✖


Jump to content

Цианофаг

(Перенаправлено с Цианофагов )

Электронная микрофотография отрицательно окрашенных Prochromococcus . миовирусов

Цианофаги — это вирусы, поражающие цианобактерии , также известные как Cyanophyta или сине-зеленые водоросли. Цианобактерии — это тип бактерий, которые получают энергию в процессе фотосинтеза . [1] [2] Хотя цианобактерии метаболизируют фотоавтотрофно, как эукариотические растения, они имеют прокариотическую клеточную структуру. Цианофаги можно найти как в пресноводной, так и в морской среде. [3] Морские и пресноводные цианофаги имеют икосаэдрические головки, содержащие двухцепочечную ДНК, прикрепленную к хвосту соединительными белками. [4] Размер головы и хвоста различается у разных видов цианофагов. Цианофаги заражают широкий спектр цианобактерий и являются ключевыми регуляторами популяций цианобактерий в водной среде, а также могут способствовать предотвращению цветения цианобактерий в пресноводных и морских экосистемах. Это цветение может представлять опасность для людей и других животных, особенно в эвтрофных пресноводных озерах. Инфицирование этими вирусами широко распространено в клетках, принадлежащих Synechococcus spp. в морской среде, где, как сообщается, до 5% клеток, принадлежащих морским цианобактериям, содержат зрелые фаговые частицы. [5]

О первом описанном цианофаге LPP-1 сообщили Сафферман и Моррис в 1963 году. [6] Цианофаги классифицируются внутри бактериофагов семейств Myoviridae (например, AS-1 , N-1 ), Podoviridae (например, LPP-1 ) и Siphoviridae (например, S-1 ). [6]

Номенклатура

[ редактировать ]

Следующие три семейства цианофагов были признаны Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV): Myoviridae , Siphoviridae и Podoviridae ; все содержат двухцепочечную ДНК. [7] Первоначально цианофаги были названы в честь своих хозяев. Однако способность цианофагов заражать нескольких хозяев и отсутствие универсальной системы наименований могут вызвать трудности с их таксономической классификацией. [8] Многие другие системы классификации использовали серологические, морфологические или физиологические свойства. [9] [10] В настоящее время предлагаемая процедура наименования штаммов следующая: Цианофаг Xx-YYZaa, где Xx — первые две буквы названия рода и вида хозяина, в котором обнаружен типовой образец фага, YY — происхождение образца, Z — семейство вируса, а аа — идентификационный номер вируса. [3]

Морфология

[ редактировать ]

Как и все другие хвостатые бактериофаги, цианофаги имеют хвост и белковый капсид, окружающий генетический материал. Двухцепочечная ДНК имеет длину примерно 45 т.п.н. и у некоторых цианофагов кодирует фотосинтетические гены, интегразу или гены, участвующие в метаболизме фосфатов (фосфат-индуцируемые). [11] Хвост связывает вирус с клеткой-хозяином и переносит вирусную ДНК в клетку-хозяина при заражении. На основании морфологических характеристик цианофаги относят к семействам Myoviridae, Podoviridae и Siphoviridae, и, хотя они официально не признаны Международным комитетом по таксономии вирусов , исторически цианофаги классифицировались как цианомиовирусы, цианоподовирусы или цианостиловирусы в зависимости от того, какой из трех вирусов семьи, в которых они группируются. [8]

Цианомиовирус

[ редактировать ]

Типовым видом цианомиовируса семейства Myoviridae является цианофаг AS-1, выделенный из пруда-стабилизатора отходов, [12] а также был первым признанным родом. [13] Хвосты могут быть сократительными или несокращающимися, их длина составляет от 20 до 244 нм, ширина от 15 до 23 нм и диапазон сокращения 93 нм. [14] [3] Цианофаги обычно имеют изометрические шестиугольные головки диаметром от 55 до 90 нм. [14] [3] В этой группе наблюдаются большие морфологические различия, что позволяет предположить, что они заражают различные виды хозяев. [15] В месте прикрепления между длинным хвостом и головой имеется опорная пластинка, к которой прикреплены короткие штифты, сократительная оболочка и внутреннее ядро, подобное другим бактериофагам Myoviridae. [12]

Цианоподовирус

[ редактировать ]

