Хранение цифровых данных ДНК
Хранение цифровых данных ДНК — это процесс кодирования и декодирования двоичных данных в синтезированные цепи ДНК и обратно . [1] [2]
Хотя ДНК как носитель информации имеет огромный потенциал из-за высокой плотности хранения, ее практическое использование в настоящее время сильно ограничено из-за ее высокой стоимости и очень медленного времени чтения и записи. [3]
В июне 2019 года ученые сообщили, что все 16 ГБ текста английской Википедии были закодированы в синтетическую ДНК . [4] В 2021 году ученые сообщили, что был разработан специальный модуль записи данных ДНК, способный записывать данные в ДНК со скоростью 1 Мбит/с. [5]
Методы кодирования
[ редактировать ]Возможны многие методы кодирования данных в ДНК. Оптимальными методами являются те, которые экономно используют ДНК и защищают от ошибок. [6] Если ДНК-сообщение предполагается хранить в течение длительного периода времени, например, 1000 лет, также полезно, чтобы последовательность была явно искусственной и рамку считывания можно было легко идентифицировать. [6]
Кодирование текста
[ редактировать ]Было предложено несколько простых методов кодирования текста. Большинство из них включают перевод каждой буквы в соответствующий «кодон», состоящий из уникальной небольшой последовательности нуклеотидов в справочной таблице . Некоторые примеры этих схем кодирования включают коды Хаффмана , коды с запятыми и альтернативные коды. [6]
Кодирование произвольных данных
[ редактировать ]Чтобы закодировать произвольные данные в ДНК, данные обычно сначала преобразуются в троичные данные (по основанию 3), а не в двоичные данные (по основанию 2). Каждая цифра (или «трит») затем преобразуется в нуклеотид с помощью справочной таблицы. Чтобы предотвратить появление гомополимеров (повторяющихся нуклеотидов), которые могут вызвать проблемы с точным секвенированием, результат поиска также зависит от предыдущего нуклеотида. Используя приведенный ниже пример таблицы поиска, если предыдущий нуклеотид в последовательности — T ( тимин ), а трит — 2, следующим нуклеотидом будет G ( гуанин ). [7] [8]
Предыдущий | 0 | 1 | 2 |
---|---|---|---|
Т | А | С | Г |
Г | Т | А | С |
С | Г | Т | А |
А | С | Г | Т |
Могут быть встроены различные системы для разделения и адресации данных, а также для их защиты от ошибок. Один из подходов к исправлению ошибок состоит в регулярном распределении нуклеотидов синхронизации между нуклеотидами, кодирующими информацию. Эти нуклеотиды синхронизации могут действовать как каркасы при реконструкции последовательности из нескольких перекрывающихся цепей. [8]
В естественных условиях
[ редактировать ]Генетический код живых организмов потенциально может быть использован для хранения информации. Кроме того, синтетическая биология может быть использована для создания в клетках «молекулярных регистраторов», позволяющих хранить и извлекать информацию, хранящуюся в генетическом материале клетки. [1] Редактирование генов CRISPR также можно использовать для вставки искусственных последовательностей ДНК в геном клетки. [1] Для кодирования данных о линии развития (молекулярный регистратор полетов) примерно 30 триллионов ядер клеток на мышь * 60 сайтов записи на ядро * 7-15 бит на сайт дают около 2 терабайт на записанную мышь (но считываются только очень выборочно). [9]
Прямое изображение и запись данных на основе света In-vivo
[ редактировать ]Подтверждение концепции системы прямой записи данных ДНК in vivo было продемонстрировано путем включения оптогенетически регулируемых рекомбиназ в состав инженерного «молекулярного регистратора», позволяющего напрямую кодировать световые стимулы в сконструированные клетки E.coli . [10] Этот подход также можно распараллелить для хранения и записи текста или данных в 8-битной форме за счет использования физически разделенных отдельных клеточных культур в планшетах для клеточных культур.
Этот подход использует редактирование «плазмиды-регистратора » с помощью рекомбиназ, регулируемых светом, что позволяет идентифицировать клеточные популяции, подвергающиеся воздействию различных стимулов. Этот подход позволяет напрямую кодировать физический стимул в «записывающую плазмиду» посредством действия рекомбиназы. В отличие от других подходов, этот подход не требует ручного проектирования, вставки и клонирования искусственных последовательностей для записи данных в генетический код. В этом процессе записи каждую отдельную клеточную популяцию в каждой лунке планшета для культивирования клеток можно рассматривать как цифровой «бит», функционирующий как биологический транзистор, способный записывать один бит данных.
