Просапозин

Псап
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	1M12, 1N69, 1SN6, 2DOB, 2GTG, 2QYP, 2R0R, 2R1Q, 2RB3, 2Z9A, 3BQP, 3BQQ, 4DDJ, 4UEX, 4V2O
Идентификаторы
Псевдонимы	PSAP , GLBA, SAP1, Proposin, SAP2, PSAPD, Park24
Внешние идентификаторы	Омим : 176801 ; MGI : 97783 ; Гомологен : 37680 ; GeneCards PSAP ; OMA : PSAP - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	71,851,251 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	60,138,376 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	monocyte; ; tendon of biceps brachii; ; right adrenal cortex; ; gallbladder; ; internal globus pallidus; ; stromal cell of endometrium; ; Achilles tendon; ; left adrenal gland; ; visceral pleura; ; left adrenal cortex;
	Top expressed in
	stroma of bone marrow; ; gastrula; ; decidua; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; superior frontal gyrus; ; cerebellar cortex; ; mesenteric lymph nodes; ; primary visual cortex;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	G protein-coupled receptor binding; protein binding; lipid binding; enzyme activator activity; beta-galactosidase activity; phospholipid binding; protein homodimerization activity; ganglioside GM1 binding; ganglioside GM2 binding; ganglioside GM3 binding; ganglioside GT1b binding; ganglioside GP1c binding; identical protein binding; protease binding;
Cellular component	lysosomal membrane; integral component of membrane; mitochondrion; lysosomal lumen; extracellular exosome; extracellular space; lysosome; plasma membrane; azurophil granule membrane; intracellular membrane-bounded organelle; extracellular matrix; extracellular region; cytoplasm; collagen-containing extracellular matrix; late endosome;
Biological process	lipid metabolism; lipid transport; epithelial cell differentiation involved in prostate gland development; regulation of MAPK cascade; glycosphingolipid metabolic process; developmental growth; adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled receptor signaling pathway; regulation of autophagy; positive regulation of MAPK cascade; cellular response to organic substance; negative regulation of hydrogen peroxide-induced cell death; regulation of lipid metabolic process; prostate gland growth; platelet degranulation; sphingolipid metabolic process; positive regulation of catalytic activity; neutrophil degranulation; ganglioside GM1 transport to membrane; corneocyte development; galactosylceramide catabolic process; G protein-coupled receptor signaling pathway; hearing; myelination; neuromuscular process controlling balance; positive regulation of hydrolase activity; urination; cochlea development; walking behavior; cornified envelope assembly; lysosomal transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5660
	19156
	ENSG00000197746
	Ensmusg00000004207
	P07602 ; Q5BJH1
	Q61207
	NM_002778 ; NM_001042465 ; NM_001042466
showNM_001146120 ; NM_001146121 ; NM_001146122 ; NM_001146123 ; NM_001146124 ;
	NM_011179
	NP_001035930 ; NP_001035931 ; NP_002769 ; NP_002769.1
showNP_001139592 ; NP_001139593 ; NP_001139594 ; NP_001139595 ; NP_001139596 ;
	NP_035309
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Просапозин , также известный как PSAP , является белком , который у людей кодируется PSAP геном . ^{[ 5 ]}

Этот высоко консервативный гликопротеин предшественником для 4 продуктов расщепления: сапозины A, B, C и D. Saposin является аббревиатурой для Phingolipid является A Ctivator P R O [ S ] TE в s. ^{[ 6 ]} Каждый домен белка -предшественника составляет приблизительно 80 аминокислотных остатков длиной с почти идентичным размещением остатков цистеина и сайтов гликозилирования. Сапозины и локализуются в первую очередь в лизосомальном компартменте, где они облегчают катаболизм гликосфинголипидов с короткими олигосахаридными группами. Белок -предшественник существует как секреторный белок, так и в качестве интегрального мембранного белка и обладает нейротрофической активностью. ^{[ 5 ]}

Сапозины A - D необходимы для гидролиза определенных сфинголипидов специфическими лизосомальными гидролазами. ^{[ 7 ]}

