✖


Jump to content

Количественная протеомика

    Add links
    Количественная масс-спектрометрия.

    Количественная протеомика — это аналитический химический метод определения количества белков в образце. [1] [2] [3] [4] Методы идентификации белков идентичны методам, используемым в общей (т.е. качественной) протеомике , но включают количественную оценку в качестве дополнительного измерения. Вместо того, чтобы просто предоставлять списки белков, идентифицированных в определенном образце, количественная протеомика дает информацию о физиологических различиях между двумя биологическими образцами. Например, этот подход можно использовать для сравнения образцов здоровых и больных пациентов. Количественная протеомика в основном выполняется с помощью двумерного гель-электрофореза (2-DE), препаративного нативного PAGE или масс-спектрометрии (MS). Однако недавно разработанный метод количественного дот-блот -анализа (QDB) способен измерять как абсолютное, так и относительное количество отдельных белков в образце в формате с высокой пропускной способностью, тем самым открывая новое направление для протеомных исследований. В отличие от 2-DE, который требует МС для идентификации последующих белков, технология МС может идентифицировать и количественно оценить изменения.

    Количественная оценка с использованием спектрофотометрии

    [ редактировать ]

    Концентрацию определенного белка в образце можно определить с помощью спектрофотометрических методов. [5] Концентрацию белка можно определить путем измерения ОП при 280 нм на спектрофотометре, который можно использовать с анализом стандартной кривой для количественного определения присутствия триптофана, тирозина и фенилаланина. [6] Однако этот метод не является самым точным, поскольку состав белков может сильно различаться, и этот метод не позволит количественно оценить белки, не содержащие вышеупомянутые аминокислоты. Этот метод также неточен из-за возможности загрязнения нуклеиновыми кислотами. Другие более точные спектрофотометрические процедуры количественного определения белка включают методы Биурета , Лоури , BCA и Брэдфорда . Альтернативным методом количественного определения белка без метки в прозрачной жидкости является метод ППР на основе кюветы , который одновременно измеряет показатель преломления в диапазоне от 1,0 до 1,6 нД и концентрацию белка в диапазоне от 0,5 мкл до 2 мл по объему. Эта система состоит из калиброванного оптического фильтра с очень высоким угловым разрешением, и взаимодействие света с этим кристаллом образует резонанс на длине волны, которая коррелирует с концентрацией и показателем преломления вблизи кристалла. [7]

    Количественная оценка с использованием двумерного электрофореза

    [ редактировать ]

    Двумерный гель-электрофорез (2-DE) представляет собой одну из основных технологий количественной протеомики, имеющую свои преимущества и недостатки. 2-DE предоставляет информацию о количестве, заряде и массе интактного белка. Он имеет ограничения для анализа белков размером более 150 кДа или менее 5 кДа, а также белков с низкой растворимостью. Количественный МС имеет более высокую чувствительность, но не дает информации о интактном белке.

    Классический 2-DE, основанный на постэлектрофоретическом окрашивании красителем, имеет ограничения: для проверки воспроизводимости требуется не менее трех технических повторов. [ нужна ссылка ] Разностный гель-электрофорез (DIGE) использует флуоресцентное мечение белков перед разделением, что повышает точность количественного определения, а также чувствительность обнаружения белков. [ нужна ссылка ] Таким образом, DIGE представляет собой основной подход к исследованию протеомов на основе 2-DE. [ нужна ссылка ]

    Количественная оценка с использованием масс-спектрометрии

    [ редактировать ]
    Примеры количественных протеомных рабочих процессов. Красный цвет представляет представляющий интерес физиологический образец, а синий — контрольный образец. Белые прямоугольники обозначают области, где наиболее вероятны ошибки, а фиолетовые прямоугольники обозначают места, где образцы были смешаны. [8]

    Масс-спектрометрия (МС) представляет собой одну из основных технологий количественной протеомики, имеющую свои преимущества и недостатки. [4] Количественный МС имеет более высокую чувствительность, но может предоставить лишь ограниченную информацию о интактном белке. Количественный МС использовался как для открытия, так и для целевого протеомного анализа, чтобы понять глобальную протеомную динамику в популяциях клеток (объемный анализ). [9] или в отдельных клетках (одноклеточный анализ). [10] [11]

    Ранние подходы, разработанные в 1990-х годах, применяли аффинные метки с изотопным кодированием (ICAT), в которых используются два реагента с тяжелыми и легкими изотопами соответственно, а также аффинная метка с биотином для модификации цистеинсодержащих пептидов. Эта технология использовалась для маркировки целых Saccharomyces cerevisiae . клеток [12] и, в сочетании с масс-спектрометрией , помог заложить основу количественной протеомики. Этот подход был заменен метками изобарной массы, [9] которые также используются для анализа одноклеточных белков. [13]

    Относительная и абсолютная количественная оценка

    [ редактировать ]

    Масс-спектрометрия по своей сути не является количественной из-за различий в эффективности ионизации и/или обнаруживаемости многих пептидов в данном образце, что привело к разработке методов определения относительного и абсолютного содержания белков в образцах. [3] [4] Интенсивность пика в масс-спектре не является хорошим индикатором количества аналита в образце, хотя различия в интенсивности пика одного и того же аналита в нескольких образцах точно отражают относительные различия в его содержании.

    Мечение стабильных изотопов в масс-спектрометрии

    [ редактировать ]
    См. также: ЖХ – МС.

    Метки стабильных изотопов

    [ редактировать ]

    Подход к относительному количественному определению, который является более дорогостоящим и трудоемким, хотя и менее чувствителен к экспериментальной погрешности, чем количественный анализ без меток, влечет за собой маркировку образцов метками стабильных изотопов , которые позволяют масс-спектрометру различать идентичные белки в отдельных образцах. Один тип метки, изотопные метки, состоит из стабильных изотопов, включенных в белковые сшивающие агенты, которые вызывают известный сдвиг массы меченого белка или пептида в масс-спектре. Дифференциально меченные образцы объединяются и анализируются вместе, а различия в интенсивности пиков пар изотопов точно отражают разницу в содержании соответствующих белков.

    Абсолютная количественная оценка протеома с использованием изотопных пептидов предполагает добавление известных концентраций синтетических тяжелых изотопологов целевых пептидов в экспериментальный образец и последующее выполнение ЖХ-МС/МС. Как и при относительном количественном определении с использованием изотопных меток, пептиды одинакового химического состава элюируются совместно и анализируются с помощью МС одновременно. Однако, в отличие от относительного количественного определения, содержание целевого пептида в экспериментальном образце сравнивается с содержанием тяжелого пептида и рассчитывается обратно по исходной концентрации стандарта с использованием заранее определенной стандартной кривой, чтобы получить абсолютное количественное определение целевого пептида. пептид.

    Методы относительного количественного определения включают аффинные метки с изотопным кодированием (ICAT), изобарическое мечение ( тандемные массовые метки (TMT) и изобарические метки для относительного и абсолютного количественного определения (iTRAQ)), без метки метки с металлическим кодированием ( MeCAT ), N-концевые метки. мечение , мечение стабильными изотопами аминокислот в культуре клеток ( SILAC ) и мечение субстратов терминальными изотопами аминов (TAILS). Появился математически строгий подход, который объединяет интенсивности пептидов и согласованность измерений пептидов в доверительные интервалы для соотношений белков. [14]

    Абсолютное количественное определение проводят с использованием мониторинга выбранных реакций (SRM).

    Метки с металлической кодировкой

    [ редактировать ]
    См. Также: Ионизация электрораспылением и лазерная десорбция / ионизация с помощью матрицы.

    Метод меток с металлическим кодированием (MeCAT) основан на химической маркировке, но вместо использования стабильных изотопов используются различные ионы лантаноидов в макроциклических комплексах. Количественная информация поступает из измерений меченых пептидов с помощью МС индуктивно связанной плазмы. MeCAT можно использовать в сочетании с элементной масс-спектрометрией ICP-MS, что позволяет впервые определить абсолютное количественное определение металла, связанного реагентом MeCAT с белком или биомолекулой. Таким образом, можно определить абсолютное количество белка вплоть до аттомольного диапазона, используя внешнюю калибровку по стандартному раствору металла. Он совместим с разделением белков с помощью 2D-электрофореза и хроматографии в мультиплексных экспериментах. Идентификация белка и относительная количественная оценка могут быть выполнены с помощью MALDI -MS/MS и ESI-MS/MS.

