Семейство предшественников микроРНК mir-160
| Семейство предшественников микроРНК mir-160 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности мир-160 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мир-160 |
| Рфам | RF00247 |
| miRBase | MI0000190 |
| семейство miRBase | МИПФ0000032 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Гены ; микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0035195 ПОЙДИТЕ: 0035068 |
| ТАК | ТАК: 0001244 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мир -160 представляет собой микроРНК , которая была предсказана или экспериментально подтверждена у ряда видов растений , включая Arabidopsis thaliana (кресс-салат мышиных ушей) и Oryza sativa (рис). [ 1 ] Предполагается, что миР-160 будет связывать комплементарные сайты в нетранслируемых областях на ауксин факторов ответа генов , чтобы регулировать их экспрессию. [ 2 ] Предшественники шпилек (представленные здесь) прогнозируются на основе спаривания оснований и межвидового сохранения; их размеры неизвестны. В этом случае зрелая последовательность вырезается из 5'-плеча шпильки .
В частности, считается, что 3 из 23 генов фактора ауксинового ответа A. thaliana посттранскрипционно регулируются с помощью mir-160. [ 3 ] [ 4 ] Когда одной из этих мишеней (ARF17) манипулируют, чтобы она стала устойчивой к микроРНК, развития . у растения-хозяина можно наблюдать несколько дефектов [ 3 ] Этот эксперимент был повторен с другой мишенью mir-160, ARF10, и результаты подчеркнули регуляторную роль в постэмбриональном развитии и прорастании семян . [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Семейство генов микроРНК: MIR160» . мирБАЗА . Университет Манчестера. Архивировано из оригинала 15 июля 2012 года . Проверено 5 сентября 2011 г.
- ^ Роудс М.В., Рейнхарт Б.Дж., Лим Л.П., Бердж CB, Бартель Б., Бартель Д.П. (август 2002 г.). «Прогнозирование мишеней микроРНК растений» . Клетка . 110 (4): 513–20. дои : 10.1016/S0092-8674(02)00863-2 . ПМИД 12202040 .
- ^ Jump up to: а б Мэллори AC, Бартель Д.П., Бартель Б. (май 2005 г.). «Направленная микроРНК регуляция AUXIN RESPONSE FACTOR17 Arabidopsis необходима для правильного развития и модулирует экспрессию ранних генов ответа на ауксин» . Растительная клетка . 17 (5): 1360–75. дои : 10.1105/tpc.105.031716 . ПМЦ 1091760 . ПМИД 15829600 .
- ^ Лю X, Хуан Дж, Ван Ю, Ханна К, Се З, Оуэн ХА, Чжао Д (май 2010 г.). «Роль цветочных органов в плодолистиках, мутация потери функции Arabidopsis в микроРНК160a, в органогенезе и механизм, регулирующий ее экспрессию» . Заводской журнал . 62 (3): 416–28. дои : 10.1111/j.1365-313X.2010.04164.x . ПМИД 20136729 .
- ^ Лю П.П., Монтгомери Т.А., Фальгрен Н., Кашау К.Д., Ноногаки Х., Кэррингтон Дж.К. (октябрь 2007 г.). «Подавление AUXIN RESPONSE FACTOR10 с помощью микроРНК160 имеет решающее значение для прорастания семян и послепрорастания» . Заводской журнал . 52 (1): 133–46. дои : 10.1111/j.1365-313X.2007.03218.x . ПМИД 17672844 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]