Семейство предшественников микроРНК mir-34
| Семейство предшественников микроРНК mir-34 | |
|---|---|
 Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности мир-34 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мир-34 |
| Рфам | RF00456 |
| miRBase | МИ0000268 |
| семейство miRBase | МИПФ0000039 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | Гены ; микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты |
| ИДТИ | ПОЙДИТЕ: 0035195 ПОЙДИТЕ: 0035068 |
| ТАК | ТАК: 0001244 |
| PDB Структуры | ПДБе |
Семейство miR-34 микроРНК предшественников представляет собой некодирующие молекулы РНК, которые у млекопитающих дают начало трем основным зрелым микроРНК. Члены семейства миР-34 были обнаружены вычислительным путем [ 1 ] и позже проверено экспериментально. [ 2 ] [ 3 ] Ствол-петля предшественника миРНК процессируется в цитоплазме клетки, при этом преобладающая зрелая последовательность миР-34 вырезается из 5'-плеча шпильки . [ 4 ]
Семейство МиР-34
[ редактировать ]У млекопитающих три предшественника миР-34 производятся из двух транскрипционных единиц. [ 5 ] Предшественник миР-34а человека транскрибируется с хромосомы 1. Предшественники миР-34b и миР-34с совместно транскрибируются из области на хромосоме 11, по-видимому, как часть транскрипта, известного как BC021736 .
Экспрессия MIR34A (гена) у мышей наблюдается во всех исследованных тканях, но наиболее высока в головном мозге. миР-34b и -c относительно менее распространены в большинстве тканей, но являются преобладающими видами миР-34 в легких. [ 5 ] Присутствие продуктов миР-34 также было подтверждено в эмбриональных стволовых клетках . Было показано, что миР-34 наследуется по материнской линии у дрозофилы и рыбок данио, а потеря миР-34 приводит к дефектам развития заднего мозга у эмбрионов рыбок данио. Это было первое сообщение о нокдауне фенотипа миР-34 в любом модельном организме, хотя этот фенотип наблюдался только примерно у 30% эмбрионов рыбок данио. [ 6 ]
Мишени миР-34
[ редактировать ]Ямакучи и др. . показали, что миР-34а нацелена на ген регулятора молчащей информации 1 (SIRT1): [ 7 ]
- «Ингибирование SIRT1 миР-34 приводит к увеличению ацетилированного р53 и экспрессии р21 и PUMA, транскрипционных мишеней р53, которые регулируют клеточный цикл и апоптоз соответственно. Более того, подавление SIRT1 миР-34 в конечном итоге приводит к апоптозу у человека WT. клетки рака толстой кишки, но не клетки рака толстой кишки человека, лишенные р53. Наконец, миР-34а сама по себе является мишенью транскрипции р53, что указывает на наличие петли положительной обратной связи между р53 и миР-34а. Таким образом, миР-34а действует как супрессор опухоли, в. частично через путь SIRT1-p53». [ 7 ]
Недавно подход количественной протеомики – SILAC был использован для идентификации мишеней миР-34a на уровне генома в клетках HEK293T . [ 8 ]
Мир-34 ингибирует опухолевые сферы рака желудка с мутацией p53 человека
[ редактировать ]В клетках рака желудка человека с дефицитом p53 восстановление функциональной миР-34 ингибирует рост клеток и индуцирует хемосенсибилизацию и апоптоз, что указывает на то, что миР-34 может восстанавливать функцию р53. Восстановление миР-34 ингибирует образование и рост опухолевых сфер, что, как сообщается, коррелирует с самообновлением раковых стволовых клеток. Механизм опосредованного миР-34 подавления самообновления, по-видимому, связан с прямой модуляцией нижестоящих мишеней Bcl-2 , Notch и HMGA2 , что указывает на то, что миР-34 может участвовать в самообновлении стволовых клеток рака желудка. дифференциация принятия решений. [ 9 ] [ 10 ] миР-34c также связана с развитием костей и раком костей. [ 11 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Лим Л.П., Гласнер М.Э., Йекта С., Бердж CB, Бартель Д.П. (март 2003 г.). «Гены микроРНК позвоночных». Наука . 299 (5612): 1540. doi : 10.1126/science.1080372 . ПМИД 12624257 . S2CID 37750545 .
