Аффимер

Аффимерные молекулы ^{[ 1 ]} представляют собой небольшие белки , которые связываются с белками-мишенями со сродством в наномолярном диапазоне. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Эти сконструированные белки, не связывающие антитела, созданы для имитации характеристик молекулярного распознавания моноклональных антител в различных приложениях. ^{[ 2 ]}^{[ 4 ]} Эти аффинные реагенты были оптимизированы для повышения их стабильности. ^{[ 5 ]} сделать их толерантными к диапазону температур и pH, ^{[ 6 ]} уменьшить их размер и увеличить их экспрессию в E.coli и млекопитающих. клетках ^{[ 2 ]}

Разработка

Аффимерные белки были первоначально разработаны в отделении раковых клеток MRC в Кембридже, а затем в двух лабораториях Университета Лидса . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} Получен из , ингибиторов цистеиновой протеазы семейства цистатинов , которые в природе действуют как ингибиторы цистеиновой протеазы. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} эти белки массой 12–14 кДа имеют общую третичную структуру альфа-спирали, лежащей поверх антипараллельного бета-листа . ^{[ 13 ]}

Аффимерные белки содержат две пептидные петли, которые можно рандомизировать для связывания с желаемыми целевыми белками. ^{[ 5 ]} аналогично моноклональным антителам . Стабилизация двух пептидов белковым каркасом ограничивает возможные конформации, которые могут принять пептиды. Это увеличивает аффинность и специфичность связывания по сравнению с библиотеками свободных пептидов, но может ограничивать целевой репертуар аффимеров.

Производство

фагового дисплея 10 библиотек ⁹ рандомизированные последовательности ^{[ 14 ]} используются для скрининга белков-аффимеров, которые демонстрируют высокую специфичность связывания с целевым белком со сродством связывания в нМ диапазоне. ^{[ 5 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]} Возможность использовать методы скрининга in vitro позволяет идентифицировать специфические аффинеры с высоким сродством. Скрининг и разработка in vitro также означают, что целевое пространство для аффимеров не ограничено иммунной системой животного . Аффимеры генерируются с использованием рекомбинантных систем, поэтому их создание происходит более быстро и воспроизводимо по сравнению с получением поликлональных антител . ^{[ 17 ]}

Были созданы мультимерные формы Аффимеры, и было показано, что они дают титры в диапазоне 200–400 мг/л при мелкомасштабной культуре с использованием бактериальных систем-хозяев. Мультимерные формы аффимеров с одинаковой целевой специфичностью обеспечивают эффекты авидности при связывании с мишенью.

множество различных меток и слитых белков, таких как флуорофоры , одноцепочечная ДНК, His и c-Myc -метки. С аффимерами можно конъюгировать ^{[ 2 ]}^{[ 18 ]}^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}^{[ 21 ]}^{[ 22 ]} В белок можно ввести специфические остатки цистеина, чтобы позволить тиоловому химическому составу равномерно ориентировать аффимеры на твердой подложке, например, на планшетах для ELISA. ^{[ 5 ]}^{[ 15 ]}^{[ 17 ]}^{[ 23 ]}^{[ 24 ]} Эта гибкая функционализация молекулы Affimer обеспечивает функциональность в различных приложениях и форматах анализа.

Характеристики

Аффимеры – рекомбинантные белки. Поскольку они производятся с использованием процессов производства рекомбинантных бактерий, стабильность аффимеров от партии к партии улучшается по сравнению с поликлональными антителами, что позволяет решить некоторые проблемы воспроизводимости и безопасности поставок. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 17 ]}^{[ 25 ]}^{[ 26 ]}

Эти синтетические антитела были разработаны так, чтобы быть стабильными, нетоксичными, биологически нейтральными и не содержать посттрансляционных модификаций или дисульфидных мостиков . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 10 ]} Две отдельные последовательности петель, включающие в общей сложности от 12 до 36 аминокислот, образуют целевую поверхность взаимодействия, поэтому поверхности взаимодействия могут находиться в диапазоне 650–1000 Å . Большая поверхность взаимодействия позволяет связываться с целевыми белками. ^{[ 5 ]}^{[ 7 ]}^{[ 10 ]}^{[ 15 ]}^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}^{[ 27 ]}^{[ 28 ]}^{[ 29 ]}^{[ 30 ]}

Приложения

Технология Affimer была коммерциализирована и разработана компанией Avacta, которая разрабатывает эти аффинные реагенты в качестве инструментов для диагностики и биотерапии.

Реагенты и диагностика

Связующие Affimer использовались на ряде платформ, включая ELISA , ^{[ 2 ]}^{[ 17 ]}^{[ 31 ]} поверхностный плазмонный резонанс , ^{[ 32 ]}^{[ 31 ]}^{[ 33 ]}^{[ 34 ]} аффинная очистка . ^{[ 2 ]}^{[ 31 ]}^{[ 35 ]}^{[ 36 ]} Аффимеры, которые ингибируют белок-белковые взаимодействия, могут быть получены с возможностью экспрессии этих ингибиторов в клетках млекопитающих, модифицирующих сигнальные пути в качестве клеточной терапии. ^{[ 2 ]}^{[ 32 ]}^{[ 33 ]}^{[ 37 ]}^{[ 38 ]}

Терапия

Небольшой размер и профиль стабильности аффимеров в сочетании с их человеческим происхождением придают им свойства, подобные лекарственным средствам. Это может представлять собой преимущество перед антителами с точки зрения проникновения в ткани, например, при солидных опухолях , где Avacta разрабатывает ингибиторы PD-L1 в качестве альтернативы Опдиво и Ервое. ^{[ 39 ]} хотя требуется модификация периода полувыведения, чтобы предотвратить быстрое выведение через почки.