Цианоподовирусы семейства Podoviridae присутствуют как в пресной, так и в морской воде. [16] Типовым экземпляром цианоподовируса является цианофаг LPP-1, который поражает Lyngbya , Plectonema и Phormidium . [17] Их капсиды представляют собой многогранники, которые в двумерном пространстве кажутся шестиугольными. [14] Хвосты полые, с шестикратной радиальной симметрией, состоят из колец из шести субъединиц неизвестной ориентации. [14] Подобно цианомиовирусам, их можно обнаружить в прудах-стабилизаторах отходов, и они имеют изометрические капсиды аналогичного размера, но с более короткими хвостами. [3]

Цианостиловирус

[ редактировать ]

Цианостиловирус принадлежит к семейству Siphoviridae , где типовым видом является цианофаг S-1, который, как известно, инфицирует Synechococcus . [3] Цианостиловирусы имеют меньшие (50 нм в диаметре) изометрические капсиды, чем предыдущие роды, но более длинные хвосты (140 нм). [18] У других родов этого семейства хвосты имеют длину от 200 до 300 нм. [15]

Хозяин

[ редактировать ]
Anabaena circinalis Нить

Диапазон хозяев цианофагов очень сложен и считается, что они играют важную роль в контроле популяций цианобактерий . [1] Сообщалось, что пресноводные цианофаги заражают хозяев более чем одного рода, хотя это также может отражать проблемы в таксономической классификации их хозяев. Тем не менее, они были разделены на три основные группы на основе таксономии их организма- хозяина . [1] [3]

Группа ЛПП

[ редактировать ]

Первая группа — ЛПП, принадлежащая к цианоподовирусам. [1] В эту группу вирусов входит оригинальный изолят цианофага, инфицировавший «сине-зеленые водоросли». [13] [3] Цианофаги этой группы легко изолировать из окружающей среды. [3] Они несут короткие несокращающиеся хвосты и вызывают лизис нескольких видов цианобактерий трех родов: Lyngbya , Plectonema и Phormidium . [3] Таким образом, название LPP ​​произошло от трех родов хозяев, которых они заражают. [13] LPP-1 и LPP-2 — два основных типа цианофагов LPP. [19] Эта группа цианофагов имеет тот же хозяин и тот же ареал; однако их сыворотка и другие жидкости организма не одинаковы. [19]

Группа АС и СМ

[ редактировать ]

Группы AS и SM представляют собой третью группу цианофагов, классифицированную по кругу хозяев. [1] Эту группу вирусов называют «новыми сине-зелеными водорослями» и они заражают одноклеточные формы цианобактерий . [3] [20] [12] Миовирус AS - 1 поражает Anacystis nidulans . [21] Synechococcus cedrorum , Synechococcus elongatus и Microcystis aeruginosa . [3] одноклеточные сине-зеленые водоросли Synechococcus elongatus и Microcystis aeruginosa . Аналогичным образом подовирусом SM-1 заражаются [3] [22] Существует новая SM-группа вирусов, известная как SM-2, которая также лизирует Microcystis aeruginosa. [22] .

Группа А, АН, Н и НП

[ редактировать ]

Цианофаги, классифицированные в группах A, AN, N и NP, представляют собой вторую группу цианофагов, классифицированную на основе круга хозяев. [18] [1] [23] [24] Они играют важную роль в инфицировании и возникновении лизиса представителей родов Nostoc , Anabaena и Plectonema . [1] А-группа вируса вызывает лизис и заражает виды Anabaena . [3] Аналогично, ареал хозяев группы AN включает виды Anabaena и Nostoc ; тогда как группа вирусов N заражает только виды Nostoc и включает цианофаг N-1 . [3] Цианофаг N-1 примечателен тем, что он кодирует функциональный массив CRISPR , который может обеспечить иммунитет хозяина к заражению конкурирующими цианофагами. [25] Наконец, цианобактериальные изоляты видов Nostoc и Plectonema инфицируются вирусами группы NP. [3] Эти изоляты цианобактерий тесно связаны с таксономической группой Nostoc . [3] Все они имеют широкий круг хозяев, и мутации . в этих группах вирусов заметны [3]

Репликация

[ редактировать ]

