миР-338
| миР-338 | |
|---|---|
 Консервативная вторичная структура предшественника микроРНК миР-338 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | миР-338 |
| Альт. Символы | МИР338 |
| Рфам | RF00686 |
| miRBase | МИ0000814 |
| семейство miRBase | МИПФ0000097 |
| Ген NCBI | 442906 |
| HGNC | 31775 |
| МОЙ БОГ | 614059 |
| RefSeq | NR_029897 |
| Другие данные | |
| РНК Тип | микроРНК |
| Домен(ы) | Млекопитающие |
| ИДТИ | 0035195 |
| ТАК | 0001244 |
| Локус | Хр. 17 q25.3 |
| PDB Структуры | ПДБе |
миР-338 представляет собой семейство специфичных для мозга предшественников микроРНК, обнаруженных у млекопитающих , включая человека . [ 1 ] Последовательность зрелой микроРНК из ~22 нуклеотидов вырезается из шпильки-предшественника с помощью фермента Dicer . [ 2 ] Затем эта последовательность связывается с RISC, который оказывает влияние на РНК-интерференцию . [ 3 ]
миР-338 расположена в интронной области гена тирозинкиназы , ассоциированной с апоптозом ( AATK ). Было предсказано, что он может подавлять гены, которые оказывают негативное влияние на экспрессию AATK. [ 4 ]
Функция
[ редактировать ]миР-338 представляет собой специфичную для мозга миРНК, которая регулирует экспрессию цитохром-с-оксидазы IV (ЦОГ4). [ 1 ] [ 5 ] Последовательность зрелой миРНК miR-338 комплементарна короткому участку 3'-нетранслируемой области COX4 мРНК . Эта последовательность мРНК представлена поверх структуры «стебель-петля» , что указывает на то, что она доступна для процессинга микроРНК. [ 5 ]
Приложения
[ редактировать ]МиР-338 не регулируется при нейробластоме и потенциально может быть использована в качестве биомаркера или будущего терапевтического агента. [ 6 ] миР-338 также связана с гепатоцеллюлярной карциномой , и был предложен крупномасштабный диагностический тест, включающий измерение экспрессии миР-338 в образцах тканей. [ 7 ] Кроме того, миР-338 является одной из семи микроРНК, профили экспрессии которых можно комбинировать, чтобы дать прогноз вероятности выживания пациента с раком желудка . [ 8 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Ашрафи А., Швехтер А.Д., Мамеза М.Г., Натера-Наранхо О., Джоио А.Е., Каплан Б.Б. (ноябрь 2008 г.). «МикроРНК-338 регулирует локальные уровни мРНК цитохром-с-оксидазы IV и окислительное фосфорилирование в аксонах симпатических нейронов» . Журнал неврологии . 28 (47): 12581–90. doi : 10.1523/JNEUROSCI.3338-08.2008 . ПМЦ 3496265 . ПМИД 19020050 .
- ^ Амброс V (декабрь 2001 г.). «микроРНК: крошечные регуляторы с огромным потенциалом» . Клетка . 107 (7): 823–6. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00616-X . ПМИД 11779458 . S2CID 14574186 .
- ^ Грегори Р.И., Чендримада Т.П., Куч Н., Шихаттар Р. (ноябрь 2005 г.). «Человеческий RISC сочетает биогенез микроРНК и посттранскрипционное молчание генов» . Клетка . 123 (4): 631–40. дои : 10.1016/j.cell.2005.10.022 . ПМИД 16271387 . S2CID 16973870 .
- ^ Барик С. (сентябрь 2008 г.). «Интронная микроРНК заставляет замолчать гены, которые функционально антагонистичны гену-хозяину» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (16): 5232–41. дои : 10.1093/нар/gkn513 . ПМЦ 2532712 . ПМИД 18684991 .
- ^ Jump up to: а б Каплан Б.Б., Джойо А.Е., Хиллефорс М., Ашрафи А. (2009). «Синтез аксонального белка и регуляция локальной функции митохондрий». Клеточная биология аксона . Результаты и проблемы дифференцировки клеток. Том. 48. стр. 225–42. дои : 10.1007/400_2009_1 . ISBN 978-3-642-03018-5 . ПМК 2786086 . ПМИД 19343315 .
- ^ Рагуза М., Майорана А., Банелли Б., Барбагалло Д., Стателло Л., Кашано И., Гульельмино М.Р., Дуро Л.Р., Скалиа М., Магро Дж., Ди Пьетро С., Романи М., Пуррелло М. (октябрь 2010 г.). «MIR152, MIR200B и MIR338, кандидаты в позиционную и функциональную нейробластому человека, участвуют в дифференцировке нейробластов и апоптозе». Журнал молекулярной медицины . 88 (10): 1041–53. дои : 10.1007/s00109-010-0643-0 . ПМИД 20574809 . S2CID 22215883 .
- ^ Хуан XH, Ван Q, Чен JS, Фу XH, Чен XL, Чен LZ, Ли W, Би J, Чжан LJ, Фу Q, Цзэн WT, Цао LQ, Тан HX, Су Q (август 2009 г.). «Анализ экспрессии микроРНК при гепатоцеллюлярной карциноме на основе микрочипов: уровень экспрессии миР-338 снижен» . Гепатологические исследования . 39 (8): 786–94. дои : 10.1111/j.1872-034X.2009.00502.x . ПМИД 19473441 . S2CID 11863697 .
- ^ Ли X, Чжан Ю, Чжан Ю, Дин Дж, Ву К, Фань Д (май 2010 г.). «Прогнозирование выживаемости при раке желудка по сигнатуре из семи микроРНК». Гут . 59 (5): 579–85. дои : 10.1136/gut.2008.175497 . ПМИД 19951901 . S2CID 25196666 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Хэ QY, Пэн ГП, Лю WX, Луо BY (ноябрь 2010 г.). «[Взаимодействие микроРНК-338 и ее потенциального нацеливающего белка eiF4E3]». Чжэцзян да Сюэ Сюэ Бао. И Сюэ Бан = Журнал Чжэцзянского университета. Медицинские науки . 39 (6): 583–8. doi : 10.3785/j.issn.1008-9292.2010.06.006 (неактивен 26 апреля 2024 г.). ПМИД 21166051 .
{{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на апрель 2024 г. ( ссылка ) (китайский) - Саба Р., Гудман С.Д., Хузаревич Р.Л., Робертсон С., Бут С.А. (2008). Акбарян С. (ред.). «Признак микроРНК нейродегенерации, вызванной прионом» . ПЛОС ОДИН . 3 (11): е3652. Бибкод : 2008PLoSO...3.3652S . дои : 10.1371/journal.pone.0003652 . ПМК 2575400 . ПМИД 18987751 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]