    Масс-спектрометры имеют ограниченную способность обнаруживать пептиды с низким содержанием в образцах с высоким динамическим диапазоном. Ограниченный рабочий цикл масс-спектрометров также ограничивает частоту столкновений, что приводит к недостаточной выборке. [15] Протоколы подготовки проб представляют собой источники экспериментальной систематической ошибки.

    Мечение стабильных изотопов аминокислотами в культуре клеток

    [ редактировать ]

    Мечение стабильными изотопами аминокислот в культуре клеток ( SILAC ) — это метод, который включает метаболическое включение «тяжелых» C- или N-меченных аминокислот в белки с последующим МС-анализом. SILAC требует выращивания клеток в специализированной среде с добавлением легких или тяжелых форм незаменимых аминокислот, лизина или аргинина. Одну популяцию клеток выращивают в среде, содержащей легкие аминокислоты, тогда как в экспериментальных условиях выращивают в присутствии тяжелых аминокислот. Тяжелые и легкие аминокислоты включаются в белки посредством клеточного синтеза белка. После лизиса клеток объединяют равные количества белка из обоих условий и подвергают протеотипическому расщеплению. Аминокислоты аргинин и лизин были выбраны потому, что трипсин, преобладающий фермент, используемый для создания протеотипических пептидов для МС-анализа, расщепляет С-конец лизина и аргинина. После расщепления трипсином все триптические пептиды из клеток, выращенных в среде SILAC, будут содержать по крайней мере одну меченую аминокислоту, что приведет к постоянному сдвигу массы от меченого образца к немеченому. Поскольку пептиды, содержащие тяжелые и легкие аминокислоты, химически идентичны, они элюируются совместно во время колоночного фракционирования с обращенной фазой и обнаруживаются одновременно во время МС-анализа. Относительное содержание белка определяется относительной интенсивностью пиков изотопно различных пептидов.

    Традиционно уровень мультиплексирования в SILAC был ограничен из-за количества доступных изотопов SILAC. Недавно появилась новая технология под названием NeuCode SILAC. [16] увеличил уровень мультиплексирования, достижимый при метаболическом мечении (до 4). Аминокислотный метод NeuCode аналогичен методу SILAC, но отличается тем, что при маркировке используются только тяжелые аминокислоты. Использование только тяжелых аминокислот устраняет необходимость 100% включения аминокислот, необходимых для SILAC. Повышенная способность мультиплексирования аминокислот NeuCode обусловлена ​​использованием дефектов массы из-за дополнительных нейтронов в стабильных изотопах. Однако эти небольшие различия в массах необходимо устранять с помощью масс-спектрометров высокого разрешения.

    Одним из основных преимуществ SILAC является низкий уровень погрешности количественного анализа из-за ошибок обработки, поскольку тяжелые и легкие образцы объединяются перед подготовкой образцов для МС-анализа. SILAC и NeuCode SILAC — отличные методы для обнаружения небольших изменений в уровнях белка или посттрансляционных модификаций между экспериментальными группами.

    Изобарная маркировка

    [ редактировать ]

    Метки изобарной массы (метки тандемной массы) — это метки, имеющие идентичную массу и химические свойства, которые позволяют тяжелым и легким изотопологам совместно элюироваться. Все массовые теги состоят из массового репортера, имеющего уникальный номер 13 Замены C, нормализатор массы, который имеет уникальную массу, которая уравновешивает массу метки, чтобы все метки были равны по массе, и реактивную часть, которая сшивается с пептидами. Эти метки предназначены для расщепления в определенной линкерной области при высокоэнергетическом CID, образуя метки разного размера, которые затем количественно оцениваются с помощью LC-MS/MS. Образцы белков или пептидов, приготовленные из клеток, тканей или биологических жидкостей, метят параллельно меткам изобарной массы и объединяют для анализа. Количественное определение белка осуществляется путем сравнения интенсивностей репортерных ионов в спектрах МС/МС. Доступны три типа тандемных масс-меток с разной реакционной способностью: (1) реактивный эфир NHS, который обеспечивает высокоэффективное аминоспецифическое мечение (TMTduplex, TMTsixplex, TMT10plex и TMT11plex), (2) реактивная йодацетильная функциональная группа, которая метит сульфгидрил-( -SH) группы (йодТМТ) и (3) реакционноспособная алкоксиаминовая функциональная группа, которая обеспечивает ковалентное мечение карбонилсодержащих соединений (аминоксиТМТ).

