мир-223
| мир-223 | |
|---|---|
 Вторичная структура и сохранение последовательности микроРНК миР-223 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мир-223 |
| Рфам | РФ00664 |
| семейство miRBase | МИПФ0000067 |
| Ген NCBI | 407008 |
| HGNC | 31603 |
| МОЙ БОГ | 300694 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты ; Эвтелеостома |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии микроРНК-223 (миР-223) представляет собой короткую молекулу РНК . МикроРНК регулируют уровни экспрессии других генов с помощью нескольких механизмов. миР-223 представляет собой гематопоэтическую специфическую микроРНК, выполняющую решающие функции в развитии миелоидного клона. [ 1 ] [ 2 ] Он играет важную роль в стимулировании гранулоцитарной дифференцировки. [ 2 ] [ 3 ] одновременно связан с подавлением дифференцировки эритроцитов . [ 4 ] миР-223 обычно репрессируется при гепатоцеллюлярной карциноме. [ 5 ] и лейкемия . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] Более высокие уровни экспрессии миРНК-223 ассоциированы с экстранодальной лимфомой маргинальной зоны слизистой лимфоидной ткани желудка. [ 10 ] и рецидив рака яичников . [ 11 ] При некоторых видах рака снижение экспрессии микроРНК-223 коррелирует с более высокой опухолевой нагрузкой, агрессивностью заболевания и плохими прогностическими факторами. [ 7 ] МикроРНК-223 также связана с ревматоидным артритом . [ 12 ] сепсис , [ 13 ] диабет 2 типа , [ 14 ] и печеночная ишемия . [ 15 ]
Характеристика
[ редактировать ]МикроРНК-223 первоначально была идентифицирована биоинформатически и впоследствии охарактеризована как часть кроветворной системы. [ 2 ] Его ген напоминает миелоидный ген и может управляться белками PU.1 и C/EBPα, которые являются миелоидными факторами транскрипции. [ 16 ]
МикроРНК-223 избирательно нацелена на отдельные популяции транскриптов, несущих элементы, богатые AU . Более конкретно, было подтверждено, что мРНК RhoB является настоящей мишенью миР-223. [ 17 ] миР-223 также регулирует активность циклина E путем модуляции экспрессии белка FBXW7 . В частности, сверхэкспрессия миР-223 снижает уровни мРНК FBXW7, одновременно увеличивая уровень эндогенного белка циклина E и уровень активности. [ 18 ]
Роль в кроветворении
[ редактировать ]Роль миР-223 в гемопоэзе тщательно анализировалась в последние несколько лет. Во время гранулопоэза миР-223 действует как регулятор дифференцировки, созревания и функции гранулоцитов. [ 19 ] Более конкретно, дифференцировка гранулоцитов человека контролируется регуляторной схемой, включающей миР-223 и два транскрипционных фактора, NFIA и C/EBPα . Эти два фактора конкурируют за связывание: NFI-A поддерживает низкие уровни миР-223, тогда как C/EBPα усиливает экспрессию миР-223. Конкуренции со стороны C/EBPα и гранулоцитарной дифференцировке благоприятствует петля отрицательной обратной связи, в которой миР-223 репрессирует трансляцию NFI-A. [ 20 ]
Анализ профилей экспрессии показывает, что экспрессия миР-223 снижается по мере созревания клеток во время дифференцировки моноцитарных , эритроидных и тучных клеток . [ 2 ] [ 19 ] Понижение уровня регуляции миР-223 во время эритропоэза необходимо для пролиферации и дифференцировки эритроцитов на уровне предшественников и предшественников. [ 19 ] Эта понижающая модуляция способствует эритропоэзу, благоприятствуя трансляции ключевого функционального белка LMO2, что приводит к обратимой регуляции дифференцировки эритроидов и мегакариоцитов. [ 4 ]
МикроРНК-223 также играет важную роль во время дифференцировки остеокластов . Более конкретно, экспрессия миР-223 подавляет дифференцировку предшественников остеокластов в остеокласты, что делает ее потенциально жизнеспособной терапевтической мишенью для ряда метаболических нарушений костной ткани с избыточной активностью остеокластов. [ 21 ]
Участие в болезни
[ редактировать ]Рак
[ редактировать ]МикроРНК-223 обычно репрессируется при гепатоцеллюлярной карциноме . [ 5 ] хронический лимфоцитарный лейкоз , [ 7 ] острый лимфобластный лейкоз , [ 8 ] острый миелолейкоз , [ 6 ] [ 9 ] MALT-лимфома желудка , [ 10 ] и рецидив рака яичников . [ 11 ]