Репликация цианофагов имеет два доминирующих цикла: литический цикл и лизогенный цикл . Репликация вирусных нуклеиновых кислот и немедленный синтез кодируемого вирусом белка считаются литическим циклом. Фаги считаются литическими, если они способны только вступать в литический цикл; тогда как умеренный фаг может либо вступить в литический цикл, либо стабильно интегрироваться с геномом хозяина и войти в лизогенный цикл. [26] Чтобы удовлетворить метаболические потребности репликации, вирусы используют множество стратегий по захвату питательных веществ у своего хозяина. Один из таких методов — морить клетку-хозяина голодом. Это достигается путем ингибирования фиксации CO 2 клетками-хозяевами , что позволяет цианофагу рекрутировать образовавшиеся фотосинтетически окислительно-восстановительный потенциал и АТФ из клетки-хозяина для удовлетворения их нуклеотидного и метаболического ответа. [27] Многие цианофаги содержат гены, известные как кодируемые вирусами вспомогательные метаболические гены (AMG), которые кодируют критические, ограничивающие скорость этапы организма-хозяина. [27] AMG кодируют гены пентозофосфатного пути, приобретения фосфата, метаболизма серы и процессинга ДНК/РНК; эти гены вмешиваются в метаболизм клетки-хозяина. Метагеномный анализ полностью поддерживает идею о том, что эти гены способствуют репликации вируса посредством деградации ДНК и РНК хозяина, а также сдвига метаболизма клетки-хозяина в сторону биосинтеза нуклеотидов. [27] Цианофаги также используют эти гены для поддержания фотосинтеза хозяина во время развития инфекции, перенаправляя энергию от фиксации углерода к анаболизму, которым пользуется вирус. [28] AMG также кодируют белки, которые помогают в восстановлении фотосистемы хозяина, подверженной фотодеградации. [28] Одним из таких примеров являются белки D1 , которые заменяют белок D1 клетки-хозяина, когда он повреждается. [28] Вирус усиливает фотосинтез, что приводит к увеличению скорости деградации белка D1. Клетка-хозяин сама по себе не может эффективно заменить эти белки, поэтому цианофаг заменяет их в клетке-хозяине, позволяя ей продолжать обеспечивать энергию для цикла репликации цианофага. [28]

Очевидно, что репликация цианофагов сильно зависит от суточного цикла. Первым шагом в инфекционном цикле является контакт цианофага и его связывание с цианобактериями. Этот процесс адсорбции сильно зависит от интенсивности света. [29] Полевые исследования также показывают, что заражение и репликация цианофагов прямо или косвенно синхронизированы с циклом света и темноты. [29]

Приверженность

[ редактировать ]

Цианофаги, как и другие бактериофаги, полагаются на броуновское движение при столкновении с бактериями , а затем используют белки, связывающие рецепторы, для распознавания белков клеточной поверхности, что приводит к прилипанию. Вирусы с сократительными хвостами затем полагаются на рецепторы, обнаруженные на их хвостах, для распознавания высококонсервативных белков на поверхности клетки-хозяина. [30] Цианофаги также имеют несколько поверхностных белков с Ig-подобными доменами, которые используются для прикрепления. [30]

Некоторые цианофаги также образуют роговидную структуру, которая выступает из вершины, противоположной хвосту. [31] Предполагается, что роговая структура способствует прикреплению к клеткам в естественной среде; однако это не было подтверждено. [31]

Литический цикл

[ редактировать ]

Цианофаги могут подвергаться как литическому, так и лизогенному циклам в зависимости от вирусов и окружающей среды. [32] [33] В одном исследовании цианомиовирусов, заражающих морские Synechococcus sp., было показано, что литическая фаза длится примерно 17 часов, при этом среднее количество вирусов, образующихся на каждую лизированную клетку (размер вспышки), варьируется от 328 при ярком освещении до 151 при слабом освещении. [34] Существуют доказательства, подтверждающие предположение о наличии корреляции между интенсивностью света и размером вспышки. [29] Исследования показывают, что репликация цианофагов осуществляется за счет энергии фотосинтетического метаболизма клетки-хозяина. [35] Лизис клетки-хозяина имеет тенденцию происходить после завершения репликации ДНК хозяина и непосредственно перед делением клетки. [35] Это связано с увеличением доступности ресурсов для репликации вирусных частиц. [ нужна ссылка ]

Экологическое значение

[ редактировать ]
Когда фаг P-SSM2 Fd ( Myoviridae, род Salacisavirus , розовый) заражает вездесущие цианобактерии Prochromococcus marinus, он вырабатывает белок ферредоксин, который присоединяется к существующей электрической структуре бактерии и изменяет ее метаболизм. [36]

Экосистема

[ редактировать ]

