мир-127
| мир-127 | |
|---|---|
 Вторичная структура и сохранение последовательности микроРНК миР-127 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мир-127 |
| Рфам | RF00676 |
| семейство miRBase | МИПФ0000080 |
| Ген NCBI | 406914 |
| HGNC | 31509 |
| МОЙ БОГ | 611709 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты ; |
| PDB Структуры | ПДБе |
МикроРНК mir-127 представляет собой короткую некодирующую молекулу РНК с интересной перекрывающейся генной структурой. Функция миР-127 регулирует уровни экспрессии генов, участвующих в развитии легких, формировании плаценты и апоптозе . Аберрантная экспрессия миР-127 связана с различными видами рака.
Генная структура
[ редактировать ]pri-miR-127 происходит из отдельного, но перекрывающегося кластера консервативных генов, кодирующего миР-433/127. миР-127 и миР-433 перекрываются в направлении 5'-3'. [ 1 ] Хотя локусы можно было найти в разных хромосомах у разных видов, структура сохранилась. У млекопитающих, включая человека, шимпанзе, лошадь, собаку, обезьяну, крысу, корову и мышь, множественное выравнивание последовательностей (MSA) между миР-433 и миР127 показало 95-100% сходство с консервативным расстоянием между миР-433 и миР-127. 127 от 986 до 1007 п.н. Более того, вышестоящие элементы ответа в промоторах миР-433/127, включая элемент ответа эстрогенсвязанных рецепторов (ERRE), были консервативны среди вышеупомянутых видов. Данные позволяют предположить, что локусы миР-433/127 могли возникнуть из общего гена происхождения. [ 2 ]
Регуляция транскрипции
[ редактировать ]Сайты связывания факторов транскрипции, расположенные выше предшественника микроРНК, играют роль в регуляции транскрипции. Активация промоторов миР-127 и миР-433 опосредуется эстрогенсвязанным гамма-рецептором (ERRgamma, NR3B3), который физически связывается с их эндогенными промоторами. Ингибирование регулируется малым гетеродимером-партнером (SHP), который действует в транс. [ 3 ] Хотя миР-127 и миР-433 имеют общие регуляторные элементы, они имеют независимые промоторы и наблюдается их дифференциальный характер экспрессии. [ 4 ]
Функциональные роли
[ редактировать ]Снижение регуляции импринтированного гена Rtl1
[ редактировать ]Rtl1 является ключевым геном в формировании плаценты, а потеря или сверхэкспрессия Rlt1 приводит к поздней плодной или неонатальной смертности у мышей. [ 5 ] миР-127 расположена вблизи CpG-островков в импринтированной области, кодирующей rtl1, и обычно транскрибируется в антисмысловой ориентации по отношению к гену. Эктопическая экспрессия миР-127 приводила к снижению экспрессии Rtl1 в клетках Hela человека и Heppa-1 мыши.
Эксперименты, проведенные на мышах, показали, что Rtl1 транскрибируется только с отцовской хромосомы, тогда как материнский аллель деградирует. Однако миР-127 и миР-136 экспрессируются только по материнской линии в соматических клетках и, таким образом, играют роль в антисмысловой регуляции импринтинга Rtl1. Статус аберрантного метилирования Rtl1 и miR-127 указывает на то, что эпигенетическое программирование . в этом процессе также участвует [ 2 ]
Контроль развития легких плода
[ редактировать ]миР-127 высоко экспрессируется на поздней стадии развития плода. Нарушение системы из-за сверхэкспрессии миР-127 в системе культуры органов легких плода привело к дефектному развитию, проявляющемуся в уменьшении количества конечных почек и изменении размеров почек. [ 6 ]
Роль в болезни
[ редактировать ]Диффузная крупноклеточная В-клеточная лимфома
[ редактировать ]Повышение уровня экспрессии миР-127 вызывало снижение уровня экспрессии белка В-клеточной лимфомы 6 , протоонкогена, который обычно подвергается гипермутации при диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме (DLCL) . [ 7 ] [ 8 ] Более того, дифференциальная экспрессия миР-127 была обнаружена при разных типах DLCL. Уровни миР-127 были значительно выше в DLCL яичка по сравнению с DLCL узловой и центральной нервной системы, что подразумевает различную биологическую сущность DLCL в разных местах. [ 9 ]
Гепатоцеллюлярная карцинома
[ редактировать ]Подавление экспрессии миР-127 связано с гепатоцеллюлярной карциномой. Механистическая связь была подтверждена изменением белка BCL6, на который нацелена миР-127. [ 10 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Сун Г, Ван Л (2008). Вольф, Жан-Николя (ред.). «МиР-433 и миР-127 возникают из независимых перекрывающихся первичных транскриптов, кодируемых локусом миР-433-127» . ПЛОС ОДИН . 3 (10): е3574. дои : 10.1371/journal.pone.0003574 . ПМК 2570487 . ПМИД 18974780 .
- ^ Jump up to: а б Сон Г, Ван Л (2009). Тора, Ласло (ред.). «Консервативная структура гена и регуляция экспрессии миР-433 и миР-127 у млекопитающих» . ПЛОС ОДИН . 4 (11): е7829. дои : 10.1371/journal.pone.0007829 . ПМЦ 2778354 . ПМИД 19946636 .
- ^ Ван Л., Лю Дж., Саха П. и др. (октябрь 2005 г.). «Сиротский ядерный рецептор SHP регулирует экспрессию PGC-1альфа и выработку энергии в коричневых адипоцитах» . Клеточные метаб . 2 (4): 227–38. дои : 10.1016/j.cmet.2005.08.010 . ПМИД 16213225 .
- ^ Сон Г, Ван Л (октябрь 2008 г.). «Механизм транскрипции парных генов миР-433 и миР-127 с помощью ядерных рецепторов SHP и ERRgamma» . Нуклеиновые кислоты Рез . 36 (18): 5727–35. дои : 10.1093/нар/gkn567 . ПМК 2566885 . ПМИД 18776219 .
- ^ Секита И., Вагацума Х., Накамура К. и др. (февраль 2008 г.). «Роль импринтированного гена, полученного из ретротранспозона, Rtl1, в фето-материнском интерфейсе плаценты мыши». Нат. Жене 40 (2): 243–8. дои : 10.1038/ng.2007.51 . ПМИД 18176565 . S2CID 5455176 .
- ^ Бхаскаран М., Ван Ю., Чжан Х. и др. (май 2009 г.). «МикроРНК-127 модулирует развитие легких плода» . Физиол. Геномика . 37 (3): 268–78. doi : 10.1152/физиологгеномика.90268.2008 . ПМЦ 2685501 . ПМИД 19439715 .
- ^ Лу Дж., Гетц Г., Миска Е.А. и др. (июнь 2005 г.). «Профили экспрессии микроРНК классифицируют рак человека». Природа . 435 (7043): 834–8. дои : 10.1038/nature03702 . ПМИД 15944708 . S2CID 4423938 .
- ^ Сайто Ю., Лян Г., Эггер Дж. и др. (июнь 2006 г.). «Специфическая активация микроРНК-127 с подавлением протоонкогена BCL6 препаратами, модифицирующими хроматин, в раковых клетках человека» . Раковая клетка . 9 (6): 435–43. дои : 10.1016/j.ccr.2006.04.020 . ПМИД 16766263 .
- ^ Робертус Дж.Л., Хармс Г., Блокзейл Т. и др. (апрель 2009 г.). «Специфическая экспрессия миР-17-5p и миР-127 в диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме яичек и центральной нервной системы» . Мод. Патол . 22 (4): 547–55. дои : 10.1038/modpathol.2009.10 . ПМИД 19287466 .
- ^ Трындяк В.П., Росс С.А., Беланд Ф.А., Погрибный ИП (июнь 2009 г.). «Понижающая регуляция микроРНК миР-34а, миР-127 и миР-200b в печени крыс во время гепатокарциногенеза, индуцированная диетой с дефицитом метила» . Мол. Карциног . 48 (6): 479–87. дои : 10.1002/mc.20484 . ПМИД 18942116 . S2CID 25308355 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Сайто Ю., Лян Г., Эггер Дж., Фридман Дж. М., Чуанг Дж. К., Кутзи Г. А., Джонс П. А. (2006). «Специфическая активация микроРНК-127 с подавлением протоонкогена BCL6 препаратами, модифицирующими хроматин, в раковых клетках человека» . Раковая клетка . 9 (6): 435–43. дои : 10.1016/j.ccr.2006.04.020 . ПМИД 16766263 .
- Цуй XS, Чжан DX, Ко Ю.Г., Ким Н.Х. (2009). «Аберрантное эпигенетическое перепрограммирование импринтированных микроРНК-127 и Rtl1 в клонированных эмбрионах мыши». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 379 (2): 390–4. дои : 10.1016/j.bbrc.2008.12.148 . ПМИД 19126398 .
- Чжан С, Ван С, Чен Икс, Ян С, Ли К, Ван Дж, Дай Дж, Ху Цзы, Чжоу Икс, Чэнь Л, Чжан Ю, Ли Ю, Цю Х, Син Дж, Лян З, Рен Б, Ян С , Зен К., Чжан Ц.И. (декабрь 2010 г.). «Профиль экспрессии микроРНК в сыворотке: отпечаток пальца плоскоклеточного рака пищевода» . Клин. Хим . 56 (12): 1871–9. дои : 10.1373/clinchem.2010.147553 . ПМИД 20943850 .