Трансмембранная домена транспортеров ABC
| ABC Transporter трансмембранная область | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | ABC_MEMBRANE | ||
| Pfam | PF00664 | ||
| InterPro | IPR011527 | ||
| PROSITE | PDOC00364 | ||
| Краткое содержание | 1pf4 / scope / supfam | ||
| TCDB | 3.A.1 | ||
| OPM Суперсемейство | 17 | ||
| OPM белок | 2how | ||
| |||
Трансмембранный домен ABC является основной трансмембранной структурной единицей АТФ -связывающих белков транспортер-кассеты, состоящих из шести альфа-спиралов , которые проходят плазматическую мембрану. Многие члены семейства ABC Transporter ( PFAM PF00005 ) имеют две такие регионы. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]
Эта семья, по -видимому, соответствует ABC1 с помощью классификации TCDB.
Подсемейства
[ редактировать ]- Сульфатный транспортер пермеаза ABC Permease Interpro : IPR005667
- Система транспорта фосфатов пермеазой белок 2 InterPro : IPR005672
- Поглощение фосфоната Transporter InterPro : IPR5769
- Транспорт нитрат пермеаза InterPro : IPR005889
- NIFC-подобный ABC-тип Porter Interpro : IPR006469
- Phosphate ABC Transporter, Permease Brotein PSTC InterPro : IPR011864
- Molybdate ABC Transporter, Permease Protein Interpro : IPR011867
- Nickel ABC Transporter, Permease Subunit Nikb InterPro : IPR014156
- Nickel ABC Transporter, Permease Subunit Nikc InterPro : IPR014157
- Эктоин/гидроксиэктоин ABC Transporter, пермеазовый белок Ehud InterPro : IPR014341
- Эктоин/гидроксиэктоин ABC Transporter, пермеазовый белок EHUC InterPro : IPR014342
Человеческие белки, содержащие этот домен
[ редактировать ]ABCB1 ; ABCB10 ; ABCB11 ; ABCB4 ; ABCB5 ; ABCB6 ; ABCB7 ; ABCB8 ; ABCB9 ; ABCC1 ; ABCC10 ; ABCC11 ; ABCC12 ; ABCC13 ; ABCC2 ; ABCC3 ; ABCC4 ; ABCC5 ; ABCC6 ; ABCC8 ; ABCC9 ; CFTR ; Tap1 ; Tap2 ; Tapl ;
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Kerr Id (2002). «Структура и ассоциация АТФ-связывающих кассет-транспортер нуклеотид-связывающие домены» . Биохим. Биофиз. Акт . 1561 (1): 47–64. doi : 10.1016/s0304-4157 (01) 00008-9 . PMID 11988180 . S2CID 7058003 .
- ^ Хант Дж.Ф., Юань Юр, Марсинкевич О., Миллен Л., Томас П.Дж., Карпович Н., Дай П.Л., Макви К. (2001). «Кристаллические структуры кассеты, связывающей АТФ MJ1267, выявляют индуцированный эффект в активном сайте АТФазы транспортера ABC» . Структура 9 (7): 571–86. doi : 10.1016/s0969-2126 (01) 00617-7 . PMID 11470432 .
- ^ Хант Дж. Ф., Юань Юр, Блекер С., Марсинкевич О., Миллен Л., Томас П.Дж. (2001). «Кристаллическая структура MJ0796-связывающей кассеты. Последствия для структурных последствий гидролиза АТФ в активном сайте транспортера ABC» . Дж. Биол. Химический 276 (34): 32313–21. doi : 10.1074/jbc.m100758200 . PMID 11402022 .
- ^ Ким Ш., Хунг Л.В., Ван Икс, Никайдо К., Лю П.К., Эймс Г.Ф. (1998). «Кристаллическая структура АТФ-связывающей субъединицы транспортера ABC». Природа . 396 (6712): 703–707. Bibcode : 1998natur.396..703h . doi : 10.1038/25393 . PMID 9872322 . S2CID 204996524 .
- ^ Welte W, Breed J, Boos W, Deederichs K, Vonrhein C, Muller C, Diez J, Greller G, Schnell C (2000). «Кристаллическая структура Малка, субъединица АТФазы транспортера Trehalose/Maltose ABC Archaeon Thermococcus litoralis» . Embo j . 19 (22): 5951–61. doi : 10.1093/emboj/19.22.5951 . PMC 305842 . PMID 11080142 .
- ^ Wiley DC, Gaudet R (2001). «Структура ABC ATPase Domain of Human TAP1, транспортер, связанный с обработкой антигена» . Embo j . 20 (17): 4964–72. doi : 10.1093/emboj/20.17.4964 . PMC 125601 . PMID 11532960 .
 | Эта статья, связанная с мембранным белком, является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |