Эфрин А1

ВЕЩЕСТВО1
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 3HEI, 3MBW, 3CZU
Идентификаторы
Псевдонимы	EFNA1 , B61, ECKLG, EFL1, EPLG1, LERK-1, LERK1, TNFAIP4, Эфрин А1, GMAN
Внешние идентификаторы	Опустить : 191164 ; МГИ : 103236 ; Гомологен : 3262 ; Генные карты : EFNA1 ; ОМА : EFNA1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 1 (human) Band 1q22 Start 155,127,876 bp End 155,134,899 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 3 (mouse) Band 3 F1|3 39.04 cM Start 89,179,040 bp End 89,188,449 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in right lobe of liver right lung skin of abdomen skin of leg upper lobe of left lung left lobe of thyroid gland right lobe of thyroid gland minor salivary glands parotid gland rectum Top expressed in lip left lung lobe right lung lobe lumbar spinal ganglion right kidney colon duodenum corneal stroma jejunum proximal tubule More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function protein binding signaling receptor binding ephrin receptor binding Cellular component membrane plasma membrane integral component of plasma membrane anchored component of membrane extracellular exosome intracellular anatomical structure extracellular region anchored component of plasma membrane Biological process regulation of cell adhesion mediated by integrin ephrin receptor signaling pathway aortic valve morphogenesis cell-cell signaling negative regulation of transcription by RNA polymerase II regulation of angiogenesis mitral valve morphogenesis endocardial cushion to mesenchymal transition involved in heart valve formation regulation of blood vessel endothelial cell migration regulation of axonogenesis neuron differentiation notochord positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation substrate adhesion-dependent cell spreading cell migration negative regulation of epithelial to mesenchymal transition negative regulation of dendritic spine morphogenesis regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation negative regulation of thymocyte apoptotic process MAPK cascade angiogenesis axon guidance positive regulation of protein phosphorylation negative regulation of MAPK cascade positive regulation of MAPK cascade protein stabilization positive regulation of protein tyrosine kinase activity positive regulation of amyloid-beta formation positive regulation of aspartic-type endopeptidase activity involved in amyloid precursor protein catabolic process negative regulation of proteolysis involved in cellular protein catabolic process Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 1942 13636 Вместе ENSG00000169242 ENSMUSG00000027954 ЮниПрот P20827 P52793 RefSeq (мРНК) НМ_004428 НМ_182685 НМ_001162425 НМ_010107 RefSeq (белок) НП_004419 НП_872626 НП_001155897 НП_034237 Местоположение (UCSC) Chr 1: 155,13 – 155,13 Мб Chr 3: 89,18 – 89,19 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Эфрин А1 — это белок , который у человека кодируется EFNA1 геном .

Этот ген кодирует члена семейства эфринов (EPH). Эфрины и рецепторы, связанные с EPH, составляют самое большое подсемейство рецепторных протеинтирозинкиназ и участвуют в опосредовании событий развития, особенно в нервной системе и эритропоэзе . В зависимости от структуры и взаимоотношений последовательностей эфрины делятся на класс эфрина-А (EFNA), которые прикреплены к мембране с помощью гликозилфосфатидилинозитоловой связи, и класс эфрина-B (EFNB), которые представляют собой трансмембранные белки . Этот ген кодирует эфрин класса EFNA, который связывается с рецепторами EPHA2 , EPHA4 , EPHA5 , EPHA6 и EPHA7 . С помощью анализа последовательностей были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.