История
[ редактировать ]Идея хранения цифровых данных ДНК возникла в 1959 году, когда физик Ричард П. Фейнман в книге «На дне много места: приглашение войти в новую область физики» обрисовал общие перспективы создания искусственных объектов. сходны с объектами микромира (в том числе биологическими) и обладают схожими или даже более обширными возможностями. [11] В 1964–65 советский физик Михаил Самойлович Нейман опубликовал 3 статьи о микроминиатюризации в электронике на молекулярно-атомном уровне, в которых самостоятельно изложил общие соображения и некоторые расчеты относительно возможности записи, хранения и восстановления информации о синтезированной ДНК. и молекулы РНК. [12] [13] [14] После публикации первой статьи М.С. Неймана и получения в редакцию рукописи его второй статьи (8 января 1964 г., как указано в этой статье) интервью с кибернетиком Норбертом Винером . было опубликовано [15] Н. Винер высказал идеи миниатюризации компьютерной памяти, близкие идеям, предложенным независимо М. С. Нейманом. Об этих идеях Винера М.С. Нейман упомянул в третьей своей статье. Эта история подробно описана. [16]
Одно из первых применений хранения ДНК произошло в 1988 году в результате сотрудничества художника Джо Дэвиса и исследователей из Гарвардского университета . Изображение, хранящееся в последовательности ДНК E.coli , было организовано в матрицу 5 x 7, которая после расшифровки образовала изображение древней германской руны, олицетворяющей жизнь и женскую часть Земли. В матрице единицы соответствовали темным пикселям, а нули — светлым пикселям. [17]
было создано устройство, В 2007 году в Университете Аризоны использующее адресные молекулы для кодирования участков несоответствия внутри цепи ДНК. Эти несоответствия затем можно было считывать путем выполнения дайджеста ограничений, тем самым восстанавливая данные. [18]
В 2011 году Джордж Чёрч, Шри Косури и Юань Гао провели эксперимент по кодированию книги размером 659 КБ , соавтором которой был Чёрч. Для этого исследовательская группа провела соответствие два к одному, где двоичный ноль был представлен либо аденином , либо цитозином , а двоичный — гуанином или тимином. После экспертизы в ДНК было обнаружено 22 ошибки. [17]
В 2012 году Джордж Чёрч и его коллеги из Гарвардского университета опубликовали статью, в которой ДНК была закодирована с помощью цифровой информации, которая включала HTML-проект книги из 53 400 слов, написанной ведущим исследователем, одиннадцать изображений JPEG и одну программу JavaScript . Для обеспечения избыточности было добавлено несколько копий, и 5,5 петабитов . в каждом кубическом миллиметре ДНК может храниться [19] Исследователи использовали простой код, в котором биты были сопоставлены с базами один к одному. [ нужны разъяснения ] у которого был тот недостаток, что он приводил к длительным прогонам одной и той же базы, последовательность которых подвержена ошибкам. Этот результат показал, что помимо других функций ДНК также может быть другим типом носителя информации, таким как жесткие диски и магнитные ленты . [20]
В 2013 году в статье, написанной исследователями из Европейского института биоинформатики (EBI) и представленной примерно в то же время, что и статья Черча и его коллег, подробно описывалось хранение, поиск и воспроизведение более пяти миллионов бит данных. Все файлы ДНК воспроизводили информацию с точностью от 99,99% до 100%. [21] Основными нововведениями в этом исследовании было использование схемы кодирования с коррекцией ошибок, обеспечивающей чрезвычайно низкую скорость потери данных, а также идея кодирования данных в серии перекрывающихся коротких олигонуклеотидов, идентифицируемых с помощью схемы индексации на основе последовательностей. . [20] Кроме того, последовательности отдельных цепей ДНК перекрывались таким образом, что каждый участок данных повторялся четыре раза, чтобы избежать ошибок. Две из этих четырех нитей были построены задом наперед, также с целью устранения ошибок. [21] Затраты на один мегабайт оценивались в 12 400 долларов США за кодирование данных и 220 долларов США за извлечение. Однако было отмечено, что экспоненциальное снижение затрат на синтез и секвенирование ДНК, если оно продолжится и в будущем, должно сделать технологию долгосрочного хранения данных экономически эффективной к 2023 году. [20]
