DTX3L

DTX3L
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3PG6
Идентификаторы
Псевдонимы	DTX3L , BBAP, дельтекс-3-подобная, убиквитинлигаза E3, убиквитинлигаза deltex E3 3L, RNF143
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 613143 ; МГИ : 2656973 ; Гомологен : 51375 ; Генные карты : DTX3L ; OMA : DTX3L — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	122,575,203 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	35,759,521 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of ileum; ; pancreatic ductal cell; ; lower lobe of lung; ; decidua; ; epithelium of nasopharynx; ; pericardium; ; mucosa of paranasal sinus; ; germinal epithelium; ; pylorus; ; human penis;
	Top expressed in
	mesenteric lymph nodes; ; jejunum; ; seminal vesicula; ; submandibular gland; ; blood; ; lumbar spinal ganglion; ; ileum; ; cervix; ; subcutaneous adipose tissue; ; thymus;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; metal ion binding; ubiquitin-protein transferase activity; transferase activity; enzyme inhibitor activity; enzyme activator activity; enzyme binding; histone binding; ubiquitin-like protein ligase binding; STAT family protein binding;
Cellular component	cytoplasm; nucleus; nucleoplasm; cytosol; early endosome; lysosome; lysosomal membrane; endosome; membrane; early endosome membrane; protein-containing complex;
Biological process	histone monoubiquitination; double-strand break repair; DNA repair; protein ubiquitination; cellular response to DNA damage stimulus; protein polyubiquitination; positive regulation of defense response to virus by host; endosome to lysosome transport; positive regulation of protein binding; histone H2A ubiquitination; histone H2B ubiquitination; positive regulation of chromatin binding; positive regulation of transcription, DNA-templated; negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity; protein autoubiquitination; protein K48-linked ubiquitination; positive regulation of protein localization to nucleus; positive regulation of NAD+ ADP-ribosyltransferase activity; positive regulation of protein localization to early endosome; positive regulation of receptor catabolic process; positive regulation of double-strand break repair via nonhomologous end joining; immune system process; protein transport; innate immune response; defense response to virus; chromatin organization; ubiquitin-dependent protein catabolic process; Notch signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	151636
	209200
	ENSG00000163840
	ENSMUSG00000049502
	Q8TDB6
	Q3UIR3
	НМ_138287
	НМ_001013371
	НП_612144
	НП_001013389
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Убиквитинлигаза 3L Deltex E3 представляет собой белок , который у человека кодируется геном DTX3L . ^{[ 5 ]} Он действует как убиквитинлигаза (Е3), ^{[ 6 ]} и сверхэкспрессируется в лимфомах, устойчивых к химиотерапии. ^{[ 7 ]} Он является членом семейства белков DTX. ^{[ 8 ]} Помимо прочего, он участвует в восстановлении повреждений ДНК.

Он был обнаружен посредством двухгибридного скрининга во время поиска партнеров по связыванию PARP9 (ранее BAL ^{[ 9 ]}), ген, связанный с риском развития В-клеточной лимфомы . и первоначально назывался BBAP (белок, ассоциированный с B-лимфомой и БАЛ). ^{[ 6 ]}

DTX3L и PARP9 расположены в одной и той же области генома размером 48 КБ и оба регулируются IFN-γ -чувствительным двунаправленным промотором . ^{[ 10 ]} DTX3L имеет длинный N-концевой домен, отличающийся от других белков семейства DTX, что позволяет ему образовывать димеры с самим собой и другими белками. ^{[ 8 ]} Было обнаружено, что он регулируется METTL3 . ^{[ 8 ]}

Функция

DTX3L функционирует как убиквитинлигаза или E3. ^{[ 6 ]} Эти белки связываются с ферментами, конъюгирующими убиквитин (E2), а затем переносят и связывают убиквитин (активируемый E1 ) от E2 к целевому белку. ^{[ 11 ]} Наряду со всеми другими известными белками семейства DTX (по состоянию на 2023 г.) DTX3L участвует в регуляции передачи сигналов Notch . ^{[ 8 ]}

DTX3L также играет роль в восстановлении повреждений ДНК. ^{[ 8 ]} что связано с его способностью избирательно моноубиквитилировать (связывать один убиквитин с) гистоном H4 . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Он помогает защитить клетки, подвергшиеся воздействию агентов, повреждающих ДНК. ^{[ 7 ]}

DTX3L может образовывать комплекс с PARP9 . ^{[ 12 ]} Этот комплекс действует как убиквитинлигаза и убиквитинирует как гистон хозяина H2BJ , чтобы способствовать экспрессии стимулируемых интерфероном генов , так и вирусную протеазу 3C , чтобы нарушить сборку вируса. ^{[ 12 ]} Это может помочь контролировать вирусную инфекцию. ^{[ 12 ]} PARP9 также может влиять на функцию DXT3L по восстановлению повреждений ДНК. ^{[ 8 ]} Комплекс DXT3L-PARP9 опосредует моно- АДФ-рибозилирование убиквитина; это предотвращает его конъюгацию ^{[ 13 ]} и ингибирует функцию DXT3L как убиквитинлигазы. ^{[ 8 ]} Вместо этого NAD + -зависимое связывание PARP9 с поли-АДФ-рибозой усиливает активность DXT3L как убиквитинлигазы. ^{[ 8 ]}^{[ почему? ]} DTX3L также может образовывать комплекс с DTX1 . ^{[ 8 ]}

DTX3L также влияет на передачу сигналов, ингибируя сортировку связанного с G-белком, рецептора CXCR4, через эндосомы и деградацию в лизосомах . ^{[ 14 ]} Когда CXCR4 активируется, DXT3L локализуется в ранних эндосомах и ингибирует белок E3 ubiquitin ligase atropin-1, взаимодействующий с атрофином-1 4 . ^{[ 14 ]} Это снижает степень убиквитинирования белка ESCRT-0 , что снижает его способность сортировать CXCR4 в лизосомы. ^{[ 14 ]} Последствия этого эффекта (по состоянию на 2023 год) в биологии рака неизвестны. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000163840 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049502 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «ДТХ3Л» . Национальный центр биотехнологической информации . Национальная медицинская библиотека . Проверено 26 марта 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Такеяма К., Агиар Р.К., Гу Л., Хе С., Фриман Г.Дж., Куток Дж.Л., Астер Дж.К., Шипп М.А. (2003). «БАЛ-связывающий белок BBAP и родственные ему члены семейства Deltex проявляют активность изопептидлигазы убиквитин-белок» . Ж. Биол. Хим . 278 (24): 21930–7. дои : 10.1074/jbc.M301157200 . ПМИД 12670957 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ян К., Датт С., Сюй Р., Грейвс К., Ющинский П., Манис Дж.П., Шипп М.А. (2009). «BBAP моноубиквитилирует гистон H4 по лизину 91 и избирательно модулирует реакцию на повреждение ДНК» . Мол. Клетка . 36 (1): 110–20. doi : 10.1016/j.molcel.2009.08.019 . ПМЦ 2913878 . ПМИД 19818714 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Скалия, Пьерлуиджи; Уильямс, Стивен Дж.; Сума, Антонио; Карневале, Винченцо (21 июня 2023 г.). «Семейство белков DTX: новый набор убиквитин-лигаз E3 при раке» . Клетки . 12 (13): 1680. doi : 10.3390/cells12131680 . ISSN 2073-4409 . ПМЦ 10340142 . ПМИД 37443713 .
^ «Отчет по символам для PARP9» . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . Проверено 20 июля 2024 г.
^ Ющинский П., Куток Дж.Л., Ли С., Митра Дж., Агиар Р.К., Шипп М.А. (2006). «BAL1 и BBAP регулируются двунаправленным промотором, реагирующим на гамма-интерферон, и сверхэкспрессируются в диффузных крупных B-клеточных лимфомах с выраженным воспалительным инфильтратом» . Мол. Клетка. Биол . 26 (14): 5348–59. дои : 10.1128/MCB.02351-05 . ПМК 1592708 . ПМИД 16809771 .
^ Нанди Д., Тахилиани П., Кумар А., Чанду Д. (март 2006 г.). «Убиквитин-протеасомная система». Журнал биологических наук . 31 (1): 137–155. дои : 10.1007/BF02705243 . ПМИД 16595883 . S2CID 21603835 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Чжан, Юн; Мао, Дайлин; Розвит, Уильям Т.; Цзинь, Сяохуа; Патель, Ананд К.; Патель, Дхара А.; Агапов, Евгений; Ван, Чжэпэн; Тидвелл, Роуз М.; Аткинсон, Джеффри Дж.; Хуан, Гуанмин; Маккарти, Рональд; Ю, Цзиньшэн; Юн, Надежда Евгеньевна; Песслер, Слободан (декабрь 2015 г.). «Убикитинлигаза PARP9-DTX3L нацелена на гистон H2BJ хозяина и вирусную протеазу 3C для усиления передачи сигналов интерферона и контроля вирусной инфекции» . Природная иммунология . 16 (12): 1215–1227. дои : 10.1038/ni.3279 . ISSN 1529-2916 . ПМЦ 4653074 . ПМИД 26479788 .
^ Ян, Чун-Сон; Дживиден, Кейси; Спенсер, Адам; Дворжак, Наталья; Ни, Ли; Остдик, Люк Т.; Чаттерджи, Мандови; Кусмидер, Беата; Реон, Брайан; Парлак, Махмут; Горбунова Вера; Аббас, Тарек; Джеффри, Эрин; Шерман, Николас Э.; Паскаль, Брайс М. (18 мая 2017 г.). «Модификация убиквитина с помощью E3-лигазы/АДФ-рибозилтрансферазы Dtx3L/Parp9» . Молекулярная клетка . 66 (4): 503–516.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2017.04.028 . ISSN 1097-2765 . ПМЦ 5556935 . ПМИД 28525742 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Холлеман Дж., Марчезе А. (2014). «Убиквитинлигаза deltex-3l регулирует эндосомальную сортировку рецептора CXCR4, связанного с G-белком» . Мол. Биол. Клетка . 25 (12): 1892–904. дои : 10.1091/mbc.E13-10-0612 . ПМК 4055268 . ПМИД 24790097 .

