НАДН-дегидрогеназа (убихинон), альфа 1

НДУФА1
Идентификаторы
Псевдонимы	NDUFA1 , CI-MWFE, MWFE, ZNF183, НАДН-дегидрогеназа (убихинон), альфа-1, субъединица А1 НАДН:убихиноноксидоредуктазы, MC1DN12
Внешние идентификаторы	Опустить : 300078 ; МГИ : 1929511 ; Гомологен : 3337 ; Генные карты : NDUFA1 ; OMA : NDUFA1 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	X chromosome (human)
End	119,876,662 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	X chromosome (mouse)
End	36,454,816 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	myocardium of left ventricle; ; right ventricle; ; apex of heart; ; right auricle; ; cardiac muscle tissue of right atrium; ; mucosa of transverse colon; ; Brodmann area 10; ; renal medulla; ; Brodmann area 9; ; muscle of thigh;
	Top expressed in
	Epithelium of choroid plexus; ; seminal vesicula; ; facial motor nucleus; ; vestibular membrane of cochlear duct; ; vestibular sensory epithelium; ; epithelium of lens; ; molar; ; right kidney; ; lobe of prostate; ; extraocular muscle;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity;
Cellular component	integral component of membrane; mitochondrion; mitochondrial respiratory chain complex I; respirasome; mitochondrial inner membrane; membrane; mitochondrial membranes; cytosol;
Biological process	mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone; mitochondrial respiratory chain complex I assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4694
	54405
	ENSG00000125356
	ENSMUSG00000016427
	О15239
	О35683
	НМ_004541
	НМ_019443
	НП_004532
	НП_062316
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 1 альфа-подкомплекса НАДН-дегидрогеназы [убихинон] 1 представляет собой белок , который у человека кодируется NDUFA1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Белок NDUFA1 представляет собой субъединицу НАДН-дегидрогеназы (убихинона) , которая расположена во внутренней мембране митохондрий и является крупнейшим из пяти комплексов цепи переноса электронов . ^{[ 7 ]} Мутации гена NDUFA1 связаны с митохондриального комплекса I. дефицитом ^{[ 6 ]}

Структура

Ген NDUFA1 расположен на длинном плече q Х-хромосомы в положении 24 и охватывает 5176 пар оснований. ^{[ 6 ]} Ген NDUFA1 производит белок массой 8,1 кДа, состоящий из 70 аминокислот . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} NDUFA1 — субъединица фермента НАДН-дегидрогеназы (убихинона) , крупнейшего из дыхательных комплексов. Структура имеет L-образную форму с длинным гидрофобным трансмембранным доменом и гидрофильным доменом периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания НАДН. ^{[ 7 ]} NDUFA1 является одной из примерно 31 гидрофобной субъединицы, образующей трансмембранную область Комплекса I. Было отмечено, что N-концевой гидрофобный домен может сворачиваться в альфа-спираль, охватывающую внутреннюю митохондриальную мембрану с C-концевым гидрофильным доменом. взаимодействующих с глобулярными субъединицами Комплекса I. Высококонсервативная двухдоменная структура позволяет предположить, что эта особенность имеет решающее значение для функции белка и что гидрофобный домен действует как якорь для комплекса НАДН-дегидрогеназы (убихинон) на внутренней митохондриальной мембране. ^{[ 6 ]}

Функция

Человеческий ген NDUFA1 кодирует субъединицу комплекса I дыхательной цепи , которая переносит электроны от НАДН к убихинону . ^{[ 6 ]} Однако NDUFA1 является вспомогательной субъединицей комплекса, которая, как полагают, не участвует в катализе. ^{[ 10 ]} Первоначально НАДН связывается с Комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо протезного плеча флавинмононуклеотида (FMN ) с образованием FMNH ₂ . Электроны передаются через серию железо-серных кластеров (Fe-S) в протезной руке и, наконец, к коферменту Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинола (CoQH ₂ ). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и сдвигу p K ионизируемой боковой цепи, которая выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса. ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

Дефицит митохондриального комплекса I (MT-C1D) вызван мутациями, затрагивающими ген NDUFA1 . Дефицит комплекса I представляет собой нарушение дыхательной цепи митохондрий, которое вызывает широкий спектр клинических проявлений: от летального неонатального заболевания до нейродегенеративных расстройств, возникающих во взрослом возрасте. Фенотипы включают макроцефалию с прогрессирующей лейкодистрофией , неспецифическую энцефалопатию , кардиомиопатию , миопатию , заболевание печени , синдром Лея , наследственную оптическую нейропатию Лебера и некоторые формы болезни Паркинсона . ^{[ 6 ]}^{[ 10 ]} Мутации Х-хромосомы , влияющие на этот ген, включают мутацию G94C, которая связана с лактоацидозом , гипотонией , увеличением соотношения бета-гидроксибутират / ацетоацетат и дефицитом комплекса I. ^{[ 11 ]}

Взаимодействия

Было показано, что NDUFA1 имеет 7 бинарных белок-белковых взаимодействий, включая 3 кокомплексных взаимодействия. NDUFA1, по-видимому, взаимодействует с GOLGB1 , TRIM63 и SMURF2 . ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000125356 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000016427 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Жученко О., Венерт М., Бэйли Дж., Сан З.С., Ли К.С. (ноябрь 1996 г.). «Выделение, картирование и геномная структура Х-связанного гена субъединицы митохондриального комплекса I человека». Геномика . 37 (3): 281–8. дои : 10.1006/geno.1996.0561 . ПМИД 8938439 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж «Ген Энтреза: субкомплекс NDUFA1 НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 альфа, 1, 7,5 кДа» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Дональд Воэт; Джудит Г. Воэт; Шарлотта В. Пратт (2013). "18" Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 100-1 581–620. ISBN 9780470547847 .
^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
^ «NDUFA1-НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-подкомплекс, субъединица 1» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .
^ Jump up to: ^а ^б «NDUFA1-НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-подкомплекс, субъединица 1» . UniProt: центр информации о белках . Консорциум UniProt . Проверено 24 марта 2015 г.
^ Майр Дж.А., Бодамер О., Хаак Т.Б., Циммерманн Ф.А., Мадинье Ф., Прокиш Х., Раушер С., Кох Дж., Сперл В. (август 2011 г.). «Гетерозиготная мутация в гене NDUFA1 Х-хромосомы у девочки с дефицитом комплекса I». Молекулярная генетика и обмен веществ . 103 (4): 358–61. дои : 10.1016/j.ymgme.2011.04.010 . ПМИД 21596602 .
^ «По запросу NDUFA1 найдено 7 бинарных взаимодействий» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.

Дальнейшее чтение

Смитинк Дж., ван ден Хевел Л. (июнь 1999 г.). «Митохондриальный комплекс человека I в норме и болезни» . Американский журнал генетики человека . 64 (6): 1505–10. дои : 10.1086/302432 . ПМЦ 1377894 . ПМИД 10330338 .
Треттер Л., Сипос И., Адам-Визи В. (март 2004 г.). «Инициирование повреждения нейронов дефицитом комплекса I и окислительным стрессом при болезни Паркинсона». Нейрохимические исследования . 29 (3): 569–77. дои : 10.1023/B:NERE.0000014827.94562.4b . ПМИД 15038604 . S2CID 38103900 .
Фраттини А., Фаранда С., Баньяско Л., Патроссо С., Нулли П., Зукки И., Веццони П. (июнь 1997 г.). «Идентификация нового члена (ZNF183) семейства генов безымянного пальца в Xq24-25». Джин . 192 (2): 291–8. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00108-X . ПМИД 9224902 .
Леффен Дж.Л., Трипельс Р.Х., ван ден Хеувел Л.П., Шуэльке М., Бушенс К.А., Смитс Р.Дж., Трийбелс Дж.М., Смейтинк Дж.А. (декабрь 1998 г.). «КДНК восьми ядерно-кодируемых субъединиц НАДН:убихиноноксидоредуктазы: завершена характеристика кДНК человеческого комплекса I». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 253 (2): 415–22. дои : 10.1006/bbrc.1998.9786 . ПМИД 9878551 .
Ау ХК, Со Б.Б., Мацуно-Яги А., Яги Т., Шеффлер И.Е. (апрель 1999 г.). «Продукт гена NDUFA1 (белок MWFE) необходим для активности комплекса I в митохондриях млекопитающих» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (8): 4354–9. Бибкод : 1999PNAS...96.4354A . дои : 10.1073/pnas.96.8.4354 . ПМК 16336 . ПМИД 10200266 .
Ядава Н., Потлури П., Смит Э.Н., Бисевац А., Шеффлер И.Е. (июнь 2002 г.). «Видоспецифичные и мутантные белки MWFE. Их влияние на сборку функционального митохондриального комплекса I млекопитающих» . Журнал биологической химии . 277 (24): 21221–30. дои : 10.1074/jbc.M202016200 . ПМИД 11937507 .
Ю-Вай-Ман П., Браун Д.Т., Венерт М.С., Зевиани М., Каррара Ф., Тернбулл Д.М., Чиннери П.Ф. (июнь 2002 г.). «NDUFA-1 не является геном-модификатором ядра при наследственной оптической невропатии Лебера». Неврология . 58 (12): 1861–2. дои : 10.1212/wnl.58.12.1861 . ПМИД 12084895 . S2CID 36459818 .
Мамелак А.Дж., Ковальски Дж., Мерфи К., Ядава Н., Захурак М., Куба Дж., Хауэлл Б.Г., Цзы Дж., Камминс Д.Л., Льежуа Н.Дж., Берг К., Саудер Д.Н. (май 2005 г.). «Понижение уровня NDUFA1 и других генов, связанных с окислительным фосфорилированием, является характерной особенностью базальноклеточной карциномы». Экспериментальная дерматология . 14 (5): 336–48. дои : 10.1111/j.0906-6705.2005.00278.x . ПМИД 15854127 . S2CID 24497641 .
Фогель Р.О., Дитерен К.Э., ван ден Хеувел Л.П., Виллемс П.Х., Смейтинк Дж.А., Купман В.Дж., Нейтманс Л.Г. (март 2007 г.). «Идентификация промежуточных продуктов сборки митохондриального комплекса I путем отслеживания меченого NDUFS3 демонстрирует точку входа митохондриальных субъединиц» . Журнал биологической химии . 282 (10): 7582–90. дои : 10.1074/jbc.M609410200 . hdl : 2066/52607 . ПМИД 17209039 .
Фернандес-Морейра Д., Угальде С., Смитс Р., Роденбург Р.Дж., Лопес-Ласо Е., Руис-Фалько М.Л., Брионес П., Мартин М.А., Смейтинк Дж.А., Аренас Дж. (январь 2007 г.). «Х-сцепленные мутации гена NDUFA1, связанные с митохондриальной энцефаломиопатией». Анналы неврологии 61 (1): 73–8 дои : 10.1002/ана.21036 . ПМИД 17262856 . S2CID 25862677 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000125356 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000016427 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid8938439-5] Жученко О., Венерт М., Бэйли Дж., Сан З.С., Ли К.С. (ноябрь 1996 г.). «Выделение, картирование и геномная структура Х-связанного гена субъединицы митохондриального комплекса I человека». Геномика . 37 (3): 281–8. дои : 10.1006/geno.1996.0561 . ПМИД 8938439 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж «Ген Энтреза: субкомплекс NDUFA1 НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 альфа, 1, 7,5 кДа» .

[Biochem-7] Jump up to: ^а ^б ^с Дональд Воэт; Джудит Г. Воэт; Шарлотта В. Пратт (2013). "18" Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 100-1 581–620. ISBN 9780470547847 .

[COPaKB-8] Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .

[url_COPaKB-9] «NDUFA1-НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-подкомплекс, субъединица 1» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .

[uniprot-10] Jump up to: ^а ^б «NDUFA1-НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-подкомплекс, субъединица 1» . UniProt: центр информации о белках . Консорциум UniProt . Проверено 24 марта 2015 г.

[11] Майр Дж.А., Бодамер О., Хаак Т.Б., Циммерманн Ф.А., Мадинье Ф., Прокиш Х., Раушер С., Кох Дж., Сперл В. (август 2011 г.). «Гетерозиготная мутация в гене NDUFA1 Х-хромосомы у девочки с дефицитом комплекса I». Молекулярная генетика и обмен веществ . 103 (4): 358–61. дои : 10.1016/j.ymgme.2011.04.010 . ПМИД 21596602 .

[12] «По запросу NDUFA1 найдено 7 бинарных взаимодействий» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]