : 10.1016/j.cell.2005.04.016 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-EB54-F . ПМИД 15989958 .
- ^ Су Х, Колдуэлл HD (январь 1992 г.). «Иммуногенность химерного пептида, соответствующего эпитопам Т-хелперов и В-клеток главного белка внешней мембраны Chlamydia trachomatis» . Журнал экспериментальной медицины . 175 (1): 227–35. дои : 10.1084/jem.175.1.227 . ПМК 2119084 . ПМИД 1370528 .
- ^ Фигейрас А.М., Гонсалес-Хаэн М.Т., Кандела М., Бенито С. (2006). «Генная гетерозиготность, хромосомные обмены и приспособленность ржи: есть ли взаимосвязь?». Генетика . 128 (1–3): 273–86. дои : 10.1007/s10709-005-6242-2 . ПМИД 17028957 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]