мир-143
| мир-143 | |
|---|---|
 Вторичная структура и сохранение последовательности микроРНК миР-143 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | мир-143 |
| Рфам | RF00683 |
| семейство miRBase | МИПФ0000094 |
| Ген NCBI | 406935 |
| HGNC | 31530 |
| МОЙ БОГ | 612117 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | микроРНК |
| Домен(ы) | Эукариоты ; Позвоночные животные |
| PDB Структуры | ПДБе |
В молекулярной биологии микроРНК mir-143 представляет собой короткую молекулу РНК . МикроРНК регулируют уровни экспрессии других генов с помощью нескольких механизмов. mir-143 высоко консервативен у позвоночных. [ 1 ] Считается, что mir-143 участвует в морфогенезе сердца , но также участвует в развитии рака.
Геномное расположение
[ редактировать ]mir– 143 расположен на 33-й позиции хромосомы 5 генома человека. [ 1 ] mir-143 расположен очень близко к mir-145 в геноме, и предполагается, что они транскрибируются как бицистронная единица. [ 2 ] Их совместная транскрипция означает, что их часто изучают вместе в одних и тех же клеточных путях и заболеваниях.
Выражение
[ редактировать ]mir-143 является прямой мишенью транскрипции сывороточного фактора ответа, миокардина и nkx2-5. [ 2 ] Считается также, что экспрессия mir-143 контролируется эпигенетически посредством сердечного ритма. [ 3 ]
Цели
[ редактировать ]Это известные генетические мишени для mir-143 и его влияние на них:
- Klf4 – способствует транскрипции. [ 2 ]
- ELK1 – способствует транскрипции. [ 2 ]
- ADD3 – подавляет транскрипцию. Белок, кэпирующий F-актин. [ 4 ]
- FNDC38 – подавляет транскрипцию. Метастазирование опухоли. [ 5 ]
- HK2 – подавляет транскрипцию. Фермент, катализирующий глюкозо-6-фосфат. [ 6 ]
- Raldh2/aldh1a2 – подавляет транскрипцию. Участвует в организации сердечной трубки. [ 3 ]
- rxrab – подавляет транскрипцию. Участвует в организации сердечной трубки. [ 3 ]
- KLF5 – Неизвестно, сохранился сайт связывания miR – 143. [ 1 ]
- MAP3K7 - Неизвестно, сохранился сайт связывания miR - 143. [ 1 ]
- TARDBP – Неизвестно, сохранился сайт связывания miR – 143. [ 1 ]
- UBE2E3 – Неизвестно, сохранился сайт связывания миР – 143. [ 1 ]
Кардиогенез
[ редактировать ]Считается, что mir-143 играет важную роль в морфогенезе сердца. Было обнаружено, что mir-143 является наиболее обогащенной миРНК в эмбриональных стволовых клетках мыши, которые дифференцируются в сердечные клетки-предшественники. [ 2 ] Это прямая мишень транскрипции сывороточного фактора ответа, миокардина и nkx2-5. [ 2 ] Исследования показали, что мир-143 играет важную роль в судьбе гладкомышечных клеток. Он транскрибируется совместно с миР-145 в сердечных предшественниках, прежде чем стать гладкомышечными клетками сосудов (VSMC). СГМК необычны тем, что могут переключаться между пролиферативным и более дифференцированным состоянием покоя. Было показано, что наряду с mir-145 mir-143 воздействует на сеть транскрипционных факторов (включая klf4 и elk-1), которые способствуют дифференцировке и подавляют пролиферацию VSMCs. [ 2 ] МиР-143 также участвует в более общем морфогенезе сердца. У рыбок данио было показано, что mir-143 необходим для камерного морфогенеза посредством репрессии add3. Нокаут привел к коллапсу желудочка. [ 4 ] Также было высказано предположение, что экспрессия mir-143 может контролироваться сердцебиением. У рыбок данио экспрессия mir-143 отсутствовала при остановке сердцебиения и восстанавливалась при возобновлении сердцебиения. [ 3 ] Понимание mir-143 может быть важным для понимания сосудистых заболеваний. Считается, что пластичность СГМК лежит в основе многих сосудистых заболеваний человека, таких как атеросклероз. [ 7 ] Также было показано, что при аневризмах аорты человека экспрессия mir-143 и mir-145 значительно снижается по сравнению с контролем. [ 8 ]