    Ключевым преимуществом изобарной маркировки по сравнению с другими методами количественного анализа (например, SILAC, ICAT, без меток) являются расширенные возможности мультиплексирования и, следовательно, увеличенный потенциал пропускной способности. Возможность объединять и анализировать несколько образцов одновременно в одном цикле ЖХ-МС устраняет необходимость анализа нескольких наборов данных и устраняет различия между сериями. Мультиплексирование снижает вариабельность обработки образцов, повышает специфичность за счет одновременного количественного определения белков в каждом состоянии и сокращает время обработки нескольких образцов. Доступные в настоящее время изобарические химические метки позволяют одновременно анализировать до 11 экспериментальных образцов.

    Количественный анализ без меток в масс-спектрометрии

    [ редактировать ]
    Основная статья: Количественный анализ без меток

    Один из подходов к относительному количественному определению заключается в отдельном анализе образцов с помощью МС и сравнении спектров для определения содержания пептидов в одном образце по сравнению с другим, как в стратегиях без меток . Принято считать, что, хотя количественная оценка без меток является наименее точной из парадигм количественной оценки, она также недорога и надежна, если подвергается тщательной статистической проверке. В количественной протеомике без меток существует два разных метода количественного определения: AUC (площадь под кривой) и спектральный подсчет.

    Методы количественного определения без меток

    [ редактировать ]

    AUC — это метод, с помощью которого для данного пептидного спектра в анализе ЖХ-МС рассчитывается площадь под спектральным пиком. Измерения пика AUC линейно пропорциональны концентрации белка в данной смеси аналитов. Количественная оценка достигается путем подсчета ионов, измерения количества иона в определенное время удерживания. [17] Для стандартизации необработанных данных необходима свобода действий. [18] Спектрометр высокого разрешения может облегчить проблемы, возникающие при попытке обеспечить воспроизводимость данных, однако большая часть работы по нормализации данных может быть выполнена с помощью такого программного обеспечения, как OpenMS и MassView. [19]

    Спектральный подсчет включает в себя подсчет спектров идентифицированного белка и последующую стандартизацию с использованием той или иной формы нормализации. [20] Обычно это делается с помощью массового отбора пептидов (МС), который затем фрагментируется, а затем подсчитываются спектры МС/МС. [17] Для точной оценки содержания белка требуется несколько отборов проб белкового пика из-за сложной физико-химической природы пептидов. Таким образом, оптимизация экспериментов МС/МС является постоянной проблемой. Одной из альтернатив решения этой проблемы является использование независимого от данных метода, который циклически переключается между высокими и низкими энергиями столкновения. Таким образом собирается большой обзор всех возможных ионов-предшественников и продуктов-продуктов. Однако это ограничено способностью программного обеспечения масс-спектрометрии распознавать и сопоставлять пептидные паттерны ассоциаций между предшественником и ионами-продуктами.

