Изоцитрат эпимераза
| Изоцитрат эпимераза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 5.1.2.6 | ||
| Номер CAS. | 81210-68-6 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
В энзимологии изоцитратэпимеразу EC классифицируют следующим образом : 5.1.2.6 . Это число указывает на то, что это изомераза , а именно рацемаза или эпимераза , которая действует на гидроксикислоты и их производные, а именно изоцитрат . [ 1 ] Изоцитратэпимераза специфически катализирует обратимую реакцию: [ 2 ]
- (1 R ,2 S )-1-гидроксипропан-1,2,3-трикарбоксилат ↔ (1 S ,2 S )-1-гидроксипропан-1,2,3-трикарбоксилат
который также можно описать как
- D -трео-изоцитрат ↔ D -эритро-изоцитрат
История
[ редактировать ]Изоцитратэпимераза была первоначально выделена из бесклеточного экстракта грибов Penicillium purpurogenum. [ 3 ] , где он был обнаружен вследствие избыточного накопления L -аллоизоцитратной кислоты ( D -эритроизоцитрата) — диастереомера изоцитрата, ранее не встречавшегося в природе. Чтобы накопить L -аллоизоцитриновую кислоту в качестве продукта ферментации , P. purpurogenum необходимо было выращивать на питательном агаре с добавкой цитрата . [ 3 ] [ 4 ] В ходе этой ферментации было обнаружено, что выход L -аллоизоцитриновой кислоты при ферментации может «превышать 70% без образования каких-либо других стереоизомеров изоцитировой кислоты или других метаболитов». [ 3 ]
Этот фермент не подвергался тщательному изучению с момента его первого обнаружения в 1982 году, в результате чего в настоящее время не существует кристаллической структуры или описания активного центра изоцитратэпимеразы. Другие изоцитратные ферменты, такие как изоцитратлиаза и изоцитратдегидрогеназа, были изучены более тщательно из-за их ключевой роли в гликолизе и цикле ТСА .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «БРЕНДА - Информация о EC 5.1.2.6 - изоцитратэпимераза» . www.brenda-enzymes.org . Проверено 22 октября 2021 г.
- ^ «РЕАКЦИЯ БОЧКИ: R02318» . www.genome.jp . Проверено 22 октября 2021 г.
- ^ Jump up to: а б с Хошико С., Кунимото Ю., Арима К., Беппу Т. (январь 1982 г.). «Механизм ферментации L-аллоизоцитриновой кислоты: активность изоцитрат-эпимеразы в бесклеточном экстракте Penicillium purpurogenum» . Сельскохозяйственная и биологическая химия . 46 (1): 143–151. дои : 10.1080/00021369.1982.10865025 . ISSN 0002-1369 .
- ^ Беппу Т., Абэ С., Сакагути К. (декабрь 2004 г.). «Накопление алло-изолимонной кислоты штаммом Penicillium» . Журнал общей и прикладной микробиологии . 50 (6): 345–352. ПМИД 15965889 .