Аффимеры можно конъюгировать с образованием мультимеров для разработки терапевтических средств. Примеры включают производство мультиспецифичных молекул аффимеров для связывания альбумина для увеличения периода их полураспада in vivo и для использования в качестве нацеливающего фрагмента в химерных рецепторах или модификации для переноса токсина в конъюгатах аффимер-лекарственное средство. ^{[ 16 ]}^{[ 39 ]}^{[ 40 ]}

Аффимеры в качестве терапевтических средств находятся в стадии открытия и доклинической разработки для борьбы с раком , как с помощью CAR-T- клеточной терапии, так и в качестве ингибиторов иммунных контрольных точек . ^{[ 39 ]}^{[ 41 ]}^{[ 42 ]}^{[ 43 ]} Ранние исследования с использованием ex vivo образцов человека показали низкую иммуногенность , связанную с каркасом Affimer, на уровнях, сравнимых с коммерческими терапевтическими антителами. ^{[ 44 ]} Кроме того, первоначальные доклинические исследования показали хорошую эффективность и переносимость против PDL1 иммуноонкологических аффимеров на мышах. Ожидается, что подача заявки в IND на первый терапевтический препарат Affimer произойдет в 2023 году. ^{[ 16 ]}

Ссылки

^ Собственное название, принадлежит Avacta.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Тиде С., Бедфорд Р., Хезелтайн С.Дж., Смит Г., Видетунга И., Росс Р. и др. (июнь 2017 г.). «Аффимерные белки — это универсальные и возобновляемые аффинные реагенты» . электронная жизнь . 6 . дои : 10.7554/elife.24903 . ПМЦ 5487212 . ПМИД 28654419 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Клонт Ф., Хаддеринг М., Хорватович П., Тен Хакен Н.Х., Бишофф Р. (август 2018 г.). «Аффимеры как альтернатива антителам в анализе аффинной ЖХ-МС для количественного определения растворимого рецептора конечных продуктов гликирования (sRAGE) в сыворотке человека» . Журнал исследований протеома . 17 (8): 2892–2899. doi : 10.1021/acs.jproteome.8b00414 . ПМК 6079930 . ПМИД 30005571 .
^ «Альтернативы антител» . Журнал «Ученый»® . Проверено 18 октября 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Шарма Р., Дикон С.Э., Новак Д., Джордж С.Е., Шимоник М.П., Тан А.А., Томлинсон, округ Колумбия, Дэвис А.Г., Макферсон М.Дж., Вэлти К. (июнь 2016 г.). «Безмаркированный электрохимический импедансный биосенсор для обнаружения интерлейкина-8 человека в сыворотке с чувствительностью менее пг/мл» . Биосенсоры и биоэлектроника . 80 : 607–613. дои : 10.1016/j.bios.2016.02.028 . ПМЦ 4785862 . ПМИД 26897263 .
^ Роулингс А.Э., Брамбл Дж.П., Тан А.А., Сомнер Л.А., Моннингтон А.Е., Кук DJ, Макферсон М.Дж., Томлинсон О.К., Станиленд СС (октябрь 2015 г.). «Фаговый дисплей выбранных адхиронов, взаимодействующих с магнетитом, для синтеза наночастиц с контролируемой формой» . Химическая наука . 6 (10): 5586–5594. дои : 10.1039/C5SC01472G . ПМЦ 5949846 . ПМИД 29861896 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Вудман Р., Йе Дж.Т., Лоренсон С., Ко Ферриньо П. (октябрь 2005 г.). «Разработка и проверка нейтрального белкового каркаса для презентации пептидных аптамеров». Журнал молекулярной биологии . 352 (5): 1118–33. дои : 10.1016/j.jmb.2005.08.001 . ПМИД 16139842 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Хоффманн Т., Стадлер Л.К., Басби М., Сонг К., Бакстон А.Т., Вагнер С.Д., Дэвис Дж.Дж., Ко Ферриньо П. (май 2010 г.). «Исследование структуры и функции сконструированного каркасного белка, полученного из стефина A. I: Разработка варианта SQM» . Белковая инженерия, проектирование и отбор . 23 (5): 403–13. дои : 10.1093/протеин/gzq012 . ПМЦ 2851446 . ПМИД 20179045 .
^ Стадлер Л.К., Хоффманн Т., Томлинсон Д.С., Сонг К., Ли Т., Басби М., Ньяти Ю., Гендра Э., Тиде С., Фланаган К., Кокелл С.Дж., Випат А., Харвуд К., Вагнер С.Д., Ноулз М.А., Дэвис Дж.Дж., Киган Н. , Ферриньо ПК (сентябрь 2011 г.). «Исследования структуры и функции сконструированного каркасного белка, полученного из Stefin A. II: разработка и применение варианта SQT». Белковая инженерия, проектирование и отбор . 24 (9): 751–63. дои : 10.1093/протеин/gzr019 . ПМИД 21616931 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Тиде С., Тан А.А., Дикон С.Э., Мандал Ю., Неттлшип Дж.Э., Оуэн Р.Л., Джордж С.Э., Харрисон Д.Д., Оуэнс Р.Дж., Томлинсон Д.С., Макферсон М.Дж. (май 2014 г.). «Адирон: стабильный и универсальный каркас для отображения пептидов для приложений молекулярного распознавания» . Белковая инженерия, проектирование и отбор . 27 (5): 145–55. дои : 10.1093/протеин/gzu007 . ПМЦ 4000234 . ПМИД 24668773 .
^ Турк В., Стока В., Турк Д. (май 2008 г.). «Цистатины: биохимические и структурные свойства и медицинская значимость» . Границы бионауки . 13 (13): 5406–20. дои : 10.2741/3089 . ПМИД 18508595 .
