MiR-433
| MiR-433 | |
|---|---|
 MIR-433 МикроРНК Вторичная структура и сохранение последовательности | |
| Идентификаторы | |
| Символ | MiR-433 |
| RFAM | RF00748 |
| Семейство mirbase | MIPF0000177 |
| Ген NCBI | 574034 |
| HGNC | 32026 |
| Омим | 611711 |
| Другие данные | |
| РНК тип | Микрорну |
| Домен (ы) | Эукариота ? Евтерия ? |
| PDB Структуры | PDBE |
В молекулярной биологии miR-433 представляет собой короткую некодирующую молекулу РНК. МикроРНК (miRNAs) функционируют как посттранскрипционные регуляторы уровней экспрессии других генов с помощью нескольких механизмов. [ 1 ] Они играют роль в разработке, метаболизме и канцерогенезе. [ 2 ]
Геномная структура и регуляция
[ редактировать ]MiR-433 является одним из 21 микроРНК, найденных в кластере на хромосоме 12. [ 3 ]
3 'кодирующая область miR-433 также является промотором соседнего гена miRNA: miR-127 . [ 3 ] Два гена перекрываются и транскрибируются в той же ориентации. [ 2 ] Это метод, с помощью которого генетическая информация может храниться компактным и эффективным способом. [ 2 ]
MiR-433, наряду с другими двадцатью генами в кластере, активируется у с небольшим гетеродимерным партнером (SHP). гомозиготных нокаутных мышей [ 3 ]
SHP is a nuclear receptor known to repress transcription, and it has a role in some metabolic diseases. Conversely, the transcription of mir-433 has been shown to be activated by estrogen related receptor (ERR).[3]
MiR-433 высоко консервативен по видам, будучи схожим на 95% у человека, шимпанзе, лошади, собаки, обезьяны, крысы, коров и мыши. [ 4 ] Расстояние между miR-433 и miR-127 также было одинаковым по этим видам; Как и позиционирование мотивов связывания транскрипционного фактора , в том числе для ERR. Это указывает на то, что регуляция генов, а также первичная последовательность сохраняется среди этих видов млекопитающих.
Также предполагается, что miR-433 и miR-127, вероятно, возникли из общего гена предков. [ 4 ]
Ассоциация болезней
[ редактировать ]Было обнаружено, что уровни miR-433 повышаются при раке желудка , путем исследования с микрочипами гена miRNA . MiR-433 регулирует экспрессию GRB2 , известного белка, ассоциированного с опухолем, который может быть объяснением этой ассоциации. [ 5 ]
Такая связь не была обнаружена между вариациями miR-433 и болезнью Паркинсона [ 6 ] Несмотря на то, что изменение в области гена FGF20 , которое связывается с miR-433, связано с болезнью Паркинсона.
MiR-433 также был связан с доминирующей унаследованной формой x связанной хондродисплазии. [ 7 ] MiR-433 обычно подавляет экспрессию HDAC6 . Было обнаружено, что один нуклеотидный полиморфизм (SNP) в 3' -нетранслируемой области (UTR) HDAC6 отделяется с хондродисплазией. Этот SNP удаляет способность miR-433 подавлять HDAC6, что приводит к его сверхэкспрессии. Следовательно, существует уменьшенное ацетилирование его мишени, альфа -тубулин , вызывая заболевание. [ 7 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Cullen BR (декабрь 2004 г.). «Транскрипция и обработка предшественников микроРНК человека» . Мол Клетка . 16 (6): 861–865. doi : 10.1016/j.molcel.2004.12.002 . PMID 15610730 .
- ^ Jump up to: а беременный в Song G, Wang L (2008). Volff JN (ред.). «MiR-433 и miR-127 возникают из независимых перекрывающихся первичных транскриптов, кодируемых локусом miR-433-127» . Plos один . 3 (10): E3574. doi : 10.1371/journal.pone.0003574 . PMC 2570487 . PMID 18974780 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Song G, Wang L (2008). «Механизм транскрипции для парных генов miR-433 и miR-127 с помощью ядерных рецепторов Shp и Errgamma» . Нуклеиновые кислоты Res . 36 (18): 5727–5735. doi : 10.1093/nar/gkn567 . PMC 2566885 . PMID 18776219 .
- ^ Jump up to: а беременный Song G, Wang L (2009). Тора Л (ред.). «Консервативная структура гена и регуляция экспрессии miR-433 и miR-127 у млекопитающих» . Plos один . 4 (11): E7829. doi : 10.1371/journal.pone.0007829 . PMC 2778354 . PMID 19946636 .
- ^ Luo H, Zhang H, Zhang Z, Zhang X, Ning B, Guo J, Nie N, Liu B, Wu X (2009). «Понижаемый miR-9 и miR-433 при раке желудка человека» . J Exp Clin Cancer Res . 28 (1): 82. doi : 10.1186/1756-9966-28-82 . PMC 2739520 . PMID 19531230 .
- ^ De Mena L, Cardo LF, Coto E, Miar A, Dãaaz M, Corao AI, Alonso B, Ricacoba R, Salvador C, Menéndez M, Moräs G, Alvarez V (2010). «Изменение FGF20 RS12720208 SNP и Microrna-433: нет связи с болезнью Паркинсона у испанских пациентов». Neurosci Lett . 479 (1): 22–25. Doi : 10.1016/j.nelet.2010.05.019 . PMID 20471450 . S2CID 15904325 .
- ^ Jump up to: а беременный Simon D, Laloo B, Barillot M, Barnetche T, Blanchard C, Rooryck C, Marche M, Burgelin I, Coupry I, Chassaing N, Gilbert-Dussardier B, Lacombe D, Grosset C, Arveiler B (2010). «Мутация в 3'-UTR гена HDAC6, отменяющая посттранскрипционную регуляцию, опосредованную HSA-MIR-433, связана с новой формой доминантной x-связанной хондродисплазии» . Hum Mol Genet . 19 (10): 2015–2027. doi : 10.1093/hmg/ddq083 . PMID 20181727 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]