    Приложения

    [ редактировать ]
    Рабочий процесс количественной оценки физиологических различий в α- и β-клетках у мышей с использованием компьютерного прогнозирования (A) и количественного определения изотопной метки SILAC (B). (C) представляет собой список кандидатов киназ, которые указывают на физиологические различия в α- и β-клетках. [21]

    Биомедицинские приложения

    [ редактировать ]

    Количественная протеомика имеет различные применения в области медицины. Особенно в области открытия лекарств и биомаркеров. Методы ЖХ-МС/МС начали вытеснять более традиционные методы, такие как вестерн-блоттинг и ИФА, из-за громоздкости маркировки различных и разделения белков с использованием этих методов и более глобального анализа количественного определения белков. Методы масс-спектрометрии более чувствительны к различиям в структуре белков, таким как посттрансляционная модификация, и, таким образом, могут количественно определять различные модификации белков. Количественная протеомика может обойти эти проблемы, требуя только получения информации о последовательности. Его можно применять на глобальном уровне протеома или для специфической изоляции партнеров связывания в экспериментах по нисходящей или аффинной очистке. [4] [22] Однако необходимо учитывать недостатки в чувствительности и времени анализа. [23]

    Открытие лекарств

    [ редактировать ]

    Количественная протеомика имеет наибольшее применение в идентификации белков-мишеней, проверке белков-мишеней и профилировании токсичности при открытии лекарств . [24] Открытие лекарств было использовано для исследования межбелкового взаимодействия, а в последнее время и взаимодействия лекарств с малыми молекулами — области исследований, называемой хемопротеомикой . Таким образом, он показал большие перспективы в мониторинге побочных эффектов небольших молекул, подобных лекарствам, и в понимании эффективности и терапевтического эффекта одного лекарства-мишени по сравнению с другим. [25] [26] Одной из наиболее типичных методик абсолютного количественного определения белка при разработке лекарств является использование ЖХ-МС/МС с мониторингом множественных реакций (MRM). Масс-спектрометрию обычно выполняют с помощью тройного квадрупольного МС . [24]

    См. также

    [ редактировать ]