Определенные цианофаги заражают и разрушают прохлорококк , самого маленького и самого распространенного в мире первичного продуцента. [37] [11] Морские цианофаги семейства Myoviridae помогают регулировать первичную продукцию главным образом за счет заражения Synechococcus spp. [3] Два других семейства, Podoviridae и Siphoviridae , обычно встречаются в пресноводных экосистемах. [3] В прибрежных океанах обилие вирусов, заражающих Synechococcus spp. может достигать >10 6 мл −1 и 10 5 г −1 в отложениях. [3] 3% синехококков . По оценкам , цианофаги ежедневно уничтожают [3] Цианофаги широко распространены как по всей толще воды, так и географически. [3] [37] [38] анализа и гиперсоленых лагун было обнаружено, что популяции цианофагов обитают в микробных матах в Арктике С помощью метагеномного . [38] [4] Они могут выдерживать температуру от 12 до 30 °C и соленость 18-70 ppt. [4] ДНК цианофагов подвержена УФ-деградации, но может быть восстановлена ​​в клетках-хозяевах посредством процесса, называемого « фотореактивацией ». [39] Вирусы не могут двигаться независимо и должны полагаться на течения, перемешивание и клетки-хозяева для их транспортировки. Вирусы не могут активно атаковать свои хозяева и должны ждать, чтобы встретиться с ними. Более высокая вероятность столкновения может объяснить, почему цианофаги семейства Myoviridae в первую очередь заражают одну из самых распространенных цианобактерий — Synechoccocus . [3] Доказательства сезонной ковариации между фагами и хозяевами, а также увеличение количества цианофагов выше порога 10. 3 до 10 4 Синехококк мл −1 , может указывать на динамику « убей победителя ». [3]

Биологическое и физическое воздействие

[ редактировать ]

Представители рода Synechococcus вносят ~ 25% первичной фотосинтетической продуктивности в океане, оказывая значительное влияние снизу вверх на более высокие трофические уровни. [40] Растворенное органическое вещество (РОВ), высвобождаемое в результате лизиса вируса цианофагами, может быть перенаправлено в микробную петлю , где оно перерабатывается или отторгается гетеротрофными бактериями с образованием неподатливого вещества, которое в конечном итоге оказывается захороненным в осадке. [40] [41] Это важный шаг в связывании углерода в атмосфере, обычно называемом биологическим насосом , и поддержании других биогеохимических циклов . [40]

Цианобактерии осуществляют оксигенный фотосинтез, который, как полагают, стал источником атмосферного кислорода примерно 2,5 млрд лет назад. [42] Популяция и, следовательно, скорость выделения кислорода могут регулироваться цианофагами. У некоторых видов цианобактерий, таких как Trichodesmium , которые осуществляют азотфиксацию, цианофаги способны увеличивать скорость поступления биодоступного органического азота посредством лизиса. [43] [44]

Цианофаги также заражают цианобактерии, образующие цветение, которые могут быть токсичными для здоровья людей и других животных за счет выработки микроцистина и вызывать эвтрофикацию , приводящую к образованию зон минимума кислорода . Цианофаги могут заражать и убивать четыре распространенные цианобактерии, образующие цветение: Lyngbya birgei , Anabaena circinalis , Anabaena flosaquae и Microcystis aeruginosa . [26] и, таким образом, может предотвратить вредное цветение водорослей в нормальных условиях. Цветение вызывает экологические, экономические проблемы, а также в пресноводных системах отрицательно влияет на качество питьевой воды. [45] Резкий рост популяций цианобактерий обычно вызван увеличением количества питательных веществ из-за стоков удобрений, пыли и сточных вод. [46] Убивая хозяев, цианофаги могут помочь восстановить естественный баланс экосистем. [ нужна ссылка ]

