мир-126
| мир-126 | |
|---|---|
 Вторичная структура и консервативность последовательности предшественника миР-126. | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мир-126 |
| Рфам | RF00701 |
| семейство miRBase | МИПФ0000115 |
| МОЙ БОГ | 611767 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ТАК | ТАК: 0001244 |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии мир-126 представляет собой короткую некодирующую молекулу РНК. МикроРНК регулируют уровни экспрессии других генов с помощью нескольких пре- и посттранскрипционных механизмов.
Мир-126 представляет собой человеческую микроРНК, которая экспрессируется только в эндотелиальных клетках , в капиллярах, а также в более крупных кровеносных сосудах. [ 1 ] и действует на различные транскрипты, контролируя ангиогенез . [ 2 ]
Геномное расположение
[ редактировать ]миР-126 расположена в 7-м интроне гена EGFL7 , который находится на 9-й хромосоме человека . [ 3 ]
мир-126*
[ редактировать ]mir-126* представляет собой цепь, комплементарную mir-126, которая образуется после расщепления двухцепочечной pri-миРНК и денатурации двух цепей, разделяющихся. mir-126* встречается в организмах реже, чем mir-126, и было идентифицировано меньше его ролей в регуляции экспрессии генов. Однако недавно mir-126* был вовлечен в подавление простаена в неэндотелиальных клетках. Простеин может вырабатываться специфически в простате за счет подавления как mir-126*, так и EGFL7. [ 4 ]
Регулирование экспрессии
[ редактировать ]mir-126 регулируется путем связывания двух факторов транскрипции : ETS1 и ETS2 . [ 5 ] Связывание этих факторов индуцирует транскрипцию пре-миРНК mir-126, что приводит к образованию шпильковой при-миРНК. Шпильчатая микроРНК направляется к Dicer для расщепления с образованием зрелых транскриптов mir-126 и mir-126*.
Эпигенетическая регуляция гена-хозяина путем накопления метилирования и молчания генов нуклеосом снижает экспрессию воздействующих интронных микроРНК. Это наблюдалось при раке, для которого полезно подавление как EGFL7, так и mir-126, что приводит к тому, что ни один из них не экспрессируется. [ 6 ]
только один однонуклеотидный полиморфизм Идентифицирован в пределах mir-126. Изменение 24-го основания предотвращает процессинг pri-миРНК в зрелую микроРНК, уменьшая подавление различных мишеней mir-126. [ 7 ] Частота SNP варьируется в зависимости от этнического происхождения и потенциально связана с дифференциальным заражением человека.
Мишени Мир-126
[ редактировать ]миРНК связывается с целевыми последовательностями, снижая экспрессию целевого гена. миРНК может связываться либо непосредственно с ДНК, предотвращая транскрипцию , либо с транскрибируемой мРНК, предотвращая трансляцию и направляя мРНК на деградацию. Одной из основных мишеней мир-126 является ген хозяина EGFL7. Транскрипция обоих происходит, однако зрелый mir-126 связывается с комплементарной последовательностью в EGFL7, предотвращая трансляцию мРНК, что приводит к снижению уровней белка EGFL7. [ 8 ] Известно, что EGFL7 участвует в миграции клеток и формировании кровеносных сосудов. [ 9 ] что делает EGFL7 и mir-126 подходящими мишенями для заболеваний, таких как рак, которые требуют постоянного образования кровеносных сосудов для снабжения опухоли питательными веществами и путей миграции клеток для опосредования инвазии в ткани.