Рак
[ редактировать ]Изменения экспрессии mir-143 часто связаны с раком. Однако точная природа этой связи до конца не изучена. Повышающая регуляция mir-143 наблюдалась на модели гепатоцеллюлярной карциномы во время метастазирования опухоли посредством репрессии FNDC38. [ 5 ] Однако в образцах рака наблюдалось снижение экспрессии mir-143 и 145. Было показано, что экспрессия снижается на различных стадиях рака, в том числе в очень ранних образцах. Это позволяет предположить, что они участвуют в онкогенезе. [ 9 ] Было показано, что модифицированная версия мир-143 (мир-143BP) с большей активностью и устойчивостью к нуклеазе оказывает опухолесупрессирующее действие на клетки колоректального рака. Недавние исследования миР-143 в сочетании с миР-506 показали эффективность в блокировании прогрессирования клеточного цикла клеточных линий рака легких. [ 10 ] Более того, такое комбинированное лечение снижает ангиогенез. [ 10 ] Это делает миР-143 кандидатом на использование РНК-препарата для лечения опухолей. [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и ж Тракулюл Н., Хикс Дж.А., Лю ХК (2010). «Идентификация генов-мишеней и путей, связанных с куриной микроРНК миР-143». Аним Жене . 41 (4): 357–64. дои : 10.1111/j.1365-2052.2009.02015.x . ПМИД 20064147 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г Кордес К.Р., Шихи Н.Т., Уайт, член парламента и др. (2009). «МиР-145 и миР-143 регулируют судьбу и пластичность гладкомышечных клеток» . Природа . 460 (7256): 705–10. Бибкод : 2009Natur.460..705C . дои : 10.1038/nature08195 . ПМК 2769203 . ПМИД 19578358 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Миясака К.Ю., Кида Ю.С., Банджо Т. и др. (2010). «Сердцебиение регулирует кардиогенез путем подавления передачи сигналов ретиноевой кислоты посредством экспрессии миР-143». Мех Дев . 128 (1–2): 18–28. дои : 10.1016/j.mod.2010.09.002 . ПМИД 20869435 . S2CID 18488540 .
- ^ Перейти обратно: а б Дикон, округ Колумбия, Невис КР, Кэшман Т.Дж. и др. (2010). «Путь миР-143-аддуцин3 необходим для морфогенеза камер сердца». Разработка . 137 (11): 1887–96. дои : 10.1242/dev.050526 . ПМИД 20460367 . S2CID 25024688 .
- ^ Перейти обратно: а б Чжан Х., Цай Х, Ван Ю и др. (2010). «МикроРНК-143, уровень экспрессии которой снижается при остеосаркоме, способствует апоптозу и подавляет онкогенность, нацеливаясь на Bcl-2» . Представитель Онкола . 24 (5): 1363–9. дои : 10.3892/or_00000994 . ПМИД 20878132 .
- ^ Лю П., Чжу Л., Чжан Ф. и др. (март 2019 г.). «Сигнальный путь LncRNA UCA1/miR-143 miR-216b/HK2/MAPK участвует в регуляции пролиферации эндотелиальных клеток посредством модуляции гликолиза при меланоме» . Европейский журнал воспаления . 17 : 1–13. дои : 10.1177/2058739219837050 . ISSN 2058-7392 .
- ^ Ваканте Ф., Денби Л., Слуимер Дж.К. и др. (январь 2019 г.). «Функция миР-143, миР-145 и гена-хозяина МиР-143 в сердечно-сосудистом развитии и заболеваниях» . Васк Фармакол . 112 : 24–30. дои : 10.1016/j.vph.2018.11.006 . ПМК 6395947 . ПМИД 30502421 .
- ^ Элия Л., Кинтавалле М., Чжан Дж. и др. (2009). «Нокаут миР-143 и -145 изменяет поддержание гладкомышечных клеток и сосудистый гомеостаз у мышей: коррелирует с заболеваниями человека» . Гибель клеток отличается . 16 (12): 1590–8. дои : 10.1038/cdd.2009.153 . ПМК 3014107 . ПМИД 19816508 .
- ^ Перейти обратно: а б Китаде Ю, Акао Ю (2010). «МикроРНК и их терапевтический потенциал при заболеваниях человека: микроРНК, миР-143 и -145, действуют как противоонкомиры и применение химически модифицированной миР-143 в качестве противоракового препарата» . J Pharmacol Sci . 114 (3): 276–80. дои : 10.1254/jphs.10R12FM . ПМИД 20953119 .
- ^ Перейти обратно: а б Хоссиан А.К., Саджиб М.С., Туллар П.Е. и др. (12 июля 2018 г.). «Множественная активность комбинаторных миР-143 и миР-506 ингибирует прогрессирование клеточного цикла рака легких и ангиогенез in vitro» . Научные отчеты . 8 (1): 10495. Бибкод : 2018NatSR...810495H . дои : 10.1038/s41598-018-28872-2 . ПМК 6043488 . ПМИД 30002440 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Кулда В., Песта М., Тополькан О. и др. (2010). «Значение экспрессии миР-21 и миР-143 в образцах тканей колоректальной карциномы и ее метастазов в печень». Рак Генета Цитогенет . 200 (2): 154–60. doi : 10.1016/j.cancergencyto.2010.04.015 . ПМИД 20620599 .
- Ян Ю, Чаеркади Р., Кандасами К. и др. (2010). «Идентификация мишеней миР-143 с использованием протеомного подхода на основе SILAC» . Мол Биосист . 6 (10): 1873–82. дои : 10.1039/c004401f . ПМЦ 3812686 . ПМИД 20544124 .
- Иио А., Накагава Ю., Хирата И. и др. (2010). «Идентификация некодирующих РНК, охватывающих кластер микроРНК-143/145» . Мол Рак . 9 :136. дои : 10.1186/1476-4598-9-136 . ПМК 2903500 . ПМИД 20525177 .
- Ван X, Ху Г, Чжоу Дж (2010). «Репрессия экспрессии версикана микроРНК-143» . J Биол Хим . 285 (30): 23241–50. дои : 10.1074/jbc.M109.084673 . ПМК 2906317 . ПМИД 20489207 .
- Гао В., Ю Ю, Цао Х и др. (2010). «Дерегулированная экспрессия миР-21, миР-143 и миР-181a при немелкоклеточном раке легкого связана с клинико-патологическими характеристиками или прогнозом пациента». Биомед Фармакотер . 64 (6): 399–408. doi : 10.1016/j.biopha.2010.01.018 . ПМИД 20363096 .
- Акао Ю., Накагава Ю., Хирата И. и др. (2010). «Роль антионкомиров миР-143 и -145 в колоректальных опухолях человека». Рак Джин Тер . 17 (6): 398–408. дои : 10.1038/cgt.2009.88 . ПМИД 20094072 . S2CID 27389187 .
- Клапе С., Фриц В., Энрике С. и др. (2009). Крейтон С. (ред.). «МиР-143 препятствует передаче сигналов ERK5 и останавливает прогрессирование рака простаты у мышей» . ПЛОС ОДИН . 4 (10): е7542. Бибкод : 2009PLoSO...4.7542C . дои : 10.1371/journal.pone.0007542 . ПМЦ 2763222 . ПМИД 19855844 .
- Борральо П.М., Крен Б.Т., Кастро Р.Э. и др. (2009). «МикроРНК-143 снижает жизнеспособность и повышает чувствительность к 5-фторурацилу в клетках колоректального рака человека HCT116» . ФЕБС Дж . 276 (22): 6689–700. дои : 10.1111/j.1742-4658.2009.07383.x . ПМИД 19843160 . S2CID 205881537 .
- Синь М., Смолл Э.М., Сазерленд Л.Б. и др. (2009). «МикроРНК миР-143 и миР-145 модулируют динамику цитоскелета и реакцию гладкомышечных клеток на повреждение» . Генс Дев . 23 (18): 2166–78. дои : 10.1101/gad.1842409 . ПМК 2751981 . ПМИД 19720868 .
- Чжан Р., Ван Л., Ян А.Г. (2009). «Действительно ли микроРНК-143 является предателем микроРНК-супрессора опухоли при гепатоцеллюлярной карциноме, связанной с вирусом гепатита В?» . Гепатология . 50 (3): 987, ответ автора 987–8. дои : 10.1002/hep.23124 . ПМИД 19670426 . S2CID 2177122 .
- Нг ЭК, Цанг В.П., Нг СС и др. (2009). «МикроРНК-143 нацелена на ДНК-метилтрансферазы 3А при колоректальном раке» . Бр Джей Рак . 101 (4): 699–706. дои : 10.1038/sj.bjc.6605195 . ПМК 2736825 . ПМИД 19638978 .
- Чжан X, Лю С, Ху Т и др. (2009). «Повышающая регуляция микроРНК-143, транскрибируемая ядерным фактором каппа B, усиливает метастазирование гепатокарциномы путем подавления экспрессии фибронектина» . Гепатология . 50 (2): 490–9. дои : 10.1002/hep.23008 . ПМИД 19472311 . S2CID 32196346 .
- Акао Ю., Накагава Ю., Иио А. и др. (2009). «Роль микроРНК-143 в Fas-опосредованном апоптозе в клетках Jurkat Т-клеточного лейкоза человека». Леук Рес . 33 (11): 1530–8. doi : 10.1016/j.leukres.2009.04.019 . ПМИД 19464056 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]