Помимо регулирования размера популяции, цианофаги, вероятно, влияют на филогенетический состав, позволяя другому фитопланктону, обычно ингибируемому цианобактериями, расти. [46] Специфика, с которой цианофаги поражают различных хозяев, также влияет на структуру сообщества. Благодаря лизогенной фазе цикла репликации цианофаги могут вести себя как мобильные генетические элементы для генетической диверсификации своих хозяев посредством горизонтального переноса генов . [47] [27] Предполагается, что доминирование литической или лизогенной фазы в данной области зависит от эвтрофных или олиготрофных условий соответственно. [41] Увеличение количества встреч напрямую связано с увеличением уровня заражения, что дает больше возможностей для селективного давления, что делает прибрежные Synechococcus более устойчивыми к вирусной инфекции, чем их морские аналоги. [3]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с д и ж г Ся Х, Ли Т, Дэн Ф, Ху Цзы (01 октября 2013 г.). «Пресноводные цианофаги» . Вирусология Синика . 28 (5): 253–259. дои : 10.1007/s12250-013-3370-1 . ISSN   1674-0769 . ПМК   8208336 . ПМИД   24132756 .
  2. ^ Уиттон Б.А., Поттс М. (2000). Экология цианобактерий: их разнообразие во времени и пространстве . Бостон: Kluwer Academic. стр. 563–589. ISBN  978-0-7923-4735-4 .
  3. ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в v В х и С Саттл, Калифорния (1 января 2000 г.). «Цианофаги и их роль в экологии цианобактерий». В Whitton BA, Potts M (ред.). Экология цианобактерий . Спрингер Нидерланды. стр. 563–589. дои : 10.1007/0-306-46855-7_20 . ISBN  978-0-7923-4735-4 .
  4. ^ Jump up to: а б с Саттл, Калифорния, Чан А.М. (1993). «Морские цианофаги, заражающие океанические и прибрежные штаммы Synechococcus: численность, морфология, перекрестная инфекционность и характеристики роста» . Серия «Прогресс в области морской экологии» . 92 : 99–109. Бибкод : 1993MEPS...92...99S . дои : 10.3354/meps092099 .
  5. ^ Проктор Л.М., Фурман Дж.А. (1990). «Вирусная смертность морских бактерий и цианобактерий». Природа . 343 (6253): 60–62. Бибкод : 1990Natur.343...60P . дои : 10.1038/343060a0 . S2CID   4336344 .
  6. ^ Jump up to: а б Сарма ТА. «Цианофаги» в Справочнике цианобактерий ( CRC Press ; 2012) ( ISBN   1466559411 )
  7. ^ Кинг А., Лефковиц Э., Адамс М., Карстенс Э. (2012). Классификация и номенклатура вирусов по таксономии вирусов: девятый отчет Международного комитета по таксономии вирусов . Эльзевир. ISBN  978-0-12-384684-6 .
  8. ^ Jump up to: а б Сафферман Р., Кэннон Р., Дежарден П., Громов Б., Хазелькорн Р., Шерман Л., Шило М. (1983). «Классификация и номенклатура вирусов цианобактерий» . Интервирусология . 19 (2): 61–66. дои : 10.1159/000149339 . ПМИД   6408019 .
  9. ^ Гиббс Эй Джей (2005). Молекулярные основы эволюции вирусов . Издательство Кембриджского университета. ISBN  978-0-521-02289-7 .
  10. ^ Станье Р. (1971). «Очистка и свойства одноклеточных сине-зеленых водорослей (отряда Chroocococcales)» . Бактериологические обзоры . 35 (2): 171–205. дои : 10.1128/MMBR.35.2.171-205.1971 . ПМК   378380 . ПМИД   4998365 .
  11. ^ Jump up to: а б Салливан М.Б., Коулман М.Л., Вейгеле П., Ровер Ф., Чисхолм С.В. (19 апреля 2005 г.). «Три генома цианофага прохлорококка: характерные особенности и экологическая интерпретация» . ПЛОС Биология . 3 (5): е144. дои : 10.1371/journal.pbio.0030144 . ISSN   1545-7885 . ПМЦ   1079782 . ПМИД   15828858 .