Дальнейшее чтение

Уилтинг С.М., де Вильде Дж., Мейер С.Дж., Беркхоф Дж., Йи Й., ван Виринген В.Н., Браахейс Б.Дж., Мейер Г.А., Илстра Б., Снейдерс П.Дж., Стинберген Р.Д. (2008). «Интегрированное геномное и транскрипционное профилирование идентифицирует хромосомные локусы с измененной экспрессией генов при раке шейки матки» . Гены Хромосомы Рак . 47 (10): 890–905. дои : 10.1002/gcc.20590 . ПМЦ 2733213 . ПМИД 18618715 .
Обьеро Дж., Уокер-младший, Де-Паганон С. (2012). «Складка консервативного домена DTC в белках Deltex». Белки . 80 (5): 1495–9. дои : 10.1002/prot.24054 . ПМИД 22411408 . S2CID 40043949 .
Ян Ц, Сюй Р, Чжу Л, Ченг Х, Ван З, Манис Дж, Шипп М.А. (2013). «BAL1 и его партнерская лигаза E3, BBAP, активируют поли(ADP-рибозу) связь, убиквитилирование и репарацию двухцепочечной ДНК независимо от ATM, MDC1 и RNF8» . Мол. Клетка. Биол . 33 (4): 845–57. дои : 10.1128/MCB.00990-12 . ПМЦ 3571337 . ПМИД 23230272 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

статья о гене на хромосоме 3 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000163840 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000049502 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «ДТХ3Л» . Национальный центр биотехнологической информации . Национальная медицинская библиотека . Проверено 26 марта 2017 г.

[:0-6] Jump up to: ^а ^б ^с Такеяма К., Агиар Р.К., Гу Л., Хе С., Фриман Г.Дж., Куток Дж.Л., Астер Дж.К., Шипп М.А. (2003). «БАЛ-связывающий белок BBAP и родственные ему члены семейства Deltex проявляют активность изопептидлигазы убиквитин-белок» . Ж. Биол. Хим . 278 (24): 21930–7. дои : 10.1074/jbc.M301157200 . ПМИД 12670957 .

