Семейство предшественников микроРНК mir-196
| Семейство предшественников микроРНК mir-196 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности mir-196 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мир-196 |
| Рфам | RF00256 |
| miRBase | МИ0000238 |
| семейство miRBase | МИПФ0000031 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Гены ; микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0035195 ПОЙДИТЕ: 0035068 |
| ТАК | ТАК: 0001244 |
| PDB Структуры | ПДБе |
миР-196 представляет собой некодирующую РНК , называемую микроРНК , которая, как было показано, экспрессируется у людей ( MI0000238 , MI0000279 ) и мышей ( MI0000552 , MI0000553 ). [ 1 ] [ 2 ] МиР-196, по-видимому, является микроРНК, специфичной для позвоночных, и в настоящее время она предсказана или экспериментально подтверждена у широкого круга видов позвоночных ( MIPF0000031 ). У многих видов микроРНК, по-видимому, экспрессируется из межгенных областей в кластерах генов HOX. Предшественники шпилек прогнозируются на основе спаривания оснований и межвидовой консервации - их масштабы неизвестны. В этом случае зрелую последовательность вырезают из 5'-плеча шпильки.
Было высказано предположение, что редкий SNP ( rs11614913 ), который перекрывается с hsa-mir-196a-2, связан с немелкоклеточной карциномой легкого . [ 3 ]
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Лагос-Кинтана М, Раухут Р, Мейер Дж, Боркхардт А, Тушл Т (2003). «Новые микроРНК мыши и человека» . РНК . 9 (2): 175–9. дои : 10.1261/rna.2146903 . ПМК 1370382 . ПМИД 12554859 .
- ^ Лим Л.П., Гласнер М.Э., Йекта С., Бердж CB, Бартель Д.П. (2003). «Гены микроРНК позвоночных». Наука . 299 (5612): 1540. doi : 10.1126/science.1080372 . ПМИД 12624257 . S2CID 37750545 .
- ^ Ху З, Чен Дж, Тянь Т, Чжоу Икс, Гу Х, Сюй Л, Цзэн Ю, Мяо Р, Цзинь Г, Ма Х, Чен Ю, Шен Х (2008). «Генетические варианты последовательностей микроРНК и выживаемость при немелкоклеточном раке легкого» . Джей Клин Инвест . 118 (7): 2600–8. дои : 10.1172/JCI34934 . ПМК 2402113 . ПМИД 18521189 .
- ^ Чжан XW, Пан С.Д., Фэн YL, Лю JB, Донг Дж, Чжан YX, Чэнь JG, Ху ZB, Шэнь HB (2011). «[Связь между генетическим полиморфизмом в предшественнике микроРНК и генетической предрасположенностью к гепатоцеллюлярной карциноме]». Чжунхуа Юй Фан И Сюэ За Чжи . 45 (3): 239–43. ПМИД 21624236 .
- ^ Жорж М (2011). «Долгая и извилистая дорога от корреляции к причинно-следственной связи». Нат Жене . 43 (3): 180–1. дои : 10.1038/ng0311-180 . ПМИД 21350497 . S2CID 205341688 .
- ^ Брест П , Лапакетт П , Суиди М , Лебриганд К , Чезаро А , Вуре-Кравиари В , Мари Б , Барбри П , Монье Ж.Ф. , Эбютерн Икс , Арель-Беллан А , Мограби Б , Дарфей-Мишо А , Хофман П (2011) . «Синонимичный вариант IRGM изменяет сайт связывания миР-196 и вызывает дерегуляцию IRGM-зависимой ксенофагии при болезни Крона» . Нат Жене . 43 (3): 242–5. дои : 10.1038/ng.762 . ПМИД 21278745 . S2CID 11224420 .
- ^ Чен С., Чжан Ю, Чжан Л., Уикли С.М., Яо Ц (2011). «МикроРНК-196: решающая роль и клиническое применение в развитии и раке» . J Cell Мол Мед . 15 (1): 14–23. дои : 10.1111/j.1582-4934.2010.01219.x . ПМК 3276076 . ПМИД 21091634 .
- ^ Сканьолари С, Зингариелло П, Векьет Дж, Сельваджи С, Раччатти Д, Талиани Г, Рива Е, Пиццигалло Е, Антонелли Дж (2010). «Дифференциальная экспрессия интерферон-индуцированных микроРНК у пациентов с хронической инфекцией вируса гепатита С, получающих пегилированный интерферон альфа» . Вирол Дж . 7 : 311. дои : 10.1186/1743-422X-7-311 . ПМЦ 2996368 . ПМИД 21070682 .
- ^ Ли Ю, Чжан М, Чен Х, Донг З, Ганапати В, Тангараджу М, Хуан С (2010). «Соотношение миР-196 к информационной РНК HOXC8 коррелирует с миграцией и метастазированием клеток рака молочной железы» . Рак Рез . 70 (20): 7894–904. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-10-1675 . ПМЦ 2955846 . ПМИД 20736365 .
- ^ Гуан Ю, Мизогути М, Ёсимото К, Хата Н, Шоно Т, Сузуки СО, Араки Ю, Куга Д, Накамидзо А, Амано Т, Ма Х, Хаяши К, Сасаки Т (2010). «МиРНК-196 активируется при глиобластоме, но не при анапластической астроцитоме, и имеет прогностическое значение» . Клин Рак Рес . 16 (16): 4289–97. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-10-0207 . ПМИД 20601442 .