Члены семьи

Сапозин А был идентифицирован как N-концевой домен в кДНК просопозина до его выделения. Известно, что он стимулирует ферментативный гидролиз 4-метилумбелиферил-β-глюкозида, глюкоцереброзида и галактоцереброзида . ^{[ 8 ]}
Сапозин B был первым, который был обнаружен и было обнаружено, что он требовался в качестве термостабильного фактора для гидролиза сульфатидов с помощью арилсульфатазы A. Он известен под многими различными именами, такими как белок-1 активатора сфинголипидов (SAP-1), белок-активатор сульфатида, ганглиозидный активатор GM ₁ , дисперсин и неспецифический. ^{[ 9 ]} Было отмечено, что этот конкретный сапозин активирует многие ферменты посредством взаимодействия с субстратами, а не самими ферментами.
Сапозин С был вторым сапозином, который был обнаружен, и стимулирует гидролиз гликоцереброзида гликозилцеридамидазой и галактоцереброзидом галактозилцеримадазой.
На данный момент Saposin D не очень известен отсутствием исследований. Это было предсказано из последовательности кДНК просопозина, как и сапозин А. Ферментативная стимуляция очень специфична для этого конкретного гликопротеина и не понимается полностью. ^{[ 7 ]}
GM2A (GM2 Gangilioside Activator) рассматривался как член семейства SAP и назывался SAP-3 (белок 3 активатора сфинголипидов)) ^{[ 10 ]}

Кристаллические структуры человеческих сапозинов AD

Сапозин А ( PDB : 2DOB ). ^{[ 11 ]}
Saposin B ( PDB : 1N69 ). ^{[ 12 ]}
Saposin C Dymer в открытой конформации ( PDB : 2QYP ). ^{[ 13 ]}
Saposin D ( PDB : 2RB3 ). ^{[ 13 ]}

Структура

Каждый сапозин содержит около 80 аминокислотных остатков и имеет шесть одинаково расположенных цистеинов, два пролина и сайт гликозилирования (два в сапозине А, по одному в сапозинах B, C и D). ^{[ 7 ]} Поскольку сапозинские характеристики экстремальной теплостойчивости, обилие дисульфидных связей и сопротивление большинству протеаз, предполагается, что они чрезвычайно компактные и жестко дисульфидные молекулы. Каждый сапозин имеет α-спиральную структуру, которая считается важной для стимуляции, поскольку эта структура максимальна при рН 4,5; что оптимально для многих лизосомальных гидролаз. ^{[ 7 ]} Эта спиральная структура наблюдается во всех (особенно с первой областью), но, как было предсказано, сапозин будет иметь конфигурацию β-листа из-за его первых 24 аминокислот N-конца. ^{[ 9 ]}

Функция

Они, вероятно, действуют, изолируя липидный субстрат из мембранной окружающей среды, что делает его более доступным для растворимых деградативных ферментов . который содержит четыре домена сапозин-B , получая активные сапозины после протеолитического расщепления, и два домена Saposin-A , которые удаляются в реакции активации. Домены сапозин-B также встречаются в других белках, многие из которых активны в лизисе мембран. ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}

Клиническое значение

Мутации в этом гене были связаны с болезнью Гоше , болезнью Тай -саха и метахроматической лейкодистрофией . ^{[ 6 ]}