^ Кондо Х., Абэ К., Эмори Ю., Арай С. (январь 1991 г.). «Организация генов оризацистатина-II, нового члена суперсемейства цистатинов растительного происхождения, тесно связана с организацией генов оризацистатина-I, но отличается от таковой у цистатинов животных» . Письма ФЭБС . 278 (1): 87–90. дои : 10.1016/0014-5793(91)80090-п . ПМИД 1993479 . S2CID 40605067 .
^ Терк В., Боде В. (июль 1991 г.). «Цистатины: белковые ингибиторы цистеиновых протеиназ». Письма ФЭБС . 285 (2): 213–9. дои : 10.1016/0014-5793(91)80804-C . ПМИД 1855589 . S2CID 40444629 .
^ Аррата И., Барнард А., Томлинсон, округ Колумбия, Уилсон А.Дж. (март 2017 г.). «Взаимодействие нативных и ненативных пептидов: использование аффимеров для распознавания фолдамеров, имитирующих α-спираль» (PDF) . Химические коммуникации . 53 (19): 2834–2837. дои : 10.1039/c6cc09395g . ПМИД 28217789 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Журауски П., Арья С.К., Джолли П., Тиде С., Томлинсон Д.С., Ко Ферриньо П., Эстрела П. (июнь 2018 г.). «Чувствительный и селективный емкостный биосенсор на основе встречно-штыревых электродов с функционалом Affimer для обнаружения опухолевых биомаркеров белка Her4» (PDF) . Биосенсоры и биоэлектроника . 108 : 1–8. дои : 10.1016/j.bios.2018.02.041 . ПМИД 29482002 . S2CID 3549374 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Басран А., Стэнли Э (01 июля 2018 г.). «Реферат 3776: Создание и форматирование биотерапевтического препарата Affimer® для ингибирования пути PD-L1/PD-1: подтверждение концепции на мышах» . Исследования рака . 78 (13 Дополнение): 3776. doi : 10.1158/1538-7445.AM2018-3776 . ISSN 0008-5472 . S2CID 81376936 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Се С, Тиде С, Чжан X, Ван C, Ли Z, Сюй X, Макферсон MJ, Томлинсон DC, Сюй W (август 2017 г.). «Разработка комбинированного иммунологического диагностического набора «Аффимер-антитело» к глипикану-3» . Научные отчеты . 7 (1): 9608. Бибкод : 2017NatSR...7.9608X . дои : 10.1038/s41598-017-10083-w . ПМК 5575301 . ПМИД 28852111 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Шлихтаерле Т., Эклунд А.С., Шудер Ф., Штраус М.Т., Тиде С., Курд А., Райс Дж., Пекхэм М., Томлинсон Д.К., Юнгманн Р. (август 2018 г.). «Метка аффимеров для конкретного участка для микроскопии ДНК-краски» (PDF) . Ангеванде Хеми . 57 (34): 11060–11063. дои : 10.1002/anie.201804020 . ПМИД 29873161 . S2CID 46950252 .
^ Бедфорд Р., Тиде С., Хьюз Р., Курд А., Макферсон М.Дж., Пекхэм М., Томлинсон, округ Колумбия (август 2017 г.). «Альтернативные реагенты к антителам в приложениях визуализации» . Биофизические обзоры . 9 (4): 299–308. дои : 10.1007/s12551-017-0278-2 . ПМЦ 5578921 . ПМИД 28752365 .
^ Лопата А., Хьюз Р., Тиде С., Хейслер С.М., Селлерс-младший, Найт П.Дж., Томлинсон Д., Пекхэм М. (апрель 2018 г.). «Аффимерные белки для F-актина: новые аффинные реагенты, которые метят F-актин в живых и фиксированных клетках» . Научные отчеты . 8 (1): 6572. Бибкод : 2018NatSR...8.6572L . дои : 10.1038/s41598-018-24953-4 . ПМК 5920084 . ПМИД 29700342 .
^ Ван В., Го И., Тиде С., Чен С., Копытински М., Конг Ю., Кулак А., Томлинсон Д., Чен Р., Макферсон М., Чжоу Д. (май 2017 г.). «Сверхэффективный протокол замены крышек для уплотнения биофункциональных квантовых точек для чувствительного ратиометрического биосенсорства и визуализации клеток» . Прикладные материалы и интерфейсы ACS . 9 (18): 15232–15244. дои : 10.1021/acsami.6b13807 . ПМЦ 5432960 . ПМИД 28421739 .
^ Фишер М.Дж., Уильямсон Д.Дж., Берслем Г.М., Планте Дж.П., Мэнфилд И.В., Тиде С., Олт Дж.Р., Стокли П.Г., Плейн С., Макбул А., Томлинсон Д.С., Фостер Р., Уорринер С.Л., Бон РС (декабрь 2015 г.). «Трёхвалентные реагенты Gd-DOTA для модификации белков» . РСК Прогресс . 5 (116): 96194–96200. Бибкод : 2015RSCAd...596194F . дои : 10.1039/c5ra20359g . ПМЦ 4786947 . ПМИД 27019702 .
^ Векман Н.Е., Макрей С., Ко Ферриньо П., Сешиа А.А. (октябрь 2016 г.). «Сравнение специфичности и сродства поверхностных иммобилизованных связующих Affimer с использованием кварцевых микровесов». Аналитик . 141 (22): 6278–6286. Бибкод : 2016Ана...141.6278Вт . дои : 10.1039/c6an01602b . ПМИД 27704086 .
^ Кутсумпели Э., Тиде С., Мюррей Дж., Тан А., Бон Р.С., Томлинсон Д.С., Джонсон С. (март 2017 г.). «Миметики антител для обнаружения малых органических соединений с использованием кварцевых микровесов» . Аналитическая химия . 89 (5): 3051–3058. дои : 10.1021/acs.analchem.6b04790 . ПМИД 28192970 .
^ «Антиидиотипические связывающие вещества для трастузумаба подтверждены в ходе нормативного биоанализа в сотрудничестве с Covance» . Авакта . Архивировано из оригинала 19 октября 2018 г. Проверено 19 октября 2018 г.
^ «Разработка и проверка антиидиотипических эффектов трастузумаба в фармакокинетическом анализе | Avacta» . www.avacta.com . Архивировано из оригинала 19 октября 2018 г. Проверено 19 октября 2018 г.
^ Дэвис Дж. Дж., Ткач Дж., Лоуренсон С., Ко Ферриньо П. (февраль 2007 г.). «Пептидные аптамеры при обнаружении белков без меток: 1. Характеристика иммобилизованного каркаса». Аналитическая химия . 79 (3): 1089–96. дои : 10.1021/ac061863z . ПМИД 17263340 .
^ Дэвис Дж.Дж., Ткач Дж., Хамфрис Р., Бакстон А.Т., Ли Т.А., Ко Ферриньо П. (май 2009 г.). «Пептидные аптамеры при обнаружении белков без меток: 2. Химическая оптимизация и обнаружение различных изоформ белка». Аналитическая химия . 81 (9): 3314–20. дои : 10.1021/ac802513n . ПМИД 19320493 .
^ «Связующие вещества Affimer улучшают эффективность диагностического анализа для обнаружения C.difficile» . Авакта . Архивировано из оригинала 19 октября 2018 г. Проверено 19 октября 2018 г.
^ «Разработка и характеристика связующих аффимеров с 4 ведущими терапевтическими антителами | Avacta» . www.avacta.com . Архивировано из оригинала 19 октября 2018 г. Проверено 19 октября 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ученый Avacta доктор Джефф Платт представляет данные Affimer на вебинаре | Avacta» . www.avacta.com . Архивировано из оригинала 22 октября 2018 г. Проверено 22 октября 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Робинсон Дж.И., Бакстер Э.В., Оуэн Р.Л., Томсен М., Томлинсон Д.С., Уотерхаус М.П., Вин С.Дж., Неттлшип Дж.Э., Тиде С., Фостер Р.Дж., Оуэнс Р.Дж., Фишвик К.В., Харрис С.А., Голдман А., Макферсон М.Дж., Морган А.В. (январь 2018 г.) ). «Аффимерные белки ингибируют связывание иммунного комплекса с FcγRIIIa с высокой специфичностью посредством конкурентного и аллостерического механизмов действия» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (1): Е72–Е81. дои : 10.1073/pnas.1707856115 . ПМЦ 5776790 . ПМИД 29247053 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Мишель М.А., Сватек К.Н., Хоспенталь М.К., Командер Д. (октябрь 2017 г.). «Аффимеры, специфичные для убиквитиновых связей, раскрывают информацию о передаче сигналов убиквитина, связанного с K6» . Молекулярная клетка . 68 (1): 233–246.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2017.08.020 . ПМК 5640506 . ПМИД 28943312 .
^ Джонсон А., Сонг Кью, Ко Ферриньо П., Буэно П.Р., Дэвис Дж.Дж. (август 2012 г.). «Чувствительный импедиметрический анализ без меток на основе аффимеров и антител для С-реактивного белка». Аналитическая химия . 84 (15): 6553–60. дои : 10.1021/ac300835b . ПМИД 22789061 .
^ «Реактивы Affimer® облегчают очистку с помощью аффинной хроматографии» . www.drugtargetreview.com . Проверено 22 октября 2018 г.
^ Печливани, Николетта; Кирни, Кэтрин Дж.; Тиде, Кристиан; Чеа, Рамса; Феникс, Фладия; Поннамбалам, Шринивасан; Олт, Джеймс Р.; Макферсон, Майкл Дж.; Томлинсон, Даррен С.; Аджан, Рамзи А. (01 мая 2022 г.). «Аффинная очистка фибриногена с использованием колонки Affimer» . Биохимия и биофизика Acta (BBA) – общие предметы 1866 : 130115.doi : (5 ) 10.1016/j.bbagen.2022.130115 . ISSN 0304-4165 . ПМИД 35240235 . S2CID 247199635 .
^ Кайл Х.Ф., Уиксон К.Ф., Стотт Дж., Берслем Г.М., Бриз А.Л., Тиде С., Томлинсон Д.С., Уорринер С.Л., Нельсон А., Уилсон А.Дж., Эдвардс Т.А. (октябрь 2015 г.). «Исследование интерфейса HIF-1α/p300 с использованием технологий пептидного и фагового дисплея Adhiron» . Молекулярные биосистемы . 11 (10): 2738–49. дои : 10.1039/c5mb00284b . ПМИД 26135796 .
^ Гейдельбергер Дж.Б., Фойгт А., Борисова М.Е., Петрозино Г., Руф С., Вагнер С.А., Бели П. (апрель 2018 г.). «Протеомное профилирование субстратов VCP связывает VCP с K6-связанным убиквитилированием и функцией c-Myc» . Отчеты ЭМБО . 19 (4): e44754. дои : 10.15252/эмбр.201744754 . ПМЦ 5891417 . ПМИД 29467282 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Интервью с Амриком Басраном из Avacta Life Sciences» . Обзор целевых показателей лекарств .
^ «Аффимерные лекарственные конъюгаты TMAC» . Авакта . Архивировано из оригинала 22 октября 2018 г. Проверено 22 октября 2018 г.
^ Маллиган, Том. «Avacta и Мемориальный онкологический центр Слоана-Кеттеринга сотрудничают в исследованиях клеточной терапии» . Архивировано из оригинала 3 июля 2022 г. Проверено 22 октября 2018 г.
^ «Пайплайн | Авакта» . www.avacta.com . Проверено 22 октября 2018 г.
^ Кинг Р., Тиде С., Симмонс К., Фишвик С., Томлинсон Д., Аджан Р. (февраль 2015 г.). «Ингибирование взаимодействия комплемента C3 и фибриногена: потенциальная новая терапевтическая мишень для уменьшения сердечно-сосудистых заболеваний при диабете». Ланцет . 385 (Приложение 1): S57. дои : 10.1016/s0140-6736(15)60372-5 . ПМИД 26312879 . S2CID 35622552 .
^ «Технология Affimer: результаты тестирования иммуногенности PBMC» . Авакта . Архивировано из оригинала 22 октября 2018 г. Проверено 22 октября 2018 г.

Внешние ссылки

[1] Собственное название, принадлежит Avacta.

[:0-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Тиде С., Бедфорд Р., Хезелтайн С.Дж., Смит Г., Видетунга И., Росс Р. и др. (июнь 2017 г.). «Аффимерные белки — это универсальные и возобновляемые аффинные реагенты» . электронная жизнь . 6 . дои : 10.7554/elife.24903 . ПМЦ 5487212 . ПМИД 28654419 .

[:3-3] Перейти обратно: ^а ^б Клонт Ф., Хаддеринг М., Хорватович П., Тен Хакен Н.Х., Бишофф Р. (август 2018 г.). «Аффимеры как альтернатива антителам в анализе аффинной ЖХ-МС для количественного определения растворимого рецептора конечных продуктов гликирования (sRAGE) в сыворотке человека» . Журнал исследований протеома . 17 (8): 2892–2899. doi : 10.1021/acs.jproteome.8b00414 . ПМК 6079930 . ПМИД 30005571 .

[4] «Альтернативы антител» . Журнал «Ученый»® . Проверено 18 октября 2018 г.

[Sharma-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Шарма Р., Дикон С.Э., Новак Д., Джордж С.Е., Шимоник М.П., Тан А.А., Томлинсон, округ Колумбия, Дэвис А.Г., Макферсон М.Дж., Вэлти К. (июнь 2016 г.). «Безмаркированный электрохимический импедансный биосенсор для обнаружения интерлейкина-8 человека в сыворотке с чувствительностью менее пг/мл» . Биосенсоры и биоэлектроника . 80 : 607–613. дои : 10.1016/j.bios.2016.02.028 . ПМЦ 4785862 . ПМИД 26897263 .

[pubs.rsc.org-6] Роулингс А.Э., Брамбл Дж.П., Тан А.А., Сомнер Л.А., Моннингтон А.Е., Кук DJ, Макферсон М.Дж., Томлинсон О.К., Станиленд СС (октябрь 2015 г.). «Фаговый дисплей выбранных адхиронов, взаимодействующих с магнетитом, для синтеза наночастиц с контролируемой формой» . Химическая наука . 6 (10): 5586–5594. дои : 10.1039/C5SC01472G . ПМЦ 5949846 . ПМИД 29861896 .

[Woodman-7] Перейти обратно: ^а ^б ^с Вудман Р., Йе Дж.Т., Лоренсон С., Ко Ферриньо П. (октябрь 2005 г.). «Разработка и проверка нейтрального белкового каркаса для презентации пептидных аптамеров». Журнал молекулярной биологии . 352 (5): 1118–33. дои : 10.1016/j.jmb.2005.08.001 . ПМИД 16139842 .