- CRK , белок, участвующий во внутриклеточных сигнальных путях, участвующих в регуляции клеточной адгезии, пролиферации, миграции и инвазии. [ 10 ] [ 11 ]
- TOM1 является негативным регулятором сигнальных путей IL-1beta и TNF-альфа . [ 12 ]
- Производство CXCL12 хемокина . регулируется mir-126 [ 13 ]
- POU3F1 , фактор, необходимый для активации транскрипционного фактора PU.1 . PU.1 отрицательно регулирует экспрессию GATA3 , изменяя реакцию Т-хелперов 2 . [ 14 ]
- Продукция белка VEGF-A снижается, поскольку mir-126 связывается с 3'-нетранслируемой областью мРНК VEGF-A. [ 15 ]
- IRS-1 переходу клеточного цикла из G0 препятствует / G1 S в -фазу . [ 16 ]
- HOXA9 , mir-126 модулирует экспрессию HOXA9 в гемопоэтических клетках . [ 17 ] Гены HOX являются важными генами, регулирующими развитие.
Участие в гомеостазе
[ редактировать ]Восстановление и поддержание тканей являются важными частями жизненного цикла организма: клетки и ткани должны оставаться в гомеостазе, чтобы обеспечить выживание. Это включает в себя контролируемую гибель клеток и реакцию на раны. Во время апоптотической гибели клеток клетки высвобождают апоптотические тельца, содержащие паракринные сигналы соседним клеткам. В эндотелиальных клетках мир-126 также высвобождается в этих тельцах и при абсорбции в соседней клетке вызывает CXCL12-зависимую сосудистую защиту. [ 13 ] CXCL12 связывается с рецептором CXCR4, активно противодействуя апоптозу и привлекая клетки-предшественники к месту повреждения.
Участие в болезни
[ редактировать ]Рак
[ редактировать ]Было показано, что мир-126 является как супрессором опухоли , так и онкогеном в зависимости от типа рака. Подавление прогрессирования рака происходит за счет негативного контроля мир-126 над пролиферацией, миграцией, инвазией и выживанием клеток, в то время как мир-126 также может поддерживать прогрессирование рака за счет стимуляции образования кровеносных сосудов и воспаления в месте активации. [ 3 ]
- mir-126 и mir126* сверхэкспрессируются при остром миелолейкозе . [ 18 ]
- Экспрессия mir-126 снижается при колоректальном раке . [ 19 ]
- Экспрессия mir-126 снижается при раке желудка . [ 10 ]
- Экспрессия mir-126 снижается в рака легких . клеточных линиях [ 15 ]
- Экспрессия mir-126 снижается при раке простаты [ 6 ] и рак мочевого пузыря . [ 6 ]
- Экспрессия mir-126 снижается при раке молочной железы . [ 16 ] Он также подавляет рекрутирование метастатического эндотелия, ангиогенез и колонизацию посредством взаимодействия со своими генами-мишенями IGFBP2 , PITPNC1 и MERTK . [ 20 ]
- Повышенная экспрессия mir-126 ингибирует пролиферацию клеток немелкоклеточной карциномы легкого in vitro и предотвращает рост опухоли за счет нацеливания на EGFL7. [ 9 ]
Недавно мир-126 был использован в качестве опухолевого маркера в методе неинвазивной диагностики. Образцы мочи позволили идентифицировать больных раком мочевого пузыря, кроме тех, кто не пострадал, поскольку малые РНК легко выводятся через мочу. [ 21 ]
Диабет
[ редактировать ]Низкие уровни экспрессии многих типов микроРНК наблюдаются при диабете 2 типа , включая: мир-15а, мир-20b, мир-21, мир-124, мир-126, мир-191, мир-197, мир-223 , мир . -320 и Мир-486. [ 22 ] Также наблюдалась повышенная экспрессия mir-28-3p. [ 22 ] Последствия неправильной регуляции этих микроРНК полностью не выяснены, однако было показано, что экспрессия mir-126 снижается в ответ на высокие уровни глюкозы. [ 22 ] Снижение уровня mir-15a, mir-29b, mir-126 и mir-223 способствует манифестации заболевания, что делает эти транскрипты возможной мишенью для диагностического тестирования диабета 2 типа.
