мир-433
| мир-433 | |
|---|---|
 Вторичная структура и сохранение последовательности микроРНК миР-433 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мир-433 |
| Рфам | RF00748 |
| семейство miRBase | МИПФ0000177 |
| Ген NCBI | 574034 |
| HGNC | 32026 |
| МОЙ БОГ | 611711 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты ; Эутерия ; |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мир-433 представляет собой короткую некодирующую молекулу РНК. МикроРНК (миРНК) функционируют как посттранскрипционные регуляторы уровня экспрессии других генов по нескольким механизмам. [ 1 ] Они играют роль в развитии, метаболизме и канцерогенезе. [ 2 ]
Геномная структура и регуляция
[ редактировать ]Мир-433 — одна из 21 микроРНК, обнаруженных в кластере на хромосоме 12. [ 3 ]
3'-кодирующая область mir-433 также является промотором соседнего гена миРНК: mir-127 . [ 3 ] Два гена перекрываются и транскрибируются в одной и той же ориентации. [ 2 ] Это метод, с помощью которого генетическая информация может храниться компактным и эффективным способом. [ 2 ]
Мир-433, наряду с другими двадцатью генами в кластере, активируется у с малым гетеродимерным партнером (SHP). гомозиготных мышей [ 3 ]
SHP is a nuclear receptor known to repress transcription, and it has a role in some metabolic diseases. Conversely, the transcription of mir-433 has been shown to be activated by estrogen related receptor (ERR).[3]
Мир-433 высококонсервативен у разных видов: он на 95% сходен у человека, шимпанзе, лошади, собаки, обезьяны, крысы, коровы и мыши. [ 4 ] Расстояние между mir-433 и mir-127 у этих видов также было одинаковым; как и расположение мотивов связывания транскрипционных факторов , включая мотивы ERR. Это указывает на то, что регуляция генов, а также первичная последовательность консервативны у этих видов млекопитающих.
Также предполагается, что мир-433 и мир-127, вероятно, произошли от общего предкового гена. [ 4 ]
Ассоциация заболеваний
[ редактировать ]генов микроРНК было обнаружено, что уровни mir-433 повышены при раке желудка При исследовании с помощью микрочипов . Мир-433 регулирует экспрессию GRB2 , известного белка, ассоциированного с опухолью, что может быть объяснением этой ассоциации. [ 5 ]
Никакой такой связи не было обнаружено между вариацией mir-433 и болезнью Паркинсона. [ 6 ] несмотря на то, что вариация области гена FGF20 , которая связывается с mir-433, связана с болезнью Паркинсона.
Мир-433 также связан с доминантно наследственной формой Х-сцепленной хондродисплазии. [ 7 ] Мир-433 обычно подавляет экспрессию HDAC6 . Было обнаружено, что однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в 3'- нетранслируемой области (UTR) HDAC6 сегрегирует при хондродисплазии. Этот SNP устраняет способность mir-433 подавлять HDAC6, что приводит к его сверхэкспрессии. Следовательно, снижается ацетилирование его мишени, альфа-тубулина , что приводит к заболеванию. [ 7 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Каллен БР (декабрь 2004 г.). «Транскрипция и процессинг предшественников микроРНК человека» . Мол. Клетка . 16 (6): 861–865. doi : 10.1016/j.molcel.2004.12.002 . ПМИД 15610730 .
- ^ Jump up to: а б с Сун Г, Ван Л (2008). Вольф Дж.Н. (ред.). «МиР-433 и миР-127 возникают из независимых перекрывающихся первичных транскриптов, кодируемых локусом миР-433-127» . ПЛОС ОДИН . 3 (10): е3574. дои : 10.1371/journal.pone.0003574 . ПМК 2570487 . ПМИД 18974780 .
- ^ Jump up to: а б с д Сун Г, Ван Л (2008). «Механизм транскрипции парных генов миР-433 и миР-127 с помощью ядерных рецепторов SHP и ERRgamma» . Нуклеиновые кислоты Рез . 36 (18): 5727–5735. дои : 10.1093/нар/gkn567 . ПМК 2566885 . ПМИД 18776219 .
- ^ Jump up to: а б Сон Г, Ван Л (2009). Тора Л. (ред.). «Консервативная структура гена и регуляция экспрессии миР-433 и миР-127 у млекопитающих» . ПЛОС ОДИН . 4 (11): е7829. дои : 10.1371/journal.pone.0007829 . ПМЦ 2778354 . ПМИД 19946636 .
- ^ Луо Х, Чжан Х, Чжан Z, Чжан X, Нин Б, Го Дж, Не Н, Лю Б, Ву X (2009). «Пониженная экспрессия миР-9 и миР-433 при карциноме желудка человека» . J Exp Clin Cancer Res . 28 (1): 82. дои : 10.1186/1756-9966-28-82 . ПМК 2739520 . ПМИД 19531230 .
- ^ де Мена Л., Кардо Л.Ф., Кото Э., Миар А., Диас М., Корао А.И., Алонсо Б., Рибакоба Р., Сальвадор К., Менендес М., Морис Г., Альварес В. (2010). «Вариации SNP FGF20 rs12720208 и микроРНК-433: нет связи с болезнью Паркинсона у испанских пациентов». Неврология Лит. 479 (1): 22–25. дои : 10.1016/j.neulet.2010.05.019 . ПМИД 20471450 . S2CID 15904325 .
- ^ Jump up to: а б Саймон Д., Лалу Б., Барийо М., Барнетш Т., Бланшар С., Рурик С., Марш М., Буржелин И., Купри И., Шассен Н., Жильбер-Дюсардье Б., Лакомб Д., Гроссе С., Арвейлер Б. (2010). «Мутация в 3'-UTR гена HDAC6, отменяющая посттранскрипционную регуляцию, опосредованную hsa-miR-433, связана с новой формой доминантной Х-сцепленной хондродисплазии» . Хум Мол Жене . 19 (10): 2015–2027. дои : 10.1093/hmg/ddq083 . ПМИД 20181727 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]