[Hoffmann-8] Перейти обратно: ^а ^б Хоффманн Т., Стадлер Л.К., Басби М., Сонг К., Бакстон А.Т., Вагнер С.Д., Дэвис Дж.Дж., Ко Ферриньо П. (май 2010 г.). «Исследование структуры и функции сконструированного каркасного белка, полученного из стефина A. I: Разработка варианта SQM» . Белковая инженерия, проектирование и отбор . 23 (5): 403–13. дои : 10.1093/протеин/gzq012 . ПМЦ 2851446 . ПМИД 20179045 .

[Stadler-9] Стадлер Л.К., Хоффманн Т., Томлинсон Д.С., Сонг К., Ли Т., Басби М., Ньяти Ю., Гендра Э., Тиде С., Фланаган К., Кокелл С.Дж., Випат А., Харвуд К., Вагнер С.Д., Ноулз М.А., Дэвис Дж.Дж., Киган Н. , Ферриньо ПК (сентябрь 2011 г.). «Исследования структуры и функции сконструированного каркасного белка, полученного из Stefin A. II: разработка и применение варианта SQT». Белковая инженерия, проектирование и отбор . 24 (9): 751–63. дои : 10.1093/протеин/gzr019 . ПМИД 21616931 .

[Tiede-10] Перейти обратно: ^а ^б ^с Тиде С., Тан А.А., Дикон С.Э., Мандал Ю., Неттлшип Дж.Э., Оуэн Р.Л., Джордж С.Э., Харрисон Д.Д., Оуэнс Р.Дж., Томлинсон Д.С., Макферсон М.Дж. (май 2014 г.). «Адирон: стабильный и универсальный каркас для отображения пептидов для приложений молекулярного распознавания» . Белковая инженерия, проектирование и отбор . 27 (5): 145–55. дои : 10.1093/протеин/gzu007 . ПМЦ 4000234 . ПМИД 24668773 .

[Turk-11] Турк В., Стока В., Турк Д. (май 2008 г.). «Цистатины: биохимические и структурные свойства и медицинская значимость» . Границы бионауки . 13 (13): 5406–20. дои : 10.2741/3089 . ПМИД 18508595 .

[Kondo-12] Кондо Х., Абэ К., Эмори Ю., Арай С. (январь 1991 г.). «Организация генов оризацистатина-II, нового члена суперсемейства цистатинов растительного происхождения, тесно связана с организацией генов оризацистатина-I, но отличается от таковой у цистатинов животных» . Письма ФЭБС . 278 (1): 87–90. дои : 10.1016/0014-5793(91)80090-п . ПМИД 1993479 . S2CID 40605067 .

[Turk_and_Bode-13] Терк В., Боде В. (июль 1991 г.). «Цистатины: белковые ингибиторы цистеиновых протеиназ». Письма ФЭБС . 285 (2): 213–9. дои : 10.1016/0014-5793(91)80804-C . ПМИД 1855589 . S2CID 40444629 .

[:9-14] Аррата И., Барнард А., Томлинсон, округ Колумбия, Уилсон А.Дж. (март 2017 г.). «Взаимодействие нативных и ненативных пептидов: использование аффимеров для распознавания фолдамеров, имитирующих α-спираль» (PDF) . Химические коммуникации . 53 (19): 2834–2837. дои : 10.1039/c6cc09395g . ПМИД 28217789 .

[:1-15] Перейти обратно: ^а ^б ^с Журауски П., Арья С.К., Джолли П., Тиде С., Томлинсон Д.С., Ко Ферриньо П., Эстрела П. (июнь 2018 г.). «Чувствительный и селективный емкостный биосенсор на основе встречно-штыревых электродов с функционалом Affimer для обнаружения опухолевых биомаркеров белка Her4» (PDF) . Биосенсоры и биоэлектроника . 108 : 1–8. дои : 10.1016/j.bios.2018.02.041 . ПМИД 29482002 . S2CID 3549374 .

[:7-16] Перейти обратно: ^а ^б ^с Басран А., Стэнли Э (01 июля 2018 г.). «Реферат 3776: Создание и форматирование биотерапевтического препарата Affimer® для ингибирования пути PD-L1/PD-1: подтверждение концепции на мышах» . Исследования рака . 78 (13 Дополнение): 3776. doi : 10.1158/1538-7445.AM2018-3776 . ISSN 0008-5472 . S2CID 81376936 .

[:2-17] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и Се С, Тиде С, Чжан X, Ван C, Ли Z, Сюй X, Макферсон MJ, Томлинсон DC, Сюй W (август 2017 г.). «Разработка комбинированного иммунологического диагностического набора «Аффимер-антитело» к глипикану-3» . Научные отчеты . 7 (1): 9608. Бибкод : 2017NatSR...7.9608X . дои : 10.1038/s41598-017-10083-w . ПМК 5575301 . ПМИД 28852111 .

[:4-18] Перейти обратно: ^а ^б Шлихтаерле Т., Эклунд А.С., Шудер Ф., Штраус М.Т., Тиде С., Курд А., Райс Дж., Пекхэм М., Томлинсон Д.К., Юнгманн Р. (август 2018 г.). «Метка аффимеров для конкретного участка для микроскопии ДНК-краски» (PDF) . Ангеванде Хеми . 57 (34): 11060–11063. дои : 10.1002/anie.201804020 . ПМИД 29873161 . S2CID 46950252 .

