микроРНК lsy-6
| лсы-6 | |
|---|---|
| Идентификаторы | |
| Символ | лсы-6 |
| Рфам | RF00823 |
| семейство miRBase | МИПФ0000265 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты ; многоклеточные животные ; Нематода ; |
| PDB Структуры | ПДБе |
микроРНК lsy-6 относится к классу микроРНК ; их функция заключается в регулировании уровней экспрессии других генов с помощью нескольких механизмов. lsy-6 представляет собой короткую некодирующую молекулу РНК и первую микроРНК, идентифицированную как играющую роль в развитии нервной системы. Он регулирует лево-правую нейрональную асимметрию у нематод Caenorhabditis elegans .
Лево-правая асимметрия через cog-1 ген
[ редактировать ]ASEL и ASER представляют собой пару двусторонних вкусовых рецепторов, нейронов которые, как полагают, ответственны за асимметричный паттерн экспрессии генов хеморецепторов у C. elegans . Эти два вкусовых нейрона билатерально симметричны морфологически, а также в отношении их связности, положения и характера экспрессии генов. Однако они асимметричны слева и справа в экспрессии специфических сигнальных молекул. [ 1 ] Нейрон ASE чрезвычайно чувствителен к правильной дозировке cog-1 гена типа Nkx , гомеобоксного , и дополнительные копии этого гена легко вызывают дефекты левой/правой асимметрии.
lsy-6 отвечает за контроль экспрессии cog-1 , поскольку одних транскрипционных механизмов недостаточно для этой регуляции. lsy-6 и cog-1 первоначально совместно экспрессируются как ASEL, так и ASER после рождения, но позже их экспрессия ограничивается одним из двух нейронов ASE (ASEL для lsy-6 и ASER для cog-1). lsy-6 кодирует миРНК длиной 21 нуклеотид, которая, в свою очередь, связывается с одним комплементарным сайтом в 3'-UTR гена cog-1 . Это взаимодействие наблюдается только в типе клеток ASEL (не ASER), что приводит к асимметричному распределению cog-1. Было замечено, что удаление lsy-6 приводит к изменению транскрипции cog-1 в ASEL, что указывает на то, что, несмотря на экспрессию lsy-6, нейрон ASEL не транскрибирует cog-1. [ 1 ]
Дальнейшее выражение
[ редактировать ]lsy-6 дополнительно экспрессируется в нескольких других типах нейронов, включая лабиальные сенсорные нейроны вентрального шнура PVQ и интернейроны . [ 1 ]
Петля обратной связи lsy-6/lsy-2
[ редактировать ]Экспрессия lsy-6 сама по себе регулируется lsy-2, фактором транскрипции цинковых пальцев . [ 2 ] Было обнаружено, что взаимодействие lsy-2 с lsy-6 является специфичным для типа клеток, и у мутантных животных lsy-2 наблюдается полная потеря экспрессии lsy-6. Имеется бистабильная петля обратной связи, необходимая для латерализации ASE, состоящая из микроРНК lsy-6, mir-273 и соответствующих им транскрипционных факторов cog-1 и die-1. Хотя lsy-6 экспрессируется в ASEL, но не в ASER, и регулирует экспрессию нижестоящего транскрипционного фактора cog-1, [ 3 ] Экспрессия mir-273 сильно смещена в сторону ASER и демонстрирует комплементарность мРНК транскрипционного фактора die-1. die-1 регулируется на посттранскрипционном уровне и контролирует хемосенсорную латеральность путем активации экспрессии lsy-6 только в ASEL. [ 4 ] Экспрессия die-1 в ASER подавляется через два сайта в его 3'-UTR- области.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с Джонстон Р.Дж., Хоберт О. (декабрь 2003 г.). «МикроРНК, контролирующая асимметрию левых/правых нейронов у Caenorhabditis elegans». Природа . 426 (6968): 845–849. дои : 10.1038/nature02255 . ПМИД 14685240 .
- ^ Джонстон Р.Дж., Хоберт О. (декабрь 2005 г.). «Новый фактор транскрипции цинковых пальцев C. elegans, lsy-2, необходимый для специфичной для типа клеток экспрессии микроРНК lsy-6» . Разработка . 132 (24): 5451–5460. дои : 10.1242/dev.02163 . ПМИД 16291785 .
- ^ Дидиано Д., Хоберт О. (июль 2008 г.). «Молекулярная архитектура 3'-UTR, регулируемой микроРНК» . РНК . 14 (7): 1297–1317. дои : 10.1261/rna.1082708 . ПМК 2441980 . ПМИД 18463285 .
- ^ Чанг С., Джонстон Р.Дж., Фрокьяер-Йенсен С., Локери С., Хоберт О. (август 2004 г.). «МикроРНК действуют последовательно и асимметрично, контролируя хемосенсорную латеральность у нематоды». Природа . 430 (7001): 785–789. дои : 10.1038/nature02752 . ПМИД 15306811 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]