Белок, связывающий витамин D

ГК
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1J78, 1J7E, 1KW2, 1KXP, 1LOT, 1MA9
Идентификаторы
Псевдонимы	GC , DBP, DBP/GRD3, HEL-S-51, VDBG, VDBP, Gc-MAF, GcMAF, белок, связывающий витамин D, DBP-maf, VDB, GC белок, связывающий витамин D
Внешние идентификаторы	Опустить : 139200 ; МГИ : 95669 ; Гомологен : 486 ; GeneCards : GC ; ОМА : GC — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 4 (human)
End	71,804,041 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 5 (mouse)
End	89,605,757 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	liver; ; right lobe of liver; ; gallbladder; ; pancreatic ductal cell; ; beta cell; ; duodenum; ; body of pancreas; ; jejunal mucosa; ; testicle; ; gonad;
	Top expressed in
	left lobe of liver; ; gallbladder; ; islet of Langerhans; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; human fetus; ; right kidney; ; human kidney; ; sexually immature organism; ; morula; ; stomach;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	vitamin D binding; calcidiol binding; actin binding; vitamin transmembrane transporter activity;
Cellular component	blood microparticle; extracellular region; lysosomal lumen; extracellular exosome; extracellular space; cytosol;
Biological process	vitamin D metabolic process; vitamin transport; transport; vitamin transmembrane transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	2638
	14473
	ENSG00000145321
	ENSMUSG00000035540
	P02774
	P21614
	НМ_000583 ; НМ_001204306 ; НМ_001204307
	НМ_008096
	НП_000574 ; НП_001191235 ; НП_001191236
	НП_032122
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Витамин D-связывающий белок (DBP), также/первоначально известный как gc-глобулин ( группоспецифический компонент , ), представляет собой белок который у человека кодируется GC геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} DBP является генетически старейшим членом семейства альбуминоидов и появился на ранних стадиях эволюции позвоночных. ^{[ 7 ]}

Структура

Человеческий GC представляет собой гликозилированный альфа-глобулин размером ~58 кДа. Его 458 аминокислот кодируются 1690 нуклеотидами на хромосоме 4 (4q11–q13). Первичная структура содержит 28 остатков цистеина, образующих множественные дисульфидные связи. GC содержит 3 домена. Домен 1 состоит из 10 альфа-спиралей, домен 2 из 9 и домен 3 из 4. ^{[ 8 ]}

Функция

Белок, связывающий витамин D, принадлежит к семейству генов альбумина вместе с сывороточным альбумином человека и альфа-фетопротеином . Это многофункциональный белок, обнаруженный в плазме, асцитической жидкости , спинномозговой жидкости и на поверхности многих типов клеток.

Он способен связывать различные формы витамина D, включая эргокальциферол (витамин D2 ₎ и холекальциферол (витамин D3 ₎ , 25-гидроксилированные формы ( кальцифедиол ) и активный гормональный продукт 1,25-дигидроксивитамин D ( кальцитриол ). . Основная часть витамина D в крови связана с этим белком. Он транспортирует метаболиты витамина D между кожей, печенью и почками, а затем к различным тканям-мишеням. ^{[ 6 ]}^{[ 9 ]}

В качестве фактора активации макрофагов, полученного из белка Gc, он представляет собой фактор активации макрофагов (MAF), который был протестирован для использования в качестве средства лечения рака, которое активирует макрофаги против раковых клеток. ^{[ 10 ]}

Интерактивная карта маршрутов

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьям. ^{[ § 1 ]}

[[Файл:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

|alt=Путь синтеза витамина D ( просмотреть / редактировать )]]

Путь синтеза витамина D ( просмотреть / редактировать )

^ Интерактивную карту маршрутов можно редактировать на WikiPathways: «ВитаминDSynthesis_WP1531» .

