предшественник микроРНК mir-7
| предшественник микроРНК mir-7 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности mir-7 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мир-7 |
| Рфам | RF00053 |
| miRBase | MI0000263 |
| семейство miRBase | МИПФ0000022 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Гены ; микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0035195 ПОЙДИТЕ: 0035068 |
| ТАК | ТАК: 0001244 |
| PDB Структуры | ПДБе |
Это семейство представляет собой предшественник микроРНК (миРНК) mir-7. Эта микроРНК была предсказана или экспериментально подтверждена у широкого круга видов. [ 1 ] микроРНК транскрибируются как предшественники ~70 нуклеотидов (смоделированные здесь) и впоследствии обрабатываются ферментом Dicer с образованием продукта из ~22 нуклеотидов. В этом случае зрелая последовательность происходит из 5'- плеча предшественника. Размеры предшественников шпилек обычно не известны и оцениваются на основе предсказания шпилек. Участие Dicer в процессинге микроРНК предполагает связь с феноменом РНК-интерференции .
Зрелая миРНК-7 происходит от трех предшественников микроРНК в геноме человека: миР-7-1, миР-7-2 и миР-7-3. микроРНК нумеруются на основе последовательности зрелой РНК.
миР-7 напрямую регулируется транскрипционным фактором HoxD10. [ 2 ]
Считается, что микроРНК играют регуляторную роль за счет комплементарности мРНК. миР-7 необходима для поддержания регуляторной стабильности в условиях изменения окружающей среды. [ 3 ] Он играет важную роль в контроле экспрессии мРНК. Ген miR-7 обнаружен у большинства секвенированных видов Urbilateria , а последовательность его зрелого продукта miRNA прекрасно консервативна от кольчатых червей до человека, что указывает на сильную функциональную консервативность. [ 3 ]
Мишени миР-7
[ редактировать ]Биоинформационные прогнозы предполагают, что 3'-нетранслируемая область мРНК EGFR человека содержит три целевых сайта микроРНК-7 (миР-7), которые не консервативны у млекопитающих. [ 4 ] В фоторецепторных клетках дрозофилы миР-7 контролирует передачу сигналов рецептора эпидермального фактора роста (EGFR) и способствует дифференцировке фоторецепторов. [ 5 ] Среди других мишеней миР-7 — рецептор инсулиноподобного фактора роста 1 (IGF1R) и PIK3CD. [ 6 ] Семейство генов E (spl) [ 7 ] и Pak1 (раковые клетки). [ 2 ] c-Fos также является мишенью миР-7b у мышей. [ 8 ] Трансляция Pax6 в латеральной стенке субвентрикулярной зоны развитых мышей посттранскрипционно регулируется с помощью miRNA-7a-опосредованного молчания генов, которое необходимо для контроля скорости продукции дофаминергических нейронов в обонятельной луковице. [ 9 ]
Клиническая значимость
[ редактировать ]Множественные роли и мишени миР-7, а также характер ее экспрессии связаны с регуляторными механизмами и патогенезом глиобластомы . [ 10 ] рак молочной железы [ 11 ] и другие виды рака, [ 4 ] [ 6 ] [ 12 ] а также при шизофрении [ 13 ] и нарушения зрения. [ 14 ] Подавление подвижности, инвазивности, независимого от прикрепления роста и туморогенного потенциала высокоинвазивных клеток рака молочной железы за счет введения миР-7 предполагает сильный терапевтический потенциал миР-7. [ 2 ] [ 15 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Семейство генов микроРНК: mir-7 (92 последовательности)» . МиРБаза . Архивировано из оригинала 29 сентября 2007 г.
- ^ Перейти обратно: а б с Редди С.Д., Оширо К., Раяла С.К., Кумар Р. (октябрь 2008 г.). «МикроРНК-7, мишень гомеобокса D10, ингибирует p21-активируемую киназу 1 и регулирует ее функции» . Исследования рака . 68 (20): 8195–200. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-08-2103 . ПМЦ 3636563 . ПМИД 18922890 .
- ^ Перейти обратно: а б Ли X, Кэссиди Дж. Дж., Рейнке К. А., Фишбёк С., Картью Р. В. (апрель 2009 г.). «МикроРНК придает устойчивость к колебаниям окружающей среды во время развития» . Клетка . 137 (2): 273–82. дои : 10.1016/j.cell.2009.01.058 . ПМЦ 2674871 . ПМИД 19379693 .
- ^ Перейти обратно: а б Вебстер Р.Дж., Джайлз К.М., Прайс К.Дж., Чжан П.М., Мэттик Дж.С., Лидман П.Дж. (февраль 2009 г.). «Регуляция передачи сигналов рецептора эпидермального фактора роста в раковых клетках человека с помощью микроРНК-7» . Журнал биологической химии . 284 (9): 5731–41. дои : 10.1074/jbc.M804280200 . ПМИД 19073608 .
- ^ Ли Икс, Картью Р.В. (декабрь 2005 г.). «МикроРНК опосредует передачу сигналов рецептора EGF и способствует дифференцировке фоторецепторов в глазу дрозофилы» . Клетка . 123 (7): 1267–77. дои : 10.1016/j.cell.2005.10.040 . ПМИД 16377567 .
- ^ Перейти обратно: а б Цзян Л., Лю X, Чэнь Z, Цзинь Ю, Хайдбредер CE, Колокитас А, Ван А, Дай Ю, Чжоу X (ноябрь 2010 г.). «МикроРНК-7 нацелена на IGF1R (рецептор инсулиноподобного фактора роста 1) в клетках плоскоклеточного рака языка» . Биохимический журнал . 432 (1): 199–205. дои : 10.1042/BJ20100859 . ПМК 3130335 . ПМИД 20819078 .
- ^ Старк А., Бреннеке Дж., Рассел Р.Б., Коэн С.М. (декабрь 2003 г.). «Идентификация мишеней микроРНК дрозофилы» . ПЛОС Биология . 1 (3): Е60. doi : 10.1371/journal.pbio.0000060 . ПМК 270017 . ПМИД 14691535 .
- ^ Ли Х.Дж., Палковиц М., Янг В.С. (октябрь 2006 г.). «МиР-7b, микроРНК, активация которой повышается в гипоталамусе после хронической гиперосмолярной стимуляции, ингибирует трансляцию Fos» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (42): 15669–74. дои : 10.1073/pnas.0605781103 . ПМЦ 1622879 . ПМИД 17028171 .
- ^ де Шевиньи А (2012). «Регуляция Pax6 миР-7а контролирует пространственное происхождение дофаминергических нейронов переднего мозга». Природная неврология . 15 (8): 1120–1126. дои : 10.1038/nn.3142 . ПМИД 22729175 . S2CID 8456253 .
- ^ Кефас Б., Годлевски Дж., Комо Л., Ли Ю., Абунадер Р., Хокинсон М., Ли Дж., Файн Х., Чиокка Э.А., Лоулер С., Пуроу Б. (май 2008 г.). «МикроРНК-7 ингибирует рецептор эпидермального фактора роста и путь Akt и снижается при глиобластоме» . Исследования рака . 68 (10): 3566–72. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-07-6639 . ПМИД 18483236 .
- ^ Фокенс Дж.А., Сьювертс А.М., Смид М., Лук М.П., де Верд В., Бурсма А.В., Клин Дж.Г., Вимер Э.А., Мартенс Дж.В. (сентябрь 2008 г.). «Четыре микроРНК связаны с агрессивностью рака молочной железы человека, отрицательного по лимфатическим узлам и положительного по эстрогеновым рецепторам» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (35): 13021–6. Бибкод : 2008PNAS..10513021F . дои : 10.1073/pnas.0803304105 . ПМК 2529088 . ПМИД 18755890 .
- ^ Веерла С., Линдгрен Д., Квист А., Фригеси А., Стааф Дж., Перссон Х., Лидберг Ф., Чебил Г., Гудьонссон С., Борг А., Монссон В., Ровира С., Хёглунд М. (май 2009 г.). «Экспрессия микроРНК при уротелиальных карциномах: важная роль миР-10а, миР-222, миР-125b, миР-7 и миР-452 для стадии опухоли и метастазирования, а также частые гомозиготные потери миР-31» . Международный журнал рака . 124 (9): 2236–42. дои : 10.1002/ijc.24183 . ПМИД 19127597 .
- ^ Перкинс Д.О., Джеффрис К.Д., Ярског Л.Ф., Томсон Дж.М., Вудс К., Ньюман М.А., Паркер Дж.С., Джин Дж., Хаммонд С.М. (2007). «Экспрессия микроРНК в префронтальной коре больных шизофренией и шизоаффективным расстройством» . Геномная биология . 8 (2): С27. дои : 10.1186/gb-2007-8-2-r27 . ПМЦ 1852419 . ПМИД 17326821 .
- ^ Арора А., Маккей Дж.Дж., Симпсон Д.А. (сентябрь 2007 г.). «Прогнозирование и проверка экспрессии микроРНК в сетчатке человека и крысы» . Исследовательская офтальмология и визуальные науки . 48 (9): 3962–7. дои : 10.1167/iovs.06-1221 . ПМИД 17724173 .
- ^ Чешский депутат (март 2006 г.). «МикроРНК как терапевтические мишени». Медицинский журнал Новой Англии . 354 (11): 1194–5. doi : 10.1056/NEJMcibr060065 . ПМИД 16540623 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Лагос-Кинтана М., Раухут Р., Лендекель В., Тушль Т. (октябрь 2001 г.). «Идентификация новых генов, кодирующих малые экспрессируемые РНК». Наука . 294 (5543): 853–8. Бибкод : 2001Sci...294..853L . дои : 10.1126/science.1064921 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F65F-2 . ПМИД 11679670 . S2CID 18101169 .
- Амброс V (декабрь 2001 г.). «микроРНК: крошечные регуляторы с огромным потенциалом» . Клетка . 107 (7): 823–6. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . ПМИД 11779458 .
- Чен Х., Шалом-Фейерштейн Р., Райли Дж., Чжан С.Д., Туччи П., Агостини М., Абердам Д., Найт Р.А., Генчи Г., Никотера П., Мелино Г., Васа-Никотера М. (апрель 2010 г.). «МиР-7 и миР-214 специфически экспрессируются во время дифференцировки нейробластомы, развития коры и дифференцировки эмбриональных стволовых клеток, а также контролируют рост нейритов in vitro». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 394 (4): 921–7. дои : 10.1016/j.bbrc.2010.03.076 . ПМИД 20230785 .
- Доксакис Э (апрель 2010 г.). «Посттранскрипционная регуляция экспрессии альфа-синуклеина с помощью mir-7 и mir-153» . Журнал биологической химии . 285 (17): 12726–34. дои : 10.1074/jbc.M109.086827 . ПМЦ 2857101 . ПМИД 20106983 .
- Пек Дж.В., Лим А.К., Кай Т. (сентябрь 2009 г.). «Водоворот дрозофилы обеспечивает правильную дифференцировку стволовых клеток зародышевой линии путем репрессии микроРНК-7» . Развивающая клетка . 17 (3): 417–24. дои : 10.1016/j.devcel.2009.07.017 . ПМИД 19758565 .
- Джунн Э, Ли К.В., Чон Б.С., Чан Т.В., Им Дж.Ю., Мурадиан М.М. (август 2009 г.). «Подавление экспрессии альфа-синуклеина и токсичности микроРНК-7» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (31): 13052–7. Бибкод : 2009PNAS..10613052J . дои : 10.1073/pnas.0906277106 . ПМЦ 2722353 . ПМИД 19628698 .
- Корреа-Медина М., Браво-Эгана В., Розеро С., Рикорди С., Эдлунд Х., Диес Дж., Пастори Р.Л. (апрель 2009 г.). «МикроРНК миР-7 преимущественно экспрессируется в эндокринных клетках поджелудочной железы развивающегося и взрослого человека». Паттерны экспрессии генов . 9 (4): 193–9. дои : 10.1016/j.gep.2008.12.003 . ПМИД 19135553 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница предшественника микроРНК mir-7 в Rfam
- Пуроу, Бенджамин (декабрь 2008 г.). «МИР7-1 (микроРНК 7-1)» . Атлас генетики и цитогенетики в онкологии и гематологии .