В 2013 году Маниш К. Гупта и его коллеги разработали программное обеспечение под названием DNACloud для кодирования компьютерных файлов в их представление ДНК. Он реализует версию алгоритма с эффективностью использования памяти, предложенную Goldman et al. для кодирования (и декодирования) данных в ДНК (файлы .dnac). [22] [23]
О долгосрочной стабильности данных, закодированных в ДНК, сообщалось в феврале 2015 года в статье исследователей из ETH Zurich . Команда добавила избыточность с помощью кодирования с коррекцией ошибок Рида-Соломона и инкапсулирования ДНК в сферы кварцевого стекла с помощью золь-гель -химии. [24]
В 2016 году было опубликовано исследование Church and Technicolor Research and Innovation , в котором 22 МБ сжатой в формате MPEG последовательности фильмов были сохранены и извлечены из ДНК. Было обнаружено, что восстановление последовательности не имеет ошибок. [25]
В марте 2017 года Янив Эрлих и Дина Зелински из Колумбийского университета и Нью-Йоркского центра генома опубликовали метод, известный как «Фонтан ДНК», который сохраняет данные с плотностью 215 петабайт на грамм ДНК. Этот метод приближается к емкости хранения ДНК Шеннона , достигая 85% от теоретического предела. Метод не был готов к широкомасштабному использованию, так как синтез 2 мегабайт данных стоит 7000 долларов, а их чтение — еще 2000 долларов. [26] [27] [28]
В марте 2018 года Вашингтонский университет и Microsoft опубликовали результаты, демонстрирующие хранение и извлечение примерно 200 МБ данных. В ходе исследования также был предложен и оценен метод произвольного доступа к элементам данных, хранящимся в ДНК. [29] [30] В марте 2019 года та же команда объявила, что продемонстрировала полностью автоматизированную систему кодирования и декодирования данных в ДНК. [31]
Исследование, опубликованное Eurecom и Имперским колледжем в январе 2019 года, продемонстрировало возможность хранить структурированные данные в синтетической ДНК. Исследование показало, как кодировать структурированные или, точнее, реляционные данные в синтетической ДНК , а также продемонстрировало, как выполнять операции обработки данных (аналогичные SQL ) непосредственно на ДНК в виде химических процессов. [32] [33]
В апреле 2019 года благодаря сотрудничеству с TurboBeads Labs в Швейцарии альбом Mezzanine группы Massive Attack был закодирован в синтетическую ДНК, что сделало его первым альбомом, хранящимся таким образом. [34]
В июне 2019 года ученые сообщили, что все 16 ГБ Википедии закодированы в синтетическую ДНК. [4] В 2021 году CATALOG сообщил, что они разработали специальный модуль записи ДНК, способный записывать данные в ДНК со скоростью 1 Мбит/с. [5]
Первая статья, описывающая хранение данных о нативных последовательностях ДНК посредством ферментативного разрыва, была опубликована в апреле 2020 года. В статье ученые демонстрируют новый метод записи информации в основной цепи ДНК, который обеспечивает побитовый произвольный доступ и вычисления в памяти. [35]
В 2021 году исследовательская группа Университета Ньюкасла под руководством Н. Красногора реализовала стековую структуру данных с использованием ДНК, позволяющую осуществлять запись и извлечение данных по принципу «последним поступил — первым отправлен» (LIFO). Их подход использовал гибридизацию и смещение цепей для записи сигналов ДНК в полимерах ДНК, которые затем высвобождались в обратном порядке. Исследование показало, что операции, подобные структурам данных, возможны в молекулярной сфере. Исследователи также изучили ограничения и будущие улучшения динамических структур данных ДНК, подчеркнув потенциал вычислительных систем на основе ДНК. [36]
Биткойн-вызов в Давосе
[ редактировать ]21 января 2015 года Ник Голдман из Европейского института биоинформатики (EBI), один из первых авторов статьи Nature 2013 года , [21] объявила о Davos Bitcoin Challenge на ежегодном собрании Всемирного экономического форума в Давосе. [37] [38] Во время его презентации аудитории были розданы пробирки ДНК с сообщением о том, что каждая пробирка содержит закрытый ключ ровно одного биткойна , закодированный в ДНК. Тот, кто первым секвенирует и декодирует ДНК, сможет получить биткойн и выиграть соревнование. Конкурс был рассчитан на три года и завершится, если никто не претендует на приз до 21 января 2018 года. [38]
Почти три года спустя, 19 января 2018 года, EBI объявил, что бельгийский аспирант Сандер Вуйтс из Университета Антверпена и Брюссельского свободного университета первым выполнил задание. [39] [40] Рядом с инструкциями о том, как получить биткойны (хранящиеся в виде обычного текста и PDF-файла логотип EBI, логотип компании, напечатавшей ДНК (CustomArray), и эскиз Джеймса Джойса ), с сайта были извлечены . ДНК. [41]
Лунная библиотека
[ редактировать ]Лунная библиотека, запущенная на посадочном модуле «Берешит» Фондом Arch Mission , несет информацию, закодированную в ДНК, которая включает в себя 20 известных книг и 10 000 изображений. Это был один из оптимальных вариантов хранения, поскольку ДНК может храниться долгое время. Фонд Arch Mission предполагает, что ее все еще можно читать спустя миллиарды лет. [42] Посадочный модуль разбился 11 апреля 2019 года и был потерян. [43]
ДНК вещей
[ редактировать ]Концепция ДНК вещей (DoT) была представлена в 2019 году группой исследователей из Израиля и Швейцарии, в том числе Янивом Эрлихом и Робертом Грассом. [44] [45] [46] DoT кодирует цифровые данные в молекулы ДНК, которые затем встраиваются в объекты. Это дает возможность создавать объекты, несущие свой собственный проект, подобно биологическим организмам. В отличие от Интернета вещей , который представляет собой систему взаимосвязанных вычислительных устройств, DoT создает объекты, которые являются независимыми объектами хранения, полностью автономными .
В качестве доказательства концепции DoT исследователь напечатал на 3D-принтере , Стэнфордского кролика чертеж которого находится в пластиковой нити, используемой для печати. Отрезав крохотный кусочек уха кролика, они смогли прочитать проект, размножить его и создать следующее поколение кроликов. Кроме того, способность DoT служить для стеганографических целей была продемонстрирована путем создания неразличимых линз, содержащих видео YouTube , интегрированное в материал.
См. также
[ редактировать ]- ДНК-вычисления
- ДНК-нанотехнологии
- Нанобиотехнологии
- Естественные вычисления
- Заводское хранилище цифровых данных
- Оптическое хранилище 5D-данных
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с Сезе Л., Нивала Дж., Штраус К. (август 2019 г.). «Молекулярное хранение цифровых данных с использованием ДНК». Обзоры природы. Генетика . 20 (8): 456–466. дои : 10.1038/s41576-019-0125-3 . ПМИД 31068682 . S2CID 148570002 .
- ^ Акрам Ф., Хак И.Ю., Али Х., Лагари А.Т. (октябрь 2018 г.). «Тенденции к хранению цифровых данных в ДНК: обзор». Отчеты по молекулярной биологии . 45 (5): 1479–1490. дои : 10.1007/s11033-018-4280-y . ПМИД 30073589 . S2CID 51905843 .
- ^ Панда Д., Молла К.А., Байг М.Дж., Суэйн А., Бехера Д., Дэш М. (май 2018 г.). «ДНК как устройство хранения цифровой информации: надежда или обман?» . 3 Биотехнологии . 8 (5): 239. дои : 10.1007/s13205-018-1246-7 . ПМЦ 5935598 . ПМИД 29744271 .
- ^ Перейти обратно: а б Шенкленд С (29 июня 2019 г.). «Стартап упаковывает все 16 ГБ Википедии в нити ДНК, чтобы продемонстрировать новую технологию хранения. Биологические молекулы прослужат намного дольше, чем новейшие компьютерные технологии хранения, считает Каталог» . CNET . Проверено 7 августа 2019 г.
- ^ Перейти обратно: а б Роке Н., Бхатия С.П., Фликингер С.А., Михм С., Норсуорси М.В., Лик Д., Парк Х (20 апреля 2021 г.). «Хранение данных на основе ДНК посредством комбинаторной сборки» . bioRxiv : 2021.04.20.440194. дои : 10.1101/2021.04.20.440194 . S2CID 233415483 .
- ^ Перейти обратно: а б с Смит Г.К., Фиддес CC, Хокинс Дж.П., Кокс Дж.П. (июль 2003 г.). «Некоторые возможные коды для шифрования данных в ДНК». Письма о биотехнологиях . 25 (14): 1125–1130. дои : 10.1023/а:1024539608706 . ПМИД 12966998 . S2CID 20617098 .
- ^ Гольдман Н., Бертоне П., Чен С., Дессимоз С., ЛеПруст Э.М., Сипос Б., Бирни Э. (февраль 2013 г.). «На пути к практическому, высокоемкому и не требующему особого обслуживания хранению информации в синтезированной ДНК» . Природа . 494 (7435): 77–80. Бибкод : 2013Natur.494...77G . дои : 10.1038/nature11875 . ПМЦ 3672958 . ПМИД 23354052 .
- ^ Перейти обратно: а б Ли Х.Х., Калхор Р., Гоэла Н., Болот Дж., генеральный директор Черча (июнь 2019 г.). «Без терминатора, независимый от матрицы ферментативный синтез ДНК для хранения цифровой информации» . Природные коммуникации . 10 (1): 2383. Бибкод : 2019NatCo..10.2383L . дои : 10.1038/s41467-019-10258-1 . ПМК 6546792 . ПМИД 31160595 .
- ^ Калхор Р., Калхор К., Мехиа Л., Липер К., Гравелин А., Мали П., генеральный директор Чёрча (август 2018 г.). «Эволюционное штрих-кодирование всей мыши с помощью самонаводящегося CRISPR» . Наука . 361 (6405). дои : 10.1126/science.aat9804 . ПМК 6139672 . ПМИД 30093604 .
- ^ Лим К.К., Йео Дж.В., Кунартама А.А., Ю В.С., По КЛ (июль 2023 г.). «Биологическая камера, которая захватывает и сохраняет изображения непосредственно в ДНК» . Природные коммуникации . 14 (1): 3921. Бибкод : 2023NatCo..14.3921L . дои : 10.1038/s41467-023-38876-w . ПМЦ 10318082 . ПМИД 37400476 .
- ^ Фейнман Р.П. (29 декабря 1959 г.). «Внизу много места» . Ежегодное собрание Американского физического общества . Калифорнийский технологический институт.
- ^ Нейман М.С. (1964). «Некоторые фундаментальные вопросы микроминиатюризации» (PDF) . Радиотехника (на русском языке) (1): 3–12. [ постоянная мертвая ссылка ]
- ^ Нейман М.С. (1965). «О взаимосвязи надежности, производительности и степени микроминиатюризации на молекулярно-атомном уровне» (PDF) . Радиотехника (на русском языке) (1): 1–9. [ постоянная мертвая ссылка ]
- ^ Нейман М.С. (1965). «О системах молекулярной памяти и направленных мутациях» (PDF) . Радиотехника (на русском языке) (6): 1–8. [ постоянная мертвая ссылка ]
- ^ Винер Н. (1964). «Интервью: машины умнее людей?». Новости США и мировой отчет . 56 : 84–86.
- ^ Rebrova IM, Rebrova OY (2020). "Storage devices based on artificial DNA: the birth of an idea and the first publications" . Voprosy Istorii Estestvoznaniia i Tekhniki (in Russian). 41 (4): 666–76. doi : 10.31857/S020596060013006-8 . S2CID 234420446 .
- ^ Перейти обратно: а б Extance A (сентябрь 2016 г.). «Как ДНК может хранить все мировые данные» . Природа . 537 (7618): 22–24. Бибкод : 2016Natur.537...22E . дои : 10.1038/537022а . ПМИД 27582204 .
- ^ Скиннер ГМ, Вишер К., Мансурипур М (1 июня 2007 г.). «Биосовместимая запись данных в ДНК». Журнал бионауки . 1 (1): 17–21. arXiv : 1708.08027 . дои : 10.1166/jbns.2007.005 . S2CID 11241232 .
- ^ Черч ГМ , Гао Ю, Косури С (сентябрь 2012 г.). «Цифровое хранилище информации нового поколения в ДНК» . Наука . 337 (6102): 1628. Бибкод : 2012Sci...337.1628C . дои : 10.1126/science.1226355 . ПМИД 22903519 . S2CID 934617 .