- ^ Асли Н.С., Кессель М. (2010). «Пространственно-временно ограниченная регуляция общих программ двигательных нейронов посредством репрессии Hoxb8, опосредованной миР-196». Дев Биол . 344 (2): 857–68. дои : 10.1016/j.ydbio.2010.06.003 . hdl : 11858/00-001M-0000-0011-F056-2 . ПМИД 20553899 .
- ^ Шотте Д., Ланге-Тюренхаут Э.А., Стампель Д.Д., Стам Р.В., Буйс-Гладдинес Дж.Г., Мейеринк Дж.П., Питерс Р., Ден Бур М.Л. (2010). «Экспрессия миР-196b не обусловлена исключительно MLL, но особенно связана с активацией генов HOXA при остром лимфобластном лейкозе у детей» . Гематологическая . 95 (10): 1675–82. дои : 10.3324/haematol.2010.023481 . ПМК 2948092 . ПМИД 20494936 .
- ^ Хоу В, Тянь Ц, Чжэн Дж, Бонковский Х.Л. (2010). «МикроРНК-196 подавляет экспрессию белка Bach1 и гена вируса гепатита С в клетках гепатомы человека, экспрессирующих вирусные белки гепатита С» . Гепатология . 51 (5): 1494–504. дои : 10.1002/hep.23401 . ПМЦ 2862129 . ПМИД 20127796 .
- ^ МакГлинн Э., Йекта С., Мэнсфилд Дж.Х., Соучек Дж., Бартель Д.П., Табин С.Дж. (2009). «Применение антагомиР in ovo указывает на роль миР-196 в формировании паттерна осевого скелета кур посредством регуляции гена Hox» . Proc Natl Acad Sci США . 106 (44): 18610–5. дои : 10.1073/pnas.0910374106 . ПМК 2773993 . ПМИД 19846767 .
- ^ Сем Т., Саксе С., Френцель С., Эчеверри К. (2009). «МиР-196 является важным регулятором ранней стадии регенерации хвоста, предшествующей ключевым событиям формирования паттерна спинного мозга» . Дев Биол . 334 (2): 468–80. дои : 10.1016/j.ydbio.2009.08.008 . ПМИД 19682983 .
- ^ Попович Р., Рисбек Л.Е., Велу К.С., Чаубей А., Чжан Дж., Ахилле Н.Дж., Эрфурт Ф.Е., Итон К., Лу Дж., Граймс Х.Л., Чен Дж., Роули Дж.Д., Железник-Ле Н.Дж. (2009). «Регуляция mir-196b с помощью MLL и его сверхэкспрессия слияниями MLL способствуют иммортализации» . Кровь . 113 (14): 3314–22. doi : 10.1182/blood-2008-04-154310 . ПМК 2665896 . ПМИД 19188669 .
- ^ Сонколи Э, Столе М, Пиварчи А (2008). «МикроРНК и иммунитет: новые игроки в регуляции нормальной иммунной функции и воспаления». Семин Рак Биол . 18 (2): 131–40. doi : 10.1016/j.semcancer.2008.01.005 . ПМИД 18291670 .
- ^ Уолтеринг Дж. М., Дерстон А. Дж. (2008). «МиР-10 подавляет HoxB1a и HoxB3a у рыбок данио» . ПЛОС ОДИН . 3 (1): e1396. дои : 10.1371/journal.pone.0001396 . ПМК 2148072 . ПМИД 18167555 .
- ^ Ричардсон М.К., Круойманс Р.П., Гроенен М.А. (2007). «Секвенирование и геномная аннотация Hox-кластеров курицы (Gallus Gallus) и картирование эволюционно консервативных регионов». Цитогенетический геном Res . 117 (1–4): 110–9. дои : 10.1159/000103171 . ПМИД 17675851 . S2CID 2643703 .
- ^ Кавасаки Х, Тайра К (2004). «МикроРНК-196 ингибирует экспрессию HOXB8 при миелоидной дифференцировке клеток HL60» . Нуклеиновые кислоты Symp Ser (Oxf) . 48 (48): 211–2. дои : 10.1093/насс/48.1.211 . ПМИД 17150553 .
- ^ Чопра В.С., Мишра РК (2006). « Чудеса в регуляции hox-генов» . Биоэссе . 28 (5): 445–8. doi : 10.1002/bies.20401 . ПМИД 16615131 .
- ^ Роншауген М., Бимар Ф., Пиль Дж., Левин М., Лай ЕС (2005). «МикроРНК iab-4 дрозофилы вызывает доминантную гомеотическую трансформацию жужжальца в крылья» . Генс Дев . 19 (24): 2947–52. дои : 10.1101/gad.1372505 . ПМЦ 1315399 . ПМИД 16357215 .
- ^ Хорнштейн Э., Мэнсфилд Дж.Х., Йекта С., Ху Дж.К., Харф Б.Д., Макманус М.Т., Баскервиль С., Бартель Д.П., Табин С.Дж. (2005). «МикроРНК миР-196 действует выше Hoxb8 и Shh в развитии конечностей». Природа . 438 (7068): 671–4. дои : 10.1038/nature04138 . ПМИД 16319892 . S2CID 2543608 .
- ^ Йекта С., Ши И.Х., Бартель Д.П. (2004). «МикроРНК-направленное расщепление мРНК HOXB8». Наука . 304 (5670): 594–6. дои : 10.1126/science.1097434 . ПМИД 15105502 . S2CID 20510339 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |