RPN2
| RPN2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | RPN2 , Ribiir, RPN-II, RPNII, SWP1, рибофорин II | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Омим : 180490 ; MGI : 98085 ; Гомологен : 2214 ; GeneCards : RPN2 ; OMA : RPN2 - ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Долихилдифосфулигосахарид-субъединица 2 белка гликозилтрансферазы 2, также называемая рибофорином ǁ является ферментом , который у людей кодируется RPN2 геном . [ 5 ]
Функция
[ редактировать ]типа I, Этот ген кодирует интегральный мембранный белок рибофорина обнаруженный только в грубой эндоплазматической ретикулуме. Кодированный белок является частью N-олигосакчарил-трансферазы, который связывает олигосахариды с высоким содержанием маннозы с остатками аспарагина, обнаруженные в консенсусном мотиве ASN-X-SER/THR зарождающихся полипептидных цепей. Этот белок похож по последовательности с субъединицей дрожжевой олигосакчарил -трансферазы SWP1. [ 5 ] Было продемонстрировано, что RPN2 является прогностическим маркером рака человека и может быть потенциальной целью клинической важности.
Структура
[ редактировать ]Gene
[edit]The RPN2 gene lies on the chromosome location of 20q11.23 and consists of 19 exons.
Protein
[edit]RPN2 consists of 631 amino acid residues and weighs 69284Da.
Function
[edit]RPN2 is a unique integral glycoprotein in rough ER membrane that is involved in translocation and the maintenance of the structural uniqueness of the rough ER. It is also an essential subunit of N-oligosaccharyl transferase complex that conjugates high mannose oligosaccharides to asparagine residues in the N-X-S/T consensus motif of nascent polypeptide chains.[6][7][8][9] RPN2 regulates the glycosylation of multi-drug resistance, and thus its interference could decrease the membrane localization of P-glycoprotein by reducing its glycosylation status and restored the sensitivity to docetaxel.[10]
Clinical significance
[edit]RPN2 has been demonstrated to be a prognostic marker of human cancer. RPN2 is highly expressed in breast cancer stem cells and is associated with tumor metastasis. Recent study has shown that its expression is correlated with clinically aggressive features of breast cancer, implying a possible application in personalized medicine.[11] RPN2 silencing has been reported to repress tumorigenicity and to sensitize the tumors to cisplatin treatment, which led to the longer survival of NSCLC-bearing mice, suggesting that RPN2 may represent a promising new target for RNAi-based medicine against NSCLC.[10] Similar potential application has also been shown in osteosarcoma, esophageal squamous cell carcinoma and colorectal cancer.[12][13][14] RPN2 is also reported to be one of the prothrombin-binding proteins on monocyte surfaces, suggesting that its involvement in the pathophysiology of thrombosis in patients with APS.[15]
Interactions
[edit]tetraspanin CD63 [16]
prothrombin [15]
References
[edit]- ^ Jump up to: a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000118705 – Ensembl, May 2017
- ^ Jump up to: a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027642 – Ensembl, May 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Jump up to: a b "Entrez Gene: RPN2 ribophorin II".
- ^ Kelleher DJ, Kreibich G, Gilmore R (April 1992). "Oligosaccharyltransferase activity is associated with a protein complex composed of ribophorins I and II and a 48 kd protein". Cell. 69 (1): 55–65. doi:10.1016/0092-8674(92)90118-v. PMID 1555242. S2CID 46304250.
- ^ Kelleher DJ, Gilmore R (April 2006). "An evolving view of the eukaryotic oligosaccharyltransferase". Glycobiology. 16 (4): 47R–62R. doi:10.1093/glycob/cwj066. PMID 16317064.
- ^ Crimaudo C, Hortsch M, Gausepohl H, Meyer DI (January 1987). "Human ribophorins I and II: the primary structure and membrane topology of two highly conserved rough endoplasmic reticulum-specific glycoproteins". The EMBO Journal. 6 (1): 75–82. doi:10.1002/j.1460-2075.1987.tb04721.x. PMC 553359. PMID 3034581.
- ^ Yuan TM, Liang RY, Chueh PJ, Chuang SM (April 2015). "Role of ribophorin II in the response to anticancer drugs in gastric cancer cell lines". Oncology Letters. 9 (4): 1861–1868. doi:10.3892/ol.2015.2900. PMC 4356382. PMID 25789057.
- ^ Jump up to: a b Fujita Y, Yagishita S, Takeshita F, Yamamoto Y, Kuwano K, Ochiya T (February 2015). "Prognostic and therapeutic impact of RPN2-mediated tumor malignancy in non-small-cell lung cancer". Oncotarget. 6 (5): 3335–45. doi:10.18632/oncotarget.2793. PMC 4413657. PMID 25595901.
- ^ Jump up to: a b Ono M, Tsuda H, Kobayashi T, Takeshita F, Takahashi RU, Tamura K, Akashi-Tanaka S, Moriya T, Yamasaki T, Kinoshita T, Yamamoto J, Fujiwara Y, Ochiya T (June 2015). "The expression and clinical significance of ribophorin II (RPN2) in human breast cancer". Pathology International. 65 (6): 301–8. doi:10.1111/pin.12297. PMID 25881688. S2CID 36249480.
- ^ Fujiwara T, Takahashi RU, Kosaka N, Nezu Y, Kawai A, Ozaki T, Ochiya T (September 2014). "RPN2 Gene Confers Osteosarcoma Cell Malignant Phenotypes and Determines Clinical Prognosis". Molecular Therapy: Nucleic Acids. 3 (9): e189. doi:10.1038/mtna.2014.35. PMC 4222647. PMID 25181275.
- ^ Kurashige J, Watanabe M, Iwatsuki M, Kinoshita K, Saito S, Nagai Y, Ishimoto T, Baba Y, Mimori K, Baba H (October 2012). "RPN2 expression predicts response to docetaxel in oesophageal squamous cell carcinoma". British Journal of Cancer. 107 (8): 1233–8. doi:10.1038/bjc.2012.396. PMC 3494434. PMID 22955852.
- ^ Zhang J, Yan B, Späth SS, Qun H, Cornelius S, Guan D, Shao J, Hagiwara K, Van Waes C, Chen Z, Su X, Bi Y (1 January 2015). "Integrated transcriptional profiling and genomic analyses reveal RPN2 and HMGB1 as promising biomarkers in colorectal cancer". Cell & Bioscience. 5: 53. doi:10.1186/s13578-015-0043-9. PMC 4574027. PMID 26388988.
- ^ Jump up to: a b Fujieda Y, Amengual O, Matsumoto M, Kuroki K, Takahashi H, Kono M, Kurita T, Otomo K, Kato M, Oku K, Bohgaki T, Horita T, Yasuda S, Maenaka K, Hatakeyama S, Nakayama KI, Atsumi T (June 2016). "Ribophorin II is involved in the tissue factor expression mediated by phosphatidylserine-dependent antiprothrombin antibody on monocytes". Rheumatology. 55 (6): 1117–26. doi:10.1093/rheumatology/kew005. PMID 26895716.
- ^ Tominaga N, Hagiwara K, Kosaka N, Honma K, Nakagama H, Ochiya T (May 2014). "RPN2-mediated glycosylation of tetraspanin CD63 regulates breast cancer cell malignancy". Molecular Cancer. 13: 134. doi:10.1186/1476-4598-13-134. PMC 4070641. PMID 24884960.
Further reading
[edit]- Стоффель М., Сян К., Белл Ги (ноябрь 1992). «Динуклеотидный повторный полиморфизм в локусе рибофорина II человека (RPN2) на хромосоме 20Q». Молекулярная генетика человека . 1 (8): 656. doi : 10.1093/hmg/1,8,656 . PMID 1301181 .
- Löffler C, Rao VV, Hansmann I (июнь 1991 г.). «Картирование гена рибофорина II (RPN II) с хромосомой человека 20Q12-Q13.1 с помощью гибридизации на месте». Человеческая генетика . 87 (2): 221–2. doi : 10.1007/bf00204188 . PMID 2066112 . S2CID 26258810 .
- Кумар В., Хейнеманн Ф.С., Озолс Дж (июнь 1998 г.). «Интерлейкин-2 индуцирует N-гликозилирование в Т-клетках: характеристика лимфоцитарной олигосакчарилтрансферазы человека». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 247 (2): 524–9. doi : 10.1006/bbrc.1998.8780 . PMID 9642163 .
- FU J, Kreibich G (февраль 2000 г.). «Удерживание субъединиц олигосакхарилтрансферазного комплекса в эндоплазматической ретикулуме» . Журнал биологической химии . 275 (6): 3984–90. doi : 10.1074/jbc.275.6.3984 . PMID 10660554 .
- Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ обработки белка с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nature Biotechnology . 21 (5): 566–9. doi : 10.1038/nbt810 . PMID 12665801 . S2CID 23783563 .
- Келлехер DJ, Караоглу Д., Мандон Е.К., Гилмор Р. (июль 2003 г.). «Изоформы олигосакхарилтрансферазы, которые содержат различные каталитические субъединицы STT3, обладают различными ферментативными свойствами» . Молекулярная клетка . 12 (1): 101–11. doi : 10.1016/s1097-2765 (03) 00243-0 . PMID 12887896 .
- Шибатани Т., Дэвид Л.Л., МакКормак А.Л., Фрю К., Скач В.Р. (апрель 2005 г.). «Протеомный анализ олигосакхарилтрансферазы млекопитающих выявляет множественные подкомплексы, которые содержат SEC61, TRAP, и две потенциальные новые субъединицы». Биохимия . 44 (16): 5982–92. doi : 10.1021/bi047328f . PMID 15835887 .
- Tu LC, Yan X, Hood L, Lin B (апрель 2007 г.). «Протеомический анализ взаимодействия N-Myc Нижнего регулируемого гена 1 и его взаимодействия с программой реакции андрогенов в клетках рака простаты» . Молекулярная и клеточная протеомика . 6 (4): 575–88. doi : 10.1074/mcp.m600249-mcp200 . PMID 17220478 .