Семейство предшественников микроРНК mir-398

мир-398
Идентификаторы
Символ	мир-398
Рфам	RF00695
семейство miRBase	МИПФ0000107
Другие данные
РНК Тип	микроРНК
Домен(ы)	Эукариоты ;
PDB Структуры	ПДБе

В молекулярной биологии микроРНК mir-398 представляет собой короткую молекулу РНК . МикроРНК регулируют уровни экспрессии других генов с помощью нескольких механизмов.

См. также

• микроРНК

Дальнейшее чтение

• Мендоса-Сото AB, Санчес Ф, Эрнандес Г (2012). «МикроРНК как регуляторы реакции растений на токсичность металлов» . Границы в науке о растениях . 3 : 105. дои : 10.3389/fpls.2012.00105 . ПМЦ   3356851 . ПМИД   22661980 .
• Берклью С.Э., Эшлок Дж., Уинфри В.Б., Чжан Б. (2012). Ву К (ред.). «Влияние наночастиц оксида алюминия на рост, развитие и экспрессию микроРНК табака (Nicotiana tabacum)» . ПЛОС ОДИН . 7 (5): e34783. Бибкод : 2012PLoSO...734783B . дои : 10.1371/journal.pone.0034783 . ПМК   3350507 . ПМИД   22606225 .
• Чжан Дж, Чжан С, Хан С, Ву Т, Ли Икс, Ли В, Ци Л (август 2012 г.). «Полногеномная идентификация микроРНК у лиственницы и стадийная модуляция 11 консервативных микроРНК и их мишеней во время соматического эмбриогенеза». Планта . 236 (2): 647–57. дои : 10.1007/s00425-012-1643-9 . ПМИД   22526500 . S2CID   6776890 .
• Юнг Дж. Х., Со Пи Джей, Ан Дж. Х., Пак К. М. (май 2012 г.). «РНК-связывающий белок FCA арабидопсиса регулирует процессинг микроРНК172 при термосенсорном цветении» . Журнал биологической химии . 287 (19): 16007–16. дои : 10.1074/jbc.M111.337485 . ПМЦ   3346135 . ПМИД   22431732 .
• Рен Л., Тан Джи (май 2012 г.). «Идентификация микроРНК, чувствительных к сахарозе, выявляет регулируемые сахарозой накопления меди SPL7-зависимым и независимым образом у Arabidopsis thaliana». Наука о растениях . 187 : 59–68. doi : 10.1016/j.plantsci.2012.01.014 . ПМИД   22404833 .
• Сункар Р., Ли Ю.Ф., Джагадисваран Г. (апрель 2012 г.). «Функции микроРНК в реакциях растений на стресс». Тенденции в науке о растениях . 17 (4): 196–203. doi : 10.1016/j.tplants.2012.01.010 . ПМИД   22365280 .
• Гулерия П., Ядав С.К. (декабрь 2011 г.). «Идентификация миР414 и анализ экспрессии консервативных миРНК из Stevia rebaudiana» . Геномика, протеомика и биоинформатика . 9 (6): 211–7. дои : 10.1016/S1672-0229(11)60024-7 . ПМК   5054151 . ПМИД   22289477 .
• Чжао М, Тай Х, Сунь С, Чжан Ф, Сюй Ю, Ли WX (2012). Пфеффер С. (ред.). «Клонирование и характеристика микроРНК кукурузы, участвующих в реакции на дефицит азота» . ПЛОС ОДИН . 7 (1): e29669. Бибкод : 2012PLoSO...729669Z . дои : 10.1371/journal.pone.0029669 . ПМК   3250470 . ПМИД   22235323 .
• Монавар Фешани А., Мохаммади С., Фрейзер Т.П., Аббаси А., Абедини Р., Карими Фарсад Л., Эхья Ф., Салекде Г.Х., Марди М. (февраль 2012 г.). «Идентификация и проверка микроРНК Asteraceae с помощью анализа меток выраженной последовательности». Джин . 493 (2): 253–9. дои : 10.1016/j.gene.2011.11.024 . ПМИД   22146318 .
• Сюй З, Чжун С, Ли Х, Ли В, Ротштейн С.Дж., Чжан С., Би Ю, Се С (2011). Мустафа А. (ред.). «Полногеномная идентификация микроРНК в ответ на низкую доступность нитратов в листьях и корнях кукурузы» . ПЛОС ОДИН . 6 (11): e28009. Бибкод : 2011PLoSO...628009X . дои : 10.1371/journal.pone.0028009 . ПМК   3223196 . ПМИД   22132192 .
• Лу С., Ян С., Чан В.Л. (ноябрь 2011 г.). «Сохранение и разнообразие связанных с микроРНК сетей, регулирующих медь, у Populus trichocarpa». Журнал интегративной биологии растений . 53 (11): 879–91. дои : 10.1111/j.1744-7909.2011.01080.x . ПМИД   22013976 .