Смотрите также

Сапозин белковый домен

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000197746 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000004207 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PSAP Prosaposin (вариант болезни Гоше и вариант метахроматической лейкодистрофии)» .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Morimoto S, Yamamoto Y, O'Brien JS, Kishimoto Y (май 1990). «Распределение белков сапозина (белки активатора сфинголипидов) в лизосомальном хранении и других заболеваниях» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 87 (9): 3493–7. Bibcode : 1990pnas ... 87.3493m . doi : 10.1073/pnas.87.9.3493 . PMC 53927 . PMID 2110365 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Kishimoto Y, Hiraiwa M, O'Brien JS (сентябрь 1992). «Сапозины: структура, функция, распределение и молекулярная генетика» . J. Lipid Res . 33 (9): 1255–67. doi : 10.1016/s0022-2275 (20) 40540-1 . PMID 1402395 .
^ Моримото С., Мартин Б.М., Ямамото Й., Крец К.А., О'Брайен Дж.С., Кишимото Ю (май 1989). «Сапозин А: второй белок активатора цереброзидазы» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 86 (9): 3389–93. Bibcode : 1989pnas ... 86.3389m . doi : 10.1073/pnas.86.9.3389 . PMC 287138 . PMID 2717620 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} O'Brien JS, Kishimoto Y (март 1991 г.). «Белки сапозина: структура, функция и роль в лизосомальных расстройствах хранения человека» . Faseb j . 5 (3): 301–8. doi : 10.1096/fasebj.5.3.2001789 . PMID 2001789 . S2CID 40251569 .
^ Комитет по номенклатуре Hugo Gene , «GM2A» , база данных HGNC , получена 2016-03-13 .
^ Ahn Ve, Leyko P, Alattia Jr, Chen L, Privé GG (август 2006 г.). «Кристаллические структуры сапозинов A и C» . Белок Sci . 15 (8): 1849–57. doi : 10.1110/ps.062256606 . PMC 2242594 . PMID 16823039 .
^ Ahn Ve, Faull KF, Whitelegge JP, Fluharty AL, Privé GG (январь 2003 г.). «Кристаллическая структура сапозина B выявляет димерную оболочку для липидного связывания» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 100 (1): 38–43. Bibcode : 2003pnas..100 ... 38a . doi : 10.1073/pnas.0136947100 . PMC 140876 . PMID 12518053 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Россманн М., Шульц-Хейенброк Р., Бехлке Дж., Реммел Н., Алингс С., Сандхофф К., Саенгер В., Майер Т (май 2008 г.). «Кристаллические структуры человеческих сапозинов C и D: последствия для распознавания липидов и мембранных взаимодействий» . Структура 16 (5): 809–17. doi : 10.1016/j.str.2008.02.016 . PMID 18462685 .
^ Ponting CP (1994). «Кислотная сфингомиелинназа обладает доменом, гомологичным по отношению к его активаторным белкам: сапозины B и D» . Белок Sci . 3 (2): 359–361. doi : 10.1002/pro.5560030219 . PMC 2142785 . PMID 8003971 .
^ Hofmann K, Tschopp J (1996). «Цитотоксические Т -клетки: больше оружия для новых целей?». Тенденции Микробиол . 4 (3): 91–94. doi : 10.1016/0966-842x (96) 81522-8 . PMID 8868085 .