Интегративный анализ гепатоцеллюлярной карциномы предполагает, что статмин 1 ( STMN1 ) является нижестоящей мишенью миР-223. Кроме того, миР-223 может подавлять активность люциферазы в репортерной конструкции, содержащей 3'-нетранслируемую область STMN1. [ 5 ] Снижение экспрессии миР-223 может предрасполагать к развитию гепатоцеллюлярной карциномы за счет широко распространенной индукции хромосомной нестабильности с помощью STMN1. [ 5 ]
МикроРНК-223 блокирует трансляцию E2F1 , что приводит к ингибированию прогрессирования клеточного цикла с последующей миелоидной дифференцировкой. [ 9 ] При остром миелолейкозе (ОМЛ) уровень экспрессии миР-223 снижается, что приводит к сверхэкспрессии E2F1. Сверхэкспрессированный E2F1 может связываться с промотором miR-223 и, в свою очередь, приводить к дальнейшему снижению экспрессии miR-223 через петлю отрицательной обратной связи с последующим прогрессированием миелоидного клеточного цикла за счет дифференцировки. [ 6 ] Было показано, что сверхэкспрессия E2F1 является онкогенным событием, предрасполагающим клетки к трансформации. Хотя имеются некоторые указания на роль миР-223 при ОМЛ, об этой функции микроРНК при хроническом лимфоцитарном и остром лимфобластном лейкозе еще мало что известно. Тем не менее, уровни экспрессии микроРНК-223 значительно снижались по мере прогрессирования этих двух заболеваний, что связывало снижение регуляции миР-223 с более высокой опухолевой нагрузкой, агрессивностью заболевания и плохими прогностическими факторами. [ 7 ] [ 8 ]
MALT-лимфома желудка и рецидивирующий рак яичников связаны с более высокими уровнями экспрессии микроРНК-223. [ 10 ] [ 11 ] что делает их потенциальным биомаркером.
Ревматоидный артрит
[ редактировать ]МикроРНК-223 сверхэкспрессируется в клетках Т-лимфоцитов пациентов с ревматоидным артритом , что позволяет предположить, что ее экспрессия в этом типе клеток может способствовать этиологии заболевания. [ 12 ]
Сепсис
[ редактировать ]Имеются некоторые доказательства того, что уровень микроРНК-223 и микроРНК-146а значительно снижается у пациентов с сепсисом по сравнению с пациентами с синдромом системного воспалительного ответа (ССВО) и/или здоровыми людьми из контрольной группы. [ 13 ] Это говорит о том, что миР-223 можно использовать в качестве биомаркера для отличия сепсиса от SIRS.
Диабет
[ редактировать ]Количественный анализ экспрессии микроРНК показал, что уровень экспрессии микроРНК-223 постоянно повышается в инсулинорезистентных сердцах пациентов с диабетом 2 типа . Этот эффект был связан с ролью миР-223 в регуляции Glut4 и метаболизме глюкозы . [ 14 ]
Печеночная ишемия
[ редактировать ]Недавнее исследование пришло к выводу, что ишемия/реперфузионное повреждение печени может быть еще одной формой заболевания печени, связанной с изменением экспрессии миР-223. [ 15 ] Корреляционный анализ показал, что уровни экспрессии печеночной миР-223 значительно положительно коррелируют с сывороточными маркерами ишемии печени. Кроме того, анализ прогнозирования мРНК-мишеней миРНК, члена 3 семейства длинноцепочечных ацил-КоА-синтетазы , эфрина А1 и члена семейства B генов-гомологов ras , как было предсказано, является нижестоящими мишенями миР-223.
См. также
[ редактировать ]- микроРНК
- Гепатоцеллюлярная карцинома
- Хронический лимфоцитарный лейкоз
- Острый лимфобластный лейкоз
- Острый миелоидный лейкоз
- MALT-лимфома желудка
- Рак яичников
- Ревматоидный артрит
- Сепсис
- Диабет
- Кроветворение
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Сунь В, Шен В, Ян С, Ху Ф, Ли Х, Чжу Т.Х. (2010). «МиР-223 и миР-142 ослабляют пролиферацию гемопоэтических клеток, а миР-223 положительно регулирует миР-142 через изоформы LMO2 и CEBP-β» . Сотовый Res . 20 (10): 1158–69. дои : 10.1038/cr.2010.134 . ПМИД 20856265 .
- ^ Jump up to: а б с д Джоннидис Дж.Б., Харрис М.Х., Уилер Р.Т., Стелинг-Сан С., Лам М.Х., Кирак О., Бруммелькамп Т.Р., Флеминг М.Д., Камарго Ф.Д. (2008). «Регуляция пролиферации клеток-предшественников и функции гранулоцитов с помощью микроРНК-223». Природа . 451 (7182): 1125–9. Бибкод : 2008Natur.451.1125J . дои : 10.1038/nature06607 . ПМИД 18278031 . S2CID 4421981 .
- ^ Фази Ф, Раканички С, Зардо Г, Старнес ЛМ, Манчини М, Траваглини Л, Диверио Д, Амматуна Е, Чимино Г, Ло-Коко Ф, Гриньяни Ф, Нерви С (2007). «Эпигенетическое подавление регулятора миелопоэза микроРНК-223 онкобелком AML1/ETO» . Раковая клетка . 12 (5): 457–66. дои : 10.1016/j.ccr.2007.09.020 . ПМИД 17996649 .
- ^ Jump up to: а б Юань Цзюй, Ван Ф, Юй Дж, Ян Г.Х., Лю XL, Чжан Дж.В. (2009). «МикроРНК-223 обратимо регулирует эритроидную и мегакариоцитарную дифференцировку клеток К562» . J Cell Мол Мед . 13 (11–12): 4551–9. дои : 10.1111/j.1582-4934.2008.00585.x . ПМК 4515070 . ПМИД 19017354 .
- ^ Jump up to: а б с д Вонг К.В., Лунг Р.В., Лоу П.Т., Лай П.Б., Чан К.Ю., То К.Ф., Вонг Н. (2008). «МикроРНК-223 обычно репрессируется при гепатоцеллюлярной карциноме и усиливает экспрессию Stathmin1». Гастроэнтерология . 135 (1): 257–69. дои : 10.1053/j.gastro.2008.04.003 . ПМИД 18555017 .
- ^ Jump up to: а б с Эйхольцер М., Шмид С., Шардт Дж.А., Хефлигер С., Мюллер Б.У., Пабст Т. (2010). «Сложность регуляции миР-223 с помощью CEBPA при ОМЛ человека». Леук Рес . 34 (5): 672–6. doi : 10.1016/j.leukres.2009.11.019 . ПМИД 20018373 .
- ^ Jump up to: а б с д Стаматопулос Б., Меулеман Н., Хайбе-Кайнс Б., Соссой П., Ван Ден Несте Е., Мишо Л., Хейманн П., Мартиат П., Брон Д., Лагно Л. (2009). «Снижение уровня регуляции микроРНК-29c и микроРНК-223 имеет значение in vivo при хроническом лимфоцитарном лейкозе и улучшает стратификацию риска заболевания» . Кровь . 113 (21): 5237–45. дои : 10.1182/кровь-2008-11-189407 . ПМИД 19144983 .
- ^ Jump up to: а б с Кьяретти С., Мессина М., Таволаро С., Зардо Г., Элиа Л., Витале А., Фатика А., Горелло П., Пичиокки А., Скаппуччи Г., Боццони И., Фозза С., Кандони А., Гуарини А., ФоÃ Р (2010). «Профилирование экспрессии генов идентифицирует подмножество острого лимфобластного лейкоза Т-клеток взрослых с миелоподобными генными особенностями и сверхэкспрессией миР-223» . Гематологический . 95 (7): 1114–21. doi : 10.3324/haematol.2009.015099 . ПМК 2895035 . ПМИД 20418243 .
- ^ Jump up to: а б с Пуликкан Дж.А., Денглер В., Перамангалам П.С., Пер Зада А.А., Мюллер-Тидов С., Боландер С.К., Тенен Д.Г., Бере Г. (2010). «Регулятор клеточного цикла E2F1 и микроРНК-223 составляют ауторегуляторную петлю отрицательной обратной связи при остром миелолейкозе» . Кровь . 115 (9): 1768–78. дои : 10.1182/blood-2009-08-240101 . ПМЦ 2832809 . ПМИД 20029046 .
- ^ Jump up to: а б с Лю Т., Чен СУ, Куо Ш., Ченг А.Л., Линь К.В. (2010). «E2A-положительная MALT-лимфома желудка имеет более слабые плазмацитоидные инфильтраты и более сильную экспрессию миР-223, связанной с B-клетками памяти: возможная корреляция со стадией и ответом на лечение» . Мод Патол . 23 (11): 1507–17. дои : 10.1038/modpathol.2010.139 . ПМИД 20802470 .
- ^ Jump up to: а б с Лайос А, О'Тул С, Флавин Р, Мартин С, Келли Л, Ринг М, Финн С.П., Барретт С, Лода М, Глисон Н, Д'Арси Т, МакГиннесс Е, Шейлс О, Шеппард Б, О'Лири Дж (2008). «Потенциальная роль миР-9 и миР-223 при рецидиве рака яичников» . Мол Рак . 7:35 . дои : 10.1186/1476-4598-7-35 . ПМК 2383925 . ПМИД 18442408 .
- ^ Jump up to: а б Фульчи В., Скаппуччи Г., Себастиани Г.Д., Джаннитти С., Франческини Д., Мелони Ф., Коломбо Т., Цитарелла Ф., Барнаба В., Минисола Г., Галеацци М., Мачино Дж. (2010). «МиР-223 сверхэкспрессируется в Т-лимфоцитах пациентов, страдающих ревматоидным артритом». Хум Иммунол . 71 (2): 206–11. дои : 10.1016/j.humimm.2009.11.008 . ПМИД 19931339 .
- ^ Jump up to: а б Ван Дж. Ф., Ю М. Л., Ю Г, Бянь Дж. Дж., Дэн XM, Ван XJ, Чжу К. М. (2010). «Сывороточные миР-146а и миР-223 как потенциальные новые биомаркеры сепсиса». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 394 (1): 184–8. дои : 10.1016/j.bbrc.2010.02.145 . ПМИД 20188071 .
- ^ Jump up to: а б Лу Хань; Бьюкен Рэйчел; Кук Стюарт (2010). «МикроРНК-223 регулирует экспрессию Glut4 и метаболизм глюкозы в кардиомиоцитах» . Кардиоваскулярный рез . 86 (3): 410–420. дои : 10.1093/cvr/cvq010 . ПМИД 20080987 .
- ^ Jump up to: а б Ю Ч., Сюй К.Ф., Ли Ю.М. (2009). «Связь экспрессии микроРНК-223 с ишемией/реперфузионным повреждением печени у мышей». Dig Dis Sci . 54 (11): 2362–6. дои : 10.1007/s10620-008-0629-8 . ПМИД 19104939 . S2CID 10255437 .
- ^ Фукао Т., Фукуда Ю., Кига К., Шариф Дж., Хино К., Эномото Ю., Кавамура А., Накамура К., Такеучи Т., Танабэ М. (2007). «Эволюционно консервативный механизм экспрессии микроРНК-223, выявленный с помощью профилирования генов микроРНК» . Клетка . 129 (3): 617–31. дои : 10.1016/j.cell.2007.02.048 . ПМИД 17482553 .
- ^ Сунь Джи, Ли Х, Росси Джей Джей (2010). «Контекст последовательности за пределами целевой области влияет на эффективность целевых сайтов миР-223 в 3'UTR RhoB» . Нуклеиновые кислоты Рез . 38 (1): 239–52. дои : 10.1093/nar/gkp870 . ПМК 2800228 . ПМИД 19850724 .
- ^ Сюй Ю, Сенгупта Т, Кукрея Л, Минелла AC (2010). «МикроРНК-223 регулирует активность циклина Е путем модуляции экспрессии белка 7 домена F-box и WD-40» . J Биол Хим . 285 (45): 34439–46. дои : 10.1074/jbc.M110.152306 . ПМК 2966058 . ПМИД 20826802 .
- ^ Jump up to: а б с Фелли Н., Педини Ф., Румыния П., Биффони М., Морсилли О., Кастелли Г., Санторо С., Чикарелла С., Соррентино А., Пешле С., Марциали Г. (2009). «МикроРНК-223-зависимая экспрессия LMO2 регулирует нормальный эритропоэз» . Гематологическая . 94 (4): 479–86. doi : 10.3324/haematol.2008.002345 . ПМЦ 2663611 . ПМИД 19278969 .
- ^ Фази Ф, Роза А, Фатика А, Гельметти В, Де Марчис МЛ, Нерви С, Боццони I (2005). «Минисхема, состоящая из микроРНК-223 и факторов транскрипции NFI-A и C/EBPalpha, регулирует гранулопоэз человека» . Клетка . 123 (5): 819–31. дои : 10.1016/j.cell.2005.09.023 . ПМИД 16325577 .
- ^ Сугатани Т., Грушка К.А. (2007). «МикроРНК-223 является ключевым фактором дифференцировки остеокластов». J Cell Biochem . 101 (4): 996–9. дои : 10.1002/jcb.21335 . ПМИД 17471500 . S2CID 29037084 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Песня, Л; Дуань, П; Го, П; Ли, Д; Ли, С; Сюй, Ю; Чжоу, Q (15 декабря 2012 г.). «Понижение уровня миР-223 и миР-153 опосредует стимулируемую механическим растяжением пролиферацию венозных гладкомышечных клеток посредством активации рецептора инсулиноподобного фактора роста-1». Архив биохимии и биофизики . 528 (2): 204–11. дои : 10.1016/j.abb.2012.08.015 . ПМИД 23046980 .