Семейство предшественников микроРНК mir-3180
| мир-3180 | |
|---|---|
 Консервативная вторичная структура микроРНК mir- 3180 . | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мир-3180 |
| Рфам | РФ02010 |
| семейство miRBase | МИПФ0000894 |
| HGNC | 38382 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты ; многоклеточные животные |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии микроРНК mir-3180 представляет собой короткую молекулу РНК . МикроРНК регулируют уровни экспрессии других генов с помощью нескольких механизмов. [ 1 ] Предшественник микроРНК mir -10 представляет собой короткий некодирующий ген РНК, который является частью семейства генов РНК, которое содержит mir-3180-1, mir-3180-2, mir-3180-3, mir-3180-4 и mir-3180-1, mir-3180-2, mir-3180-3, mir-3180-4 и mir-10. 3180-5. В настоящее время они предсказаны или экспериментально подтверждены в отношении широкого спектра видов рака у людей. [ 2 ] [ 3 ] ( MIPF0000894 , mir-3180 ) mir-3180 в настоящее время идентифицирован только у человека Homo sapiens .
Распространение видов
[ редактировать ]Присутствие mir-3180 было обнаружено у ряда катаральных обезьян. Он был идентифицирован у приматов, включая человека ( Homo sapiens ), суматранского орангутанга ( Pongo abelii ), западной равнинной гориллы ( Gorilla gorilla gorilla ), северного белощекого гиббона ( Nomascus leucogenys ), Chlorocebus sabaeus ( Chlorocebus sabaeus ), оливкового павиана ( Papio) . анубис ) и макак-резус ( макака мулатка ). [ 4 ] [ 5 ] У некоторых из этих видов присутствие mir-3180 было показано экспериментально, у других гены, кодирующие mir-3180, можно было предсказать с помощью вычислений.
Геномное расположение
[ редактировать ]Гены mir-3180 обнаружены в хромосоме 16 . У человека имеется пять кластеров mir-3180, они содержат пять генов, кодирующих микроРНК ( mir-3180-1 , mir-3180-2 , mir-3180-3 , mir-3180-4 и mir-3180-5 ). Гены mir-3180 расположены в следующих местах:
hsa-mir-3180-1 chr16 Начало: 14911220 Конец: 14911313 Берег: +
hsa-mir-3180-2 chr16 Начало: 16309879 Конец: 16309966 Берег: +
hsa-mir-3180-3 chr16 Начало: 18402178 Конец: 18402271 Стрэнд: -
hsa-mir-3180-4 chr16 Начало: 15154850 Конец: 15155002 Стрэнд: -
hsa-mir-3180-5 chr16 Начало: 2135977 Конец: 2136129 Стрэнд: -
Ассоциация с раком
[ редактировать ]В последнее время наблюдается большой интерес к аномальным уровням экспрессии микроРНК при раке . Повышение регуляции mir-3180 обнаружено при раке. Повышенные уровни мир-3180 были обнаружены при раке толстой кишки . [ 6 ]
См. также
[ редактировать ]Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- ^ Куреши А., Тхакур Н., Монга И., Тхакур А., Кумар М. (1 января 2014 г.). «VIRmiRNA: комплексный ресурс экспериментально подтвержденных вирусных микроРНК и их мишеней» . База данных . 2014 : бау103. дои : 10.1093/база данных/bau103 . ПМК 4224276 . ПМИД 25380780 .
- ^ Цзинь Л., Чжан Цзы (декабрь 2020 г.). «Сывороточные миР-3180-3p и миР-124-3p могут действовать как неинвазивные биомаркеры резистентности к цисплатину при раке желудка» . Клиническая лаборатория . 66 (12). doi : 10.7754/Clin.Lab.2020.200302 . ПМИД 33337849 .
- ^ Саягес Х.М., Корчете Л.А., Гутьеррес М.Л., Сараскете М.Э., Дель Мар Абад М., Бенгоечеа О. и др. (ноябрь 2016 г.). «Геномная характеристика метастазов в печень больных колоректальным раком» . Онкотаргет . 7 (45): 72908–72922. дои : 10.18632/oncotarget.12140 . ПМК 5341953 . ПМИД 27662660 .
- ^ Крейтон С.Дж., Бенхам А.Л., Чжу Х., Хан М.Ф., Рид Дж.Г., Нагараджа А.К. и др. (март 2010 г.). «Открытие новых микроРНК в женских репродуктивных путях с помощью секвенирования нового поколения» . ПЛОС ОДИН . 5 (3): е9637. Бибкод : 2010PLoSO...5.9637C . дои : 10.1371/journal.pone.0009637 . ПМЦ 2835764 . ПМИД 20224791 .
- ^ Старк М.С., Тьяги С., Нанкарроу Д.Д., Бойл Г.М., Кук А.Л., Уайтман, округ Колумбия, и др. (март 2010 г.). «Характеристика миРНКома меланомы путем глубокого секвенирования» . ПЛОС ОДИН . 5 (3): е9685. Бибкод : 2010PLoSO...5.9685S . дои : 10.1371/journal.pone.0009685 . ПМЦ 2837346 . ПМИД 20300190 .
- ^ Хамфьорд Дж., Стангеланд А.М., Хьюз Т., Скреде М.Л., Твейт К.М., Икдал Т., Куре Э.Х. (2012). Чо WC (ред.). «Дифференциальная экспрессия микроРНК при колоректальном раке: сравнение парной опухолевой ткани и прилегающей нормальной слизистой оболочки с использованием высокопроизводительного секвенирования» . ПЛОС ОДИН . 7 (4): е34150. Бибкод : 2012PLoSO...734150H . дои : 10.1371/journal.pone.0034150 . ПМЦ 3328481 . ПМИД 22529906 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |