PCGF2

PCGF2
Идентификаторы
Псевдонимы	PCGF2 , MEL-18, RNF110, ZNF144, безымянный палец 2 группы полисот, TPFS
Внешние идентификаторы	ПРОПУСКАТЬ : 600346 ; МГИ : 99161 ; Гомологен : 5174 ; Генные карты : ПКГФ2 ; ОМА : PCGF2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	38,749,817 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	97,591,323 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ganglionic eminence; ; stromal cell of endometrium; ; ventricular zone; ; pituitary gland; ; anterior pituitary; ; canal of the cervix; ; human kidney; ; body of uterus; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland;
	Top expressed in
	genital tubercle; ; tail of embryo; ; ventricular zone; ; gallbladder; ; superior surface of tongue; ; epiblast; ; neural layer of retina; ; yolk sac; ; plantaris muscle; ; superior frontal gyrus;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	metal ion binding; chromatin binding; DNA-binding transcription factor activity; DNA binding; protein binding; promoter-specific chromatin binding;
Cellular component	nucleoplasm; nucleus; sex chromatin; nuclear body; PcG protein complex; PRC1 complex;
Biological process	anterior/posterior pattern specification; transcription, DNA-templated; negative regulation of apoptotic signaling pathway; embryonic skeletal system morphogenesis; cellular response to hydrogen peroxide; histone acetylation; in utero embryonic development; regulation of transcription, DNA-templated; embryonic skeletal system development; negative regulation of transcription by RNA polymerase II; histone H2A-K119 monoubiquitination; negative regulation of G0 to G1 transition;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	7703
	22658
	ENSG00000277258 ; ENSG00000278644
	ENSMUSG00000018537
	P35227
	P23798
	НМ_007144 ; НМ_001369614 ; НМ_001369615
	НМ_001163307 ; НМ_001163308 ; НМ_009545
	НП_009075 ; НП_001356543 ; НП_001356544
	НП_001156779 ; НП_001156780 ; НП_033571
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 2 RING-пальца группы Polycomb , PCGF2, также известный как MEL18 или RNF110, представляет собой белок , который у людей кодируется PCGF2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Белок, кодируемый этим геном, содержит мотив RING-пальца . PCGF2 является компонентом канонического комплекса PRC1, состоящего из RING1A/B , CBX2 /CBX4, полигомеотических ( PHC ) белков, и очень похож на PCGF4/ BMI1 , содержащий PRC1. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Канонический PRC1 связывается с хроматином через хромодомен субъединицы CBX, который распознает метку H3K27me3 , депонированную PRC2 . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} Было показано, что канонические комплексы PRC1 компактируют хроматин и опосредуют структуры хроматина более высокого порядка. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}

Комплексы Polycomb поддерживают репрессию транскрипции генов, участвующих в эмбриогенезе , клеточных циклах и онкогенезе . Было показано, что PCGF2 действует как негативный регулятор транскрипции и обладает опухолевой супрессорной активностью. Экспрессия этого гена обнаружена в различных опухолевых клетках, но ограничена в нервных органах нормальных тканей. Исследования нокаута на мышах показали, что этот белок может отрицательно регулировать экспрессию различных цитокинов , хемокинов и хемокиновых рецепторов и, таким образом, играет важную роль в дифференцировке и миграции лимфоцитов , а также в иммунных реакциях. ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000278644 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000277258, ENSG00000278644 — Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018537 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Исида А., Асано Х., Хасегава М., Косеки Х., Оно Т., Ёсида М.К., Танигучи М., Канно М. (июль 1993 г.). «Клонирование и картирование хромосом человеческого гена Mel-18, который кодирует ДНК-связывающий белок с новым мотивом «КОЛЬЦЕВОГО пальца». Джин . 129 (2): 249–55. дои : 10.1016/0378-1119(93)90275-8 . ПМИД 8325509 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: безымянный палец 2 полисотовой группы PCGF2» .
^ Гао З., Чжан Дж., Бонасио Р., Стрино Ф., Савай А., Паризи Ф. и др. (февраль 2012 г.). «Гомологи PCGF, белки CBX и RYBP определяют функционально различные комплексы семейства PRC1» . Молекулярная клетка . 45 (3): 344–56. doi : 10.1016/j.molcel.2012.01.002 . ПМК 3293217 . ПМИД 22325352 .
^ Хаури С., Комольо Ф., Сеймия М., Герстунг М., Глаттер Т., Хансен К. и др. (октябрь 2016 г.). «Карта высокой плотности для навигации по поликомбному комплексому человека» . Отчеты по ячейкам . 17 (2): 583–595. дои : 10.1016/j.celrep.2016.08.096 . hdl : 20.500.11850/122094 . ПМИД 27705803 .
^ Бернштейн Э., Дункан Э.М., Масуи О., Гил Дж., Херд Э., Эллис CD (апрель 2006 г.). «Мышиные полисотовые белки дифференциально связываются с метилированным гистоном H3 и РНК и обогащены факультативным гетерохроматином» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (7): 2560–9. дои : 10.1128/MCB.26.7.2560-2569.2006 . ПМЦ 1430336 . ПМИД 16537902 .
^ Цао Р., Ван Л., Ван Х., Ся Л., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П. и др. (ноябрь 2002 г.). «Роль метилирования лизина 27 гистона H3 в молчании группы Polycomb». Наука . 298 (5595): 1039–43. Бибкод : 2002Sci...298.1039C . дои : 10.1126/science.1076997 . ПМИД 12351676 . S2CID 6265267 .
^ Фурсова Н.А., Блэкледж Н.П., Накаяма М., Ито С., Косеки Ю., Фаркас А.М. и др. (июнь 2019 г.). «Синергия между вариантными комплексами PRC1 определяет репрессию генов, опосредованную Polycomb» . Молекулярная клетка . 74 (5): 1020–1036.e8. doi : 10.1016/j.molcel.2019.03.024 . ПМК 6561741 . ПМИД 31029541 .
^ Блэкледж Н.П., Фурсова Н.А., Келли Дж.Р., Хусейн М.К., Фельдманн А., Клозе Р.Дж. (февраль 2020 г.). «Каталитическая активность PRC1 играет центральную роль в функционировании системы Polycomb» . Молекулярная клетка . 77 (4): 857–874.е9. doi : 10.1016/j.molcel.2019.12.001 . ПМК 7033600 . ПМИД 31883950 .
^ Бойл С., Флямер И.М., Уильямсон И., Сенгупта Д., Бикмор В.А., Иллингворт Р.С. (июль 2020 г.). «Центральная роль канонического PRC1 в формировании трехмерного ядерного ландшафта» . Гены и развитие . 34 (13–14): 931–949. дои : 10.1101/gad.336487.120 . ПМЦ 7328521 . ПМИД 32439634 .

Дальнейшее чтение

Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Й, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Й, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б, Тампе Дж, Хойбнер Д, Вамбутт Р, Корн Б, Кляйн М, Пустка А (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Кимура М, Косеки Ю, Ямасита М, Ватанабэ Н, Симидзу С, Кацумото Т, Китамура Т, Танигучи М, Косеки Х, Накаяма Т (август 2001 г.). «Регуляция дифференцировки клеток Th2 с помощью mel-18, гена группы полисот млекопитающих» . Иммунитет . 15 (2): 275–87. дои : 10.1016/S1074-7613(01) 00182-0 ПМИД 11520462 .
Миядзаки К., Иноуэ Х., Онаи Н., Исихара Х., Канно М. (февраль 2002 г.). «Хемокин-опосредованный тимопоэз регулируется геном группы Polycomb млекопитающих, mel-18». Письма по иммунологии . 80 (2): 139–43. дои : 10.1016/S0165-2478(01)00315-7 . ПМИД 11750047 .
Левин С.С., Вайс А., Эрджумент-Бромаж Х., Шао З., Темпст П., Кингстон Р.Э. (сентябрь 2002 г.). «Ядро полисотового репрессивного комплекса композиционно и функционально консервативно у мух и людей» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (17): 6070–8. дои : 10.1128/MCB.22.17.6070-6078.2002 . ПМК 134016 . ПМИД 12167701 .
Сузуки М, Мизутани-Косеки Ю, Фудзимура Ю, Миягишима Х, Канеко Т, Такада Ю, Акасака Т, Танзава Х, Такихара Ю, Накано М, Масумото Х, Видал М, Исоно К, Косеки Х (сентябрь 2002 г.). «Участие гена Ring1B группы Polycomb в спецификации передне-задней оси у мышей». Развитие 129 (18): 4171–83. дои : 10.1242/dev.129.18.4171 . ПМИД 12183370 .
Мацуо Ф, Яно К, Сайто Х, Моротоми К, Като М, Ёсимото М, Касуми Ф, Акияма Ф, Сакамото Г, Мики Ю (2002). «Мутационный анализ гена mel-18, который показывает снижение экспрессии в клеточных линиях рака молочной железы человека». Рак молочной железы . 9 (1): 33–8. дои : 10.1007/BF02967544 . ПМИД 12196719 . S2CID 26605827 .
Виманн С., Арльт Д., Хубер В., Велленройтер Р., Шлегер С., Мерле А., Бектель С., Зауэрманн М., Корф У., Пепперкок Р., Зюльтманн Х., Пустка А. (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геномные исследования . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Кимура К, Вакамацу А, Судзуки Ю, Ота Т, Нисикава Т, Ямашита Р, Ямамото Дж, Секине М, Цуритани К, Вакагури Х, Исии С, Сугияма Т, Сайто К, Исоно Ю, Ириэ Р, Кушида Н, Ёнеяма Т , Оцука Р., Канда К., Ёкой Т., Кондо Х., Вагацума М., Муракава К., Исида С., Исибаши Т., Такахаши-Фуджи А., Танасе Т., Нагай К., Кикучи Х., Накаи К., Исогай Т., Сугано С. (январь 2006 г.) «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов человеческих генов» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65 . 10.1101 . ПМЦ 1356129 . гр.4039406 /
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бехтель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К.Х., Хубер В., Пепперкок Р., Пустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .
Сильва Х., Гарсия Х.М., Рок С., Гарсия В., Домингес Г., Суарес Д., Камачо Ф.И., Эспиноза Р., Провенсио М., Испания П., Бонилья Ф (декабрь 2006 г.). «Роль членов поликомба Bmi-1, Mel-18 и Hpc-2 в регуляции экспрессии p16INK4a, p14ARF, h-TERT и c-Myc при первичном раке молочной железы» . Клинические исследования рака . 12 (23): 6929–36. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-06-0788 . ПМИД 17145810 .
Го В.Дж., Датта С., Группа V, Димри Г.П. (февраль 2007 г.). «Mel-18, белок группы полисот, регулирует пролиферацию и старение клеток посредством репрессии транскрипции онкопротеинов Bmi-1 и c-Myc» . Молекулярная биология клетки . 18 (2): 536–46. doi : 10.1091/mbc.E06-05-0447 . ПМЦ 1783768 . ПМИД 17151361 .
Видерсшейн Д., Чен Л., Джонсон Б., Беттано К., Джексон Д., Тарашка Дж., Ван Ю.К., Джонс М.Д., Моррисси М., Дидс Дж., Мошер Р., Форджур П., Ленгауэр С., Бенсон Дж.Д. (июль 2007 г.). «Вклад полисотовых гомологов Bmi-1 и Mel-18 в патогенез медуллобластомы» . Молекулярная и клеточная биология . 27 (13): 4968–79. дои : 10.1128/MCB.02244-06 . ЧВК 1951487 . ПМИД 17452456 .
Го В.Дж., Цзэн М.С., Ядав А., Сонг Л.Б., Го Б.Х., Группа V, Димри Г.П. (июнь 2007 г.). «Mel-18 действует как супрессор опухоли, подавляя экспрессию Bmi-1 и подавляя активность Akt в клетках рака молочной железы» . Исследования рака . 67 (11): 5083–9. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-06-4368 . ПМК 2386662 . ПМИД 17545584 .
Шафрански К., Шиндлер С., Тауден С., Хиллер М., Хус К., Ян Н., Шрайбер С., Бакофен Р., Платцер М. (2007). «Нарушение правил сплайсинга: динуклеотиды TG функционируют как альтернативные 3'-сайты сплайсинга в U2-зависимых интронах» . Геномная биология . 8 (8): 154 р. дои : 10.1186/gb-2007-8-8-r154 . ПМК 2374985 . ПМИД 17672918 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 17 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с ENSG00000278644 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000277258, ENSG00000278644 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018537 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8325509-5] Исида А., Асано Х., Хасегава М., Косеки Х., Оно Т., Ёсида М.К., Танигучи М., Канно М. (июль 1993 г.). «Клонирование и картирование хромосом человеческого гена Mel-18, который кодирует ДНК-связывающий белок с новым мотивом «КОЛЬЦЕВОГО пальца». Джин . 129 (2): 249–55. дои : 10.1016/0378-1119(93)90275-8 . ПМИД 8325509 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: безымянный палец 2 полисотовой группы PCGF2» .

[7] Гао З., Чжан Дж., Бонасио Р., Стрино Ф., Савай А., Паризи Ф. и др. (февраль 2012 г.). «Гомологи PCGF, белки CBX и RYBP определяют функционально различные комплексы семейства PRC1» . Молекулярная клетка . 45 (3): 344–56. doi : 10.1016/j.molcel.2012.01.002 . ПМК 3293217 . ПМИД 22325352 .

[8] Хаури С., Комольо Ф., Сеймия М., Герстунг М., Глаттер Т., Хансен К. и др. (октябрь 2016 г.). «Карта высокой плотности для навигации по поликомбному комплексому человека» . Отчеты по ячейкам . 17 (2): 583–595. дои : 10.1016/j.celrep.2016.08.096 . hdl : 20.500.11850/122094 . ПМИД 27705803 .

[9] Бернштейн Э., Дункан Э.М., Масуи О., Гил Дж., Херд Э., Эллис CD (апрель 2006 г.). «Мышиные полисотовые белки дифференциально связываются с метилированным гистоном H3 и РНК и обогащены факультативным гетерохроматином» . Молекулярная и клеточная биология . 26 (7): 2560–9. дои : 10.1128/MCB.26.7.2560-2569.2006 . ПМЦ 1430336 . ПМИД 16537902 .

[10] Цао Р., Ван Л., Ван Х., Ся Л., Эрджюмент-Бромаж Х., Темпст П. и др. (ноябрь 2002 г.). «Роль метилирования лизина 27 гистона H3 в молчании группы Polycomb». Наука . 298 (5595): 1039–43. Бибкод : 2002Sci...298.1039C . дои : 10.1126/science.1076997 . ПМИД 12351676 . S2CID 6265267 .

[11] Фурсова Н.А., Блэкледж Н.П., Накаяма М., Ито С., Косеки Ю., Фаркас А.М. и др. (июнь 2019 г.). «Синергия между вариантными комплексами PRC1 определяет репрессию генов, опосредованную Polycomb» . Молекулярная клетка . 74 (5): 1020–1036.e8. doi : 10.1016/j.molcel.2019.03.024 . ПМК 6561741 . ПМИД 31029541 .

[12] Блэкледж Н.П., Фурсова Н.А., Келли Дж.Р., Хусейн М.К., Фельдманн А., Клозе Р.Дж. (февраль 2020 г.). «Каталитическая активность PRC1 играет центральную роль в функционировании системы Polycomb» . Молекулярная клетка . 77 (4): 857–874.е9. doi : 10.1016/j.molcel.2019.12.001 . ПМК 7033600 . ПМИД 31883950 .

[13] Бойл С., Флямер И.М., Уильямсон И., Сенгупта Д., Бикмор В.А., Иллингворт Р.С. (июль 2020 г.). «Центральная роль канонического PRC1 в формировании трехмерного ядерного ландшафта» . Гены и развитие . 34 (13–14): 931–949. дои : 10.1101/gad.336487.120 . ПМЦ 7328521 . ПМИД 32439634 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]