• Атталлах К.В., Велхен Э., Мартин А.П., Спинелли С.В., Боннар Дж., Палатник Дж.Ф., Гонсалес Д.Х. (август 2011 г.). «Растения содержат два белка SCO, которые по-разному участвуют в функции цитохром-с-оксидазы, а также в гомеостазе меди и окислительно-восстановительного процесса» . Журнал экспериментальной ботаники . 62 (12): 4281–94. дои : 10.1093/jxb/err138 . ПМИД   21543521 .
• Чжу С, Дин Ю, Лю Х (сентябрь 2011 г.). «MiR398 и реакция растений на стресс». Физиология Плантарум . 143 (1): 1–9. дои : 10.1111/j.1399-3054.2011.01477.x . ПМИД   21496029 .
• Кантар М., Лукас С.Дж., Будак Х. (март 2011 г.). «Модели экспрессии микроРНК Triticum dicoccoides в ответ на стресс, вызванный засухой». Планта . 233 (3): 471–84. дои : 10.1007/s00425-010-1309-4 . ПМИД   21069383 . S2CID   27289636 .
• Буше Н. (июнь 2010 г.). «Новое понимание функций miR398 у Arabidopsis» . Сигнализация и поведение растений . 5 (6): 684–6. дои : 10.4161/psb.5.6.11573 . ПМК   3001559 . ПМИД   20400846 .
• Миура Э., Като Ю., Сакамото В. (май 2010 г.). «Сравнительный транскриптомный анализ зелено-белых пестрых секторов арабидопсиса желтого пестрого2: реакции на окислительные и другие стрессы в белых секторах» . Журнал экспериментальной ботаники . 61 (9): 2433–45. дои : 10.1093/jxb/erq075 . ПМЦ   2877895 . ПМИД   20400527 .
• Цзя Икс, Менду В, Тан Г (2010). «Массивная платформа для идентификации стресс-реактивных микроРНК в растениях». Стрессоустойчивость растений . Методы молекулярной биологии. Том. 639. стр. 253–69. дои : 10.1007/978-1-60761-702-0_15 . ISBN  978-1-60761-701-3 . ПМИД   20387051 .
• Ли Ю.Ф., Чжэн Ю., Аддо-Квай С., Чжан Л., Сайни А., Джагадисваран Г., Акстелл М.Дж., Чжан В., Сункар Р. (июнь 2010 г.). «Полнотранскриптомная идентификация мишеней микроРНК в рисе» . Заводской журнал . 62 (5): 742–59. дои : 10.1111/j.1365-313X.2010.04187.x . ПМИД   20202174 .
• Дин Ю.Ф., Ван Г.И., Фу Ю.П., Чжу С. (февраль 2010 г.). «[Роль миР398 в реакции растений на стресс]». И Цюань = Эредитас . 32 (2): 129–34. дои : 10.3724/sp.j.1005.2010.00129 . ПМИД   20176556 . S2CID   29055138 .
• Боклер Л., Ю.А., Буше Н. (май 2010 г.). «Направляемое микроРНК расщепление и репрессия трансляции медного шаперона мРНК супероксиддисмутазы у Arabidopsis» (PDF) . Заводской журнал . 62 (3): 454–62. дои : 10.1111/j.1365-313X.2010.04162.x . ПМИД   20128885 .
• Ли Х, Ю С.Дж., Ли Дж.Х., Ким В., Ю С.К., Фицджеральд Х., Кэррингтон Дж.С., Ан Дж.Х. (май 2010 г.). «Генетическая основа регуляции времени цветения с помощью микроРНК, чувствительных к температуре окружающей среды, у арабидопсиса» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (9): 3081–93. дои : 10.1093/нар/gkp1240 . ПМК   2875011 . ПМИД   20110261 .
• Гу М, Сюй К, Чен А, Чжу Ю, Тан Г, Сюй Г (февраль 2010 г.). «Анализ экспрессии предполагает потенциальную роль микроРНК в передаче сигналов фосфатов и арбускулярной микоризы в Solanum lycopersicum». Физиология Плантарум . 138 (2): 226–37. дои : 10.1111/j.1399-3054.2009.01320.x . ПМИД   20015123 .
• Тринидад I, капитан С, Далмей Т, февральский депутат, Сантос ДМ (февраль 2010 г.). «МиР398 и миР408 активируются в ответ на дефицит воды у Medicago truncatula». Растение . 231 (3): 705–16. дои : 10.1007/s00425-009-1078-0 . ПМИД   20012085 . S2CID   12943657 .