  12. ^ Jump up to: а б с Сафферман Р., Динер Т., Дежарден П., Моррис М. (1972). «Выделение и характеристика AS-1, фиковируса, поражающего сине-зеленые водоросли Anacystis nidulans и Synechococcus cedrorum ». Вирусология . 47 (1): 105–113. дои : 10.1016/0042-6822(72)90243-7 . ПМИД   4110125 .
  13. ^ Jump up to: а б с Сафферман Р.С., Моррис М.Е. (1964). «Характеристики роста вируса сине-зеленых водорослей LPP-1» . Дж. Бактериол . 88 (3): 771–775. дои : 10.1128/JB.88.3.771-775.1964 . ПМЦ   277376 . ПМИД   14208517 .
  14. ^ Jump up to: а б с д Падан Э, Шило М (1973). «Цианофаги-вирусы, поражающие сине-зеленые водоросли» . Бактериологические обзоры . 37 (3): 343–370. дои : 10.1128/ММБР.37.3.343-370.1973 . ПМК   413822 . ПМИД   4202147 .
  15. ^ Jump up to: а б Gromov B (1983). "Cyanophages". Annales de l'Institut Pasteur / Microbiologie . 134 (1): 43–59. doi : 10.1016/s0769-2609(83)80096-9 . PMID  6416127 .
  16. ^ Ху НТ, Тиль Т., Гиддингс Т.Х., Волк С. (1981). «Новые цианофаги Anabaena и Nostoc из прудов-отстойников сточных вод». Вирусология . 114 (1): 236–246. дои : 10.1016/0042-6822(81)90269-5 . ПМИД   6269286 .
  17. ^ Шнайдер И.Р., Динер Т.О., Сафферман Р.С. (29 мая 1964 г.). «Вирус сине-зеленых водорослей LPP-1: очистка и частичная характеристика». Наука . 144 (3622): 1127–1130. Бибкод : 1964Sci...144.1127S . дои : 10.1126/science.144.3622.1127 . ISSN   0036-8075 . ПМИД   14148431 . S2CID   45125402 .
  18. ^ Jump up to: а б Адольф К.В., Хазелькорн Р. (1973). «Выделение и характеристика вируса, поражающего сине-зеленые водоросли рода Synechococcus ». Вирусология . 54 (1): 230–236. дои : 10.1016/0042-6822(73)90132-3 . ПМИД   4197413 .
  19. ^ Jump up to: а б ДЖОНСОН Д.В., ПОТТС М. (1985). «Хозяинный круг цианофагов ЛПП» . Международный журнал систематической бактериологии . 35 : 76–78. дои : 10.1099/00207713-35-1-76 .
  20. ^ САФФЕРМАН Р., Шнайдер И., Стир Р., МОРРИС М., ДИНЕР Т. (1969). «Фиковирус SM-1: вирус, поражающий одноклеточные сине-зеленые водоросли». Вирусология . 37 (3): 386–397. дои : 10.1016/0042-6822(69)90222-0 . ПМИД   5777559 .
  21. ^ Орквишевский К.Г., Кейни А.Р. (июнь 1974 г.). «Генетическая трансформация сине-зеленой бактерии Anacystis nidulans». Арх Микробиол . 98 (1): 31–37. Бибкод : 1974ArMic..98...31O . дои : 10.1007/BF00425265 . ПМИД   4209657 . S2CID   5635245 .
  22. ^ Jump up to: а б Фокс Дж. А., Бут С., Мартин Э. (1976). «Цианофаг СМ-2: новый вирус сине-зеленых водорослей». Вирусология . 73 (2): 557–560. дои : 10.1016/0042-6822(76)90420-7 . ПМИД   8869 .
  23. ^ МУРАДОВ М.М. (1990). «СРАВНИТЕЛЬНОЕ ИЗУЧЕНИЕ ЦИАНОФАГОВ NP-1T, ЛИЗОГЕНИЗИРУЮЩИХ АЗОТОСЪЕМЛЯЮЩИЕ БАКТЕРИИ РОДА NOSTOC И PLECTONEMA». Микробиология . 59 (5): 558–563.
  24. ^ Козаяков С (1977). «Цианофаги серии А(L), специфичные для сине-зеленой водоросли Anabaena variabilis . В». Экспериментальная альгология : 151–171.
  25. ^ Ченар С., Вирт Дж. Ф., Саттл Калифорния (2016), «Вирусы, заражающие пресноводную нитчатую цианобактерию ( Nostoc sp.), Кодируют функциональный массив CRISPR и протеобактериальную ДНК-полимеразу B», mBio , 7 (3): e00667-16, doi : 10.1128/mBio.00667-16 , PMC   4916379 , PMID   27302758
  26. ^ Jump up to: а б Жассим С.А., Лимож Р.Г. (01.10.2013). «Влияние внешних сил на взаимодействие цианофага и хозяина в водных экосистемах». Всемирный журнал микробиологии и биотехнологии . 29 (10): 1751–1762. дои : 10.1007/s11274-013-1358-5 . ISSN   0959-3993 . ПМИД   23619821 . S2CID   24177191 .