- ^ Перейти обратно: а б с Ён Э (2013). «Синтетическая двойная спираль добросовестно хранит сонеты Шекспира». Природа . дои : 10.1038/nature.2013.12279 . S2CID 61562980 .
- ^ Перейти обратно: а б с Гольдман Н., Бертоне П., Чен С., Дессимоз С., ЛеПруст Э.М., Сипос Б., Бирни Э. (февраль 2013 г.). «На пути к практическому, высокоемкому и не требующему особого обслуживания хранению информации в синтезированной ДНК» . Природа . 494 (7435): 77–80. Бибкод : 2013Natur.494...77G . дои : 10.1038/nature11875 . ПМЦ 3672958 . ПМИД 23354052 .
- ^ Шах С., Лимбахия Д., Гупта МК (25 октября 2013 г.). «DNACloud: потенциальный инструмент для хранения больших данных на ДНК». arXiv : 1310.6992 [ cs.ET ].
- ^ Лимбахия Д., Дхамелия В., Хахар М., Гупта МК (25 апреля 2016 г.). «Об оптимальном семействе кодов для архивного хранения ДНК». 2015 Седьмой международный семинар по проектированию сигналов и их применениям в связи (IWSDA) . стр. 123–127. arXiv : 1501.07133 . дои : 10.1109/IWSDA.2015.7458386 . ISBN 978-1-4673-8308-0 . S2CID 7062541 .
- ^ Грасс Р.Н., Хекель Р., Пудду М., Паунеску Д., Старк В.Дж. (февраль 2015 г.). «Надежное химическое сохранение цифровой информации о ДНК в кремнеземе с помощью кодов, исправляющих ошибки». Ангеванде Хеми . 54 (8): 2552–2555. дои : 10.1002/anie.201411378 . ПМИД 25650567 .
- ^ Блават М., Гаедке К., Хюттер И., Чен Х.М., Турчик Б., Инверсо С., Прюитт Б.В., Чёрч GM (2016). «Прямое исправление ошибок при хранении данных ДНК» . Procedia Информатика . 80 : 1011–1022. дои : 10.1016/j.procs.2016.05.398 .
- ^ Ён Э. «Этот кусочек ДНК содержит фильм, компьютерный вирус и подарочную карту Amazon» . Атлантика . Проверено 3 марта 2017 г.
- ^ Служба РФ (2 марта 2017). «ДНК могла бы хранить все мировые данные в одной комнате» . Научный журнал . Проверено 3 марта 2017 г.
- ^ Эрлих Ю., Зелински Д. (март 2017 г.). «Фонтан ДНК обеспечивает надежную и эффективную архитектуру хранения». Наука . 355 (6328): 950–954. Бибкод : 2017Sci...355..950E . дои : 10.1126/science.aaj2038 . ПМИД 28254941 . S2CID 13470340 .
- ^ Органик Л., Анг С.Д., Чен Ю.Дж., Лопес Р., Еханин С., Макарычев К. и др. (март 2018 г.). «Произвольный доступ в крупномасштабном хранилище данных ДНК». Природная биотехнология . 36 (3): 242–248. дои : 10.1038/nbt.4079 . ПМИД 29457795 . S2CID 205285821 .
- ^ Патель П (20 февраля 2018 г.). «Хранилище данных ДНК получает произвольный доступ» . IEEE Spectrum: Новости технологий, техники и науки . Проверено 8 сентября 2018 г.
- ^ Лэнгстон Дж (21 марта 2019 г.). «Привет» Microsoft и UW демонстрируют первое полностью автоматизированное хранилище данных ДНК» . Инновационные истории . Проверено 21 марта 2019 г.
- ^ Аппусвами Р., Ле Бриганд К., Барбри П., Антонини М., Мэддерсон О., Фримонт П., Макдональд Дж., Хейнис Т. (2019). «OligoArchive: Использование ДНК в иерархии хранения СУБД» (PDF) . Конференция по исследованиям инновационных систем данных (CIDR) .
- ^ «Сайт ОлигоАрхив» . oligoarchive.github.io . Проверено 06 февраля 2019 г.
- ^ Ю Н (20 апреля 2018 г.). «Альбом Massive Attack Encoding в ДНК» . Вилы .