[:10-19] Бедфорд Р., Тиде С., Хьюз Р., Курд А., Макферсон М.Дж., Пекхэм М., Томлинсон, округ Колумбия (август 2017 г.). «Альтернативные реагенты к антителам в приложениях визуализации» . Биофизические обзоры . 9 (4): 299–308. дои : 10.1007/s12551-017-0278-2 . ПМЦ 5578921 . ПМИД 28752365 .

[:11-20] Лопата А., Хьюз Р., Тиде С., Хейслер С.М., Селлерс-младший, Найт П.Дж., Томлинсон Д., Пекхэм М. (апрель 2018 г.). «Аффимерные белки для F-актина: новые аффинные реагенты, которые метят F-актин в живых и фиксированных клетках» . Научные отчеты . 8 (1): 6572. Бибкод : 2018NatSR...8.6572L . дои : 10.1038/s41598-018-24953-4 . ПМК 5920084 . ПМИД 29700342 .

[21] Ван В., Го И., Тиде С., Чен С., Копытински М., Конг Ю., Кулак А., Томлинсон Д., Чен Р., Макферсон М., Чжоу Д. (май 2017 г.). «Сверхэффективный протокол замены крышек для уплотнения биофункциональных квантовых точек для чувствительного ратиометрического биосенсорства и визуализации клеток» . Прикладные материалы и интерфейсы ACS . 9 (18): 15232–15244. дои : 10.1021/acsami.6b13807 . ПМЦ 5432960 . ПМИД 28421739 .

[22] Фишер М.Дж., Уильямсон Д.Дж., Берслем Г.М., Планте Дж.П., Мэнфилд И.В., Тиде С., Олт Дж.Р., Стокли П.Г., Плейн С., Макбул А., Томлинсон Д.С., Фостер Р., Уорринер С.Л., Бон РС (декабрь 2015 г.). «Трёхвалентные реагенты Gd-DOTA для модификации белков» . РСК Прогресс . 5 (116): 96194–96200. Бибкод : 2015RSCAd...596194F . дои : 10.1039/c5ra20359g . ПМЦ 4786947 . ПМИД 27019702 .

[:5-23] Векман Н.Е., Макрей С., Ко Ферриньо П., Сешиа А.А. (октябрь 2016 г.). «Сравнение специфичности и сродства поверхностных иммобилизованных связующих Affimer с использованием кварцевых микровесов». Аналитик . 141 (22): 6278–6286. Бибкод : 2016Ана...141.6278Вт . дои : 10.1039/c6an01602b . ПМИД 27704086 .

[:15-24] Кутсумпели Э., Тиде С., Мюррей Дж., Тан А., Бон Р.С., Томлинсон Д.С., Джонсон С. (март 2017 г.). «Миметики антител для обнаружения малых органических соединений с использованием кварцевых микровесов» . Аналитическая химия . 89 (5): 3051–3058. дои : 10.1021/acs.analchem.6b04790 . ПМИД 28192970 .

[:16-25] «Антиидиотипические связывающие вещества для трастузумаба подтверждены в ходе нормативного биоанализа в сотрудничестве с Covance» . Авакта . Архивировано из оригинала 19 октября 2018 г. Проверено 19 октября 2018 г.

[:17-26] «Разработка и проверка антиидиотипических эффектов трастузумаба в фармакокинетическом анализе | Avacta» . www.avacta.com . Архивировано из оригинала 19 октября 2018 г. Проверено 19 октября 2018 г.

[27] Дэвис Дж. Дж., Ткач Дж., Лоуренсон С., Ко Ферриньо П. (февраль 2007 г.). «Пептидные аптамеры при обнаружении белков без меток: 1. Характеристика иммобилизованного каркаса». Аналитическая химия . 79 (3): 1089–96. дои : 10.1021/ac061863z . ПМИД 17263340 .

[28] Дэвис Дж.Дж., Ткач Дж., Хамфрис Р., Бакстон А.Т., Ли Т.А., Ко Ферриньо П. (май 2009 г.). «Пептидные аптамеры при обнаружении белков без меток: 2. Химическая оптимизация и обнаружение различных изоформ белка». Аналитическая химия . 81 (9): 3314–20. дои : 10.1021/ac802513n . ПМИД 19320493 .

[29] «Связующие вещества Affimer улучшают эффективность диагностического анализа для обнаружения C.difficile» . Авакта . Архивировано из оригинала 19 октября 2018 г. Проверено 19 октября 2018 г.

[:6-30] «Разработка и характеристика связующих аффимеров с 4 ведущими терапевтическими антителами | Avacta» . www.avacta.com . Архивировано из оригинала 19 октября 2018 г. Проверено 19 октября 2018 г.

[:13-31] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ученый Avacta доктор Джефф Платт представляет данные Affimer на вебинаре | Avacta» . www.avacta.com . Архивировано из оригинала 22 октября 2018 г. Проверено 22 октября 2018 г.