Производство

Он синтезируется паренхиматозными клетками печени и секретируется в кровоток . ^{[ 9 ]}

Регулирование

Факторы транскрипции HFN1α являются положительным регулятором, тогда как HFN1β является доминантным негативным регулятором экспрессии DBP. ^{[ 11 ]}

Вариация

множество генетических вариантов гена GC Известно . Они производят 6 основных гаплотипов и 3 основных варианта белка (Gc1S, Gc1F и Gc2). ^{[ 12 ]} Генетические вариации связаны с различиями в уровнях циркулирующего 25-гидроксивитамина D. ^{[ 13 ]} Было предложено объяснить некоторые различия в статусе витамина D в разных этнических группах. ^{[ 14 ]} Было обнаружено, что они коррелируют с реакцией на добавки витамина D. ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000145321 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035540 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Миккельсен М., Якобсен П., Хеннингсен К. (июль 1977 г.). «Возможная локализация системы Gc на хромосоме 4. Потеря материала длинного плеча 4, связанная с несовместимостью отца и ребенка внутри системы Gc». Наследственность человека . 27 (2): 105–7. дои : 10.1159/000152857 . ПМИД 558959 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: компонент, специфичный для группы GC (белок, связывающий витамин D)» .
^ Бульон, Р.; Шуит, Ф.; Антонио, Л.; Растинежад, Ф. (2020). «Белок, связывающий витамин D: исторический обзор» . Границы эндокринологии . 10 :910. дои : 10.3389/fendo.2019.00910 . ПМК 6965021 . ПМИД 31998239 .
^ Вербовен С., Рабинс А., Де Майер М., Ван Баелен Х., Бульон Р., Де Рантер С. (февраль 2002 г.). «Структурная основа уникальных свойств связывания человеческого белка, связывающего витамин D». Структурная биология природы . 9 (2): 131–6. дои : 10.1038/nsb754 . ПМИД 11799400 . S2CID 38990672 .
^ Jump up to: ^а ^б Норман А.В. (август 2008 г.). «От витамина D к гормону D: основы эндокринной системы витамина D, необходимые для хорошего здоровья» . Американский журнал клинического питания . 88 (2): 491С–499С. дои : 10.1093/ajcn/88.2.491S . ПМИД 18689389 .
^ Ямамото Н., Суяма Х., Ямамото Н. (июль 2008 г.). «Иммунотерапия рака простаты с помощью фактора активации макрофагов, полученного из белка Gc, GcMAF» ([PDF]) . Трансляционная онкология . 1 (2): 65–72. дои : 10.1593/tlo.08106 . ПМК 2510818 . ПМИД 18633461 .
^ Буйон Р., Шуит Ф., Антонио Л., Растинежад Ф. (2019). «Белок, связывающий витамин D: исторический обзор» . Границы эндокринологии . 10 :910. дои : 10.3389/fendo.2019.00910 . ПМК 6965021 . ПМИД 31998239 .
^ Jump up to: ^а ^б Малик С., Фу Л., Джурас Дж., Кармали М., Вонг Б.И., Гоздзик А., Коул Д.Е. (январь – февраль 2013 г.). «Распространенные варианты гена белка, связывающего витамин D, и неблагоприятные последствия для здоровья» . Критические обзоры клинических лабораторных наук . 50 (1): 1–22. дои : 10.3109/10408363.2012.750262 . ПМЦ 3613945 . ПМИД 23427793 .
^ МакГрат Дж.Дж., Саха С., Бёрн Т.Х., Эйлс Д.В. (июль 2010 г.). «Систематический обзор связи между частыми однонуклеотидными полиморфизмами и концентрациями 25-гидроксивитамина D». Журнал биохимии стероидов и молекулярной биологии . 121 (1–2): 471–7. дои : 10.1016/j.jsbmb.2010.03.073 . ПМИД 20363324 . S2CID 20057294 .
^ Пау С.Э., Эванс М.К., Венгер Дж., Зондерман А.Б., Берг А.Х., Ноллс М., Тамез Х., Чжан Д., Бхан И., Каруманчи С.А., Пау Н.Р., Тадхани Р. (ноябрь 2013 г.). «Витамин D-связывающий белок и статус витамина D у чернокожих и белых американцев» . Медицинский журнал Новой Англии . 369 (21): 1991–2000. дои : 10.1056/NEJMoa1306357 . ПМК 4030388 . ПМИД 24256378 .

Дальнейшее чтение

Свасти Дж., Куроски А., Беннетт А., Боуман Б.Х. (апрель 1979 г.). «Молекулярная основа трех основных форм человеческого сывороточного белка, связывающего витамин D (групповой компонент)». Биохимия . 18 (8): 1611–7. дои : 10.1021/bi00575a036 . ПМИД 218624 .
Браун А., Бичльмайер Р., Клив Х. (июнь 1992 г.). «Молекулярный анализ гена человеческого витамина-D-связывающего белка (группоспецифический компонент): аллельные различия общих генетических типов GC». Генетика человека . 89 (4): 401–6. дои : 10.1007/BF00194311 . ПМИД 1352271 . S2CID 1913655 .
Эстебан С., Гескенс М., Эна Дж.М., Мишал З., Мачо А., Торрес Дж.М., Уриэль Дж. (май 1992 г.). «Рецепторно-опосредованный захват и обработка витамина D-связывающего белка в B-лимфоидных клетках человека» . Журнал биологической химии . 267 (14): 10177–83. дои : 10.1016/S0021-9258(19)50216-2 . ПМИД 1374401 .
Шпирер С., Ривьер М., Кортезе Р., Накамура Т., Ислам М.К., Леван Г., Шпирер Дж. (июнь 1992 г.). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C/EBP, DBP и HNF1/LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1 соответственно) и фактора роста гепатоцитов». ген фактора рассеяния (HGF)». Геномика . 13 (2): 293–300. дои : 10.1016/0888-7543(92)90245-N . ПМИД 1535333 .
Доусон С.Дж., Уайт, Лос-Анджелес (май 1992 г.). «Лечение эндокардита, вызванного Haemophilus aphrophilus, ципрофлоксацином». Журнал инфекции . 24 (3): 317–20. дои : 10.1016/S0163-4453(05)80037-4 . ПМИД 1602151 .
Ян Ф., Бержерон Дж.М., Линехан Л.А., Лэлли П.А., Сакагути А.Ю., Боуман Б.Х. (август 1990 г.). «Картирование и сохранение гена компонента, специфичного для группы, у мышей». Геномика . 7 (4): 509–16. дои : 10.1016/0888-7543(90)90193-X . ПМИД 1696927 .
Ян Ф., Луна В.Дж., Макэнелли Р.Д., Наберхаус К.Х., Капплс Р.Л., Боуман Б.Х. (ноябрь 1985 г.). «Эволюционные и структурные взаимоотношения между группоспецифичным компонентом, альбумином и альфа-фетопротеином» . Исследования нуклеиновых кислот . 13 (22): 8007–17. дои : 10.1093/нар/13.22.8007 . ПМК 322106 . ПМИД 2415926 .
Ян Ф., Брюн Дж.Л., Нейлор С.Л., Капплс Р.Л., Наберхаус К.Х., Боуман Б.Х. (декабрь 1985 г.). «Групповой компонент человека (Gc) является членом семейства альбуминов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (23): 7994–8. Бибкод : 1985PNAS...82.7994Y . дои : 10.1073/pnas.82.23.7994 . ПМЦ 391428 . ПМИД 2415977 .
Кук Н.Э., Дэвид Э.В. (декабрь 1985 г.). «Сывороточный белок, связывающий витамин D, является третьим членом семейства генов альбумина и альфа-фетопротеина» . Журнал клинических исследований . 76 (6): 2420–4. дои : 10.1172/JCI112256 . ПМК 424397 . ПМИД 2416779 .
Шентген Ф., Мец-Бутиг М.Х., Жоллес Дж., Констанс Дж., Жоллес П. (июнь 1986 г.). «Полная аминокислотная последовательность человеческого витамина D-связывающего белка (группоспецифический компонент): свидетельство трехкратной внутренней гомологии, как в сывороточном альбумине и альфа-фетопротеине». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 871 (2): 189–98. дои : 10.1016/0167-4838(86)90173-1 . ПМИД 2423133 .