- ^ Табатабаи С.К., Ван Б., Атрея Н.Б., Энгиад Б., Эрнандес А.Г., Филдс С.Дж. и др. (апрель 2020 г.). «Перфокарты ДНК для хранения данных о нативных последовательностях ДНК посредством ферментативного надреза» . Природные коммуникации . 11 (1): 1742. Бибкод : 2020NatCo..11.1742T . дои : 10.1038/s41467-020-15588-z . ПМК 7142088 . ПМИД 32269230 .
- ^ Лоппиколло А., Рубашка-Эдисс Б., Торелли Е., Олулана А., Кастроново М., Феллерманн Х. и др. (август 2021 г.). «Структура данных стека «последний пришел — первый обслужен», реализованная в ДНК» . Природные коммуникации . 12 : 4861. Бибкод : 2021NatCo..12.4861L . дои : 10.1038/s41467-021-25023-6 . ПМЦ 8358042 . ПМИД 34381035 .
- ^ Голдман Н. (10 марта 2015 г.), «Вычисления будущего: жесткие диски ДНК» , Всемирный экономический форум , получено 19 мая 2018 г.
- ^ Перейти обратно: а б «Хранилище ДНК» . Европейский институт биоинформатики . Проверено 19 мая 2018 г.
- ^ «Бельгийский аспирант расшифровывает ДНК и выигрывает биткойн» . Европейский институт биоинформатики . 19 января 2018 года . Проверено 19 мая 2018 г.
- ^ Оберхаус Д (24 января 2018 г.). «Часть ДНК содержала ключ к 1 биткойну, и этот парень взломал код» . Порок: Материнская плата . Проверено 19 мая 2018 г.
- ^ Вуйтс С (16 января 2018 г.). «От ДНК к биткойну: как я выиграл биткойн-конкурс по хранению ДНК в Давосе» . Слово Пресс . Проверено 19 мая 2018 г.
- ^ Московиц К. «Лунная библиотека с кодом ДНК направлена на сохранение цивилизации на тысячелетия» . Научный американец . Проверено 9 января 2022 г.
- ^ Лидман, Мелани. «Израильский космический корабль «Берешит» врезался в Луну при попытке приземления» . Таймс Израиля .
- ^ Кох Дж., Гантенбейн С., Масания К., Старк В.Дж., Эрлих Ю., Грасс Р.Н. (январь 2020 г.). «Архитектура хранения ДНК вещей для создания материалов со встроенной памятью». Природная биотехнология . 38 (1): 39–43. дои : 10.1038/s41587-019-0356-z . ПМИД 31819259 . S2CID 209164262 .
- ^ Молтени М (09.12.2019). «Эти пластиковые кролики получили обновление ДНК. Дальше — мир?» . Проводной . Проверено 9 декабря 2019 г.
- ^ Хотц Р.Л. (09.12.2019). «Ученые хранят данные в синтетической ДНК, встроенной в пластикового кролика» . Уолл Стрит Джорнал . Проверено 9 декабря 2019 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Мардис ЭР (2008). «Методы секвенирования ДНК нового поколения». Ежегодный обзор геномики и генетики человека . 9 : 387–402. дои : 10.1146/annurev.genom.9.081307.164359 . ПМИД 18576944 . S2CID 2484571 .
- Жирнов В., Задеган Р.М., Сандху Г.С., Черч ГМ, Хьюз В.Л. (апрель 2016 г.). «Нуклеиновая память» . Природные материалы . 15 (4): 366–370. Бибкод : 2016NatMa..15..366Z . дои : 10.1038/nmat4594 . ПМК 6361517 . ПМИД 27005909 .
- Коул А. (24 января 2013 г.). «Должен ли я закодировать тебя в ДНК? Сонеты, хранящиеся на двойной спирали?» (Статья доступна для скачивания и аудио) . Национальное общественное радио.
- Наик Г. (24 января 2013 г.). «Хранение цифровых данных в ДНК» . Уолл Стрит Джорнал . Нью-Йорк: Dow Jones & Company . Проверено 25 января 2012 г.
- Секвенирование ДНК попало в поток данных . Нью-Йорк Таймс (NYTimes.com).
- Арон Дж. (15 февраля 2015 г.). «Застекленная ДНК представляет собой идеальную капсулу времени» . Новый учёный . Проверено 19 февраля 2015 г.
- «Storagene — использование ДНК для долгосрочного цифрового хранения данных» . Конкурс iGEM . 21 октября 2021 г. . Проверено 26 октября 2022 г.