[:1-7] Jump up to: ^а ^б ^с Ян К., Датт С., Сюй Р., Грейвс К., Ющинский П., Манис Дж.П., Шипп М.А. (2009). «BBAP моноубиквитилирует гистон H4 по лизину 91 и избирательно модулирует реакцию на повреждение ДНК» . Мол. Клетка . 36 (1): 110–20. doi : 10.1016/j.molcel.2009.08.019 . ПМЦ 2913878 . ПМИД 19818714 .

[:4-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Скалия, Пьерлуиджи; Уильямс, Стивен Дж.; Сума, Антонио; Карневале, Винченцо (21 июня 2023 г.). «Семейство белков DTX: новый набор убиквитин-лигаз E3 при раке» . Клетки . 12 (13): 1680. doi : 10.3390/cells12131680 . ISSN 2073-4409 . ПМЦ 10340142 . ПМИД 37443713 .

[9] «Отчет по символам для PARP9» . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . Проверено 20 июля 2024 г.

[10] Ющинский П., Куток Дж.Л., Ли С., Митра Дж., Агиар Р.К., Шипп М.А. (2006). «BAL1 и BBAP регулируются двунаправленным промотором, реагирующим на гамма-интерферон, и сверхэкспрессируются в диффузных крупных B-клеточных лимфомах с выраженным воспалительным инфильтратом» . Мол. Клетка. Биол . 26 (14): 5348–59. дои : 10.1128/MCB.02351-05 . ПМК 1592708 . ПМИД 16809771 .

[Nandi-11] Нанди Д., Тахилиани П., Кумар А., Чанду Д. (март 2006 г.). «Убиквитин-протеасомная система». Журнал биологических наук . 31 (1): 137–155. дои : 10.1007/BF02705243 . ПМИД 16595883 . S2CID 21603835 .

[:3-12] Jump up to: ^а ^б ^с Чжан, Юн; Мао, Дайлин; Розвит, Уильям Т.; Цзинь, Сяохуа; Патель, Ананд К.; Патель, Дхара А.; Агапов, Евгений; Ван, Чжэпэн; Тидвелл, Роуз М.; Аткинсон, Джеффри Дж.; Хуан, Гуанмин; Маккарти, Рональд; Ю, Цзиньшэн; Юн, Надежда Евгеньевна; Песслер, Слободан (декабрь 2015 г.). «Убикитинлигаза PARP9-DTX3L нацелена на гистон H2BJ хозяина и вирусную протеазу 3C для усиления передачи сигналов интерферона и контроля вирусной инфекции» . Природная иммунология . 16 (12): 1215–1227. дои : 10.1038/ni.3279 . ISSN 1529-2916 . ПМЦ 4653074 . ПМИД 26479788 .

[13] Ян, Чун-Сон; Дживиден, Кейси; Спенсер, Адам; Дворжак, Наталья; Ни, Ли; Остдик, Люк Т.; Чаттерджи, Мандови; Кусмидер, Беата; Реон, Брайан; Парлак, Махмут; Горбунова Вера; Аббас, Тарек; Джеффри, Эрин; Шерман, Николас Э.; Паскаль, Брайс М. (18 мая 2017 г.). «Модификация убиквитина с помощью E3-лигазы/АДФ-рибозилтрансферазы Dtx3L/Parp9» . Молекулярная клетка . 66 (4): 503–516.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2017.04.028 . ISSN 1097-2765 . ПМЦ 5556935 . ПМИД 28525742 .

[:2-14] Jump up to: ^а ^б ^с Холлеман Дж., Марчезе А. (2014). «Убиквитинлигаза deltex-3l регулирует эндосомальную сортировку рецептора CXCR4, связанного с G-белком» . Мол. Биол. Клетка . 25 (12): 1892–904. дои : 10.1091/mbc.E13-10-0612 . ПМК 4055268 . ПМИД 24790097 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]