Дальнейшее чтение

Geeselmann V, Zlotogora J, Harris A, et al. (1995). «Молекулярная генетика метахроматической лейкодистрофии » Гул мутат 4 (4): 233–4 Doi : 10.1002/ huma.1380040402 7866401PMID 23519007S2CID
Schnabel D, Schröder M, Fürst W, et al. (1992). «Одновременный дефицит белков активатора сфинголипидов 1 и 2 вызваны мутацией в кодоне инициации их общего гена» . Дж. Биол. Химический 267 (5): 3312–5. doi : 10.1016/s0021-9258 (19) 50733-5 . PMID 1371116 .
Хирайва М., Соеда С., Кишимото Й., О'Брайен Дж. С. (1993). «Переплет и транспорт ганглиозидов просопозином» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 89 (23): 11254–8. doi : 10.1073/pnas.89.23.11254 . PMC 50528 . PMID 1454804 .
Rorman EG, Scheinker V, Grabowski GA (1992). «Структура и эволюция человеческого хромосомного гена человека». Геномика . 13 (2): 312–8. doi : 10.1016/0888-7543 (92) 90247-p . PMID 1612590 .
Кондо К, Хинено Т., Сано А., Какимото Ю (1992). «Выделение и характеристика просопозина из человеческого молока». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 181 (1): 286–92. doi : 10.1016/s0006-291x (05) 81415-9 . PMID 1958198 .
Holtschmidt H, Sandhoff K, Fürst W, et al. (1991). «Организация гена для белка активатора сульфата головного мозга человека» . Фебс Летт . 280 (2): 267–70. doi : 10.1016/0014-5793 (91) 80308-P . PMID 2013321 . S2CID 38952277 .
Holtschmidt H, Sandhoff K, Kwon HY, et al. (1991). «Белок -активатор сульфатида. Альтернативный сплайсинг, который генерирует три мРНК и вновь обнаруженную мутацию, ответственную за клиническое заболевание» . Дж. Биол. Химический 266 (12): 7556–60. doi : 10.1016/s0021-9258 (20) 89483-6 . PMID 2019586 .
Хинено Т., Сано А., Кондо К. и др. (1991). «Секреция предшественника активатора гидролазы сфинголипидов, Просапозин». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 176 (2): 668–74. doi : 10.1016/s0006-291x (05) 80236-0 . PMID 2025281 .
Schnabel D, Schröder M, Sandhoff K (1991). «Мутация в белке 2 активатора сфинголипидов у пациента с вариантом болезни Гоше». Фебс Летт . 284 (1): 57–9. doi : 10.1016/0014-5793 (91) 80760-z . PMID 2060627 . S2CID 42681055 .
Чжан XL, Рафи М.А., Дегала Г., Венгер Д.А. (1991). «Механизм для вставки 33-нуклеотидов в мРНК, вызывающую метахроматическую лейкодистрофию с сфинголипидным активатором (SAP-1)». Гул Генет . 87 (2): 211–5. doi : 10.1007/bf00204185 . PMID 2066109 . S2CID 23791396 .
Fürst W, Schubert J, Machleidt W, et al. (1990). «Полные аминокислотные последовательности белка активатора ганглиозида человека GM2 и белка активатора сульфата цереброзида». Евро. J. Biochem . 192 (3): 709–14. doi : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb19280.x . PMID 2209618 .
Рафи М.А., Чжан XL, Дегала Г., Венгер Д.А. (1990). «Обнаружение точечной мутации в мРНК белка-активатора сфинголипидов у пациентов с вариантной формой метахроматической лейкодистрофии». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 166 (2): 1017–23. doi : 10.1016/0006-291x (90) 90912-7 . PMID 2302219 .
Kretz KA, Carson GS, Morimoto S, et al. (1990). «Характеристика мутации в семействе с дефицитом сапозина B: дефект сайта гликозилирования» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 87 (7): 2541–4. Bibcode : 1990pnas ... 87.2541K . doi : 10.1073/pnas.87.7.2541 . PMC 53725 . PMID 2320574 .
Накано Т., Сандхофф К., Стюмпер Дж. И др. (1989). «Структура полноразмерной кДНК, кодирующейся для сульфатидного активатора, со-бета-глюкозидазы и двух других гомологичных белков: две альтернативные формы активатора сульфатида». J. Biochem . 105 (2): 152–4. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a122629 . PMID 2498298 .
Rorman EG, Grabowski GA (1990). «Молекулярное клонирование кДНК-адвоката человека-глюкозидазы: свидетельство того, что четыре белки активатора гидролазы сфинголипидов кодируются отдельными генами у людей и крыс». Геномика . 5 (3): 486–92. doi : 10.1016/0888-7543 (89) 90014-1 . PMID 2515150 .
Morimoto S, Martin BM, Yamamoto Y, et al. (1989). «Сапозин А: второй белок активатора цереброзидазы» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 86 (9): 3389–93. Bibcode : 1989pnas ... 86.3389m . doi : 10.1073/pnas.86.9.3389 . PMC 287138 . PMID 2717620 .
Dewji NN, Wenger DA, O'Brien JS (1988). «Нуклеотидная последовательность клонированной кДНК для предшественника белка 1 активатора человека» человека » . Прокурор Нат. Академический Наука США . 84 (23): 8652–6. doi : 10.1073/pnas.84.23.8652 . PMC 299604 . PMID 2825202 .
O'Brien JS, Kretz KA, Dewji N, et al. (1988). «Кодирование двух белков активатора сфинголипидов (SAP-1 и SAP-2) по одному генетическому локусу». Наука . 241 (4869): 1098–101. Bibcode : 1988sci ... 241.1098o . doi : 10.1126/science.2842863 . PMID 2842863 .
Моримото С., Мартин Б.М., Кишимото Ю., О'Брайен Дж. С. (1988). «Сапозин D: активатор сфингомиелиназы» . Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 156 (1): 403–10. doi : 10.1016/s0006-291x (88) 80855-6 . PMID 2845979 .
Dewji N, Wenger D, Fujibayashi S, et al. (1986). «Молекулярное клонирование белка-1 активатора сфинголипида (SAP-1), активатор сульфатидсульфатазы». Биохимия. Биофиз. Резерв Общение 134 (2): 989–94. doi : 10.1016/s0006-291x (86) 80518-6 . PMID 2868718 .

Внешние ссылки

Сапозины в Национальной медицинской библиотеке Медицинской библиотеки США (Mesh)

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000197746 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000004207 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PSAP Prosaposin (вариант болезни Гоше и вариант метахроматической лейкодистрофии)» .

[pmid2110365-6] Jump up to: ^а ^{беременный} Morimoto S, Yamamoto Y, O'Brien JS, Kishimoto Y (май 1990). «Распределение белков сапозина (белки активатора сфинголипидов) в лизосомальном хранении и других заболеваниях» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 87 (9): 3493–7. Bibcode : 1990pnas ... 87.3493m . doi : 10.1073/pnas.87.9.3493 . PMC 53927 . PMID 2110365 .

[pmid1402395-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Kishimoto Y, Hiraiwa M, O'Brien JS (сентябрь 1992). «Сапозины: структура, функция, распределение и молекулярная генетика» . J. Lipid Res . 33 (9): 1255–67. doi : 10.1016/s0022-2275 (20) 40540-1 . PMID 1402395 .

[pmid2717620-8] Моримото С., Мартин Б.М., Ямамото Й., Крец К.А., О'Брайен Дж.С., Кишимото Ю (май 1989). «Сапозин А: второй белок активатора цереброзидазы» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 86 (9): 3389–93. Bibcode : 1989pnas ... 86.3389m . doi : 10.1073/pnas.86.9.3389 . PMC 287138 . PMID 2717620 .

[pmid2001789-9] Jump up to: ^а ^{беременный} O'Brien JS, Kishimoto Y (март 1991 г.). «Белки сапозина: структура, функция и роль в лизосомальных расстройствах хранения человека» . Faseb j . 5 (3): 301–8. doi : 10.1096/fasebj.5.3.2001789 . PMID 2001789 . S2CID 40251569 .

[hgnc_id_4367-10] Комитет по номенклатуре Hugo Gene , «GM2A» , база данных HGNC , получена 2016-03-13 .

[pmid16823039-11] Ahn Ve, Leyko P, Alattia Jr, Chen L, Privé GG (август 2006 г.). «Кристаллические структуры сапозинов A и C» . Белок Sci . 15 (8): 1849–57. doi : 10.1110/ps.062256606 . PMC 2242594 . PMID 16823039 .

[pmid12518053-12] Ahn Ve, Faull KF, Whitelegge JP, Fluharty AL, Privé GG (январь 2003 г.). «Кристаллическая структура сапозина B выявляет димерную оболочку для липидного связывания» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 100 (1): 38–43. Bibcode : 2003pnas..100 ... 38a . doi : 10.1073/pnas.0136947100 . PMC 140876 . PMID 12518053 .

[pmid18462685-13] Jump up to: ^а ^{беременный} Россманн М., Шульц-Хейенброк Р., Бехлке Дж., Реммел Н., Алингс С., Сандхофф К., Саенгер В., Майер Т (май 2008 г.). «Кристаллические структуры человеческих сапозинов C и D: последствия для распознавания липидов и мембранных взаимодействий» . Структура 16 (5): 809–17. doi : 10.1016/j.str.2008.02.016 . PMID 18462685 .

[PUB00005721-14] Ponting CP (1994). «Кислотная сфингомиелинназа обладает доменом, гомологичным по отношению к его активаторным белкам: сапозины B и D» . Белок Sci . 3 (2): 359–361. doi : 10.1002/pro.5560030219 . PMC 2142785 . PMID 8003971 .

[PUB00005765-15] Hofmann K, Tschopp J (1996). «Цитотоксические Т -клетки: больше оружия для новых целей?». Тенденции Микробиол . 4 (3): 91–94. doi : 10.1016/0966-842x (96) 81522-8 . PMID 8868085 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]