Макнирни Т.А., Оделл С., Холерс В.М., Спир П.Г., Аткинсон Дж.П. (ноябрь 1987 г.). «Гликопротеины вируса простого герпеса gC-1 и gC-2 связываются с третьим компонентом комплемента и обеспечивают защиту от опосредованной комплементом нейтрализации вирусной инфекционности» . Журнал экспериментальной медицины . 166 (5): 1525–35. дои : 10.1084/jem.166.5.1525 . ПМК 2189652 . ПМИД 2824652 .
Ян Ф., Наберхаус К.Х., Адриан Г.С., Гарделла Дж.М., Бриссенден Дж.Э., Боуман Б.Х. (1987). «Ген витамина D-связывающего белка содержит консервативные нуклеотидные последовательности, которые реагируют на сигналы тяжелых металлов, адипоцитов и митотики». Джин . 54 (2–3): 285–90. дои : 10.1016/0378-1119(87)90499-9 . ПМИД 2958390 .
Кук Н.Э., Уиллард Х.Ф., Дэвид Э.В., Джордж Д.Л. (июль 1986 г.). «Прямое региональное отнесение гена белка, связывающего витамин D (Gc-глобулин), к хромосоме человека 4q11-q13 и идентификация связанного с ним полиморфизма ДНК». Генетика человека . 73 (3): 225–9. дои : 10.1007/BF00401232 . ПМИД 3015768 . S2CID 38816588 .
Нестлер Дж. Э., Маклеод Дж. Ф., Ковальски М. А., Штраус Дж. Ф., Хаддад Дж. Г. (май 1987 г.). «Обнаружение белка, связывающего витамин D, на поверхности цитотрофобластов, выделенных из плаценты человека». Эндокринология . 120 (5): 1996–2002. doi : 10.1210/endo-120-5-1996 . ПМИД 3552627 .
Пирс Э.А., Дам MC, Бульон Р., Ван Баелен Х., ДеЛука Х.Ф. (декабрь 1985 г.). «Моноклональные антитела к белку, связывающему витамин D человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 82 (24): 8429–33. Бибкод : 1985PNAS...82.8429P . дои : 10.1073/pnas.82.24.8429 . ПМЦ 390929 . ПМИД 3936035 .
Вутен М.В., Нел А.Е., Гольдшмидт-Клермон П.Дж., Гэлбрейт Р.М., Ренн Р.В. (октябрь 1985 г.). «Идентификация основного эндогенного субстрата фосфолипидной/Ca2+-зависимой киназы в ацинусах поджелудочной железы в виде Gc (витамин D-связывающий белок)» . Письма ФЭБС . 191 (1): 97–101. дои : 10.1016/0014-5793(85)81001-2 . ПМИД 4054306 . S2CID 29613843 .
Констанс Дж., Оксман Ф., Виау М. (август 1981 г.). «Связывание апо- и голо-форм сывороточного белка, связывающего витамин D, с цитоплазмой и мембраной лимфоцитов человека методом непрямой иммунофлуоресценции». Письма по иммунологии . 3 (3): 159–62. дои : 10.1016/0165-2478(81)90120-6 . ПМИД 7026425 .
Браун А., Кофлер А., Моравец С., Клив Х. (декабрь 1993 г.). «Последовательность и организация гена человеческого витамина D-связывающего белка». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1216 (3): 385–94. дои : 10.1016/0167-4781(93)90005-х . ПМИД 7505619 .
Свами Н., Рой А., Чанг Р., Бриссон М., Рэй Р. (апрель 1995 г.). «Аффинная очистка витамина D-связывающего белка плазмы человека» . Экспрессия и очистка белков . 6 (2): 185–8. дои : 10.1006/prep.1995.1023 . ПМИД 7606167 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P02774 (белок, связывающий витамин D) в PDBe-KB .

[WikiPathways-11] Интерактивную карту маршрутов можно редактировать на WikiPathways: «ВитаминDSynthesis_WP1531» .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000145321 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035540 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid558959-5] Миккельсен М., Якобсен П., Хеннингсен К. (июль 1977 г.). «Возможная локализация системы Gc на хромосоме 4. Потеря материала длинного плеча 4, связанная с несовместимостью отца и ребенка внутри системы Gc». Наследственность человека . 27 (2): 105–7. дои : 10.1159/000152857 . ПМИД 558959 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: компонент, специфичный для группы GC (белок, связывающий витамин D)» .

[7] Бульон, Р.; Шуит, Ф.; Антонио, Л.; Растинежад, Ф. (2020). «Белок, связывающий витамин D: исторический обзор» . Границы эндокринологии . 10 :910. дои : 10.3389/fendo.2019.00910 . ПМК 6965021 . ПМИД 31998239 .

[pmid11799400-8] Вербовен С., Рабинс А., Де Майер М., Ван Баелен Х., Бульон Р., Де Рантер С. (февраль 2002 г.). «Структурная основа уникальных свойств связывания человеческого белка, связывающего витамин D». Структурная биология природы . 9 (2): 131–6. дои : 10.1038/nsb754 . ПМИД 11799400 . S2CID 38990672 .

[Norman2008-9] Jump up to: ^а ^б Норман А.В. (август 2008 г.). «От витамина D к гормону D: основы эндокринной системы витамина D, необходимые для хорошего здоровья» . Американский журнал клинического питания . 88 (2): 491С–499С. дои : 10.1093/ajcn/88.2.491S . ПМИД 18689389 .

[10] Ямамото Н., Суяма Х., Ямамото Н. (июль 2008 г.). «Иммунотерапия рака простаты с помощью фактора активации макрофагов, полученного из белка Gc, GcMAF» ([PDF]) . Трансляционная онкология . 1 (2): 65–72. дои : 10.1593/tlo.08106 . ПМК 2510818 . ПМИД 18633461 .

[Bouillon_2019-12] Буйон Р., Шуит Ф., Антонио Л., Растинежад Ф. (2019). «Белок, связывающий витамин D: исторический обзор» . Границы эндокринологии . 10 :910. дои : 10.3389/fendo.2019.00910 . ПМК 6965021 . ПМИД 31998239 .

[Malik-2013-13] Jump up to: ^а ^б Малик С., Фу Л., Джурас Дж., Кармали М., Вонг Б.И., Гоздзик А., Коул Д.Е. (январь – февраль 2013 г.). «Распространенные варианты гена белка, связывающего витамин D, и неблагоприятные последствия для здоровья» . Критические обзоры клинических лабораторных наук . 50 (1): 1–22. дои : 10.3109/10408363.2012.750262 . ПМЦ 3613945 . ПМИД 23427793 .

[14] МакГрат Дж.Дж., Саха С., Бёрн Т.Х., Эйлс Д.В. (июль 2010 г.). «Систематический обзор связи между частыми однонуклеотидными полиморфизмами и концентрациями 25-гидроксивитамина D». Журнал биохимии стероидов и молекулярной биологии . 121 (1–2): 471–7. дои : 10.1016/j.jsbmb.2010.03.073 . ПМИД 20363324 . S2CID 20057294 .

[15] Пау С.Э., Эванс М.К., Венгер Дж., Зондерман А.Б., Берг А.Х., Ноллс М., Тамез Х., Чжан Д., Бхан И., Каруманчи С.А., Пау Н.Р., Тадхани Р. (ноябрь 2013 г.). «Витамин D-связывающий белок и статус витамина D у чернокожих и белых американцев» . Медицинский журнал Новой Англии . 369 (21): 1991–2000. дои : 10.1056/NEJMoa1306357 . ПМК 4030388 . ПМИД 24256378 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ § 1 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]