  27. ^ Jump up to: а б с д Каплан А (2016). «Цианофаги: голодание хозяина для набора ресурсов» . Клетка . 26 (12): Р511–Р513. Бибкод : 2016CBio...26.R511K . дои : 10.1016/j.cub.2016.04.030 . ПМИД   27326715 .
  28. ^ Jump up to: а б с д Фрэнк Дж.А., Лоример Д., Юл М., Витте П., Крейг Т., Абендрот Дж., Ровер Ф., Эдвардс Р.А., Сегалл А.М. (01.06.2013). «Структура и функция пептидной деформилазы, кодируемой цианофагом» . Журнал ISME . 7 (6): 1150–1160. Бибкод : 2013ISMEJ...7.1150F . дои : 10.1038/ismej.2013.4 . ISSN   1751-7362 . ПМЦ   3660681 . ПМИД   23407310 .
  29. ^ Jump up to: а б с Ни Т, Цзэн Ц (01 января 2016 г.). «Диэльское заражение цианобактерий цианофагами» . Границы морской науки . 2 . дои : 10.3389/fmars.2015.00123 .
  30. ^ Jump up to: а б Фокин А, Россманн М.Г. (1 января 2014 г.). «Молекулярная архитектура хвостатых двухцепочечных ДНК-фагов» . Бактериофаг . 4 (1): e28281. дои : 10.4161/bact.28281 . ПМЦ   3940491 . ПМИД   24616838 .
  31. ^ Jump up to: а б Райчева Д.А., Хаасе-Петтингелл С, Пирет Дж, Кинг Дж.А. (15 февраля 2014 г.). «Два новых белка Syn5 цианофага составляют его необычную роговую структуру» . Журнал вирусологии . 88 (4): 2047–2055. дои : 10.1128/JVI.02479-13 . ISSN   0022-538X . ПМЦ   3911526 . ПМИД   24307583 .
  32. ^ МакДэниел Л., Хоучин Л.А., Уильямсон С.Дж., Пол Дж.П. (2002). «Цветение планктона – лизогения морских синехококков » . Природа . 415 (6871): 496. Бибкод : 2002Natur.415..496M . дои : 10.1038/415496a . ПМИД   11823851 . S2CID   4418714 .
  33. ^ Ортманн AC, Лоуренс Дж. Э., Саттл, Калифорния (2002). «Лизогения и литическая продукция вирусов во время цветения цианобактерий Synechococcus spp». Микробная экология . 43 (2): 225–231. Бибкод : 2002MicEc..43..225O . дои : 10.1007/s00248-001-1058-9 . ПМИД   12023729 . S2CID   27385452 .
  34. ^ Бригден С. (2003). Динамика репликации цианофагов (магистр ботаники). Университет Британской Колумбии. дои : 10.14288/1.0091069 .
  35. ^ Jump up to: а б Ни Т, Цзэн Ц (01 января 2016 г.). «Диэльское заражение цианобактерий цианофагами» (PDF) . Границы морской науки . 2 . дои : 10.3389/fmars.2015.00123 . ISSN   2296-7745 .
  36. ^ Ян Дж. Кэмпбелл, Хосе Луис Олмос младший, Вэйджун Сюй, Димитри Каханда, Джошуа Т. Аткинсон, Отнил Ноубл Спаркс, Митчелл Д. Миллер, Джордж Н. Филлипс младший, Джордж Н. Беннетт, Джонатан Дж. Силберг: Прохлорококк фаговый ферредоксин: структурная характеристика и перенос электронов цианобактериальным сульфитредуктазам - характеристика Phage Fd и взаимодействия SIR с хозяином, в: J. Biol. Chem., Публикации ASBMB, 19 мая 2020 г., doi:10.1074/jbc.RA120.013501 , PDF . Вместе с:
    • Океанский вирус захватывает бактерии, накапливающие углерод, Источник: Университет Райса.
  37. ^ Jump up to: а б Партенский Ф., Гесс В.Р., Вало Д. (1 марта 1999 г.). « Прохлорококк , морской фотосинтетический прокариот глобального значения» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 63 (1): 106–127. дои : 10.1128/ММБР.63.1.106-127.1999 . ISSN   1092-2172 . ПМК   98958 . ПМИД   10066832 .
  38. ^ Jump up to: а б Варин Т., Лавджой С., Юнгблут А.Д., Винсент В.Ф., Корбейла Дж. (2010). «Метагеномное профилирование сообществ арктических микробных матов как систем улавливания и переработки питательных веществ» . Лимнология и океанография . 55 (5): 1901–1911. Бибкод : 2010LimOc..55.1901V . дои : 10.4319/lo.2010.55.5.1901 . S2CID   55550366 .
  39. ^ Ченг К., Чжао Ю, Ду С, Чжан Ю, Лан С, Ши Цзы (20 июня 2007 г.). «Распад инфекционности цианофагов, вызванный солнечной радиацией, и фотореактивация цианофага цианобактериями-хозяевами» . Водная микробная экология . 48 (1): 13–18. дои : 10.3354/ame048013 .
  40. ^ Jump up to: а б с Ван К., Уоммак К.Е., Чен Ф (01 ноября 2011 г.). «Численность и распространение видов Synechococcus и цианофагов в Чесапикском заливе» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (21): 7459–7468. Бибкод : 2011ApEnM..77.7459W . дои : 10.1128/АЕМ.00267-11 . ISSN   0099-2240 . ПМК   3209163 . ПМИД   21821760 .
  41. ^ Jump up to: а б Вайнбауэр М (2011). «Вирус-опосредованное перераспределение и разделение углерода в глобальных океанах». ResearchGate : 54–56.
  42. ^ Ширмейстер Б.Е., Антонелли А., Багери ХК (01.01.2011). «Происхождение многоклеточности у цианобактерий» . Эволюционная биология BMC . 11 (1): 45. Бибкод : 2011BMCEE..11...45S . дои : 10.1186/1471-2148-11-45 . ISSN   1471-2148 . ПМЦ   3271361 . ПМИД   21320320 .
  43. ^ Бергман Б., Санд Г., Лин С., Ларссон Дж., Карпентер Э.Дж. (01 мая 2013 г.). «Триходезмий – широко распространенная морская цианобактерия с необычными свойствами азотфиксации» . Обзоры микробиологии FEMS . 37 (3): 286–302. дои : 10.1111/j.1574-6976.2012.00352.x . ISSN   0168-6445 . ПМЦ   3655545 . ПМИД   22928644 .
  44. ^ Кашьяп А.К., Рай А.Н., Сингх С. (1 июня 1988 г.). «Влияние развития цианофага Н-1 на азотистый обмен цианобактерии Nostoc muscorum » . Письма FEMS по микробиологии . 51 (2–3): 145–148. дои : 10.1111/j.1574-6968.1988.tb02986.x . ISSN   0378-1097 .
  45. ^ Беверсдорф Л.Дж., Миллер Т.Р., МакМахон К.Д. (06 февраля 2013 г.). «Роль фиксации азота в токсичности цветения цианобактерий в эвтрофном озере с умеренным климатом» . ПЛОС ОДИН . 8 (2): e56103. Бибкод : 2013PLoSO...856103B . дои : 10.1371/journal.pone.0056103 . ISSN   1932-6203 . ПМК   3566065 . ПМИД   23405255 .
  46. ^ Jump up to: а б Фурман Дж. А., Саттл, Калифорния (1993). «Вирусы в морских планктонных системах» . Океанография . 6 (2): 51–63. дои : 10.5670/oceanog.1993.14 .
  47. ^ Фрост Л.С., Лепле Р., Саммерс А.О., Туссен А. (2005). «Мобильные генетические элементы: агенты эволюции открытого исходного кода». Обзоры природы Микробиология . 3 (9): 722–732. дои : 10.1038/nrmicro1235 . ПМИД   16138100 . S2CID   398029 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
  1. Клоки М.Р., Манн, Нью-Хэмпшир (декабрь 2006 г.). «Морские цианофаги и свет» . Окружающая среда. Микробиол . 8 (12): 2074–82. Бибкод : 2006EnvMi...8.2074C . дои : 10.1111/j.1462-2920.2006.01171.x . ПМИД   17107549 .
  2. Манн, Нью-Хэмпшир (апрель 2003 г.). «Фаги морского цианобактериального пикофитопланктона» . ФЭМС Микробиол. Преподобный . 27 (1): 17–34. дои : 10.1016/S0168-6445(03)00016-0 . ПМИД   12697340 .
  3. Пол Дж. Х., Салливан М.Б. (июнь 2005 г.). «Геномика морских фагов: что мы узнали?». Современное мнение в области биотехнологии . 16 (3): 299–307. дои : 10.1016/j.copbio.2005.03.007 . ПМИД   15961031 .
  4. Саттл, Калифорния (2000). «Глава 20: Цианофаги и их роль в экологии цианобактерий». В Whitton BA, Potts M (ред.). Экология цианобактерий: их разнообразие во времени и пространстве . Академическое издательство Клювер. стр. 563–589. ISBN  978-0-7923-4755-2 .
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Cyanophage&oldid=1215914849"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 7f201ded9feee629745abe4b4643d47a__1711567260
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/7f/7a/7f201ded9feee629745abe4b4643d47a.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Cyanophage - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)