Муковисцидоз
[ редактировать ]Сравнение муковисцидоза с эпителиальными клетками дыхательных путей, не страдающими муковисцидозом, показывает, что различные микроРНК по-разному регулируются в ответ на заболевание. Предполагается, что mir-126 играет роль в регуляции врожденных иммунных реакций в легких, пораженных муковисцидозом. [ 12 ]
Аллергическая астма
[ редактировать ]Мир-126 усиливает иммунный ответ на определенные антигены, что приводит к чрезмерной стимуляции иммунной системы и аллергической астме . Клетки Т-хелперов 2 подвергаются воздействию mir-126 посредством сложного пути взаимодействия, увеличение уровня mir-126 приводит к усилению ответа клеток T-хелперов 2. [ 14 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ ван Золинген С., Сегерс Л., Бийкерк Р., Дуйс Дж. М., Ротен М. К., ван Оверен-Ритдейк А. М., Бельде Х. Дж., Монж М., Вос Дж. Б., де Бур Х. К., Куакс П.Х., Рабелинк Т. Дж., ван Зонневельд А. Дж. (2009). «Опосредованное антагомиром подавление специфической для эндотелиальных клеток микроРНК-126 нарушает ангиогенез, индуцированный ишемией» . Журнал клеточной и молекулярной медицины . 13 (8А): 1577–85. дои : 10.1111/j.1582-4934.2008.00613.x . ПМЦ 3828868 . ПМИД 19120690 .
- ^ Ван С., Аврора А.Б., Джонсон Б.А., Ци Икс, Макэналли Дж., Хилл Дж.А., Ричардсон Дж.А., Бассель-Дюби Р., Олсон Э.Н. (2008). «Эндотелиально-специфическая микроРНК миР-126 управляет целостностью сосудов и ангиогенезом» . Ячейка разработчиков . 15 (2): 261–71. дои : 10.1016/j.devcel.2008.07.002 . ПМЦ 2685763 . ПМИД 18694565 .
- ^ Jump up to: а б Мейстер Дж., Шмидт М.Х. (2010). «МиР-126 и миР-126*: новые игроки в раке» . Научный мировой журнал . 10 : 2090–100. дои : 10.1100/tsw.2010.198 . ПМЦ 5763667 . ПМИД 20953557 .
- ^ Мусиенко А, Битко В, Барик С (2008). «Эктопическая экспрессия миР-126*, интронного продукта сосудистого эндотелия EGF-подобного гена 7, регулирует трансляцию простаина и инвазивность клеток LNCaP рака простаты» . Журнал молекулярной медицины . 86 (3): 313–22. дои : 10.1007/s00109-007-0296-9 . ПМЦ 3263384 . ПМИД 18193184 .
- ^ Харрис Т.А., Ямакучи М., Кондо М., Оттген П., Ловенштейн С.Дж. (2010). «Ets-1 и Ets-2 регулируют экспрессию микроРНК-126 в эндотелиальных клетках» . Артериосклеры Тромб Васк Биол . 30 (10): 1990–7. дои : 10.1161/ATVBAHA.110.211706 . ПМК 3121560 . ПМИД 20671229 .
- ^ Jump up to: а б с Сайто Ю., Фридман Дж. М., Чихара Ю., Эггер Дж., Чуанг Дж. К., Лян Дж. (2009). «Эпигенетическая терапия повышает активность микроРНК-126-супрессора опухоли и ее гена-хозяина EGFL7 в раковых клетках человека». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 379 (3): 726–31. дои : 10.1016/j.bbrc.2008.12.098 . ПМИД 19116145 .
- ^ Харнпрасопват Р., Ха Д., Тоёшима Т., Лодиш Х., Тодзё А., Котани А. (2010). «Изменение процессинга, индуцированное однонуклеотидным полиморфизмом в pri-miR-126» . Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 399 (2): 117–22. дои : 10.1016/j.bbrc.2010.07.009 . ПМЦ 3056433 . ПМИД 20621067 .
- ^ Сунь Ю.К., Чжан Ф., Бай Ю.Ф., Го Л.Л. (2010). «[миР-126 модулирует экспрессию домена 7, подобного эпидермальному фактору роста, в эндотелиальных клетках пупочной вены человека in vitro]». Нань Фан И Кэ да Сюэ Сюэ Бао . 30 (4): 767–70. ПМИД 20423846 .
- ^ Jump up to: а б Сунь Ю, Бай Ю, Чжан Ф, Ван Ю, Го Ю, Го Л (2010). «МиР-126 ингибирует пролиферацию клеток немелкоклеточного рака легких путем нацеливания на EGFL7». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 391 (3): 1483–9. дои : 10.1016/j.bbrc.2009.12.098 . ПМИД 20034472 .
- ^ Jump up to: а б Фэн Р, Чен X, Ю Ю, Су Л, Ю Б, Ли Дж, Цай Ц, Ян М, Лю Б, Чжу З (2010). «МиР-126 действует как супрессор опухоли при раке желудка человека». Рак Летт . 298 (1): 50–63. дои : 10.1016/j.canlet.2010.06.004 . ПМИД 20619534 .
- ^ Кроуфорд М., Браунер Э., Батт К., Ю. Л., Хантер М.Г., Оттерсон Г.А., Нуово Дж., Марш CB, Нана-Синкам С.П. (2008). «МикроРНК-126 ингибирует инвазию в клеточные линии немелкоклеточной карциномы легкого». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 373 (4): 607–12. дои : 10.1016/j.bbrc.2008.06.090 . ПМИД 18602365 .
- ^ Jump up to: а б Оглсби И.К., Брей И.М., Чотирмалл С.Х., Столлингс Р.Л., О'Нил С.Дж., МакЭлвани Н.Г., Грин К.М. (2010). «МиР-126 подавляется в эпителиальных клетках дыхательных путей при муковисцидозе и регулирует экспрессию TOM1» . Журнал иммунологии . 184 (4): 1702–9. doi : 10.4049/jimmunol.0902669 . ПМИД 20083669 .
- ^ Jump up to: а б Цернеке А, Биджеков К, Ноэлс Х, Шагдарсурен Е, Ган Л, Денеке Б, Христов М, Кёппель Т, Джахантиг МН, Лутгенс Э, Ван С, Олсон Е.Н., Шобер А, Вебер С (2009). «Доставка микроРНК-126 апоптотическими тельцами индуцирует CXCL12-зависимую сосудистую защиту». Научный сигнал . 2 (100): ра81. дои : 10.1126/scisignal.2000610 . ПМИД 19996457 . S2CID 45583628 .
- ^ Jump up to: а б Мэттс Дж., Коллисон А., Планк М., Фиппс С., Фостер П.С. (2009). «Антагонизм микроРНК-126 подавляет эффекторную функцию клеток ТН2 и развитие аллергических заболеваний дыхательных путей» . Труды Национальной академии наук США . 106 (44): 18704–9. Бибкод : 2009PNAS..10618704M . дои : 10.1073/pnas.0905063106 . ПМЦ 2773983 . ПМИД 19843690 .
- ^ Jump up to: а б Лю Б, Пэн XC, Чжэн XL, Ван Дж, Цинь YW (2009). «Восстановление МиР-126 подавляет VEGF и ингибирует рост клеточных линий рака легких in vitro и in vivo». Рак легких . 66 (2): 169–75. дои : 10.1016/j.lungcan.2009.01.010 . ПМИД 19223090 .
- ^ Jump up to: а б Чжан Дж., Ду Ю.И., Линь Ю.Ф., Чен Ю.Т., Ян Л., Ван Х.Дж., Ма Д. (2008). «Супрессор клеточного роста mir-126 нацелен на IRS-1». Биохимия Биофиз Рес Коммьюнити . 377 (1): 136–40. дои : 10.1016/j.bbrc.2008.09.089 . ПМИД 18834857 .
- ^ Шен В.Ф., Ху Ю.Л., Уттарвар Л., Пассег Э., Ларгман С. (2008). «МикроРНК-126 регулирует HOXA9 путем связывания с гомеобоксом» . Мол Клеточная Биол . 28 (14): 4609–19. дои : 10.1128/MCB.01652-07 . ПМЦ 2447122 . ПМИД 18474618 .