    Ссылки

    [ редактировать ]
    1. ^ Онг С.Е., Манн М. (октябрь 2005 г.). «Протеомика, основанная на масс-спектрометрии, становится количественной». Химическая биология природы . 1 (5): 252–62. дои : 10.1038/nchembio736 . ПМИД   16408053 . S2CID   32054251 .
    2. ^ Банщефф М., Ширле М., Свитман Г., Рик Дж., Кастер Б. (октябрь 2007 г.). «Количественная масс-спектрометрия в протеомике: критический обзор» . Аналитическая и биоаналитическая химия . 389 (4): 1017–31. дои : 10.1007/s00216-007-1486-6 . ПМИД   17668192 .
    3. ^ Jump up to: а б Николов М., Шмидт С., Урлауб Х. (2012). «Количественная протеомика на основе масс-спектрометрии: обзор». В Маркусе К. (ред.). Количественные методы в протеомике . Методы молекулярной биологии. Том. 893. Хумана Пресс. стр. 85–100. дои : 10.1007/978-1-61779-885-6_7 . hdl : 11858/00-001M-0000-000F-C327-D . ISBN  978-1-61779-884-9 . ПМИД   22665296 . S2CID   33009117 .
    4. ^ Jump up to: а б с д Розанова Светлана; Барковиц, Каталин; Николов, Мирослав; Шмидт, Карла; Урлауб, Хеннинг; Маркус, Катрин (2021). «Количественная протеомика на основе масс-спектрометрии: обзор». В Маркусе, Катрин; Эйзенахер, Мартин; Ситек, Барбара (ред.). Количественные методы в протеомике . Методы молекулярной биологии. Том. 2228. Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Springer US. стр. 85–116. дои : 10.1007/978-1-0716-1024-4_8 . ISBN  978-1-0716-1023-7 . ПМИД   33950486 .
    5. ^ Нинфа, Баллу, Бенор. Фундаментальные подходы к биохимии и биотехнологии, 2-е издание, 2010 г. Fitzgerald Science Press, Бетесда, Мэриленд.
    6. ^ Уитакер-младший, Granum PE (ноябрь 1980 г.). «Абсолютный метод определения белка, основанный на разнице поглощения при 235 и 280 нм». Аналитическая биохимия . 109 (1): 156–159. дои : 10.1016/0003-2697(80)90024-x . ПМИД   7469012 .
    7. ^ Херманссон, Петур Г.; Ваннаме, Кристоф; Смит, Кэмерон LC; Соренсен, Кристиан Т.; Кристенсен, Андерс (2015). «Измерение дисперсии показателя преломления с использованием массива фотонно-кристаллических резонансных отражателей» (PDF) . Письма по прикладной физике . 107 (6): 061101. Бибкод : 2015ApPhL.107f1101H . дои : 10.1063/1.4928548 . S2CID   62897708 .
    8. ^ Энгхольм-Келлер К., Ларсен М.Р. (март 2013 г.). «Технологии и проблемы крупномасштабной фосфопротеомики». Протеомика . 13 (6): 910–931. дои : 10.1002/pmic.201200484 . ПМИД   23404676 . S2CID   11166402 .
    9. ^ Jump up to: а б Эберсольд Р., Манн М. (сентябрь 2016 г.). «Масс-спектрометрическое исследование структуры и функции протеома» . Природа . 537 (7620): 347–355. Бибкод : 2016Natur.537..347A . дои : 10.1038/nature19949 . ПМИД   27629641 . S2CID   4448087 .
    10. ^ Шпехт Х, Эммотт Э, Петельски А, Хаффман Р.Г., Перлман Д.Х., Серра М., Харченко П., Коллер А., Славов Н. (27 января 2021 г.). «Одноклеточный протеомный и транскриптомный анализ гетерогенности макрофагов с использованием SCoPE2» . Геномная биология . 22 (1). 50. дои : 10.1186/s13059-021-02267-5 . ПМЦ   7839219 . ПМИД   33504367 . S2CID   195403321 .
    11. ^ Славов Н. (июнь 2020 г.). «Анализ одноклеточных белков методом масс-спектрометрии» . Современное мнение в области химической биологии . 60 : 1–9. arXiv : 2004.02069 . дои : 10.1016/j.cbpa.2020.04.018 . ПМЦ   7767890 . ПМИД   32599342 . S2CID   219966629 .
    12. ^ Ода Ю, Хуан К., Кросс ФР, Коуберн Д., Чайт Б.Т. (июнь 1999 г.). «Точная количественная оценка экспрессии белка и сайт-специфического фосфорилирования» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (12): 6591–6. Бибкод : 1999PNAS...96.6591O . дои : 10.1073/pnas.96.12.6591 . ЧВК   21959 . ПМИД   10359756 .
    13. ^ Славов Н. (январь 2020 г.). «Распаковка протеома в одиночных клетках» . Наука . 367 (6477): 512–513. Бибкод : 2020Sci...367..512S . дои : 10.1126/science.aaz6695 . ПМК   7029782 . ПМИД   32001644 .
    14. ^ Пешкин Л., Рязанова Л., Вур М. и др. (2017). «Байесовские доверительные интервалы для мультиплексной протеомики объединяют ионную статистику с согласованием количественного определения пептидов». биоRxiv   10.1101/210476 .
    15. ^ Пракаш А., Пининг Б., Уайтакер Дж., Чжан Х., Шаффер С.А., Мартин Д. и др. (октябрь 2007 г.). «Оценка систематической ошибки при планировании эксперимента для крупномасштабной количественной протеомики на основе масс-спектрометрии» . Молекулярная и клеточная протеомика . 6 (10): 1741–8. дои : 10.1074/mcp.M600470-MCP200 . ПМИД   17617667 .
    16. ^ Меррилл А.Е., Хеберт А.С., МакГилврей М.Э., Роуз К.М., Бэйли Д.Д., Брэдли Дж.К. и др. (сентябрь 2014 г.). «Метки NeuCode для относительного количественного определения белка» . Молекулярная и клеточная протеомика . 13 (9): 2503–12. дои : 10.1074/mcp.M114.040287 . ПМК   4159665 . ПМИД   24938287 .
    17. ^ Jump up to: а б Нилсон К.А., Али Н.А., Муралидхаран С., Мирзаи М., Мариани М., Ассадурян Г. и др. (февраль 2011 г.). «Меньше меток, больше свободы: подходы к количественной масс-спектрометрии без меток» . Протеомика . 11 (4): 535–53. дои : 10.1002/pmic.201000553 . ПМИД   21243637 . S2CID   34809291 .
    18. ^ Америка AH, Кордевенер Дж. Х. (февраль 2008 г.). «Сравнительная ЖХ-МС: ландшафт вершин и долин» . Протеомика . 8 (4): 731–49. дои : 10.1002/pmic.200700694 . ПМИД   18297651 . S2CID   13022870 .
    19. ^ Ван В., Чжоу Х., Лин Х., Рой С., Шалер Т.А., Хилл Л.Р. и др. (сентябрь 2003 г.). «Количественное определение белков и метаболитов методом масс-спектрометрии без изотопной маркировки или стандартов с добавлением». Аналитическая химия . 75 (18): 4818–26. дои : 10.1021/ac026468x . ПМИД   14674459 .
    20. ^ Лундгрен Д.Х., Хван С.И., Ву Л., Хан Д.К. (февраль 2010 г.). «Роль спектрального подсчета в количественной протеомике». Экспертное обозрение по протеомике . 7 (1): 39–53. дои : 10.1586/апр.09.69 . ПМИД   20121475 . S2CID   29355269 .
    21. ^ Чоудхари А., Ху Хе К., Мертинс П., Удеши Н.Д., Данчик В., Фомина-Ядлин Д. и др. (23 апреля 2014 г.). «Количественно-протеомное сравнение альфа- и бета-клеток для выявления новых целей для перепрограммирования клонов» . ПЛОС ОДИН . 9 (4): е95194. Бибкод : 2014PLoSO...995194C . дои : 10.1371/journal.pone.0095194 . ПМЦ   3997365 . ПМИД   24759943 .
    22. ^ Шема-Яакоби, Эфрат; Николов, Мирослав; Хадж-Яхья, Махмуд; Симан, Питер; Аллеманд, Эрик; Ямагучи, Юки; Мухардт, Кристиан; Урлауб, Хеннинг; Брик, Ашраф; Орен, Моше; Фишле, Вольфганг (15 августа 2013 г.). «Систематическая идентификация белков, связывающихся со встроенным в хроматин убиквитилированным H2B, показывает использование SWI/SNF для регулирования транскрипции» . Отчеты по ячейкам . 4 (3): 601–608. дои : 10.1016/j.celrep.2013.07.014 . hdl : 11858/00-001M-0000-0014-4E3E-6 . ПМИД   23933260 .
    23. ^ Банщефф М., Лемер С., Савицкий М.М., Кустер Б. (сентябрь 2012 г.). «Количественная масс-спектрометрия в протеомике: обновление критического обзора с 2007 года по настоящее время». Аналитическая и биоаналитическая химия . 404 (4): 939–965. дои : 10.1007/s00216-012-6203-4 . ПМИД   22772140 . S2CID   21085313 .
    24. ^ Jump up to: а б Оцуки С., Учида Ю., Кубо Ю., Терасаки Т. (сентябрь 2011 г.). «Количественное целевое исследование ADME на основе абсолютной протеомики как новый путь к открытию и разработке лекарств: методология, преимущества, стратегия и перспективы» . Журнал фармацевтических наук . 100 (9): 3547–59. дои : 10.1002/jps.22612 . ПМИД   21560129 .
    25. ^ Рикс Ю, Суперти-Фурга G (сентябрь 2009 г.). «Целевое профилирование малых молекул методом химической протеомики». Химическая биология природы . 5 (9): 616–24. дои : 10.1038/nchembio.216 . ПМИД   19690537 .
    26. ^ Шеноне М., Данчик В., Вагнер Б.К., Клемонс П.А. (апрель 2013 г.). «Идентификация цели и механизм действия в химической биологии и открытии лекарств» . Химическая биология природы . 9 (4): 232–40. дои : 10.1038/nchembio.1199 . ПМЦ   5543995 . ПМИД   23508189 .
    Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Quantitative_proteomics&oldid=1224553451"
    Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
    Arc.Ask3.Ru
    Номер скриншота №: acc7f5dc26504c44825d78b016b3f993__1716071760
    URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/ac/93/acc7f5dc26504c44825d78b016b3f993.html
    Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
    Quantitative proteomics - Wikipedia
    Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)