• Се LC, Линь СИ, Ши AC, Чен JW, Линь WY, Ценг CY, Ли WH, Чиу TJ (декабрь 2009 г.). «Выявление малых РНК-опосредованных ответов на дефицит фосфатов у арабидопсиса путем глубокого секвенирования» . Физиология растений . 151 (4): 2120–32. дои : 10.1104/стр.109.147280 . ПМК   2785986 . ПМИД   19854858 .
• Цзя X, Ван WX, Рен Л, Чен QJ, Менду В, Уиллкат Б, Динкинс Р, Тан X, Тан G (сентябрь 2009 г.). «Дифференциальная и динамическая регуляция миР398 в ответ на АБК и солевой стресс у Populus tremula и Arabidopsis thaliana». Молекулярная биология растений . 71 (1–2): 51–9. дои : 10.1007/s11103-009-9508-8 . ПМИД   19533381 . S2CID   21096126 .
• Дин Ю.Ф., Чжу С. (август 2009 г.). «Роль микроРНК в гомеостазе меди и кадмия». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 386 (1): 6–10. дои : 10.1016/j.bbrc.2009.05.137 . ПМИД   19501049 .
• Сире С, Морено А.Б., Гарсия-Чапа М., Лопес-Мойя Х.Дж., Сан-Сегундо Б (март 2009 г.). «Суточные колебания накопления микроРНК Arabidopsis, miR167, miR168, miR171 и miR398». Письма ФЭБС . 583 (6): 1039–44. дои : 10.1016/j.febslet.2009.02.024 . hdl : 10261/101742 . ПМИД   19236868 . S2CID   25968907 .
• Джагадисваран Г., Сайни А., Сункар Р. (март 2009 г.). «Биотический и абиотический стресс подавляет экспрессию miR398 у арабидопсиса». Планта . 229 (4): 1009–14. дои : 10.1007/s00425-009-0889-3 . ПМИД   19148671 . S2CID   31993796 .
• Ямасаки Х., Хаяси М., Фукадзава М., Кобаяши Ю., Шиканай Т. (январь 2009 г.). «Промотор SQUAMOSA, связывающий белок, подобный 7, является центральным регулятором гомеостаза меди у арабидопсиса» . Растительная клетка . 21 (1): 347–61. дои : 10.1105/tpc.108.060137 . ПМК   2648088 . ПМИД   19122104 .
• Хевези Т., Хоу П., Майер Т.Р., Баум Т.Дж. (декабрь 2008 г.). «Малые РНК арабидопсиса и их мишени при паразитизме цистовых нематод» . Молекулярные растительно-микробные взаимодействия . 21 (12): 1622–34. дои : 10.1094/MPMI-21-12-1622 . ПМИД   18986258 .
• Абдель-Гани С.Э., Пилон М. (июнь 2008 г.). «Системное снижение экспрессии белка меди, опосредованное микроРНК, в ответ на низкую доступность меди в Arabidopsis» . Журнал биологической химии . 283 (23): 15932–45. дои : 10.1074/jbc.M801406200 . ПМЦ   3259626 . ПМИД   18408011 .
• Дугас Д.В., Бартель Б. (июль 2008 г.). «Индукция сахарозой miR398 Arabidopsis подавляет две супероксиддисмутазы Cu/Zn». Молекулярная биология растений . 67 (4): 403–17. дои : 10.1007/s11103-008-9329-1 . ПМИД   18392778 . S2CID   22984450 .
• Ямасаки Х., Пилон М., Шиканай Т. (апрель 2008 г.). «Как растения реагируют на дефицит меди?» . Сигнализация и поведение растений . 3 (4): 231–2. дои : 10.4161/psb.3.4.5094 . ПМК   2634185 . ПМИД   19704637 .
• Бутц А., Спрингер Ф., Чаппелл Л., Баулкомб, округ Колумбия, Кер Дж. (март 2008 г.). «Идентификация и характеристика малых РНК из флоэмы Brassica napus» . Заводской журнал . 53 (5): 739–49. дои : 10.1111/j.1365-313X.2007.03368.x . ПМИД   18005229 .
• Ямасаки Х., Абдель-Гани С.Э., Коху С.М., Кобаяши Ю., Шиканай Т., Пилон М. (июнь 2007 г.). «Регуляция гомеостаза меди с помощью микро-РНК у арабидопсиса» . Журнал биологической химии . 282 (22): 16369–78. дои : 10.1074/jbc.M700138200 . ПМИД   17405879 .
• Сункар Р., Капур А., Чжу Дж. К. (август 2006 г.). «Посттранскрипционная индукция двух генов супероксиддисмутазы Cu/Zn у Arabidopsis опосредована подавлением miR398 и важна для толерантности к окислительному стрессу» . Растительная клетка . 18 (8): 2051–65. дои : 10.1105/tpc.106.041673 . ПМЦ   1533975 . ПМИД   16861386 .

Внешние ссылки

• Страница семейства предшественников микроРНК mir-398 в Rfam