[:12-32] Перейти обратно: ^а ^б Робинсон Дж.И., Бакстер Э.В., Оуэн Р.Л., Томсен М., Томлинсон Д.С., Уотерхаус М.П., Вин С.Дж., Неттлшип Дж.Э., Тиде С., Фостер Р.Дж., Оуэнс Р.Дж., Фишвик К.В., Харрис С.А., Голдман А., Макферсон М.Дж., Морган А.В. (январь 2018 г.) ). «Аффимерные белки ингибируют связывание иммунного комплекса с FcγRIIIa с высокой специфичностью посредством конкурентного и аллостерического механизмов действия» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (1): Е72–Е81. дои : 10.1073/pnas.1707856115 . ПМЦ 5776790 . ПМИД 29247053 .

[:14-33] Перейти обратно: ^а ^б Мишель М.А., Сватек К.Н., Хоспенталь М.К., Командер Д. (октябрь 2017 г.). «Аффимеры, специфичные для убиквитиновых связей, раскрывают информацию о передаче сигналов убиквитина, связанного с K6» . Молекулярная клетка . 68 (1): 233–246.e5. doi : 10.1016/j.molcel.2017.08.020 . ПМК 5640506 . ПМИД 28943312 .

[34] Джонсон А., Сонг Кью, Ко Ферриньо П., Буэно П.Р., Дэвис Дж.Дж. (август 2012 г.). «Чувствительный импедиметрический анализ без меток на основе аффимеров и антител для С-реактивного белка». Аналитическая химия . 84 (15): 6553–60. дои : 10.1021/ac300835b . ПМИД 22789061 .

[35] «Реактивы Affimer® облегчают очистку с помощью аффинной хроматографии» . www.drugtargetreview.com . Проверено 22 октября 2018 г.

[36] Печливани, Николетта; Кирни, Кэтрин Дж.; Тиде, Кристиан; Чеа, Рамса; Феникс, Фладия; Поннамбалам, Шринивасан; Олт, Джеймс Р.; Макферсон, Майкл Дж.; Томлинсон, Даррен С.; Аджан, Рамзи А. (01 мая 2022 г.). «Аффинная очистка фибриногена с использованием колонки Affimer» . Биохимия и биофизика Acta (BBA) – общие предметы 1866 : 130115.doi : (5 ) 10.1016/j.bbagen.2022.130115 . ISSN 0304-4165 . ПМИД 35240235 . S2CID 247199635 .

[37] Кайл Х.Ф., Уиксон К.Ф., Стотт Дж., Берслем Г.М., Бриз А.Л., Тиде С., Томлинсон Д.С., Уорринер С.Л., Нельсон А., Уилсон А.Дж., Эдвардс Т.А. (октябрь 2015 г.). «Исследование интерфейса HIF-1α/p300 с использованием технологий пептидного и фагового дисплея Adhiron» . Молекулярные биосистемы . 11 (10): 2738–49. дои : 10.1039/c5mb00284b . ПМИД 26135796 .

[38] Гейдельбергер Дж.Б., Фойгт А., Борисова М.Е., Петрозино Г., Руф С., Вагнер С.А., Бели П. (апрель 2018 г.). «Протеомное профилирование субстратов VCP связывает VCP с K6-связанным убиквитилированием и функцией c-Myc» . Отчеты ЭМБО . 19 (4): e44754. дои : 10.15252/эмбр.201744754 . ПМЦ 5891417 . ПМИД 29467282 .

[:8-39] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Интервью с Амриком Басраном из Avacta Life Sciences» . Обзор целевых показателей лекарств .

[40] «Аффимерные лекарственные конъюгаты TMAC» . Авакта . Архивировано из оригинала 22 октября 2018 г. Проверено 22 октября 2018 г.

[41] Маллиган, Том. «Avacta и Мемориальный онкологический центр Слоана-Кеттеринга сотрудничают в исследованиях клеточной терапии» . Архивировано из оригинала 3 июля 2022 г. Проверено 22 октября 2018 г.

[42] «Пайплайн | Авакта» . www.avacta.com . Проверено 22 октября 2018 г.

[43] Кинг Р., Тиде С., Симмонс К., Фишвик С., Томлинсон Д., Аджан Р. (февраль 2015 г.). «Ингибирование взаимодействия комплемента C3 и фибриногена: потенциальная новая терапевтическая мишень для уменьшения сердечно-сосудистых заболеваний при диабете». Ланцет . 385 (Приложение 1): S57. дои : 10.1016/s0140-6736(15)60372-5 . ПМИД 26312879 . S2CID 35622552 .

[44] «Технология Affimer: результаты тестирования иммуногенности PBMC» . Авакта . Архивировано из оригинала 22 октября 2018 г. Проверено 22 октября 2018 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

v т и Сконструированные моноклональные антитела и миметики антител
Цельное антитело	биспецифический Трехфункциональное антитело
Потрясающий фрагмент	F(ab') ₂ фрагмент / Fab' фрагмент биспецифический Химически связанный Fab
Переменный фрагмент	Одноцепочечный вариабельный фрагмент/di-scFv/tri-scFv Однодоменное антитело Малый модульный иммунофармацевтический биспецифический Активатор Т-клеток
Меньшие единицы	Микроантитело
Внутриклеточный	Внутритела
Миметики антител	Молекула аффитела Аффилин Аффимер Аффитин Альфатело Антикалин Авимер в DARP Пептид домена Кунитца Монокело наноЗАЖИМ