Дальнейшее чтение

• Пандей А., Линдберг Р.А., Диксит В.М. (сентябрь 1995 г.). «Клеточная сигнализация. Рецепторные сироты обретают семью» . Современная биология . 5 (9): 986–9. Бибкод : 1995CBio....5..986P . дои : 10.1016/S0960-9822(95)00195-3 . ПМИД   8542290 . S2CID   13338632 .
• Фланаган Дж. Г., Вандерхаген П. (1998). «Эфрины и рецепторы Eph в развитии нервной системы». Ежегодный обзор неврологии . 21 : 309–45. дои : 10.1146/annurev.neuro.21.1.309 . ПМИД   9530499 .
• Чжоу Р. (март 1998 г.). «Рецепторы и лиганды семейства Eph». Фармакология и терапия . 77 (3): 151–81. дои : 10.1016/S0163-7258(97)00112-5 . ПМИД   9576626 .
• Холдер Н., Кляйн Р. (май 1999 г.). «Рецепторы Eph и эфрины: эффекторы морфогенеза». Разработка . 126 (10): 2033–44. дои : 10.1242/dev.126.10.2033 . ПМИД   10207129 .
• Уилкинсон Д.Г. (2000). «Эф-рецепторы и эфрины: регуляторы наведения и сборки». Международный обзор цитологии . 196 : 177–244. дои : 10.1016/S0074-7696(00)96005-4 . ISBN  978-0-12-364600-2 . ПМИД   10730216 .
• Сюй Ц, Меллитцер Г., Уилкинсон Д.Г. (июль 2000 г.). «Роль рецепторов Eph и эфринов в формировании сегментного паттерна» . Философские труды Лондонского королевского общества. Серия Б, Биологические науки . 355 (1399): 993–1002. дои : 10.1098/rstb.2000.0635 . ПМЦ   1692797 . ПМИД   11128993 .
• Уилкинсон Д.Г. (март 2001 г.). «Множественные роли рецепторов EPH и эфринов в развитии нервной системы». Обзоры природы. Нейронаука . 2 (3): 155–64. дои : 10.1038/35058515 . ПМИД   11256076 . S2CID   205014301 .
• Махадеван Д., Танки Н., Сингх Дж., Макфи П., Зангрилли Д., Ван Л.М., Герреро С., Левин Х., Хамблет С., Салданья Дж. (июль 1995 г.). «Структурные исследования доменов PH Db1, Sos1, IRS-1 и бета-ARK1 и их дифференциальное связывание с субъединицами G-бета-гамма». Биохимия . 34 (28): 9111–7. дои : 10.1021/bi00028a021 . ПМИД   7619809 .
• Козлоски С.Дж., Марасковский Э., МакГрю Дж.Т., ВанденБос Т., Тип М., Лайман С.Д., Шринивасан С., Флетчер Ф.А., Гейл Р.Б., Серретти Д.П. (январь 1995 г.). «Лиганды рецепторов тирозинкиназ hek и elk: выделение кДНК, кодирующих семейство белков». Онкоген . 10 (2): 299–306. ПМИД   7838529 .
• Дэвис С., Гейл Н.В., Олдрич Т.Х., Мезонпьер ПК, Лотак В., Поусон Т., Гольдфарб М., Янкопулос Г.Д. (ноябрь 1994 г.). «Лиганды для тирозинкиназ рецепторов, связанных с EPH, которым для активности требуется прикрепление к мембране или кластеризация». Наука . 266 (5186): 816–9. Бибкод : 1994Sci...266..816D . дои : 10.1126/science.7973638 . ПМИД   7973638 .
• Бекманн М.П., ​​Серретти Д.П., Баум П., Ванден Бос Т., Джеймс Л., Фарра Т., Козлоски С., Холлингсворт Т., Шиллинг Х., Марасковски Э. (август 1994 г.). «Молекулярная характеристика семейства лигандов для eph-связанных тирозинкиназных рецепторов» . Журнал ЭМБО . 13 (16): 3757–62. дои : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06685.x . ПМЦ   395287 . ПМИД   8070404 .
• Гейл Н.В., Холланд С.Дж., Валенсуэла Д.М., Фленникен А., Пан Л., Райан Т.Е., Хенкемейер М., Стребхардт К., Хираи Х., Уилкинсон Д.Г., Поусон Т., Дэвис С., Янкопулос Г.Д. (июль 1996 г.). «Рецепторы и лиганды Eph включают два основных подкласса специфичности и взаимно компартментализируются во время эмбриогенеза» . Нейрон . 17 (1): 9–19. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80276-7 . ПМИД   8755474 . S2CID   1075856 .
• Эфноменклатурный комитет (август 1997 г.). «Единая номенклатура рецепторов семейства Eph и их лигандов, эфринов. Комитет по номенклатуре Eph» . Клетка . 90 (3): 403–4. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80500-0 . ПМИД   9267020 . S2CID   26773768 .
• Нагель В., Шильчер П., Цейтльманн Л., Коланус В. (август 1998 г.). «Домен PH и многоосновный домен c цитогезина-1 специфически взаимодействуют в ассоциации плазматических мембран и клеточных функциях» . Молекулярная биология клетки . 9 (8): 1981–94. дои : 10.1091/mbc.9.8.1981 . ПМК   25450 . ПМИД   9693361 .