ADH1B

ADH1B
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1DEH, 1HDX, 1HDY, 1HDZ, 1HSZ, 1HTB, 1U3U, 1U3V, 3HUD
Идентификаторы
Псевдонимы	ADH1B , ADH2, HEL-S-117, алкогольдегидрогеназа 1B (класс I), бета-полипептид
Внешние идентификаторы	Опустить : 103720 ; МГИ : 87921 ; Гомологен : 133563 ; GeneCards : ADH1B ; OMA : ADH1B — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	99,352,760 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 3 (mouse)
End	137,996,459 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lobe of liver; ; right coronary artery; ; lower lobe of lung; ; abdominal fat; ; gastric mucosa; ; Descending thoracic aorta; ; left coronary artery; ; right lung; ; superficial temporal artery; ; left uterine tube;
	Top expressed in
	conjunctival fornix; ; left lung lobe; ; transitional epithelium of urinary bladder; ; left colon; ; adrenal gland; ; left lobe of liver; ; gallbladder; ; seminal vesicula; ; efferent ductule; ; right kidney;
	More reference expression data
	n/a
показывать Генная онтология
Molecular function	oxidoreductase activity; zinc ion binding; alcohol dehydrogenase (NAD+) activity; metal ion binding; alcohol dehydrogenase activity, zinc-dependent; NAD-retinol dehydrogenase activity;
Cellular component	cytoplasm; nucleoplasm; cytosol; plasma membrane;
Biological process	ethanol oxidation; retinol metabolic process; retinoic acid metabolic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	125
	11522
	ENSG00000196616
	ENSMUSG00000074207
	P00325
	P00329
	НМ_001286650 ; НМ_000668
	НМ_007409
	НП_000659 ; НП_001273579
	НП_031435
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Алкогольдегидрогеназа 1B — это фермент , который у человека кодируется ADH1B геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства алкогольдегидрогеназ . Члены этого семейства ферментов метаболизируют широкий спектр субстратов, включая этанол (пищевой спирт), ретинол , другие алифатические спирты, гидроксистероиды и продукты перекисного окисления липидов . Кодируемый белок, известный как ADH1B или бета-ADH, может образовывать гомодимеры и гетеродимеры с субъединицами ADH1A и ADH1C, проявляет высокую активность в отношении этанола . окисления ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} и играет важную роль в катаболизме этанола (окислении этанола в ацетальдегид). Ацетальдегид далее метаболизируется до ацетата генами альдегиддегидрогеназы . Три гена, кодирующие близкородственные альфа-, бета- и гамма-субъединицы, тандемно организованы в сегменте генома в виде кластера генов . ^{[ 9 ]}

Ген человека расположен на хромосоме 4 в 4q22.

Раньше ADH1B назывался ADH2 . В семействе алкогольдегидрогеназы больше генов. Эти гены теперь называются ADH1A , ADH1C и ADH4 , ADH5 , ADH6 и ADH7 . ^{[ 10 ]}

Варианты

Однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в ADH1B представляет собой rs1229984 , который заменяет аргинин на гистидин в остатке 47 зрелого белка; ^{[ 11 ]} Стандартная номенклатура теперь включает инициирующий метионин, поэтому официально позиция равна 48. «Типичный» вариант этого варианта называется ADH2(1) или ADH2*1, тогда как «атипичный» обозначается, например, ADH2( 2), ADH2*2, ADH1B*48His. Этот SNP связан с риском развития алкогольной зависимости, расстройств, связанных с употреблением алкоголя, и употребления алкоголя, при этом атипичный генотип снижает риск алкоголизма . ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]} Атипичный генотип вырабатывает более активный фермент и связан с одомашниванием риса . ^{[ 15 ]}

Другой SNP — rs2066702 [Arg370Cys]. ^{[ 16 ]} первоначально назывался позицией 369. Этот SNP часто встречается у населения Африки, а также снижает риск алкогольной зависимости. ^{[ 17 ]}

Роль в патологии

Заметное снижение мРНК ADH1B было обнаружено в фибробластах роговицы , взятых у лиц, страдающих кератоконусом . ^{[ 18 ]}

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196616 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074207 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Смит М. (март 1986 г.). «Генетика алкогольных и альдегиддегидрогеназ человека». Достижения в области генетики человека 15 . Том. 15. С. 249–90. дои : 10.1007/978-1-4615-8356-1_5 . ISBN 978-1-4615-8358-5 . ПМИД 3006456 .
^ Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж. (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. ПМЦ 3756590 . ПМИД 23134050 .
^ Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж., Босрон В.Ф. (1990). «Экспрессия и кинетическая характеристика вариантов бета-1-бета-1-алкогольдегидрогеназы человека, содержащих замены в аминокислоте 47» . Ж. Биол. Хим . 265 (27): 16366–72. дои : 10.1016/S0021-9258(17)46232-6 . ПМИД 2398055 .
^ Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж. (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. ПМЦ 3756590 . ПМИД 23134050 .
^ «Ген Энтреза: алкогольдегидрогеназа ADH1B IB (класс I), бета-полипептид» . Проверено 19 декабря 2019 г.
^ Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж. (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. ПМЦ 3756590 . ПМИД 23134050 .
^ Мацуо Ю, Ёкояма Р, Ёкояма С (август 1989 г.). «Гены алкогольдегидрогеназ человека бета-1 и бета-2 различаются всего одним нуклеотидом» . Европейский журнал биохимии . 183 (2): 317–20. дои : 10.1111/j.1432-1033.1989.tb14931.x . ПМИД 2547609 .
^ Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж. (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. ПМЦ 3756590 . ПМИД 23134050 .
^ Томассон Х.Р., Эденберг Х.Дж., Крабб Д.В., Май XL, Джером Р.Э., Ли Т.К., Ван С.П., Лин Ю.Т., Лу Р.Б., Инь С.Дж. (апрель 1991 г.). «Генотипы алкогольной и альдегиддегидрогеназы и алкоголизм у китайских мужчин» . Американский журнал генетики человека . 48 (4): 677–81. ПМК 1682953 . ПМИД 2014795 .
^ Берут Л.Дж., Гоут А.М., Бреслау Н., Джонсон Э.О., Бертельсен С., Фокс Л., Агравал А., Бухольц К.К., Груча Р. , Хессельброк В., Крамер Дж., Куперман С., Нюрнбергер Дж., Порьеш Б., Сакконе Н.Л., Шукит М., Тишфилд Дж. , Ван Дж.С., Форуд Т., Райс Дж.П., Эденберг Х.Дж. (апрель 2012). «ADH1B связан с алкогольной зависимостью и употреблением алкоголя среди населения европейского и африканского происхождения» . Молекулярная психиатрия . 17 (4): 445–50. дои : 10.1038/mp.2011.124 . ПМЦ 3252425 . ПМИД 21968928 .
^ Пэн Ю и др. (2010). «Полиморфизм ADH1B Arg47His в популяциях Восточной Азии и расширение одомашнивания риса в истории» . Эволюционная биология BMC . 10 (1): 15. Бибкод : 2010BMCEE..10...15P . дои : 10.1186/1471-2148-10-15 . ПМЦ 2823730 . ПМИД 20089146 .
^ Бернелл Дж.К., Карр Л.Г., Дулет Ф.Е., Эденберг Х.Дж., Ли Т.К., Босрон В.Ф. (август 1987 г.). «Субъединица бета-3-алкогольдегидрогеназы человека отличается от бета-1 заменой Cys на Arg-369, которая уменьшает связывание НАД(Н)». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 146 (3): 1227–33. дои : 10.1016/0006-291x(87)90779-0 . ПМИД 3619918 .
^ Уолтерс Р.К., Адамс М.Дж., Адкинс А.Е., Алиев Ф., Бакану С.А., Батцлер А. и др. (10 марта 2018 г.). «Транс-наследственный GWAS алкогольной зависимости обнаруживает общие генетические основы с психическими расстройствами» . bioRxiv : 257311. doi : 10.1101/257311 . hdl : 1871.1/c28775f1-af5b-4205-93cc-8fc89d2429b3 .
^ Моота В.В., Канофф Дж.М., Шанкардас Дж., Димитриевич С. (2009). «Заметное снижение алкогольдегидрогеназы в фибробластах роговицы при кератоконусе» . Молекулярное видение . 15 : 706–12. ПМЦ 2666775 . ПМИД 19365573 .

Дальнейшее чтение

Харада С. (апрель 2001 г.). «[Классификация ферментов и полиморфизмов, метаболизирующих алкоголь - специфичность на японском языке]». Нихон Арукору Якубуцу Игаккай Засши = Японский журнал исследований алкоголя и наркозависимости . 36 (2): 85–106. ПМИД 11398342 .
Грин РФ, Столер Дж. М. (июль 2007 г.). «Генотип алкогольдегидрогеназы 1B и алкогольный синдром плода: мини-обзор HuGE» . Американский журнал акушерства и гинекологии . 197 (1): 12–25. дои : 10.1016/j.ajog.2007.02.028 . ПМИД 17618743 .
Ланге Л.Г., Ситковски А.Дж., Валле Б.Л. (октябрь 1976 г.). «Алкогольдегидрогеназа печени человека: очистка, состав и каталитические особенности». Биохимия . 15 (21): 4687–93. дои : 10.1021/bi00666a023 . ПМИД 9982 .
Херли Т.Д., Босрон В.Ф., Гамильтон Дж.А., Амзель Л.М. (сентябрь 1991 г.). «Структура бета-1-бета-1-алкогольдегидрогеназы человека: каталитические эффекты замен в неактивных центрах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 88 (18): 8149–53. Бибкод : 1991PNAS...88.8149H . дои : 10.1073/pnas.88.18.8149 . ПМК 52464 . ПМИД 1896463 .
Стюарт М.Дж., Макбрайд М.С., Уинтер Л.А., Дустер Дж. (июнь 1990 г.). «Промоторы генов алкогольдегидрогеназы человека ADH1, ADH2 и ADH3: взаимодействие CCAAT/энхансер-связывающего белка с элементами, фланкирующими ТАТА-бокс ADH2». Джин . 90 (2): 271–9. дои : 10.1016/0378-1119(90)90190-3 . ПМИД 2169444 .
Уинтер Л.А., Стюарт М.Дж., Шин М.Л., Донг Ю., Поеллингер Л., Окрет С., Густафссон Дж.А., Дустер Г. (июль 1990 г.). «Элемент гормонального ответа выше гена алкогольдегидрогеназы человека ADH2 состоит из трех тандемных сайтов связывания глюкокортикоидных рецепторов». Джин . 91 (2): 233–40. дои : 10.1016/0378-1119(90)90093-7 . ПМИД 2210383 .
Карр Л.Г., Эденберг Х.Дж. (январь 1990 г.). «цис-действующие последовательности, участвующие в связывании белков и транскрипции in vitro гена алкогольдегидрогеназы человека ADH2» . Журнал биологической химии . 265 (3): 1658–64. дои : 10.1016/S0021-9258(19)40066-5 . ПМИД 2295648 .
Ясунами М., Кикучи И., Сарапата Д., Ёсида А. (июнь 1990 г.). «Кластер генов алкогольдегидрогеназы человека класса I: три гена тандемно организованы в сегменте генома длиной 80 т.п.н.». Геномика . 7 (2): 152–8. дои : 10.1016/0888-7543(90)90535-3 . ПМИД 2347582 .
Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж., Босрон В.Ф. (сентябрь 1990 г.). «Экспрессия и кинетическая характеристика вариантов бета-1-бета-1-алкогольдегидрогеназы человека, содержащих замены в аминокислоте 47» . Журнал биологической химии . 265 (27): 16366–72. дои : 10.1016/S0021-9258(17)46232-6 . ПМИД 2398055 .
Карр Л.Г., Сюй Ю, Хо WH, Эденберг HJ (август 1989 г.). «Нуклеотидная последовательность гена ADH2 (3), кодирующая субъединицу бета 3 алкогольдегидрогеназы человека». Алкоголизм: клинические и экспериментальные исследования . 13 (4): 594–6. дои : 10.1111/j.1530-0277.1989.tb00383.x . ПМИД 2679216 .
Цукахара М., Ёсида А. (февраль 1989 г.). «Хромосомное присвоение локуса кластера алкогольдегидрогеназы человеческой хромосоме 4q21-23 путем гибридизации in situ». Геномика . 4 (2): 218–20. дои : 10.1016/0888-7543(89)90304-2 . ПМИД 2737681 .
Дустер Дж., Смит М., Биланшоне В., Хэтфилд Г.В. (февраль 1986 г.). «Молекулярный анализ семейства генов алкогольдегидрогеназы человека класса I и нуклеотидной последовательности гена, кодирующего бета-субъединицу» . Журнал биологической химии . 261 (5): 2027–33. дои : 10.1016/S0021-9258(17)35892-1 . ПМИД 2935533 .
Икута Т., Сзето С., Ёсида А. (февраль 1986 г.). «Три субъединицы алкогольдегидрогеназы человека: структура кДНК, молекулярное и эволюционное расхождение» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (3): 634–8. Бибкод : 1986PNAS...83..634I . дои : 10.1073/pnas.83.3.634 . ПМК 322918 . ПМИД 2935875 .
Икута Т., Фудзиёси Т., Курачи К., Ёсида А. (май 1985 г.). «Молекулярное клонирование полноразмерной кДНК алкогольдегидрогеназы человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (9): 2703–7. Бибкод : 1985PNAS...82.2703I . дои : 10.1073/pnas.82.9.2703 . ПМЦ 397633 . ПМИД 2986130 .
Хеден Л.О., Хёг Д.О., Ларссон К., Лейк М., Лагерхольм Э., Хольмгрен А., Валле Б.Л., Йорнвалль Х., фон Бахр-Линдстрем Х. (январь 1986 г.). «Клоны кДНК, кодирующие бета-субъединицу алкогольдегидрогеназы печени человека, имеют 3'-некодирующие области разного размера». Письма ФЭБС . 194 (2): 327–32. дои : 10.1016/0014-5793(86)80111-9 . ПМИД 3000832 . S2CID 39171264 .
Сюй Ю.Л., Карр Л.Г., Босрон В.Ф., Ли Т.К., Эденберг Х.Дж. (апрель 1988 г.). «Генотипирование алкогольдегидрогеназ человека по локусам ADH2 и ADH3 после амплификации последовательности ДНК». Геномика . 2 (3): 209–14. дои : 10.1016/0888-7543(88)90004-3 . ПМИД 3397059 .

Внешние ссылки

Расположение генома человека ADH1B и ADH1B страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196616 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074207 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid3006456-5] Смит М. (март 1986 г.). «Генетика алкогольных и альдегиддегидрогеназ человека». Достижения в области генетики человека 15 . Том. 15. С. 249–90. дои : 10.1007/978-1-4615-8356-1_5 . ISBN 978-1-4615-8358-5 . ПМИД 3006456 .

[6] Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж. (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. ПМЦ 3756590 . ПМИД 23134050 .

[7] Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж., Босрон В.Ф. (1990). «Экспрессия и кинетическая характеристика вариантов бета-1-бета-1-алкогольдегидрогеназы человека, содержащих замены в аминокислоте 47» . Ж. Биол. Хим . 265 (27): 16366–72. дои : 10.1016/S0021-9258(17)46232-6 . ПМИД 2398055 .

[8] Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж. (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. ПМЦ 3756590 . ПМИД 23134050 .

[entrez-9] «Ген Энтреза: алкогольдегидрогеназа ADH1B IB (класс I), бета-полипептид» . Проверено 19 декабря 2019 г.

[10] Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж. (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. ПМЦ 3756590 . ПМИД 23134050 .

[11] Мацуо Ю, Ёкояма Р, Ёкояма С (август 1989 г.). «Гены алкогольдегидрогеназ человека бета-1 и бета-2 различаются всего одним нуклеотидом» . Европейский журнал биохимии . 183 (2): 317–20. дои : 10.1111/j.1432-1033.1989.tb14931.x . ПМИД 2547609 .

[12] Херли Т.Д., Эденберг Х.Дж. (2012). «Гены, кодирующие ферменты, участвующие в метаболизме этанола» . Исследование алкоголя . 34 (3): 339–44. ПМЦ 3756590 . ПМИД 23134050 .

[13] Томассон Х.Р., Эденберг Х.Дж., Крабб Д.В., Май XL, Джером Р.Э., Ли Т.К., Ван С.П., Лин Ю.Т., Лу Р.Б., Инь С.Дж. (апрель 1991 г.). «Генотипы алкогольной и альдегиддегидрогеназы и алкоголизм у китайских мужчин» . Американский журнал генетики человека . 48 (4): 677–81. ПМК 1682953 . ПМИД 2014795 .

[14] Берут Л.Дж., Гоут А.М., Бреслау Н., Джонсон Э.О., Бертельсен С., Фокс Л., Агравал А., Бухольц К.К., Груча Р. , Хессельброк В., Крамер Дж., Куперман С., Нюрнбергер Дж., Порьеш Б., Сакконе Н.Л., Шукит М., Тишфилд Дж. , Ван Дж.С., Форуд Т., Райс Дж.П., Эденберг Х.Дж. (апрель 2012). «ADH1B связан с алкогольной зависимостью и употреблением алкоголя среди населения европейского и африканского происхождения» . Молекулярная психиатрия . 17 (4): 445–50. дои : 10.1038/mp.2011.124 . ПМЦ 3252425 . ПМИД 21968928 .

[15] Пэн Ю и др. (2010). «Полиморфизм ADH1B Arg47His в популяциях Восточной Азии и расширение одомашнивания риса в истории» . Эволюционная биология BMC . 10 (1): 15. Бибкод : 2010BMCEE..10...15P . дои : 10.1186/1471-2148-10-15 . ПМЦ 2823730 . ПМИД 20089146 .

[16] Бернелл Дж.К., Карр Л.Г., Дулет Ф.Е., Эденберг Х.Дж., Ли Т.К., Босрон В.Ф. (август 1987 г.). «Субъединица бета-3-алкогольдегидрогеназы человека отличается от бета-1 заменой Cys на Arg-369, которая уменьшает связывание НАД(Н)». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 146 (3): 1227–33. дои : 10.1016/0006-291x(87)90779-0 . ПМИД 3619918 .

[17] Уолтерс Р.К., Адамс М.Дж., Адкинс А.Е., Алиев Ф., Бакану С.А., Батцлер А. и др. (10 марта 2018 г.). «Транс-наследственный GWAS алкогольной зависимости обнаруживает общие генетические основы с психическими расстройствами» . bioRxiv : 257311. doi : 10.1101/257311 . hdl : 1871.1/c28775f1-af5b-4205-93cc-8fc89d2429b3 .

[pmid19365573-18] Моота В.В., Канофф Дж.М., Шанкардас Дж., Димитриевич С. (2009). «Заметное снижение алкогольдегидрогеназы в фибробластах роговицы при кератоконусе» . Молекулярное видение . 15 : 706–12. ПМЦ 2666775 . ПМИД 19365573 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]