- ^ Дости Дж., Мурелатос З., Ян М., Шарма А., Дрейфусс Г. (февраль 2003 г.). «Многочисленные микроРНП в нейрональных клетках, содержащие новые микроРНК» . РНК . 9 (2): 180–6. дои : 10.1261/rna.2141503 . ПМК 1370383 . ПМИД 12554860 .
- ^ Хубавий Х.Б., Мюррей М.Ф., Шарп, Пенсильвания (август 2003 г.). «МикроРНК, специфичные для эмбриональных стволовых клеток» . Развивающая клетка . 5 (2): 351–8. дои : 10.1016/S1534-5807(03)00227-2 . ПМИД 12919684 .
- ^ Хе Л, Хе Х, Лим ЛП, де Станчина Э, Сюань З, Лян Ю, Сюэ В, Зендер Л, Магнус Дж, Ридзон Д, Джексон А.Л., Линсли П.С., Чен С., Лоу С.В., Клири М.А., Хэннон Г.Дж. (июнь 2007). «Компонент микроРНК сети супрессоров опухолей р53» . Природа . 447 (7148): 1130–4. дои : 10.1038/nature05939 . ПМК 4590999 . ПМИД 17554337 .
- ^ Перейти обратно: а б Хермекинг Х (февраль 2010 г.). «Семейство миР-34 при раке и апоптозе». Смерть клеток и дифференцировка . 17 (2): 193–9. дои : 10.1038/cdd.2009.56 . ПМИД 19461653 . S2CID 25936686 .
- ^ Сони К., Чоудхари А., Патовари А., Сингх А.Р., Бхатия С., Сивасуббу С., Чандрасекаран С., Пиллаи Б. (апрель 2013 г.). «МиР-34 наследуется по материнской линии у Drosophila melanogaster и Danio rerio» . Исследования нуклеиновых кислот . 41 (8): 4470–80. дои : 10.1093/нар/gkt139 . ПМЦ 3632126 . ПМИД 23470996 .
- ^ Перейти обратно: а б Ямакучи М., Ферлито М., Ловенштейн С.Дж. (сентябрь 2008 г.). «Репрессия SIRT1 миР-34а регулирует апоптоз» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (36): 13421–6. дои : 10.1073/pnas.0801613105 . ПМК 2533205 . ПМИД 18755897 .
- ^ Баргадже Р., Гупта С., Саркешик А., Парк Р., Сюй Т., Саркар М., Халимани М., Рой СС, Йейтс Дж., Пиллаи Б. (2012). «Идентификация новых мишеней для миР-29а с использованием протеомики миРНК» . ПЛОС ОДИН . 7 (8): е43243. дои : 10.1371/journal.pone.0043243 . ПМЦ 3428309 . ПМИД 22952654 .
- ^ Цзи Q, Хао X, Мэн Ю, Чжан М, Десано Дж, Фань Д и др. (2008). «Восстановление опухолевого супрессора миР-34 ингибирует опухолевые сферы рака желудка с мутацией р53 человека» . БМК Рак . 8 : 266. дои : 10.1186/1471-2407-8-266 . ПМК 2564978 . ПМИД 18803879 .
- ^ Путь Мир-34 и p53
- ^ Бэ Ю, Ян Т, Цзэн ХК, Кампо ПМ, Чен Ю, Бертин Т, Доусон БК, Мунивес Э, Тао Дж, Ли БХ (июль 2012 г.). «миРНК-34c регулирует передачу сигналов Notch во время развития костей» . Молекулярная генетика человека . 21 (13): 2991–3000. дои : 10.1093/hmg/dds129 . ПМЦ 3373245 . ПМИД 22498974 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Страница семейства предшественников микроРНК mir-34 в Rfam
- Запись miRBase для мышиной миР-34а (mmu-miR-34a)
- Запись miRBase для человеческой миР-34a (hsa-miR-34a)