- ^ Ли З, Чен Дж (2011). «Функциональное исследование миР-126 in vitro при лейкемии». МикроРНК и рак . Методы молекулярной биологии. Том. 676. стр. 185–95. дои : 10.1007/978-1-60761-863-8_13 . ISBN 978-1-60761-862-1 . ПМИД 20931398 .
- ^ Ли XM, Ван AM, Чжан Дж, И Х (2010). «Понижение экспрессии миР-126 при колоректальном раке и его клиническое значение». Мед Онкол . 28 (4): 1054–7. дои : 10.1007/s12032-010-9637-6 . ПМИД 20680522 . S2CID 24084013 .
- ^ Пнг, КДж; Халберг, Н.; Ёсида, М.; Тавазои, Сан-Франциско (2011). «Регулон микроРНК, который опосредует рекрутирование эндотелия и метастазирование раковыми клетками». Природа . 481 (7380): 190–194. дои : 10.1038/nature10661 . ПМИД 22170610 . S2CID 205227054 .
- ^ Ханке М., Хоефиг К., Мерц Х., Феллер А.С., Кауш И., Йохам Д., Варнеке Дж.М., Счакиэль Г. (2009). «Надежная методология изучения микроРНК мочи как опухолевого маркера: микроРНК-126 и микроРНК-182 связаны с раком мочевого пузыря». Урол Онкол . 28 (6): 655–61. дои : 10.1016/j.urolonc.2009.01.027 . ПМИД 19375957 .
- ^ Jump up to: а б с Зампетаки А, Кихл С, Дроздов И, Виллейт П, Майр У, Прокопи М, Майр А, Вегер С, Оберхолленцер Ф, Бонора Э, Шах А, Виллейт Дж, Майр М (2010). «Профилирование микроРНК плазмы выявляет потерю эндотелиальной миР-126 и других микроРНК при диабете 2 типа» . Цир Рес . 107 (6): 810–7. дои : 10.1161/CIRCUS.110.226357 . ПМИД 20651284 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Кунерт Ф., Манкузо М.Р., Хэмптон Дж., Станкунас К., Асано Т., Чен Ч.З., Куо С.Дж. (2008). «Атрибуция сосудистых фенотипов мышиного локуса Egfl7 микроРНК миР-126» . Разработка . 135 (24): 3989–93. дои : 10.1242/dev.029736 . ПМИД 18987025 .
- Фиш Дж.Э., Санторо М.М., Мортон С.У., Ю.С., Йе РФ, Уайт Дж.Д., Айви К.Н., Бруно Б.Г., Стейнер Д.Ю., Шривастава Д. (2008). «миР-126 регулирует передачу ангиогенных сигналов и целостность сосудов» . Ячейка разработчиков . 15 (2): 272–84. дои : 10.1016/j.devcel.2008.07.008 . ПМК 2604134 . ПМИД 18694566 .
- Го С., Сах Дж. Ф., Бирд Л., Уилсон Дж. К., Марковиц С. Д., Гуда К. (2008). «Некодирующая РНК, миР-126, подавляет рост неопластических клеток, воздействуя на передачу сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы, и часто теряется при раке толстой кишки» . Гены Хромосомы Рак . 47 (11): 939–46. дои : 10.1002/gcc.20596 . ПМК 2739997 . ПМИД 18663744 .
- Харрис Т.А., Ямакучи М., Ферлито М., Менделл Дж.Т., Ловенштейн С.Дж. (2008). «МикроРНК-126 регулирует эндотелиальную экспрессию молекулы адгезии 1 сосудистых клеток» . Труды Национальной академии наук США . 105 (5): 1516–21. Бибкод : 2008PNAS..105.1516H . дои : 10.1073/pnas.0707493105 . ПМК 2234176 . ПМИД 18227515 .